Diskussion:DNA-Methylierung

message: Hallo, ich hab mich mal dran versucht... 
1. Keine Banane: Ich habe Ninas Einwand, dass die Info, dass ein Apfel keine Banane ist, irrelevant erscheint, versucht zu berücksichtigen [1]. Jetzt steht da:
Da ein Apfel eher süß und auf dem Teller zum Hauptgang des Mittagessens nicht vertreten ist, ist ein Apfel kein Gemüse. Der Apfel gehört zum Obst. ;-)
Naja... Ich denke, dass die Abgrenzung zur Mutation irgendwo auftauchen sollte, da es die Verwechslungsmöglichkeiten durch die Worte "Modifikation" und "Abänderung" gibt. Der eigens dafür erschaffene Abschnitt ist vielleicht etwas sülzig ausgefallen...
2. English - Deutsch: Ich hab mal die englische Version zum Thema konsultiert. Dort fehlt die Sache mit den Methylierungs/Restriktionssystem und dass es auch Bakterien gibt, vollständig. Deswegen habe ich den Artikel nicht translatiert.
3. Flexikon: Den Eintrag, dass der Artikel vom Flexikon herrührt, habe ich entfernt. Der Ersteintrag in der Wikipedia war eine Kopie der Flexikon-Eintrags. In der Zwischenzeit ist soviel editiert worden, das jenes nicht mehr relevant war. Der Flexikon-Eintrag war sehr kondensiert und auf den medizinischen Aspekt fokussiert, ohne präzise zu sein. 
4. Quellen: Die fehlen gänzlich. Ich hab zwar dies und das gelesen und mich zum Teil an Vorlesungen erinnert, muss dort aber noch was reinsetzen - kommt demnächst.
5. Vollständigkeit: Ich hab ganz stolz geschrieben, dass es drei biologische Bedeutungen gibt. Ob ich nicht doch noch was übersehen hab...? (Ihr wisst ja, niemand sagt nach dem Vortrag in der Diskussion "Das weiß ich nicht." sondern "Darüber ist bisher nichts bekannt.")
So hoffe ich denn, eine Verbesserung des vorherigen Patchworks erreicht zu haben und freute mich sehr , ein Template weiterer Verbesserung generiert zu haben. 
[1] Was für ein schlechter, aber syntaktisch korrekter Satz!
Mit bessten Grüßen Dirk123456 27.01.2006 19:15
::Ei, wer hätte das gedacht! Dann war das doch ein Anstoß mit anschließendem Volltreffer. Da hat sich doch offensichtlich auch der Richtige gefunden und sich auf die Schnelle so gut des Artikels angenommen, soweit das meine Wenigkeit beurteilen kann ;-) Da sind doch schon mal die Wünsche von Einigen recht gut in Erfüllung gegangen. Und eine Fortsetzung ist auch noch angekündigt, super! Wenn's doch hier bei WP bloß immer so gehen könnte, herzlich willkommen!! Gruß -- Muck 21:11, 27. Jan 2006 (CET)
thread_title:   18:20, 27. Jan 2006 Dirk123456 (''komplett überarbeitet'') 

message: Kopiert aus dem Text: Die Methyltransferasen erkennen eine (meist kurze) DNA-Sequenz und hängen eine Methylgruppe an eine definierte Nukleobase. Dadurch entsteht ein sogenanntes Methylierungsmuster. Die Restriktionsenzyme erkennen ebenfalls eine (meist kurze) DNA-Sequenz und trennen die DNA an definierten Stellen zwischen Phosphat und Desoxyribose. Viele Restriktionsenzyme sind methylierungssensitiv. Das heißt, sie zerschneiden die DNA nur, wenn an bestimmten Stellen Methylierungen vorliegen oder wenn an bestimmten Stellen keine Methylierungen vorhanden sind.
Kurz vorweg: Restriktionsendonucleasen kommen in Bakterien vor und dienen als Schutzmechanismus vor eingedrungener Fremd-DNA (z.B. von Bakteriophagen). Wenn diese Fremd-(bzw. Phagen-)DNA methyliert ist, kann das Restriktionsenzym diese nicht zerschneiden. Die Behauptung, die DNA würde nur zerschnitten werden, wenn eine Methylierung vorhanden sei oder wenn an bestimmten Stellen keine Methylierung vorhanden sei, ist nach meinem Wissensstand also falsch.
Literatur:
- W. J. Thieman/ M. A. Palladino: Biotechnologie.
- Prof. U. Weber (Hg.): Biologie Oberstufe
- Braunschweig: Bildungshaus Schulbuchverlage: Genetik
-- 90.128.98.95 21:16, 14. Jan. 2010 (CET)
thread_title:  Notiz zu: DNA-Methylierung und Schutz vor fremder DNA 

