Vorlage Diskussion:Infobox Protein

message: Da bisher dort keine Antwort kam, versuche ich es mal hier. In der en:WP wird seit ein paar Wochen eine stark erweiterte Infobox verwendet, z.B. hier :en:KiSS1-derived peptide receptor, den ich gerade übersetzen will (Benutzer:Drahkrub/Spielwiese), oder noch umfangreicher in diesem Artikel :en:Kisspeptin. Für mich stellt sich die Frage wie ich mit den Orthologen verfahren soll. Natürlich kann ich die Maus einfach rausschmeissen, aber das wäre schade. Ich würde vermuten, dass ich nicht der einzige Benutzer bin, dem sich diese Frage stellt. Evtl. ist ja eine neue Version der Infobox in Planung? -- Burkhard 10:57, 3. Jan. 2008 (CET)
replies: text: Du könntest zunächst erstmal zwei Infoboxen verwenden. Gruß, --Hoffmeier 13:55, 3. Jan. 2008 (CET)
replies: text: Daran habe ich auch schon gedacht. Sähe aber eher bescheiden aus und löst das grundsätzliche Problem auch nicht. --Burkhard 14:27, 3. Jan. 2008 (CET)
thread_title:  Orthologe in Protein Infobox 

message: Im Gegensatz zur englischen Wikipedia scheint in der deutschen Wikipedia der Link Symbol nicht mehr zu funktionieren. --Hdumann 12:37, 22. Feb. 2008 (CET)
replies: text: Geht auch in en:WP gerade nicht mehr. Grund ist wohl ein fehlender Eintrag für die Domain gene.ucl.ak.uk. Wer weiss mehr? --Burkhard 19:40, 22. Feb. 2008 (CET)
replies: text: en:WP benutzt jetzt offensichtlich http://www.genenames.org --Burkhard 23:16, 25. Feb. 2008 (CET)
replies: text: O.k. - hab mich getraut und den Link gefixt. --Burkhard 23:26, 25. Feb. 2008 (CET)
thread_title:  Symbol 

message: Von meiner Diskussionsseite hierher kopiert: 
::Hallo Leyo, bei der Diskussion damals blieben einige Fragen offen: z.B. der Umgang mit Orthologen und die ausschliessliche Verlinkung auf das menschliche Chromosom. In der WP:en wurden gleich eine Reihe von Problemen durch Einführung einer Vorlage Vorlage GNF protein box gelöst, die als eine Art Infobox-Wrapper dient. Vielleicht wäre es sinnvoll, sich zunächst mal anzuschauen, was von dem dortigen Modell sinnvoll übernommen werden kann - auch im Hinblick darauf, dass viele Protein-Artikel durch Übersetzungen aus en entstehen.  Was meinst Du? --Burkhard 09:56, 24. Aug. 2008 (CEST)
replies: text: Ich fände es am sinnvollsten, die Diskussion auf der Vorlagendiskussionsseite fortzusetzen (inkl. deiner obigen Anmerkung) und somit einer breiteren Benutzerzahl „zugänglich“ zu machen. Die engl. Version schaue ich mir demnächst noch genauer an. --Leyo 23:12, 24. Aug. 2008 (CEST)
thread_title:  [[:en:Template:GNF Protein box|Vorlage GNF protein box]] 

message: die grüne Farbe der Proteinbox doof. Ansonsten is sie ganz praktisch, vor allem weil man jetzt verschiedene Spezies nebeneinander eintragen kann. Ich hab auf die Schnelle nur Probleme mit der chromosomalen Lokalisation. Vielleicht krieg ich es ja raus. Gute Arbeit! Gruß -- Andreas Werle 23:24, 17. Sep. 2008 (CEST)
replies: text: Ich hab mal unter Genlocus den UCSC Browser verlinkt. Mach doch mal nen Beispiel, was die Farbe angeht. --Ayacop 08:35, 18. Sep. 2008 (CEST)
replies: text: Ich fand die Farbe zuerst auch doof, sehe inzwischen aber, dass durch das eher dezente Grün die Lesbarkeit, sowohl der Box als auch des Artikels, durchaus unterstützt wird. Ich bin für behalten. --Burkhard 22:00, 18. Sep. 2008 (CEST)
replies: text: Das Problem sind zwei verschiedene Grüntöne, die beißen sich. Zumindest sieht das auf meinem TV so aus. Ich finde die grau-grün-Kombination auf en angenehmer. lg -- Andreas Werle 21:27, 19. Sep. 2008 (CEST)
thread_title:  ich finde 

