質問: OSの入れ替えで完全にHDDは入れ替わりますか?
回答: 気にしすぎです。 そもそもコンピューターウイルスはインターネットに接続しても勝手に侵入してくるような物ではなく、利用者が何かしらの方法でダウンロードしたファイルから感染する物です。 そしてHDDを初期化しても残るような物、BIOSに感染してHDD初期化では駆除できない物もありますが、それらは「そういった物もある」程度で、そこらへんにゴロゴロしているような物ではありません。 初期化して普通に使っていて、それでも何か不具合でもあるなら疑った方が良い、くらいのレベルです。