質問: what is the difference between 会社はどこですか and 会社はどこにありますか ? what is the difference between 会社はどこですか and 会社はどこにありますか ?
回答: 「会社はどこにありますか」は、明確に会社の所在を尋ねています。 「会社はどこですか」も会社の所在を尋ねていますが、所属する会社の名前を聞く時にも使えます。明確に所在を聞いていないので、会社はどこ=どの会社に勤めているか、と解釈することも出来るからです。 どちらの意味になるかは、文脈に依ります。