Arutelu:Onkogenoomika

message: Kas ei pea see artiklis Vähk (haigus) olema? Geonarva 21. oktoober 2011, kell 19:37 (EEST)
replies: text: Inglise vikipeedias on artikkel Genetics of cancer, ehkki artikkel on orvuks märgitud. --Vihelik 4. november 2011, kell 00:15 (EET)
Minu meelest võiks kogu materjal olla artiklis Vähk (haigus). Andres 4. november 2011, kell 00:50 (EET)
<<>>
Tegu on samateemalisest ingliskeelsest wikiartiklist oluliselt põhjalikuma käsitlusega, ent sellegipoolest tuleks nii sisulise 
kui keelelise poolega veel vaeva näha.
Olgu esmalt ära toodud sisulised puudused.
Esiteks, terminit "onkogeen" ei saa tõlkida vähi geeniks. Seda seetõttu, et ykski geen per se ei tekita vähki. Kui kirjutada "vähi geen", 
jääb mulje, nagu oleks mõne geeni eesmärk vähki tekitada. On geene, mille mõtteks on vähi teket maha suruda (tuumor-supressorgeenid), 
kuid mitte vastupidi.
(Võib ka vaielda selle yle, kuidas "vähigeen" kirjutada tuleks, kui seda yldse kasutada - kokku või 
lahku. Klassikaline näide: venna raamat. Raamat on venna oma. Vähi geen - geen ei ole vähi oma, seega kokku, vähigeen.)
Teine suurem sisuline viga on peatyki "vähid on invasiivsed tuumorid" juures. Tegu on siiski neoplaasia ehk ebanormaalse, 
kontrollimatu kudede kasvuga, mitte neoplasmaga ("uus plasma"). Neoplasm on neoplaasia tagajärg ehk tykk ebanormaalselt vohavat kudet. 
Vähk on definitsiooni kohaselt pahaloomuliselt vohav ebanormaalne kude (malignant neoplasm).
Kolmandaks, invasive = metastatic. Invasiivne ja siirdeline on synonyymid, seega oleks õigem mitte kasutada ingliskeelse sõna eestindust 
"metastaseeruma", kuna seda on võimalik väljendada ka palju lihtsamalt.
Ka tuumor-supressorgeenide olemust on autor mõistnud vääriti. ("Tuumor-suppressor geen ehk anti-onkogeen on vähi geeni tüüp, mis on tekkinud nn. funktsiooni kaotuse mutatsioonina (loss-of-function)") Kuna tegu on täiesti funktsionaalse geeniga, mille eesnärk on maha suruda kasvaja teket. Juhul kui tuumor-supressorgeenis leiab aset mutatsioon, mille tõttu viimane oma funktsiooni kaotab, suureneb risk vähi tekkeks, kuid enamasti on selleks vaja täiendavat mutatsiooni mõnes teises geenis.
Nuriseda võib ka teksti liigendatuse yle, kuna esineb osaliselt kattuva sisuga alalõike. Jääb tunne, nagu oleks tegu tõlkega ainult yhe 
allika põhjal, ilmselt mõnes ingliskeelse õpiku põhjal, mille sisukorrast pärinevad alalõikude nimed. Mitme allika kasutamise suureks 
eeliseks on see, et kirjutajale endale saab neid lugedes yha selgemaks, mis on teema põhilised ivad ja kuidas neid loogilises järjekorras
esitada. 
Kirjavigu leidus tekstis ysna palju, samuti oli probleeme lausestusega. Ma ei tea, kes on selle artikli kirjutanud, kuid kui tema 
emakeeleks pole eesti keel, leian, et puudujääkidele vaatamata on tegu hästikirjutatud artikliga, mille kallal on palju vaeva nähtud. 
Helgasch 10. november 2011, kell 20:44 (EET)

Inglise keelses raamatus, mida ma kasutasin artikli koostamisel, oli palju kohti, kus kasutati terminit "cancer gene" ehk "vähigeen". Eraldi oli peatükk nimega "Onkogeenid", nende kohta koostasin ka artiklis peatükki ning kõik, mis on seal kirjeldatud, on tõlgitud inglise keelest ja natuke formuleeritud üle. Seepärast artikli esimestes peatükkides kasutatakse just terminit "vahigeen", mitte aga onkogeen. Tõepoolest vähigeenid ise ei tekita vähki, aga nad on agentid, mis ajavad rakke formeerima tuumoreid ning onkogeen ongi üks vähigeenide tüüp.
Vähigeen kirjutatakse tõesti koos, nii et kõik vead on artiklis parandatud.
"A tumor suppressor gene is a type of cancer gene that is created by loss-offunction mutations" - raamatust. Minu poolt tõlgitud lause peab endas sisaldama samasugust mõtet. --alex90 14. november 2011, kell 13:43 (EET)

