質問: 電気泳動で分子量マーカーの味方が分かりません。 画像を添付しました。
回答: 現役の頃の記憶が結構錆び付いているのでうろ覚えですがご了承ください。 分子量マーカーは、配列が判っているDNAを特定の配列で分断する制限酵素(EcoRIなど)で処理したものです。ですので、DNAの配列に制限酵素の認識配列を照らし合わせるとどこでカットしたのかが推測でき、それぞれのDNA断片のサイズもbpレベルで判断できます。 DNAと制限酵素の種類によって、マーカーのバンドのサイズや組み合わせも変わります。各バンドが微妙な数字なのはそのマーカーに使用している制限酵素の仕様です。親切な製品などは5kbpずつ刻んでいる便利なものもあります。 また普通は分子量マーカーの説明書に各バンドの分子量が掲載されているものだとおもいますけどね。 分子量を載せていない部分は、サイズにばらつきがあったりバンドが近すぎるなどして目盛りに適さないからではないでしょうか。 で、サンプルの分子量自体はマーカーとの比較で判断するため、完璧に正確な値は求められません。あくまで目安です。 ですが写真と参考サイトのものは、使用しているプラスミドも制限酵素の認識配列も予め全て判っているものなので詳細なbp数が割り出せるだけです。 当然、配列が不明なサンプルだとマーカーとの比較で「〇〇bp程度」としか判断できません。