医学生物学文献からのオントロジー構築のためのメンション非依存型情報抽出

生物学的プロセスなどのエンティティは、医学生物学文献内で常に明示的に言及されているとは限らず、しばしば専門知識の共有を仮定して暗黙的に言及される。本研究では、医学生物学文献からのオントロジー自動構築を目指し、プロセス抽出と文書レベル関係抽出の二段階からなるメンション非依存型情報抽出システムを提案する。提案システムでは、一貫してメンション表現に依存せず、入力文書に対して対象オントロジーに紐づいたプロセスエンティティ集合の抽出とエンティティ間関係の同定を可能にする。新たなベンチマークデータセットを構築し、BERTベースまたはLLMベースのメンション非依存型アプローチを提案し、評価と比較を行う。