質問: 現在環境系の研究室にいるM1です。 私は群集動態に関する研究をテーマにしており、サンプルが一通りそろったため、Rを使った解析を進めようと考えています。
回答: nMDSもクラスター解析も多変量解析です。veganパッケージは有名ですし、どちらもネットで調べたらいくらでもコードが落ちてます。それを見ながらするのが早いです。 データをどこかのディレクトリにおいて、setwdでそのディレクトリを指定したら読めるはずです。データはcsvが一般的と思います。vegdistも調べたらいくらでも出てきます。まずは人のコードをみながら考えてみてください。 英語のほうが詳しい単行本が出ていますが、それを読む時間はありますか?