message: Zuächst mal ein Lob: Die Box gefällt mir schon ganz gut. Allerdings sollte sie noch deutlich OMA-freundlicher gestaltet werden. Das fängt schon damit an, dass man die Fachbegriffe erläutern oder zumindest verlinken sollte, damit man nachschauen kann, was sich dahinter verbirgt.
* Unter dem Punkt Größe kann man Aminosäuren ruhig ausschreiben und kDa verlinken.
* Bei Vorkommen sollte auf jeden Fall auch die deutsche Bezeichnung des Taxons stehen. Unter Euteleostomi und dergleichen kann sich kaum jemand etwas vorstellen.
* Was auf jeden Fall noch fehlt ist die Aufgabe des Proteins. Handelt es sich um ein Strukturprotein, ein Enzym, einen Rezeptor etc.? Zudem könnte man eine kurze Zusammenfassung der Aufgabe auflisten, etwa „Eisentransport im Blut“ bei Transferrin.
* Wir sollten eine Zusammenfassen mit der Enzymbox in Erwägung ziehen. Die Enzymbox ist redundant und es bräuchte nur ein wenig Anpassung der Proteinbox.
* Warum ist der Text der rechten Spalte größtenteils zentriert? Bei den anderen Boxen aus den Naturwissenschaften, die mir spontan einfallen, ist der Text durchgehend linksbündig.
* Was haltet ihr von einem zusätzlichen Parameter Proteindomänen, bei dem man die wichtigsten enthaltenen Domänen angeben kann?
Das ist erstmal alles, was mir bisher auf- und eingefallen ist. Gruß, --NEURO ⇌ ± 20:32, 20. Sep. 2008 (CEST)
replies: text: Euteleostomi hat auch in der deutschen WP keine deutsche Bezeichnung, die beste Übersetzung wäre Wirbeltiere ohne Schleimaale und Neunaugen oder Knochenfische aufwärts. Oder kennt jemand eine passende deutsche Bezeichnung dafür? Coelomata ist auch noch so ein Fall, Triploblasten ist auch nicht viel verständlicher.  Ansonsten steht es in der Verantwortung des Bearbeiters, auch die deutsche Bezeichnung in Klammern nachzustellen, wie ja auch sonst oft geschehen. Coelomata ist auch noch so ein Fall, Triploblasten ist auch nicht viel besser. (Habe bei den Zoologen nicht richtig aufgepasst - das rächt sich jetzt). --Burkhard 20:56, 20. Sep. 2008 (CEST)
replies: text: Ja, und die Aufgabe des Proteins, da sind wir wieder bei Ninas Argument, dem ich zustimme, dass das bei vielen Proteinen eine lange Liste wird, und die Box ist ohnehin schon sehr lang. Dass die Enzymbox wegfallen kann, war klar, bei ein einem halben Dutzend Enzymen ist das bereits der Fall. Domänen sind interessant, und da sage ich, wie über den Rest der Anregungen: gerne, sei mutig und danke für die Ideen. --Ayacop 08:20, 21. Sep. 2008 (CEST)
thread_title:  Anregungen 

message: Neu hinzugekommen sind die Felder Peptidase_fam für die MEROPS-Klassifikation von Proteasen, sowie TCDB und TranspText für die TCDB-Klassifikation von Membrantransportern. Beides hervorragende Informationsquellen, beides von UniProt verlinkt, so dass man nicht selbst suchen muss. --Ayacop 10:08, 23. Okt. 2008 (CEST)
thread_title:  Weitere Felder 

message: Ich finde den Rahmen um das Strukturbild unschön und unnötig (Beispiel). Gibt es einen Grund dafür? --Leyo 18:05, 30. Jun. 2009 (CEST)
replies: text: Finde ich auch. --NEURO ⇌ ± 19:09, 30. Jun. 2009 (CEST)
replies: text: Da es keine Gegenstimmen gab, habe ich's umgesetzt. --Leyo 18:47, 28. Jul. 2009 (CEST)
thread_title:  Rahmen um Bild 

message: Wieso muss die Erklärung in der Protein-Infobox fettgeschrieben werden? Wer's lesen will tut's sowieso, und die anderen stört's. Hundsnormale Formatierung ist völlig ausreichend. (Fettschreibung hier als Beispiel.... und dort Cytochrom P450) -- Robodoc 13:34, 5. Jun. 2010 (CEST)
replies: text: ich hatte erst gar nicht verstanden was Du meinst - bis ich den IE angeworfen habe. Scheint ein Browserproblem zu sein, denn bei Chrome und Firefox erscheint die Erklärung ("Molekülstruktur von Cytochrom P450eryF (PDB:1EGY)") nicht fett. Keine Ahnung woran das liegt, vielleicht mal auf Wikipedia:WikiProjekt Vorlagen/Werkstatt nachfragen? --Tinz 15:15, 5. Jun. 2010 (CEST)
replies: text:  Etwas in der Richtung, möglich. Allerdings benutze ich immer den Firefox. -- Robodoc 07:50, 6. Jun. 2010 (CEST)
thread_title:  Fettschreibung  

message: Hmm... die Angabe "Größe" scheint mir im zusammenhang mit einer Massenangabe falsch - müsste "Masse" heißen. Außerdem ist die Atomare Masseeinheit das "u" und kein "Dalton". Bitte um Kommentare!--Mager 20:17, 21. Aug. 2010 (CEST)
replies: text: Kommentar (mit 12-jähriger Verspätung): Das Dalton ist ein Synonym, was mittlerweile nicht nur im Artikel Atomare Masseneinheit steht, sondern auch in der SI-Broschüre. Allerdings ist das Einheitenzeichen Da, also muss in der Doku kDa stehen, nicht kD. — Wassermaus (Diskussion) 11:13, 5. Okt. 2022 (CEST)
replies: text: Done.--Mabschaaf 11:35, 5. Okt. 2022 (CEST)
thread_title:  Größe/Masse/Daltons/u... 

