Diskussion:Cytochrom-c-Oxidase

message: Hallo, ich habe ein paar Bemerkungen zum Absatz Funktion, bevor ich diese direkt ändere wollte ich meine Änderungsvorschläge aber zur Diskussion stellen:
Die Reaktion ist in 5 Schritte unterteilt.
Das ist eine recht willkürliche Behauptung. Besser man schreibt: "Es konnten photometrisch 6 Intermediate aufgezeigt werden, die sich durch die Anzahl aufgenommener Elektronen bzw. durch die Art der Sauerstoffbindung an das Reaktionszentrum unterscheiden. Zahlreiche weitere Intermediate wurden postuliert". Noch besser man vereinfacht und läßt das ganz weg, um den Absatz nicht unnötig kompliziert werden zu lassen. 
Im ersten Schritt geben zwei reduzierte Cyt c (vom Komplex III) 2 e− an das CuA/CuA-Zentrum (bestehend aus zwei Cu-Atomen und stabilisierenden Aminosäureseitenketten) ab. Die e− werden dann über Häm a an Häm a3 und das CuB weitergeleitet und reduzieren diese.
Da dies nacheinander geschieht und man zwischen zwei Intermediaten unterschieden kann (E und R2), würde ich nicht von dem ersten Schritt schreiben. Auch sollte man die Struktur des CuA-Zentrums ind das Kapitel Struktur stellen. Mein Vorschlag wäre "Geht man vom vollständig oxidiertem Zustand der Cytochrom c Oxidase aus werden nacheinander zwei Elektronen über das CuA- und das Häm a - Zentrum in das katalytisch aktive Häm a3 - CuB-Zentrum transferiert.  
Jetzt kann der Sauerstoff (O2 entspricht O=O) durch Aufnahme von 2 Elektronen als Peroxid (O22- entspricht -O-O-) an das reaktive Zentrum binden (Fe3+-O-O-CuB). 
Das ist falsch: der Sauerstoff bindet zunächst als "Superoxy" also als Fe(3+)-O=O (mit einer negativen Ladung am Sauerstoff) an das Häm a3. Dieses Intermediat wird als "A" oder "Oxy-Intermediat" bezeichnet, es wurde sogar die O=O-Streckschwingung des an das Eisen gebundenen Sauerstoffs mittels Resonanzramanspektroskopie nachgewiesen. Nun erfolgt quasi instantan der O=O Bindungsbruch durch die Reduktion mit 4 Elektronen. Das entstandene Intermediat wurde als "P-Intermediat" (wie Peroxi-) bezeichnet, da fäschlicherweise eine Stufenweise Reduktion des Sauerstoffs vermutet wurde. Ebenfalls durch Resonanz-Raman Experimente konnte gezeigt werden, dass ein Oxoferryl-Intermediat vorliegt, durch den Nachweis einer Fe(4+)=O^2- -Schwingung. Das hat physiologische Relevanz, denn so kann die Bildung von giftigen, reaktiven Sauerstoffspezies vermieden werden! Mein Vorschlag wäre: "Im 2 Elektronen-reduzierten Zustand bindet das Häm a3 Zentrum den Sauerstoff, dieser wird konzertiert mit 4 Elektronen reduziert. Die zwei gebildeten Sauerstoffionen binden als Oxo-Gruppe (=O^2-) an das Häm a3 und das CuB-Zentrum. 
Durch zwei weitere Cyt c erreichen die letzten erforderlichen 2 Elektronen und 2 Protonen das reaktive Zentrum und es entsteht jeweils eine OH-Gruppe am Fe3+ des Häm a3 und eines am CuB. Nun folgen zwei weitere Protonen, die mit der OH-Gruppe reagieren und Wasser bilden. Gleichzeitig werden vier Protonen in den Intermembranraum gepumpt. Das Enzym steht für einen neuen Zyklus bereit.
Sie sprechen im ersten Satz zum ersten mal von Protonen, dabei wurden bis zur Ausbildung des "P-Intermediats bereits 2 Protonen gepumpt und 2 weitere "chemische" Protonen auf das aktive Zentrum übertragen. Weiterhin ist nicht bekannt, wann genau Hydroxydliganden (mit einer negativen Ladung)und später Wasser entstehen, du könntest hier höchstens eine Vermutung aussprechen. Die 4 Protonen werden auch nicht gleichzeitig zur Wiedergewinnung des Grundzustands gepumpt, sondern jedes mal, wenn ein Elektron in das reaktive Zentrum injiziert wird. Leider ist ein genauer Mechanismus noch nicht bekant, wie in der 4. Zeile des Kapitels erwähnt. Mein Vorschlag wäre: "Durch die Aufnahme von 2 weiteren Elektronen, und die Abspaltung von 2 Wassermolekülen relaxiert das Enzym wieder zum Ausgangszustand. Protonenaufnahme und Pumpschritte sind mit jedem der Elektronentransferreaktionen vom reduzierten Cytochrom c zum Reaktionszentrum verbunden."
Hier habe ich unterschlagen, dass die Wasserabspaltung auch vom vollständig oxidiertem zum 1 Elektronen-reduziertem Zustand erfolgen könnte. Ich denke das zu Formulieren müsste man die Intermediate O, E, R2, A, P und F einführen, was meiner Meinung nach unbedingt vermieden werden sollte.
Zuletzt würde ich noch gerne hinzufügen: "Die für die Wasserbildung erforderlichen Protonen werden nur von der Innenseite der Membran aufgenommen, die Ausbildung eines Protonengradienten durch die Protonenpumpaktivität der Oxidase wird demnach zusätzlich verstärkt." 
Ich habe die Änderungen vorgenommen, sowie Zwecks geeigneter Überleitung den Satz "Redoxreaktion und Protonentranslokation sind in der Cytochrom c Oxidase über einen bisher nicht bekannten Mechanismus miteinander gekoppelt." an anderer Stelle ersetzt durch:
"Das komplexe Zusammenspiel der ablaufenden Sauerstoffchemie, der Elektronentransferreaktionen, sowie den Protonenaufnahme- und Pumpschritten und deren genauen zeitlichen Abfolgen konnten bisher noch nicht detailliert aufgeklärt werden." 
:Nur Mut, vielleicht könnte man auch noch ein entsprechendes Bild zum katalytischen Zyklus beisteuern. Gruss, --Hoffmeier 01:52, 28. Nov. 2007 (CET)
thread_title:  Funktion 

message: Liebe Autoren,
Da ich entdeckt habe, dass dieser Artikel in der russischen Wiki zwei Zeilen umfasste, schämte ich mich dafür und habe ihn teilweise ins Russische übersetzt. Dies habe ich natürlich im neuen Artikel vermerkt; die Beschreibung des Mechanismus ist auf meinem bzw. Stryers Mist gewachsen. Ich hoffe, dass das für alle Beteiligten o.k. ist! :-)
-- MultiOlga 22:11, 15. Okt. 2010 (CEST)
thread_title:  Übersetzung 

message: Lieber Autor,
die Anzahl der Protonen in der Transportgleichung stimmt nicht mit der im Seitenkasten, siehe Substrat und Produkt, überein. 
Mit freundlichen Grüßen,
M. (nicht signierter Beitrag von 141.109.112.28 (Diskussion) 16:54, 12. Aug. 2014 (CEST)
thread_title:  Anzahl der Protonen