質問: 1つのchip-seqライブラリーに対し、実際にどのくらいのリード数を費やす必要がありますか?
回答: これは、目的のタンパク質によって異なります。鋭いピークを持つヒストン修飾の場合は3,000万リード(h3k4m3)、ピーク幅が広く量が多いもの(h3k27m3など)の場合、約5,000万リードが推奨されます。