Wikipedia Diskussion:Wie erstelle ich Strukturformeln?

message: Wie sieht's mit dem Rand bei Strukturformeln aus? Gibt's da auch eine Regel bzw. ein Konsens? Bei BKchem und andern Programmen kann ja bequem angeben wie gross der Margin beim Croppen sein soll. Standardeinstellung bei BKchem ist 10px, was bei kleinen Molekülen meiner Meinung nach eher etwas gross ist (siehe z.B. Oxazolidin). --Leyo 09:36, 23. Okt. 2006 (CEST)
replies: text: Ich habe bei den letzten Strukturformeln immer 5px Rand angegeben. 10 fand ich auch zuviel. 5 erscheint mir gut. In Tabellen würde ein 0 Rand auch reichen, da kann man über padding Rand hinzufügen. Wie das bei framed gehen soll wüsste ich jetzt nicht. --Rhododendronbusch 09:54, 23. Okt. 2006 (CEST)
replies: text: Danke für die schnelle Antwort. 5px finde ich auch besser. Vielleicht könnte man dies als Empfehlung auf der Projektseite eintragen. --Leyo 11:31, 23. Okt. 2006 (CEST)
thread_title:  Rand 

message: Folgender Link wurde hier eingefügt:
Strukturformeleditor (Freeware inkl. Tutorial)
Da auf deren Seite zu lesen ist 
„Dieses Programm ist für den privaten (nicht kommerziellen) Gebrauch kostenlos.“ 
gehe ich davon aus, dass das Progrann nicht für WP benutzt werden darf, denn die WP-Inhalte dürfen kommerziell verwendet werden. Richtig? Wenn sich kein Widerspruch regt, werde ich den Link entfernen. Pathomed 19:38, 8. Nov. 2006 (CET)
replies: text: Eine Beschränkung der Benutzung des Programms hat nicht das Geringste mit den erzeugten Dateien zu tun. Du findest z.B. auf Commons haufenweise Formeln, die mit kommerzieller Software erstellt wurden. Die Dateien enthalten nichts, worauf die Softwarefirma ein Recht anmelden könnte.
Andererseits halte ich nach Durchsicht des Manuals das Programm selbst für Schrott, da es nicht mal Ringstrukturen vorgibt. Bin daher für eine Löschung. -- Ayacop 10:03, 9. Nov. 2006 (CET)

text: Ich kann Ayacop nur zustimmen und nehme die Löschung gleich vor. --Leyo 10:24, 9. Nov. 2006 (CET)
thread_title:  strukturformeleditor.de 

message: Hallo, an die ab initio Strukturberechnung werden im Artikel (zu Recht) gewisse Qualitätsansprüche gerichtet. Bisher benutzte ich dafür das CORINA Online Demo, wobei man zur Methode allerdings auf deren Seiten rein gar nichts finden kann. Da ich aber kein Experte bin, würde ich gern wissen,
*ob das was da online angeboten wird, Hand und Fuß für die Zwecke der WP hat - also bis ein-, maximal zweihundert Atomen.
*mit welchen Molekülen man testen kann, ob solche Software was bringt
*ob jemand was zur Methode sagen kann?
Vielen Dank im Voraus. -- Ayacop 17:21, 18. Dez. 2006 (CET)
thread_title:  3D: CORINA Online Demo ausreichend? 

message: Ich zeichne derzeit mit ChemSketch und das kann ja gerade einmal im GIF-Format abspeichern. Deswegen wollte ich wissen, welche Freeware-Programm im SWG-Format abspeicher kann und die selben Funktionen wie ChemSketch bietet. Danke--L3nnox 00:55, 12. Mär. 2007 (CET)
replies: text: Für schnelle Information rate ich dir, direkt in der Redaktion Chemie anzufragen. Ein Strukturformelzeichenprogramm, das direkt SVG ausgibt ist beispielsweise BKChem. Dazu gibt es auch ein ausführliches Tutorial für Wikipediazwecke. --NEUROtiker 01:17, 12. Mär. 2007 (CET)

