Citation: 1C_338/2023 E. C

Agissant par la voie du recours en matière de droit public, O.________ SA demande principalement au Tribunal fédéral d'annuler l'arrêt attaqué et de renvoyer la cause à l'instance précédente pour nouvelle décision dans le sens des considérants. Subsidiairement, elle conclut à la réforme de l'arrêt attaqué en ce sens que le recours au TAF est admis, la décision d'approbation du 17 décembre 2019 annulée et les frais des procédures A-646/2020 et A-1348/2022 mis à la charge des CFF; une équitable indemnité pour ses frais de défense lui est par ailleurs allouée à la charge des CFF. Elle requiert également l'octroi de l'effet suspensif et la suspension de la procédure jusqu'à droit connu sur la procédure d'approbation visant la révision générale et partielle du plan d'aménagement local (ci-après: PAL) de la Commune d'Avry (planification confirmée par arrêts de ce jour (dans les causes 1C_604/2022, 1C_620/2022 et 1C_621/2022), requêtes rejetées par ordonnances du 4 août 2023; la demande de révision de cette ordonnance déposée par la recourante a pour sa part été rejetée le 11 janvier 2024. Le TAF se réfère intégralement à son arrêt et n'a pas d'autres observations à formuler. Sans prendre de conclusions formelles, l'OFT estime que la majorité des arguments de la recourante relèvent de l'action populaire; l'office fédéral se détermine également sur le fond. Les CFF concluent principalement à l'irrecevabilité du recours, subsidiairement à son rejet, dans la mesure de sa recevabilité. La recourante réplique et persiste dans ses conclusions. Le 21 décembre 2023, les CFF se sont nouvellement déterminés confirmant leur position. Par acte du 9 janvier 2024, l'OFT précise ses conclusions, demandant principalement l'irrecevabilité du recours, subsidiairement son rejet dans la mesure de sa recevabilité. La recourante s'est encore exprimée le 19 février 2024.