人们最常用的方法，就是放入冰箱里面冷冻，这是长期的保存方法。短时保存可以把购买回来的新鲜的生蚝用清水洗刷干净，放入水盆里，滴几滴香油，这样就可以保存一两天。但是生蚝最好在购买回来是活的时候就吃了，这样才能摄取到丰富的营养成分，生蚝的味道也会更美味。
生蚝的冷藏一般在4至5摄氏度的恒温，高了滋生细菌，导致蚝肉腐烂，低了会冻坏或冻死生蚝。最多在冰柜中保存6天，而且不能随意翻动或与其他食品混杂搁放。