فهرست آنزیم‌ها

آنزیمها را براساس واکنش شیمیایی که کاتالیز میکنند طبق شماره کمیسیون آنزیم (EC number) شماره گذاری میکنند
نامگذاری
در گذشته بر اساس پیش‌ماده نام‌گذاری می‌شد که به آخر آنها از پسوند "از" اضافه می‌شد مثل پروتئاز
روش دیگر بر اساس کاری که آن آنزیم انجام می‌دهد مثل دهیدرژناز
روش پیشرفته‌تر براساس کاری که انجام می‌دهد و نام پیش‌ماده الکل دهیدرژناز
روش استاندارد (EC numbers) که در این روش آنزیم‌ها رده‌بندی شده و رده‌ها به زیررده تقسیم شده و در نهایت هر آنزیم کد مخصوص به خود می‌گیرد مثل EC ۱.۱.۱.۸۶ این رده‌ها به شکل زیر است
۱-اکسیدو رداکتازها (EC 1)
۲-ترانسفرازها (EC 2)
۳-هیدرولازها (EC 3)
۴-لیازها (EC 4)
۵-ایزومرازها (EC 5)
۶-لیگازها (EC 6)
طبقه بندی استاندارد
۱-اکسیدو رداکتازها (EC 1)
1.1 گروه:EC 1.1 (act on the CH-OH group of donors)
1.2 گروه:EC 1.2 (act on the aldehyde or oxo group of donors)
1.3 گروه:EC 1.3 (act on the CH-CH group of donors)
1.4 گروه:EC 1.4 (act on the CH-NH2 group of donors)
1.5 گروه:EC 1.5 (act on CH-NH group of donors)
1.6 گروه:EC 1.6 (act on NADH or NADPH)
1.7 گروه:EC 1.7 (act on other nitrogenous compounds as donors)
1.8 گروه:EC 1.8 (act on a sulfur group of donors)
1.9 گروه:EC 1.9 (act on a heme group of donors)
1.10 گروه:EC 1.10 (act on diphenols and related substances as donors)
1.11 گروه:EC 1.11 (act on peroxide as an acceptor -- peroxidases)
1.12 گروه:EC 1.12 (act on hydrogen as a donor)
1.13 گروه:EC 1.13 (act on single donors with incorporation of molecular oxygen)
1.14 گروه:EC 1.14 (act on paired donors with incorporation of molecular oxygen)
1.15 گروه:EC 1.15 (act on superoxide radicals as acceptors)
1.16 گروه:EC 1.16 (oxidize metal ions)
1.17 گروه:EC 1.17 (act on CH or CH2 groups)
1.18 گروه:EC 1.18 (act on iron-sulfur proteins as donors)
1.19 گروه:EC 1.19 (act on reduced flavodoxin as donor)
1.20 گروه:EC 1.20 (act on phosphorus or arsenic as donors)
1.21 گروه:EC 1.21 (act on X-H and Y-H to form an X-Y bond)
1.22 گروه:EC 1.97 (other oxidoreductases)
۲-ترانسفرازها (EC 2)
2.1 گروه:EC 2.1 (transfer one-carbon groups, Methylase)
2.2 گروه:EC 2.2 (transfer aldehyde or ketone groups)
2.3 گروه:EC 2.3 (acyltransferases)
2.4 گروه:EC 2.4 (glycosyltransferases)
2.5 گروه:EC 2.5 (transfer alkyl or aryl groups, other than methyl groups)
2.6 گروه:EC 2.6 (transfer nitrogenous groups)
2.7 گروه:EC 2.7 (transfer phosphorus-containing groups)
2.8 گروه:EC 2.8 (transfer sulfur-containing groups)
2.9 گروه:EC 2.9 (transfer selenium-containing groups)
۳-هیدرولازها (EC 3)
3.1 گروه:EC 3.1 (act on ester bonds)
3.2 گروه:EC 3.2 (act on sugars - glycosylases)
3.3 گروه:EC 3.3 (act on ether bonds)
3.4 گروه:EC 3.4 (act on peptide bonds - Peptidase)
3.5 گروه:EC 3.5 (act on carbon-nitrogen bonds, other than peptide bonds)
3.6 گروه:EC 3.6 (act on acid anhydrides)
3.7 گروه:EC 3.7 (act on carbon-carbon bonds)
3.8 گروه:EC 3.8 (act on halide bonds)
3.9 گروه:EC 3.9 (act on phosphorus-nitrogen bonds)
3.10 گروه:EC 3.10 (act on sulfur-nitrogen bonds)
3.11 گروه:EC 3.11 (act on carbon-phosphorus bonds)
3.12 گروه:EC 3.12 (act on sulfur-sulfur bonds)
3.13 گروه:EC 3.13 (act on carbon-sulfur bonds)
۴-لیازها (EC 4)
4.1 گروه EC 4.1 : (carbon-carbon lyases)
4.2 گروه:EC 4.2 (carbon-oxygen lyases)
4.3 گروه:EC 4.3 (carbon-nitrogen lyases)
4.4 گروه:EC 4.4 (carbon-sulfur lyases)
4.5 گروه:EC 4.5 (carbon-halide lyases)
4.6 گروه:EC 4.6 (phosphorus-oxygen lyases)
۵-ایزومرازها (EC 5)
5.1 گروه:EC 5.1 (racemases and epimerases)
5.2 گروه:EC 5.2 (cis-trans-isomerases)
5.3 گروه:EC 5.3 (intramolecular oxidoreductases)
5.4 گروه:EC 5.4 (intramolecular transferases -- mutases)
5.5 گروه:EC 5.5 (intramolecular lyases)
5.6 گروه:EC 5.99 (other isomerases)
۶-لیگازها (EC 6)
6.1 گروه:EC 6.1 (form carbon-oxygen bonds)
6.2 گروه:EC 6.2 (form carbon-sulfur bonds)
6.3 گروه:EC 6.3 (form carbon-nitrogen bonds)
6.4 گروه:EC 6.4 (form carbon-carbon bonds)
6.5 گروه:EC 6.5 (form phosphoric ester bonds)
6.6 گروه:EC 6.6 (form nitrogen-metal bonds)
برخی از آنزیم‌های مهم عبارتند از:
آنزیم‌های فعال در حمله آنزیمی
اندونوکلئازها
اگزونوکلئازها
آنزیم همتاسازی مولکولی
آنزیم دی‌ان‌ای لیگاز
اندونوکلئازهای محدودکننده
SacI
SalI
HindIII
BamI
EcoRI
KpnI
XbaI
XhoI
PstI
آنزیم