質問: dna抽出の際のゲル化について 植物のゲノムdnaの抽出を行っています。 ところが、最後のエタ沈の段階でdnaがゲル化し、 溶けにくくなって困っています。 (濃度の高いdna溶液を作りたいため) 方法はctab、sds共試してみましたが、同じようにゲル化してしまいました。 何かいい方法はないでしょうか?
回答: ゲル化しているのは、主に多糖類ですね。 うまくいくとは保証できませんが、いくつかヒントを、 1.ゲル化した多糖類より核酸は溶けやすいので、遠心して不溶性のゲルを除き上澄みだけ回収する。 2.沈殿を十分量のteに溶かし、多糖類が十分に取り除けるまで、再びctab/nacl沈殿を繰り返す。 3.沈殿をを十分量のteに溶かし、多糖類が十分に取り除けるまでフェノール抽出を繰り返す(多糖類を除くのには、クロロフォルムを含まないバッファ飽和のフェノールを使うほうが効果的です)。