text: Ja, z. B. hier und hier. Es wundert mich aber, dass es nur so wenige sein sollen... --NEUROtiker 22:34, 14. Mär. 2007 (CET)
thread_title:  Schnelle Information 

message: (@Hoffmeier)
Ich habe den Einschub etwas umformuliert, weil das Erstellen von korrekten (sagen wir besser: wirklichkeitsnahen) 3D-Modellen auch ohne MM-Rechnungen erfolgen kann, z.B. aus den Daten der Röntgenkristallstrukturanalyse. Umgekehrt kann man auch MM-Rechnungen anstellen, die nicht in der 3D-Darstellung resultieren, sondern in der Darstellung von Energiehyperflächen oder einfach nur in Zahlenkolonnen. Dass die meisten MM-Programme heutzutage die Möglichkeit der graphischen Ausgabe als Kalotten- oder Kugel-Stab-Modell bieten, ist zwar verbreitet, aber noch nicht allzulange selbstverständlich. --Dschanz → Bla  17:30, 17. Sep. 2007 (CEST)
thread_title:  3D-Modelle erstellen vs. Molecular Modelling 

message: Also bei mir arbeitet BALLView standardmäßig mit zwei 3D-Fenstern. Weiß jemand, wie man das auf eins umstellt? Sonst sieht das Ergebnis ja recht gequetscht aus... --87.172.209.23 19:52, 20. Mai 2009 (CEST)
thread_title:  Probleme mit BALLView 

message: Gibt es verschiedene Bändermodelle bzw. verschieden Komplexitätsstufen? Ich als Laie kann jedenfalls nicht nachvollziehen, was das Bild mit dem dazu verlinkten Artikel zu tun hat. --Fredric 00:35, 26. Jun. 2009 (CEST)
replies: text: Die Interpretation einer Proteinstruktur bleibt ohnehin fast nur den Strukturbiologen überlassen. Empfohlen sei zumindest protopedia, wo man auch ohne Softwareinstallation Modelle manipulieren kann und so vielleicht zunächst ein Gefühl für die Vielfalt erhält, dann zwischen Membranproteinen und anderen unterscheiden kann etc. -- Ayacop 09:11, 9. Nov. 2010 (CET)
thread_title:  Bändermodell 

message: In der Version 0.14 kann man die Bilder als svg im Format svg (Cario) abspeichern. Dies beseitigt den svg-Bug.
Beispiel Crotonic acid structure.svg, zuerst als normales svg gespeichert, dann mit cario. -- Yikrazuul 15:13, 11. Jun. 2011 (CEST)
thread_title:  BKChem und SVG 

message: Leider sind viele Dateien noch immer als PNG hochgeladen. Mir war lange Zeit nicht klar, dass mit Chemsketch über Umwege auch ein Export als SVG möglich ist. Ich habe es daher so knapp wie möglich ergänzt. --Minihaa (Diskussion) 15:21, 12. Nov. 2012 (CET)
thread_title:  Chemsketch SVG 