message: Der im Artikel beschriebene Prozess der Methylierung von Cytosinen in GC Paaren zum erkennen des altern Strangs nach der Replikation bei Menschen und Säugetieren ist falsch. 
Bislang ist dieser Erkennungsmechanismus zur Reparatur fehlerhafter Sequenzen/Mutationen auf dem neu synthetisierten Strang ausschließlich bei Prokaryoten bekannt (E. coli). davon abgesehen werden hier Adenine im Motiv GATC methyliert. Modelle gehen davon aus, dass die Reperaturenzyme in Eukaryoten nicht von hemimetylierter DNA sondern von von der Sliding Clamp (PCNA) rekrutiert werden. Quelle: Molecular Biology of the Gene, Watson u.A., 2008, Pearson (nicht signierter Beitrag von Fishflap (Diskussion | Beiträge) 20:28, 20. Jun. 2010 (CEST)
thread_title:  Fehler: DNA Methylierung zur Erkennung des alten Strangs bei Replikation 

message: Wird die Methylierung denn nun bei der DNA-Replikation im Zuge einer Zellteilung mit kopiert oder ja? Im Artikel geht es nur um die Reparatur von DNA-Kopierfehlern, zur Methylierung der Kopie sehe ich da nichts. Und passen diese zusätzlichen Methylgruppen denn auf der Eingangsseite auch in diese Kopierenzyme rein und gehen dabei nicht kaputt? Müsste ja eigentlich. - Wenn alles denn mitkopiert würde, dann würde das ja auch durch die Übertragung in die Keimzellen mit vererbt, dann könnten sich auch auf dieser Ebene Mutter- und Vaterdaten mischen usw. Ist das so? --PeterFrankfurt 02:05, 22. Okt. 2010 (CEST)
replies: text: Darf ich also den neu eingefügten Abschnitten entnehmen, dass meine obige Frage durch die Ausführungen zum Enzym DNMT3 beantwortet sind? Sieht eigentlich danach aus. --PeterFrankfurt 01:57, 1. Okt. 2011 (CEST)
thread_title:  Zellteilung 

message: Habe die passenden Textabschnitte von Artikel Epigenetik hierher transferiert und bitte um Überarbeitung zur besseren Textintegration. -- Muck 04:38, 30. Sep. 2011 (CEST)
thread_title:  Überarbeitung zur angemahnten Redundanzabarbeitung 

message: Vermutlich ist die Methylierung ein Schutz vor "herumhopsenden" Transposons.
Ist die Methylierung aufgehoben (etwa bei einer befruchteten Eizelle), wird somit epigenetische Variation für kurze Zeit möglich... (weil nachher ja wieder methyliert wird). (nicht signierter Beitrag von 62.203.255.31 (Diskussion) 20:54, 23. Okt. 2011 (CEST)
thread_title:  Methylierung und Transposons 

message: Da es um die Methylierung von DNA geht, müsste es sich auch korrekter Weise um Desoxycytidin handeln. (nicht signierter Beitrag von 87.79.172.212 (Diskussion) 00:14, 10. Feb. 2016 (CET)
thread_title:  Cytidin 

