質問: 今、eclipseでプロジェクトに手を加えたりしたりしているのですが、ディレクトリが多く、階層も深いので、どの機能や設定がどこらへんにあるのか、頭の中がぐちゃぐちゃな状態になっています。
回答: まずはパッケージ名をちゃんと機能などに適した名前にしましょう。 それとeclipse使っているなら、例えばクラス名にマウスポインタ置いてCtrl+クリックすればソースコードに飛んでくれますし、こういった機能を使えばどこに何があるかはあまり覚える必要はないです。