『はつゆきさくら』のテーマは「卒業」と「復讐」である。「卒業」は誰でも体験していて共感しやすいこと、四季シリーズの最後にふさわしいことからテーマに選ばれた。テーマが「卒業」であるため、主人公は卒業間近の3年生という設定である。卒業に価値を見出だせない主人公が、ヒロインに触発されて卒業を意識するようになるという物語になっている。各ヒロインルートにおいても「卒業」が様々な角度から描かれており、主人公自身が卒業を迎えるルートや主人公が親しい人の卒業を経験するルートなどがある。もう1つのテーマである「復讐」は、主人公の根幹を成す感情である。主人公が抱える復讐心が、季節が冬から春に変わるのに合わせて溶けてなくなるという物語になっている。各ヒロインルートでも「復讐」の要素が取り込まれており、死者の復讐心に狂わされる少女を描いた話や、自身の悪評を流されて復讐心を抱く少女の話などがある。『はつゆきさくら』のタイトルは紆余曲折を経て決定された。新島夕は初め、企画名を「GhostGraduation」として提出したが、スタッフから猛反対された。そこでキャッチコピーの「初雪から桜まで、卒業おめでとう——」を省略した「はつゆきさくら」を提案し、ようやくスタッフから賛成された。どうしても「GhostGraduation」を推したい新島夕がサブタイトルに「GhostGraduation」を入れていたところ、ビジュアルアーツの広報からも反対され、サブタイトルは「WhiteGraduation」になり、「Ghost」の文字はタイトルからは消失した。

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