シジミ（蜆）とは、二枚貝綱異歯亜綱シジミ科 (Cyrenidae) に分類される二枚貝の総称。淡水域や汽水域に生息する小型の二枚貝である。通常目にする二枚貝のうちでは小型なので「縮み」が転じて名づけられたとする説がある。 従来使用されてきた学名CorbiculidaeはCyrenidae Gray, 1847のシノニムとされる。 日本本土の在来種としては、汽水性のヤマトシジミと淡水性のマシジミ、セタシジミの計3種が生息し、大きさは何れも2-3cm程度である。また、琉球列島には汽水性で10cmの大きさに及ぶマングローブシジミ属（ヒルギシジミ属） (Geloina) なども生息する。しかし、20世紀末期以降、中国や台湾を中心とした東アジアの淡水域に生息するタイワンシジミ類が外来し繁殖するようになり、場所によっては非常な高密度で生息し、在来種のマシジミの存続を危ぶませるなどの問題も起こるようになった。 ヤマトシジミ Corbicula japonica 日本全国の汽水の砂泥底に生息し雌雄異体で卵生。殻の内面は、白紫色。ロシア極東、朝鮮半島にも分布。 マシジミ Corbicula leana （全国の淡水）の砂礫底や砂底に生息し雌雄同体で卵胎生で雄性発生をするが、繁殖様式は十分に解明されていない。殻の内面は、 紫色。平均水温19℃程度以上で繁殖し、繁殖期間は4月〜10月。 セタシジミ Corbicula sandai 琵琶湖固有種。水深10m程度までの砂礫底や砂泥底に生息し、寿命は7〜8年程度とされている。雌雄異体で卵生。殻の内面は、濃紫色。漁業調整規則による制限殻長は15mm。減少した資源回復のため滋賀県は、捕獲の体長制限と種苗放流を主とした琵琶湖セタシジミ資源回復計画を策定し回復に努めている。 シジミ科に近縁なマメシジミ科（数mm程度）や、近縁ではないが見かけが似るドブシジミ科（1cm程度）が広く分布するが、小型であるために目立たず、利用もされない。 卵生の種の生活史は海産の貝とほぼ同じで、受精後はトロコフォア幼生、D型幼生、穀頂期、変態期の各期を経て着底する。但し、トロコフォア期およびＤ型幼生期には遊泳しない。初期幼生での種の同定は困難である。寿命は種と環境によるが7〜8年から10年以上である。 1980年代以降は、中華人民共和国、大韓民国、ロシアなどから輸入されたタイワンシジミ類 (Corbicula fluminea) も多く、日本国内産と比べて、比較的廉価に販売される。また、これらは日本国内産との識別が難しく、また種の特定も困難なため、産地偽装なども多い。 輸入されたタイワンシジミが野外に逸出したものか、1990年代から日本国内各地で外来のシジミが出現し、在来種との交雑などの懸念が持たれている。また、タイワンシジミが進入した水域では、急速にマシジミが減少することが報告されている。 アメリカ合衆国南西部では1924年までに中国人が食用に持ち込んだとされるタイワンシジミが大量に繁殖し問題になっている。タイワンシジミは1980年代にはライン川に帰化し、ライン・マイン・ドナウ運河を通じてドナウ川にも帰化した。1998年にはすでにエルベ川にも定着している。 味噌汁の具に利用される二枚貝としては、アサリと並んで日本人に最も馴染み深いものである。佃煮・時雨煮などにもされる。食味ではセタシジミがもっとも美味とされ、次いで汽水産のヤマトシジミ、マシジミがおいしいとされる。ただし、上記のような種不明の外来種が激増したことにより、これら食用シジミも減少傾向にある。 オルニチンが肝臓に作用するため、俗に「シジミの味噌汁は二日酔いに効く」と言われているが確証はない。鉄分が多く貧血に良いともされ、更にうま味成分の一種であるコハク酸を豊富に含んでおり、江戸時代の昔より肝臓に良い食材とされている。健康食品として「シジミエキス」なども販売されている。 慢性肝炎、NASH、アルコール性肝障害等を罹患している場合は、肝臓に蓄積する過剰な鉄分が有害性を生じるとの報告があり摂食制限が必要な場合もある。 日本国内の市場に出回るシジミのうち、国産として最も一般的なのは主に塩分濃度が1.5%以下（海水は約3.5%前後）の水域で採れるヤマトシジミで、有名な産地としては北海道の網走湖・パンケ沼・天塩川中下流域、青森県の十三湖・小川原湖、宮城県の北上川、 茨城県の涸沼川・利根川、島根県の宍道湖（宍道湖七珍の一つ）などがある。また琵琶湖に固有のセタシジミも流通する。しかし1980年代以降は国内漁場の環境悪化や価格高騰などにより国内産シジミが減り、それを補うように中国、韓国、北朝鮮、ロシアを原産国とする輸入シジミの市場に占める割合が増えるようになり、2001年（平成13年）には輸入シジミが国産シジミを上回るようになった。