Citation: 1C_201/2021 E. B

Le 6 février 2018, le Consortium B.________ a déposé auprès du Département cantonal de l'aménagement, du logement et de l'énergie, devenu le Département cantonal du territoire (ci-après: DT), une demande d'autorisation portant sur la construction, sur cette parcelle, d'un immeuble de 20 logements avec parking souterrain, abattages d'arbres et aménagement de places de parking extérieures. A l'appui de sa demande, le Consortium de B.________ a exposé que l'immeuble projeté présentait un gabarit supérieur à celui prévu par le PLQ - lequel avait déjà été passablement réinterprété -, soit R+2+attique. La toiture s'élèverait à 440,80 m; certains bâtiments réalisés sur les parcelles voisines présentaient des hauteurs supérieures. Le sous-périmètre no 7 autorisait un indice d'utilisation du sol (IUS) de 6'958 m², dont 4'397 m² avaient déjà été réalisés; le projet utilisait le solde et affichait une surface brute de plancher (ci-après: SBP) de 2'560 m². B.a. Le 23 mars 2018, le service des préavis et instruments de la direction de la planification directrice cantonale et régionale du DT (ci-après: SPI) a préavisé favorablement le projet avec dérogation et sous conditions. Le gabarit n'était pas conforme au PLQ mais s'alignait sur les gabarits effectivement réalisés sur les parcelles voisines. Le projet terminait le PLQ, tout en rejoignant l'esprit des constructions antérieures. B.b. Le 18 septembre 2018, la direction générale des transports, devenue l'office cantonal des transports (ci-après: OCT), a préavisé favorablement le projet, sous conditions. B.c. Le 9 avril 2018, la direction générale de l'agriculture et de la nature, devenue l'Office cantonal de l'agriculture et de la nature (ci-après: OCAN), a sollicité la modification du projet afin que le cordon arboré se trouvant au sud de la parcelle soit conservé et l'image du PLQ respectée. Des modifications ont été apportées au projet permettant des replantations (en pleine terre) sur la dalle du parking souterrain. Le consortium a déposé un plan d'aménagement paysager (ci-après: PAP) indiquant la suppression d'une vingtaine d'arbres et la plantations de huit nouveaux arbres ainsi que des haies vives. Sur demande de l'OCAN, le Consortium B.________ a produit un diagnostic des arbres établi par un arboriste le 19 novembre 2018, recommandant en substance l'abattage de l'ensemble des arbres de cette "zone forestière" (risque de chute de branches, maladie/chalarose) afin d'utiliser la valeur de compensation pour recréer un cordon boisé de qualité. Le 16 janvier 2019, l'OCAN a rendu un préavis favorable à l'abattage des arbres, sous conditions: la conservation du tilleul; la reconstitution d'un cordon arboré au sud de la parcelle, côté ouest. Le cordon d'arbres situé au sud devait autant que possible être conservé, notamment l'if et les arbres entre ce dernier et l'est de la parcelle. Le 28 janvier 2019, l'OCAN a rendu "un préavis liant arbres hors-forêts" favorable, sous condition notamment de replanter des arbres, dont des tilleuls, des charmilles et des chênes verts sur la parcelle pour un montant de 70'000 fr. B.d. Les autres services de l'Etat concernés ont également préavisé favorablement le projet, sous certaines conditions. B.e. Par arrêté du 20 mars 2019, le Conseiller d'Etat en charge du DT a autorisé l'application des normes de la quatrième zone rurale aux bâtiments à construire. Par décision du 26 mars 2019, publiée le même jour dans la Feuille d'avis officielle de la République et canton de Genève, le DT a délivré l'autorisation sollicitée. Les conditions contenues dans les divers préavis en faisaient partie intégrante et devaient être strictement respectées.