message: Hallo, ich stelle mal eine Übersetzung der englischen Einleitung von "DNA Methylation" hier zur Verfügung.
Übersetzte Version 2016-12-01, 08:11; Benutzer Dirk123456; en.wikipedia.org/wiki/DNA_methylation
DNA-Methylierung
DNA-Methylierung ist ein Prozess, bei dem Methylgruppen auf DNA-Segmente übertragen werden. Die Methylierung ändert die Aktivität eines DNA-Segments, ohne die Sequenz zu ändern. Das wird als epigenetische Modifikation bezeichnet. Wenn DNA-Methylierung in einem Gen Promotor vorliegt, unterdrücket sie typischerweise die Gen-Transkription. DNA-Methylierung ist für die normale Entwicklung wichtig und ist mit einer Reihe von Schlüsselprozessen verbunden. Das schließt die genomische Prägung, die X-Chromosom-Inaktivierung, die Unterdrückung von repetitiven Elementen, Alterung und Karzinogenese ein.	DNA methylation is a process by which methyl groups are added to DNA segments. Methylation changes the activity of a DNA segment without changing the sequence. This is known as an epigenetic modification. When located in a gene promoter, DNA methylation typically acts to repress gene transcription. DNA methylation is essential for normal development and is associated with a number of key processes including genomic imprinting, X-chromosome inactivation, repression of repetitive elements, aging and carcinogenesis.
Zwei der vier DNA-Nukleotide, Cytosin und Adenin, können methyliert werden. Die Rate der Cytosin-DNA-Methylierung unterscheidet sich stark zwischen den Arten: 14% der Cytosine sind in Arabidopsis thaliana (Ackerwinde) methyliert, 4% in Mus musculus (Hausmaus), 2,3% in Escherichia coli (Darmbakterium), 0,03% in Drosophila (Fruchtfliege) und praktisch keine (<0,0002%) in Hefe-Arten. [1] Gegenwärtige Verfahren haben in Säugetieren nur methyliertes Cytosin nachgewiesen, während in Bakterien- und Pflanzen-DNA sowohl methyliertes Adenin als auch methylierts Cytosin beobachtet wurde. [2]	Two of DNA's four nucleotides, cytosine and adenine, can be methylated. The rate of cytosine DNA methylation differs strongly between species: 14% of cytosines are methylated in Arabidopsis thaliana, 4% in Mus musculus, 2.3% in Escherichia coli, 0.03% in Drosophila, and virtually none (< 0.0002%) in yeast species.[1] Current methods have only detected methylated cytosine in mammals, whereas bacterial and plant DNA is observed to have methylated adenine and cytosine.[2]
[1] - Capuano, F.; Muelleder, M.; Kok, R. M.; Blom, H. J.; Ralser, M. (2014). "Cytosine DNA methylation is found in Drosophila melanogaster but absent in Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe and other yeast species". Analytical Chemistry. 86 (8): 140318143747008. . . PMID 24640988.  EN->DE: "Cytosin-DNA-Methylierung findet sich in Drosophila melanogaster, fehlt jedoch in Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe und anderen Hefearten"
[2] - Ratel, David. "N6-methyladenine: the other methylated base of DNA". . .  EN->DE: "N6-Methyladenin: die andere methylierte Base der DNA" 
Die Methylierung von Cytosin 5-Methylcytosin tritt an der gleichen Stelle am Pyrimidinring auf (Position 5), wo sich bei der DNA-Base Thymin die Methylgruppe befindet, die Thymin von der analogen RNA Base Uracil unterscheidet. Der nahezu universelle Ersatz von Uracil durch Thymin in DNA, nicht aber in RNA, könnte sich als ein Fehlerkontrollmechanismus entwickelt haben, der die Entfernung von Uracilen durch die spontane Desaminierung von Cytosin erleichtern soll. [3] Es besteht die Annahme, dass sich die DNA-Methylierung zusammen mit vielen ihrer heutigen DNA-Methyltransferasen in der frühen Welt mit primitiver RNA-Methylierungsaktivität entwickelt hat, was von unterschiedlichen Seiten mit Hinweisen gestützt wird. [4]	Methylation of cytosine to form 5-methylcytosine occurs at the same 5 position on the pyrimidine ring where the DNA base thymine's methyl group is located, distinguishing it from the analogous RNA base uracil which has no methyl group. The near-universal replacement of uracil by thymine in DNA, but not RNA, may have evolved as an error-control mechanism, to facilitate removal of uracils generated by the spontaneous deamination of cytosine.[3] DNA methylation as well as many of its contemporary DNA methyltransferases has been thought to evolve from early world primitive RNA methylation activity and is supported by several lines of evidences.[4]
[3] - Angéla Békési and Beáta G Vértessy (2011-03-03) "Uracil in DNA: error or signal?" www.scienceinschool.org/2011/issue18/uracilEN->DE: "Uracil in der DNA: Fehler oder Signal?"
[4] - Rana, Ajay K.; Ankri, Serge (2016). "Reviving the RNA World: An Insight into the Appearance of RNA Methyltransferases". RNA: 99. .  EN->DE: "Wiederbelebung der RNA-Welt: Einblick in das Erscheinungsbild von RNA-Methyltransferasen"
DNA-Methylierung kann die Expression von Genen in den Zellen stabil verändern, wenn sie sich teilen und sich aus embryonalen Stammzellen in spezifische Gewebe differenzieren. Die resultierende Änderung ist in der Regel permanent und unidirektional, was eine Zelle daran hindert, zu einer Stammzelle zurück zu kehren oder in einem anderen Zelltyp zu konvertieren. Allerdings können DNA Methylierungen auch passiv oder schneller, aktiv entfernt werden. Die passive Möglichkeit besteht durch Verdünnung, wenn die Zellen sich teilen. Der aktive Vorgang beseitigt die Methylgruppen durch deren Hydroxylierung, statt sie vollständig zu entfernen. [5] [6]	DNA methylation can stably alter the expression of genes in cells as cells divide and differentiate from embryonic stem cells into specific tissues. The resulting change is normally permanent and unidirectional, preventing a cell from reverting to a stem cell or converting into a different cell type. However, DNA methylation can be removed either passively, by dilution as cells divide, or by a faster, active, process. The latter process occurs via hydroxylation of the methyl groups that are to be removed, rather than by complete removal of methyl groups.[5][6]