message: Ich wäre dafür, die Software-Liste auf eine Unterseite auszulagern - die bläst die Seite unnötig auf und trifft auch letztlich nicht das Kernthema, nämlich die in WP gültigen Vereinbarungen über das Aussehen von Strukturformelbildern.--Mabschaaf 12:26, 15. Nov. 2012 (CET)
replies: text: Ausdünnen wäre die andere Möglichkeit. --Leyo 13:14, 15. Nov. 2012 (CET)
replies: text: Die weiterführende Frage ist: Kann man auf die Liste komplett verzichten? Die meisten Benutzer, die Strukturen zeichnen wollen, dürften entweder beruflich Zugriff oder privat eine wahrscheinlich freie (Lieblings-)Software haben. Eine Hilfestellung, welches Softwarepaket am besten geeignet ist, um Strukturen für die WP zu zeichnen, ist die Liste auch nicht. (Gibt es da überhaupt Unterschiede? - Wahrscheinlich ist erst mal jedes Programm geeignet.) Die Liste ist also praktisch eine Marktübersicht. Für ein Ausdünnen stellt sich die Frage, nach welchen Kriterien das geschehen sollte.--Mabschaaf 13:35, 15. Nov. 2012 (CET)
replies: text: Wenn mit einem Programm keine WEIS-konformen Strukturformeln erstellt werden können (oder nur sehr umständlich), gehört es nicht in die Liste. --Leyo 13:38, 15. Nov. 2012 (CET)
replies: text: Habe erstmal eingeteilt. Man könnte die Liste ohne Weiterentwicklung IMHO sofort hierherschieben. Nicht löschen, bitte. --Ayacop (Diskussion) 16:22, 15. Nov. 2012 (CET)
thread_title:  Software-Liste  

message: Bei dem Eintrag zu "ChemDoodle Web Components: 2D Sketcher" ist angegeben "nur PNG". Ist dies zutreffend? Ich habe für PNG keine Möglichkeit gefunden. Zweite Frage: Kann man einstellen, dass ALLE Atome schwarz sind - nicht rot für "O", blau für "N", usw.? MfG 193.5.216.100 18:57, 19. Mär. 2014 (CET)
replies: text: Es scheinen nur Chemie-spezifische Dateiformate angeboten zu werden, aber keine Grafikformate. Vielleicht weiss beispielsweise Benutzer:Matthias M. mehr… --Leyo 09:13, 20. Mär. 2014 (CET)
replies: text: Es scheint, dass ChemDoodle sich weiterentwickelt hat. Vorher war da immer noch ein dynamisch generiertes PNG im Hintergrund, dass man mit Rechts-Klick → Speicher unter... noch runterladen konnte. Mittlerweile scheinen sie Moleküle nur noch in einem JSON-Format zu speichern und dynamisch zu rendern. Für unsere alt hergebrachte Art individuell erstellte Pixel- oder besser Vektorgrafiken hochzuladen, ist das eventuell weniger geeignet. Gruß Matthias 11:19, 20. Mär. 2014 (CET)
thread_title:  Frage zum ChemDoodle Web Components 

message: Zumindest bei organischen Verbindungen mit weniger als 10 Atomen sollen in WEIS-konformen Strukturformeln alle Kohlenstoffatome gezeichnet werden. Welche freie Software leistet dies? Ich gebe Nachhilfe und kenne ich die abschreckende Wirkung von Totenkopfsymbol und Skelettformeln.
--Rohwedder (Diskussion) 14:17, 27. Nov. 2014 (CET)
thread_title:  Strukturformeln mit Kohlenstoffatomen 

message: 3D-Formeln sollten ein eigenes Lemma bekommen, das ist wirklich ein anderes Thema und das würde Übersichtlichkeit schaffen. -- itu (Disk) 10:52, 13. Feb. 2017 (CET)
thread_title:  Lemma splitten 

message: Siehe dort . -- itu (Disk) 23:30, 2. Apr. 2017 (CEST)
thread_title:  Rand 

message: Das ist doch nicht mehr so vollkommen lizenzfrei, zum Beispiel hier. Wenn man die Version runterlädt und installiert ist das auch mit einer 30 Tage Frist zum Ausprobieren verbunden.--Claude J (Diskussion) 11:10, 2. Apr. 2018 (CEST)
thread_title: Pymol

message: Als Nicht-Chemiker schrecken mich Skelettformal ab. Ich kann mir - trotz des Wissen, dass die Ecken für ein "H-C-H" stehen - den Aufbau eines Moleküls nicht, oder nur sehr mühsam, vorstellen. Bei der Valenzstrich- oder Keilstrichformel kann ich das Molekül direkt "sehen". Das ist natürlich reine Übungssache. Aber genau die kann man bei einem Nutzer einer allg. Enzyklopädie eben nicht erwarten. Also: Hiermit beantrage ich, dass Valenzstrich- oder Keilstrichformeln bevorzugt werden. Meinungen? An welcher Stelle kann den Antrag eher unterbringen? Danke schon mal
--Fredric (Diskussion) 16:15, 1. Mär. 2019 (CET)
thread_title:  Antrag:  Skelettformel vermeiden 

