質問: chip-seqに異なる複数のchip免疫沈降物をプールしても良いですか?その場合、インプットサンプルも同じくプールしたほうが良いですか?
回答: 免疫沈降作業中に技術的なバイアスがかかることを考慮すると、複数のchip免疫沈降物を同時に同じクロマチンから平行して処理することによって可能になると考えられますが、異なる実験から得られた免疫沈降物はプールすることは避けたほうが良いと思われます。 インプットサンプルは各処理に使用したクロマチンからそれぞれ調製してください。