[5] - Iqbal, K.; Jin, S. -G.; Pfeifer, G. P.; Szabo, P. E. (2011). "Reprogramming of the paternal genome upon fertilization involves genome-wide oxidation of 5-methylcytosine". Proceedings of the National Academy of Sciences. 108 (9): 3642-3647. . . PMID 21321204.  EN->DE: "Die Reprogrammierung des väterlichen Genoms nach der Befruchtung beinhaltet die genomweite Oxidation von 5-Methylcytosin"
[6] - Wossidlo, M.; Nakamura, T.; Lepikhov, K.; Marques, C. J.; Zakhartchenko, V.; Boiani, M.; Arand, J.; Nakano, T.; Reik, W.; Walter, J. R. (2011). "5-Hydroxymethylcytosine in the mammalian zygote is linked with epigenetic reprogramming". Nature Communications. 2: 241. . PMID 21407207.  EN->DE: "5-Hydroxymethylcytosin in der Säuger-Zygote ist mit einer epigenetischen Reprogrammierung verknüpft."
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Die DNA-Methylierung wird in der Regel während der Zygotenbildung entfernt und durch aufeinanderfolgende Zellteilungen während der Entwicklung wieder hergestellt. Die Methylierungs-Modifikationen, die die Genexpression regulieren, sind in der Regel bei mitotischer Zellteilung erblich. Einige Methylierungen sind auch bei der spezialisierten meiotischen Zellteilung erblich, was zu Eizellen bzw. Spermien mit genomischer Prägung führt. Die DNA-Methylierung unterdrückt die Expression von endogenen retroviralen Genen und anderen schädlichen DNA-Abschnitten, die in das Wirtsgenom über die Zeit aufgenommen hat. Die DNA-Methylierung bildet die Basis der Chromatin-Struktur, die eine einzelne Zelle dazu befähigt, in verschiedenen Organen zu wachsen und verschiedene Funktionen zu erfüllen. Bei der Entwicklung fast aller Arten von Krebs spielt die DNA-Methylierung ebenfalls eine entscheidende Rolle. [7]	DNA methylation is typically removed during zygote formation and re-established through successive cell divisions during development. Methylation modifications that regulate gene expression are usually heritable through mitotic cell division; some methylation is also heritable through the specialized meiotic cell division that creates egg and sperm cells, resulting in genomic imprinting. DNA methylation suppresses the expression of endogenous retroviral genes and other harmful stretches of DNA that have been incorporated into the host genome over time. DNA methylation also forms the basis of chromatin structure, which enables a single cell to grow into multiple organs or perform multiple functions. DNA methylation also plays a crucial role in the development of nearly all types of cancer.[7]
[7] - Jaenisch, R.; Bird, A. (2003). "Epigenetic regulation of gene expression: how the genome integrates intrinsic and environmental signals". Nature Genetics. 33 Suppl (3s): 245-254. . PMID 12610534. EN->DE: "Epigenetische Regulation der Genexpression: Wie das Genom intrinsische und umweltrelevante Signale integriert."
Die DNA-Methylierung an der 5-Position von Cytosin hat die spezifische Wirkung einer Verringerung der Genexpression und wurde bei jedem untersuchten Wirbeltier nachgewiesen. In erwachsenen somatischen Zellen (Zellen im Körper, die nicht für die Reproduktion verwendet werden) erfolgt die DNA-Methylierung typischerweise in einem CpG-Dinukleotid-Kontext (d. h., wo einem Cytosin ein Guanin folgt). Die Nicht-CpG-Methylierung ist in embryonalen Stammzellen weit verbreitet [8] [9] [10] und wurde auch bei der neuronalen Entwicklung gezeigt. [11] Weiterhin wurde die Nicht-CpG-Methylierung in hämatopoetischen Progenitorzellen beobachtet und es trat dort hauptsächlich in einem CpApC-Sequenzkontext auf. [12]	DNA methylation at the 5 position of cytosine has the specific effect of reducing gene expression and has been found in every vertebrate examined. In adult somatic cells (cells in the body, not used for reproduction), DNA methylation typically occurs in a CpG dinucleotide context (i.e. where a cytosine is followed by a guanine); non-CpG methylation is prevalent in embryonic stem cells,[8][9][10] and has also been indicated in neural development.[11] Furthermore, non-CpG methylation has also been observed in hematopoietic progenitor cells, and it occurred mainly in a CpApC sequence context.[12]
[8] - Dodge, J.E.; Ramsahoye, B.H.; Wo, Z.G.; Okano, M.; Li, E. (2002). "De novo methylation of MMLV provirus in embryonic stem cells: CpG versus non-CpG methylation". Gene. 289 (1-2): 41-48. .  EN->DE: "De novo-Methylierung von MMLV-Provirus in embryonalen Stammzellen: CpG gegenüber Nicht-CpG-Methylierung"
[9] - Haines, T.R.; Rodenhiser, D.I.; Ainsworth, P.J. (2001). "Allele-Specific Non-CpG Methylation of the Nf1 Gene during Early Mouse Development". Developmental Biology. 240 (2): 585-598. . PMID 11784085.  EN->DE: "Allelspezifische Nicht-CpG-Methylierung des Nf1-Gens während der frühen Mausentwicklung".
[10] - Lister, R., Pelizzola, M.; Dowen, R.H. et al. (October 2009). "Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences". Nature. 462 (7271): 315-22. . . PMID 19829295.  EN->DE: "Humane DNA-Methylome mit Auflösung bis zu Base zeigen weitreichende epigenomische Unterschiede "
[11] - Lister R, Mukamel EA, Nery JR, Urich M, Puddifoot CA, Johnson ND, Lucero J, Huang Y, Dwork AJ, Schultz MD, Yu M, Tonti-Filippini J, Heyn H, Hu S, Wu JC, Rao A, Esteller M, He C, Haghighi FG, Sejnowski TJ, Behrens MM, Ecker JR. (4 July 2013). "Global Epigenomic Reconfiguration During Mammalian Brain Development". Science. 341 (6146): 1237905. .  EN->DE: "Globale epigenomische Rekonfiguration während der Entwicklung des Gehirns bei Säugetieren "
[12] - Kulis, Marta; Merkel, Angelika; Heath, Simon; Queirós, Ana C.; Schuyler, Ronald P.; Castellano, Giancarlo; Beekman, Renée; Raineri, Emanuele; Esteve, Anna (2015-07-01). "Whole-genome fingerprint of the DNA methylome during human B cell differentiation". Nature Genetics. 47 (7): 746-756. . ISSN 1061-4036.  EN->DE: "Vollgenom-Fingerabdruck des DNA-Methyloms während der menschlichen B-Zelldifferenzierung"
--Dirk123456 (Diskussion) 22:24, 2. Dez. 2016 (CET)
replies: text: Hallo Dirk123456, Danke für Deine Arbeit bei der Übersetzung der Einleitung. Einige Sätze davon können sicher in diesen Artikel übernommen werden, allerdings werden in der de.wp generell keine existenten Texte ersetzt, sondern nur Bestehende ergänzt und präzisiert. Grüße, --Ghilt (Diskussion) 00:44, 3. Dez. 2016 (CET)
thread_title: Englische Einleitung übersetzt

