質問: abiのシークエンスである塩基の波形がずれる abi310でシークエンスをしています。キットはbigdye terminater ver.3.1です。解析ソフトはsequencing analysis 3.4.1です。 最近使い始めて、コントロールとして付属のプラスミドとプライマーでサンプルを作って装置にかけました。結果、波形はきれいに出たのですが、tの波形が若干右にずれていて、テキストとしてみるとnがいくつも出てしまいます。 たとえば、atgcという配列があったとすると、波形ではtが右にずれているため、aとtの間が通常より隙間が広く、tとgの間が狭く、テキストにするとantgcとかanncとかになってしまいます。 一応、dyeset/primer settingとかinstrument fileとかをいじって見たんですが今度はgがずれたりして、キッチリとピークが並んでくれません。 どうすれば直るのでしょうか?よろしくお願いします
回答: 初めましてこんにちは。 私は理学部卒です。 国立でなくて私立大学ですので よろしくお願いします。 シーケンサーは、塩基配列を調べる機器です。 やはりabiがこの業界での標準です。 この機械で論文を書かないと信用されません。 メーカーとしても、利幅の大きい機械です。 質量分析装置も良く売れていますよ。 科学研究費でよく買われていますね。 一度ご検討してみられてはどうですか。 ネイチャーに載る可能性もぐんと近づきますよ。