message: See artikkel tuleb ilmselt liita artikliga Vähk (haigus), aga võtame seda siin praegu kui artiklit.
*'''mitusada'''; samas lauses -des-vormi (kontrollides) ees peab olema koma
*'''rakkudes'''
*''', jäävad vähi geneetika põhiprintsiibid'''
*'''arenevad silma võrkkestas'''
*'''See seletab, kuidas nii pärilikud kui'''
*''detekteerimises'' → '''tuvastamises'''
*'''mis tahes'''
*'''normaalsete rakke ümbritsevate kudede'''
*'''sissetungival'''
*'''võib vähk metastaseeruda'''
*'''Arvatakse, et tuumorid arenevad üksikust'''
*''Tuumori kasvamine selle raku tulijatest'' Ei saa aru
*'''metastaatiliste kasvajateni'''
*'''Nagu ka sirprakuline aneemia, võib vähk päranduda'''
Palun võta mõni eesti keelt emakeelena oskav sõber appi ja paranda ise edasi. [[Kasutaja:Adeliine|Adeliine]] 27. november 2011, kell 03:13 (EET)

message: *Lauses "Viimaste aastate jooksul kirjeldati..." peab sõna "kontrollides" ees olema koma
*''', jäävad vähi geneetika põhiprintsiibid'''
*''mistahes'' → '''mis tahes'''
*''Tuumorid on arvatud kerkima üksikust'' → '''Arvatakse, et tuumorid arenevad üksikust'''
*'''Suurt osa inimpopulatsiooni mõjutavatest vähkidest ei saa ennustada Mendeli'''
*'''Geenid, mis kutsuvad esile klassikalisi geneetilisi haigusi, kanduvad ühest generatsioonist teise, kuid vähigeenid'''
*'''vähki haigestumise riski'''
*mis on "geneetiline vaateväli"?
*jne [[Kasutaja:Adeliine|Adeliine]] 12. detsember 2011, kell 16:05 (EET)
Toimetasin esimesed neli lõiku, samamoodi tuleks lõpuni läbi käia. [[Kasutaja:Taivo|Taivo]] 2. jaanuar 2012, kell 19:48 (EET)<br />
Redigeerisin mitu päeva tagasi koos oma eesti keele õpetajaga. Ainult praegu nägin, et ma polnud sisse loginud. Palun vaadake artikkel üle. [[Kasutaja:Ent90|Ent90]] 5. jaanuar 2012, kell 22:02 (EET)

message: Selles artiklis on niipalju vigu, et see on mõtet kustutada - või siis vaadata, kas on mõni lause, mida annaks täienduseks artiklisse [[vähk (haigus)]] siit enne lisada. 
Täiesti vigane on juba esimeses lauses toodud definitsioon. Sest vähk võib ka epigeneetilistel põhjustel kujuneda.--[[Kasutaja:Dr Oldekop|Dr Oldekop]] 5. jaanuar 2012, kell 22:52 (EET)<br />
Parandasin niipalju kui suutsin, sest teaduslikult ei valda ma materjali tõesti vabalt. Mõned rumalad laused kustutasin ära. alex90 6. jaanuar 2012, kell 17:08 (EET)<br />