輸入シジミには複数種があるが、一見すると同じように見えるため外国産シジミを国産と偽って販売する業者もある。またロシアや朝鮮半島ではヤマトシジミも漁獲されており、外見上で日本産のヤマトシジミと識別するのは困難である。 殻は布でくるんでアクセサリーにすることもある。 食用にもなるマシジミ 日本国内で増加中の外来シジミ （写真：タイワンシジミ） ヤマトシジミ ^ 文部科学省 「日本食品標準成分表2015年版（七訂）」 ^ 厚生労働省 「日本人の食事摂取基準（2015年版）」 ^ Philippe Bouchet, Jean-Pierre Rocroi, Rüdiger Bieler, Joseph G. Carter & Eugene V. Coan (2010年). “Nomenclator of Bivalve Families with a Classification of Bivalve Families”. Malacologia 52 (2): 1–184. doi:10.4002/040.052.0201. http://www.bioone.org/doi/abs/10.4002/040.052.0201?journalCode=mala#aff4lCode=l.  ^ 琵琶湖セタシジミ資源回復計画の概要 ^ 藤山雄次・高島義和 ヤマトシジミの初期幼生の観察 日本海洋生物研究所 年報 2002 (PDF) ^ 強清水で生息が確認されたシジミの同定結果について 和光市役所 ^ 肝臓病食における鉄制限 (群馬県肝臓病食懇話会記録 (PDF) ^ 北海道の漁業図鑑 「しじみがい漁業」 2011年5月23日閲覧。 ^ 長宗拓弥(2015年4月25日). “シジミ漁獲量:県、4年ぶり全国一 青森から奪還 湖沼別でも宍道湖”. 毎日新聞 (毎日新聞社) ^ http://www.pref.shimane.lg.jp/suigi/publish/jigyouhou/2005/naisuimen.data/III-1-5.pdf ^ 独立行政法人水産総合研究センター (2004) シジミ種判別技術研修会を開催します.2004年12月8日プレリリース/ ^ 古丸 明, 堀 寿子, 柳瀬 泰宏, 尾之内 健次, 加藤 武, 石橋 亮, 河村 功一, 小林 正裕, 西田 睦 (2010年). “日本，韓国，中国産シジミ類の mtDNA16S rDNA 塩基配列分析による判別”. 日本水産学会誌 76 (4): 621-629. doi:10.2331/suisan.76.621. https://doi.org/10.2331/suisan.76.621.  ^ NCBI Taxonomy Browser より ^ Taylor, J. D.; Williams, S. T.; Glover, E. A.; Dyal, P., “A molecular phylogeny of heterodont bivalves (Mollusca: Bivalvia: Heterodonta): new analyses of 18S and 28S rRNA genes”, Zoologica Scripta 36 (6): 587–606, doi:10.1111/j.1463-6409.2007.00299.x, http://www3.interscience.wiley.com/journal/118504423/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0  ^ http://www.iza.ne.jp/news/newsarticle/natnews/topics/256030 ロシア産シジミ「国内産」と偽装 秋田の会社を書類送検：iza（2009年5月20日） ^ タイワンシジミ種群 小池文人 外来生物の分布拡大予報 ^ 日本産淡水貝類図鑑〈1〉琵琶湖・淀川産の淡水貝類 (ピーシーズ生態写真図鑑シリーズ) 紀平 肇 (著), 内山 りゅう (著), 松田 征也 (著) アサリ ハマグリ 鋤簾 : シジミを採取する漁具の一つ しじみのダンス - シジミをテーマにしたNHKみんなのうたの楽曲 マシジミ Corbicula leana Prime (PDF) 愛知県 マシジミの稚貝の成長について 藤原次男 貝類学雑誌Venus : the Japanese journal of malacology 36(1), 19-24, 1977-05-15 日本貝類学会 マシジミの雄性発生ってなあに 相模川水系におけるタイワンシジミの侵入状況とシジミ亜科分類の変遷 園原哲司 向上高等学校 生物部 シジミ - 「健康食品」の安全性・有効性情報（国立健康・栄養研究所） 宍道湖漁業協同組合