message: Hallo, 
soeben habe ich in wikicommons eine Strukturformel von Clavorubin hochgeladen. Während der Bearbeitungszeit etc. war alles super, nach dem Hochladen zeigt wikicommons leider keine Elementsymbole an.
In der Originaldatei werden alle Elementsymbole angezeigt. Diese suboptimale Darstellung müsste durch eine mit Elementsymbolen ersetzt werden, allerdings verstehe ich meinen Fehler momentan nicht. Über einen Tipp würde ich mich freuen! --Kchm123 (Diskussion) 17:12, 9. Mai 2019 (CEST)
replies: text: Das könnte was zu tun haben mit der Erstellung der SVG-Dateien also mit dem Formatwechsel (Ursprungsformat Deines Formelzeichenprogramms?) hin zum SVG-Format. Mit welchen Chemiezeichenprogramm arbeitest Du? MfG --Jü  (Diskussion) 17:35, 9. Mai 2019 (CEST)
replies: text:  Ich arbeite mit Chemdraw, überführe die Dateien dann im svg-Format in Inscape, um die Qualität zu erhöhen. Die Elementsymbole sind bei jedem Arbeitsschritt (sowie in der Originalversion auf wikicommons) vorhanden. Zudem müsste die aktuelle Abbildung gelöscht werden, weil sie ohne Elementsymbole fachlich falsch ist und missinterpretiert werden könnte. MfG --Kchm123 (Diskussion) 11:28, 10. Mai 2019 (CEST)
replies: text:  Versuch's doch mal mittels Scribus. --Leyo 12:04, 10. Mai 2019 (CEST)
replies: text:  Hallo, vielen Dank für die Hilfestellungen. Nun habe ich ghoastscript runtergeladen und installiert. Dabei müssen die Pfade korrekt angegeben werden, das ist wichtig und das war auch der Fehler. Die in chemdraw erstellte svg-Datei kann dann als eps-Datei gespeichert und mittels Inscape geöffnet werden. Dann weist die in Commons hochgeladene Datei keine Veränderungen auf, zumindest dieses mal nicht. MfG --Kchm123 (Diskussion) 15:44, 13. Mai 2019 (CEST)
thread_title:  Problem: Elementsymbole 

message: Hallo, 
beim Versuch unterschiedliche Zeichnungen hochzuladen begegnet mir immer wieder ein Problem: Teilweise werden Atome/Atomgruppen oder Ladungen an ungewollte Stellen verschoben. Dabei lässt sich keine Regelmäßigkeit (z.B. alle Hydroxidgruppen werden in eine bestimmte Richtung verschoben) erkennen, das geschieht meines Erachtens nach recht willkürlich. 
Ich habe schon unterschiedliche Dinge versucht (z.B. die Zeichnungen leicht verändert, häufig hin und her geschoben, Pfadisierung der Objekte), wenn der Upload geklappt hat, dann ebenfalls ohne dass ich einen Grund dafür erkennen konnte. 
Mein Vorgehen: Zeichnen in ChemDraw, Datei als .eps speichern, diese in Inkscape öffnen und als .svg-Datei speichern. Bis hierhin läuft alles einwandfrei. Beim Upload kann ich dann bereits in der Vorschau erkennen, dass etwas verrutscht ist. Kennt jemand das Problem? Habt ihr vielleicht Lösungsvorschläge? Vielen Dank im Voraus, MfG --Kchm123 (Diskussion) 15:07, 6. Sep. 2019 (CEST)
thread_title:  Verschiebung von Atomen/Atomgruppen während des Uploads