質問: タンパク質への翻訳について はっきりしないことがあるので,わかる方がいらっしゃいましたらご回答お願いします. ある遺伝子のスタートコドンの,同じフレームの上流にストップコドンがある場合,翻訳には何らかの影響が出るのでしょうか? 私は,リボソームが完成するのはスタートコドンでの話なので,ストップコドンが手前にあっても関係ない,と考えています.
回答: cdnaの塩基配列を調べて、フレーム解析をしてみると実感できますが、5', 3' の非翻訳領域(utr)はどのフレームを取ってもストップコドンだらけ、というのは当たり前ですよ。ストップコドンだらけのutrに挟まれて、翻訳領域のorfがスカッときれいに空いて見えます。 ちなみに、 実際の翻訳開始は、スタートコドンのaugだけでは起こりません。リボゾームが結合する配列が必要です。真核生物では一般にkozak配列というのがコンセンサスとされています(ご存じなければ文献等調べてみてください)。 フレームの中に複数のaugがあった場合、必ずしも先に出てくるaugから翻訳が始まるとは限りません。先にあるaugは実はコンセンサスからはずれていて機能しなくて、 コンセンサスに適合した後の方のaugから翻訳が始まっていることもあるので注意です。