message: :Hallo,
:Die Abbildung „Folgen der Desaminierung“ enthält zwei Nummern, die im Bild und in der Bildunterschrift nicht übereinstimmen. Auf den ersten Blick ließe sich das leicht beheben. Allerdings zeigten sich beim zweiten Blick Stolpersteine, die mir ein umfänglicheres Vorgehen sinnvoll erscheinen ließen. </br>
:Daher habe ich mich eingehend mit dem Thema befasst und meine Gedankengänge und Arbeitsschritte (teilweise) in meiner 
Baustelle-2.14 protokolliert, um sie nachvollziehbar zu machen. 
:Dabei ist eine neue Bildbeschreibung zum bestehenden Bild herausgekommen, die auch die Enzyme Cytidin-Deaminase und Uracil-DNA-Glycosidase (oder Cytidin-Desaminase und Uracil-DNA-Glycosylase) beachtet, die bisher nur gezeigt aber nicht kommentiert wurden. Weiterhin sind Zitate dazu gekommen. Das Eingehen auf jedes gezeigte Bildelement könnte die Wahrscheinlichkeit verringern, das Nummern zwischen Bild und Bildbeschreibung ungenau zugeordnet werden. 
:Die füge diese neue Version mit dem bereits vorhandenen Bild jetzt in den Artikel ein. 
:Beste Grüße, --Dirk123456 (Diskussion) 13:11, 21. Jan. 2019 (CET)
thread_title:  Abbildung „Folgen der Desaminierung“