Citation: 2C_577/2023 E. A

A.________ Sàrl (ci-après: la Société), dont le siège est à V.________, est inscrite au registre du commerce du canton de Vaud depuis le 26 juillet 2018. Elle a pour but la gestion et l'exploitation de crèches privées, d'écoles primaires, d'écoles de sport, de fitness, de petits commerces et pop-up stores (magasins éphémères), l'organisation de tous types d'événements (anniversaires, conférences, etc.). Le Service d'autorisation et de surveillance de l'accueil de jour de la République et canton de Genève (ci-après: le Service cantonal) a délivré à la Société une autorisation d'exploiter une structure d'accueil de la petite enfance dès le 14 mai 2018. Cette autorisation a été régulièrement renouvelée les 1er janvier, 1er mars et 3 novembre 2019, ainsi que le 20 juillet 2021. La capacité d'accueil de la crèche était alors de cinquante-cinq enfants simultanément. A.a. Le 1er mars 2019, s'est tenue une séance d'information sur la mise en application des "Usages petite enfance 2020" (ci-après: les usages ou UPE). Le nom de la crèche genevoise et celui de l'adjointe de direction figuraient sur la liste des participants. Le 30 avril 2019, le Service cantonal a invité les entités non signataires d'une convention collective de travail à s'annoncer sans délai auprès de l'Office cantonal de l'inspection et des relations du travail de la République et canton de Genève (ci-après: l'Office cantonal) afin notamment que les conditions appliquées dans les structures d'accueil de la petite enfance puissent être analysées et que celles-ci puissent signer, d'ici la fin de l'année 2019, un engagement à respecter les usages. Le courrier précisait que la surveillance formelle par le Service cantonal serait effective dès le 1er janvier 2020. Dans un courrier du 28 octobre 2019, la Société a indiqué à l'Office cantonal qu'elle remplissait les conditions légales et réglementaires qui lui avaient été imposées à sa création et qu'elle refusait de signer les UPE. Le 27 juillet 2020, l'Office cantonal a informé la Société de l'entrée en vigueur le 1er septembre 2020 des UPE avec des modifications portant notamment sur les catégories professionnelles et les salaires. La Société a réitéré, dans un courrier adressé le 1er septembre 2020 à l'Office cantonal, qu'elle refusait de se soumettre aux usages. Le 12 mars 2021, l'Office cantonal a indiqué à la Société qu'il communiquait son refus de s'engager à respecter les UPE au Service cantonal. Il ajoutait qu'après examen des documents transmis par la Société, il apparaissait à première vue que la crèche ne se conformait pas aux usages de son secteur sur neuf points liés aux conditions de travail et aux prestations sociales. A.b. Parallèlement à la demande de mise en conformité aux usages, l'Office cantonal a initié, le 15 mars 2021, une procédure de contrôle du respect du salaire minimum.