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¿Qué tipo de genoma debe secuenciarse primero para evitar la confusión antes de la forma tetraploide?
Un esfuerzo público de secuenciación del genoma del algodón se inició en 2007 por un consorcio de investigadores públicos. Acordaron una estrategia para secuenciar el genoma del algodón tetraploide cultivado. "Tetraploide" significa que el algodón cultivado en realidad tiene dos genomas separados dentro de su núcleo, conocidos como genomas A y D. El consorcio de secuenciación acordó secuenciar el genoma D en relación con el algodón cultivado (G. raimondii, una especie silvestre de algodón centroamericana) debido a su pequeño tamaño y número limitado de elementos repetitivos. Es casi un tercio del número de bases de algodón tetraploide (AD), y cada cromosoma solo está presente una vez. El genoma de G. arboreum sería secuenciado después. Su genoma es aproximadamente el doble del tamaño de G. raimondii. Parte de la diferencia de tamaño entre los dos genomas es la amplificación de retrotransposones (garganta). Una vez que se ensamblan ambos genomas diploides, entonces la investigación podría comenzar a secuenciar los genomas reales de las variedades de algodón cultivadas. Esta estrategia es por necesidad. Si uno secuenciara el genoma tetraploide sin genomas diploides modelo, las secuencias de ADN eucromático de los genomas AD se reunirían y los elementos repetitivos de los genomas AD se ensamblarían de forma independiente. Entonces no habría manera de desentrañar el desorden de secuencias AD sin compararlas con sus contrapartes diploides.
question: ¿Qué tipo de genoma debe secuenciarse primero para evitar la confusión antes de la forma tetraploide?, answer: diploid