質問: さくらインターネット(マネージドサーバ)で.shtmlに書いたinclude文が動かず困っています。
回答: さくらインターネット(マネージドサーバ)を使ったことがないので分かりませんが、shtmlなら、.htaccessか、Apacheのhttpd.conf辺りで設定するのではないでしょうか。 SSIは働いているみたいなので、PHP側で何らかの理由でパスが正しく認識されてないとかですかね? あとbodyタグの前に書くべきとか言う記事もありますね。