message: Minu arvates kirjutada, et artikkel on vigane ja vajab kustutamist 5. jaanuaril kella 23 paiku arvestades seda, et 6. jaanuar on tähtajaks, on vähemalt ebaviisakas. Parandasin esimest lauset. Kritiseerida oskab igaüks, aga inimlikult aidata ainult mõni üksik. Ma väga tahan parandada artiklit, aga kuidas ma saan seda teha, kui ma ei tea isegi missugused need vead on? Palun tooge need välja või aidake kaasa. Vikipeedia on vist mõeldud koostööks? Samuti aidake palun liita artikli vähk (haigus) artikliga, ma ei oska seda teha. alex90 7. jaanuar 2012, kell 14:51 (EET)
replies: text: Palun vabandust. Ma ei teadnud midagi õppetöö tähtajast, võtsin seda kui tavalist Vikipeedia artiklit. Tunnistan, et nüüd on see hulga paremaks saanud. Materjali parem tundmine aitab kirjutamisele kaasa. :-))) Igatahes palju jõudu ja edu! --Dr Oldekop 7. jaanuar 2012, kell 18:53 (EET)
----
===Näiteid vigadest ja arusaamatutest kohtadest===
*mille korral on kaotatud raku kasvu normaalne kontroll Mis on kasvu kontroll? http://www.eki.ee/dict/ekss/index.cgi?Q=kontroll&F=M Sõnal kontroll on eesti keeles inglise keelest erinev tähendus, tänapäeval kasutatakse kontrolli sõna nii eesti kui inglise keele tähenduse märkimiseks, seega selle tähendus on muutunud laialivalguvaks. Parem on kasutada mõnda muud sõna, mis toob mõtte paremini välja. Seda ka mujal, mitte ainult selles artiklis.
* Mis on haiguste spekter? http://www.eki.ee/dict/ekss/index.cgi?Q=spekter&F=M
* Mis on koekompartment, klonaalne? Eesti keeles on need sõnad tundmatud.
Lisaks on veel õigekirja- ja stiilivigu, kuid need on teisejärgulised. Artiklit saaks parandada inimene, kes saaks sellest aru ning tunneks meditsiini oskuskeelt. Mitte-asjatundja jaoks on selles liiga palju võõrsõnu ja erialaseid mõisteid. Valju 7. jaanuar 2012, kell 18:45 (EET)
----
Liitmise tarviduse osas ma ei ole enam kindel. Vähk on ulatuslik teema, ja selle geneetika kohta eraldi võib ju artikkel olla küll, seda enam, et geneetiline aspekt pole vähi puhul osutunud eriti tähtsaks, kuigi sellest on väga palju kirjutatud. 
Võõrsõnu võib olla mu meelest küll, kui neid kasutatakse korrektselt ja kui nad on artiklis esimesel kasutamisel lingitud neid selgitavatele artiklitele.--Dr Oldekop 7. jaanuar 2012, kell 19:02 (EET)

text: Kopeerisin osa artiklisse "Vähk (haigus)" ümber ja eemaldasin liitmismärkuse.

text: Kui vähigeen võib olla defineeritud kui geen, mis suurendab vähki haigestumise riski või edendab vähi arengut, siis kuidas saab tuumor-suppressor geeni nimetada vähigeeni tüübiks, kui see kaitseb rakke vähi eest? Ivo 7. jaanuar 2012, kell 19:07 (EET)
----
Peamine probleem selle artikliga on kohati äärmiselt populariseeriv stiil, mis lihtsustab sedavõrd, et asi pole enam õige. --Dr Oldekop 7. jaanuar 2012, kell 19:14 (EET)
thread_title: Viisakus ja inimlikus

message: *mille korral on kaotatud raku kasvu normaalne kontroll Mis on kasvu kontroll? http://www.eki.ee/dict/ekss/index.cgi?Q=kontroll&F=M Sõnal kontroll on eesti keeles inglise keelest erinev tähendus, tänapäeval kasutatakse kontrolli sõna nii eesti kui inglise keele tähenduse märkimiseks, seega selle tähendus on muutunud laialivalguvaks. Parem on kasutada mõnda muud sõna, mis toob mõtte paremini välja. Seda ka mujal, mitte ainult selles artiklis.
* Mis on haiguste spekter? http://www.eki.ee/dict/ekss/index.cgi?Q=spekter&F=M
* Mis on koekompartment, klonaalne? Eesti keeles on need sõnad tundmatud.
Lisaks on veel õigekirja- ja stiilivigu, kuid need on teisejärgulised. Artiklit saaks parandada inimene, kes saaks sellest aru ning tunneks meditsiini oskuskeelt. Mitte-asjatundja jaoks on selles liiga palju võõrsõnu ja erialaseid mõisteid. Valju 7. jaanuar 2012, kell 18:45 (EET)
----
Liitmise tarviduse osas ma ei ole enam kindel. Vähk on ulatuslik teema, ja selle geneetika kohta eraldi võib ju artikkel olla küll, seda enam, et geneetiline aspekt pole vähi puhul osutunud eriti tähtsaks, kuigi sellest on väga palju kirjutatud. 
Võõrsõnu võib olla mu meelest küll, kui neid kasutatakse korrektselt ja kui nad on artiklis esimesel kasutamisel lingitud neid selgitavatele artiklitele.--Dr Oldekop 7. jaanuar 2012, kell 19:02 (EET)
replies: text: Kopeerisin osa artiklisse "Vähk (haigus)" ümber ja eemaldasin liitmismärkuse.

