質問: 法務局の公図にも、市役所の公図にも載っていない土地
回答: 単なる現況確認不能地では? 国勢調査の漏れだとか、そんなところではないかと思います。 役所は登記にある限り、どこにあるかわからない土地でも課税をしますので、 現所有者が閉鎖すればいいのだと思います。