質問: 断片化クロマチンの鎖長が100〜500 bpの場合、220 bpのアンプリコンサイズは問題ありませんか?
回答: このアンプリコンのサイズはqpcrに最適なサイズ範囲からは外れますが、それでも機能する可能性はあります。 300bp未満のクロマチンフラグメントのうち、両方のプライマー配列を含み、増幅が可能な断片はごくわずかです。 小さいアンプリコンのプライマーペアを設計できない場合は、このような大きいアンプリコンが必要な場合があるかもしれません。