text: Kui vähigeen võib olla defineeritud kui geen, mis suurendab vähki haigestumise riski või edendab vähi arengut, siis kuidas saab tuumor-suppressor geeni nimetada vähigeeni tüübiks, kui see kaitseb rakke vähi eest? Ivo 7. jaanuar 2012, kell 19:07 (EET)
----
Peamine probleem selle artikliga on kohati äärmiselt populariseeriv stiil, mis lihtsustab sedavõrd, et asi pole enam õige. --Dr Oldekop 7. jaanuar 2012, kell 19:14 (EET)
thread_title: Näiteid vigadest ja arusaamatutest kohtadest

message: V-o võiks artikli teisaldada pealkirja alla Vähktõve geneetika, siis ei peaks seda täpsustusrubriiki artikli päises olema--Bioneer1 8. jaanuar 2012, kell 10:56 (EET)
----
Mõned vead tõi eespool välja Valju.
*Eristav tunnusjoon hea- ja pahaloomulise kasvaja vahel tugineb selle sissetungival (invasiivsel) tegutsemisvõimel.  Ei saa aru.
*ingliskeelsed sõnad ja väljendid kaldkirja
*Lauses "Huvitav on see, et vähigeenid..." koma puudu
*otseseotud → otseselt seotud
*Tõepoolest enamik geene ja nende mutatsioone ei pea olema seotud vähiga. Halb lause
*vastavat valku
*RNA splaissing
*mitme aastakümne või aastakümnete
*Proto-onkogeenid reguleerivad tavaliselt rakkude kasvu
*Onkogeenid on unikaalsed vähigeenid, sest
*kaitseb rakku vähi arengu teele astumisest. halb stiil
Adeliine 11. jaanuar 2012, kell 19:24 (EET)
Artikkel hakkab juba üsna viisakaks muutuma. Saaks mõne pildi ka Commonsist :) Ivo 12. jaanuar 2012, kell 16:08 (EET)
Parandasin viimaseid vigu alex90 12. jaanuar 2012, kell 17:58 (EET)
thread_title: Pealkirja muutmise ettepanek

message: Tere! Minu meelest oleks eestikeelsesse Vikisse terminina kasulik tuua sisse mõiste onkogenoomika, sest ka kunagine inglisekeelne Genetics of cancer on nüüd Oncogenomics alla kolinud. See on viimasel aastatel olnud jõuliselt arenev valdkond, mis uurib nii päritavaid ehk iduliinis esinevaid muutusi, mis võivad vähiriski tõsta, kui somaatilisi muutusi, mis esinevad vahetult vähkkasvajas. Asusin tegema onkogenoomika kohta artiklit, sest Oncogenomics alt eestikeelsele leheküljele "Vähi geneetika" hetkel suunamine puudub, kui avastasin, et eksisteerib selline artikkel ka. Darja.Lavogina (arutelu) 24. oktoober 2023, kell 15:59 (EEST)
replies: text: Kui vähi geneetika on sama asi mis onkogenoomika, siis võib artikli lihtsalt uue pealkirja alla teisaldada. --Andres (arutelu) 24. oktoober 2023, kell 17:36 (EEST)
replies: text: :Jah, see on uuem termin, mis võtab arvesse geenide paljusust ja omavahelisi vastastikmõjusid. Nii et ma pakuks, et tuleks ümber nimetada ja linkida vastava inglisekeelse leheküljega. Vajadus eestikeelse onkogenoomika-alase Viki-artikli järele tuli välja ka näiteks seoses vastavateemalise ettekandega arstiteaduskonna aastapäeva konverentsil, mis toimus üle-eelmisel nädalal. Darja.Lavogina (arutelu) 24. oktoober 2023, kell 19:38 (EEST)
replies: text: ::Ma ei saa küll aru, kuidas uuem termin midagi rohkem arvesse võtab, aga ma nimetan selle ümber ja kirjuta sinna, mida vajalikuks pead, ainult et säilita see, mida on võimalik säilitada. Andres (arutelu) 24. oktoober 2023, kell 20:51 (EEST)
replies: text: :::Aitäh. Ma olen Wikidata osas liiga koba - kas saaksid palun aidata ka cross-linkimise osas, et lehekülg ei suunaks vanale Genetics of cancer, vaid uuele inglisekeelsele Oncogenomics leheküljele? Darja.Lavogina (arutelu) 24. oktoober 2023, kell 21:51 (EEST)
thread_title:  Onkogenoomika