message: Die Infobox ist bei fehlendem Bild nicht besonders schön. Was soll der "-"-Platzhalter da? Und der Balken, der sonst wohl Bilduntertitel und Rest der Box optisch voneinander abtrennen soll? Kann man diese Elemente nicht einfach ausblenden, solange kein Bild vorhanden ist? --y work? 13:54, 30. Dez. 2011 (CET)
thread_title:  Fehlendes Bild 

message: ...aus der Versionsgeschichte: "der Aufruf von ESIS funktioniert NICHT ohne Dereferrer; ob das jemand "Käse findet" ist hier schlicht egal!!!"
"schlicht egal" ist ob man die Seite mit oder ohne Dereferer (wisst ihr was das ist?) aufruft... probier doch mal: http://esis.jrc.ec.europa.eu/lib/esis_pgm.php?GENRE=ECNO&ENTREE=200-816-9
aber schwärzt mich mal weiter fröhlich an --.love.is.war. 02:51, 20. Jan. 2012 (CET)
replies: text: Nö keine Ahnung, was das ist...aber probier doch mal den folgenden Link aus ESIS (Cas-No 200-816-9) ohne Dereferer und dann ESIS (Cas-No 200-816-9) mit Dereferer.org mit den Browsern Firefox oder IE. Vielleicht überlegst Du Dir mal, dass auch andere Leute hier ein Hirn zum Einschalten haben und Dinge nicht einfach so machen. --Cvf-psDisk+/− 08:43, 20. Jan. 2012 (CET)
thread_title:  ESIS 

message: In Analogie zur Infobox Chemikalie, wo der Parameter Verschreibungspflicht gemäss Diskussionsergebnis entfernt wurde, würde es sich wohl auch hier aufdrängen. Gibt es Gegenstimmen? --Leyo 15:19, 2. Aug. 2013 (CEST)
replies: text: Ich war schon bei der Infobox Chemie für die Entfernung - das ist hier nicht anders. Soweit ich sehe, waren auch andere RM-Mitglieder dieser Meinung. Grüße --Partynia ∞ RM 15:47, 2. Aug. 2013 (CEST)
replies: text: Danke für dein Feedback. IMO sollten wir noch ein Weilchen warten und dann einen Entfernungantrag unter WP:B/A stellen. --Leyo 00:19, 3. Aug. 2013 (CEST)
replies: text: Schade, dass sich nicht mehr zur Diskussion gemeldet haben. Vielleicht liegt´s an der Urlaubszeit. ich denke aber, dass das in Ordnung geht. Argumente wurden ja schon bei der Infobox Chemie ausgetauscht. Grüße --Partynia ∞ RM 19:54, 8. Aug. 2013 (CEST)
replies: text: Die genannten Argumente & Meinungen bei der Infobox Chemikalie gelten wohl auch hier, d.h. der Parameter sollte raus. Gruß --Cvf-psDisk+/− 12:45, 12. Aug. 2013 (CEST)
thread_title:  Entfernung von ''Verschreibungspflicht'' 

message: Hallo, könnte man die Infobox Protein um den Parameter der ID-Nummer von GeneCards erweitern? Deren Seite stellt eine Verlinkung zu den meisten Datenbanken bereit. Grüße, --Ghilt (Diskussion) 16:03, 28. Apr. 2014 (CEST)
replies: text: Wurde umgesetzt, Grüße, --Ghilt (Diskussion) 16:38, 22. Jun. 2014 (CEST)
thread_title:  Aufnahme des Parameters 'GeneCards' 

message: Hallo, kann man den KEGG Eintrag in der Infobox ergänzen? Schöne Grüße RoM1982 (Diskussion) 20:58, 2. Mai 2015 (CEST)
replies: text: Es gab hier mal eine Diskussion zu weiteren Datenbank-IDs, in der auch KEGG erwähnt wurde. Zusammenfassen kann man das dort mit: Identifier gehören auf Wikidata, nicht aber massenhaft in die Box.--Mabschaaf 21:47, 2. Mai 2015 (CEST)
thread_title:  KEGG 

message: bitte s. Wikipedia:Redaktion_Chemie#.C3.84nderung_der_Vorlage:Infobox_Protein, Grüße, --Ghilt (Diskussion) 16:02, 2. Apr. 2017 (CEST)
thread_title:  Änderung der Variablen homolog_db in der [[Vorlage:Infobox Protein]] 

message: Wie man am Beispiel Lysosomales Schutzprotein sehen kann, leitet die Seite merops.sanger.ac.uk (so steht es in der Vorlage) nach www.ebi.ac.uk/merops/ um und wirft dabei alle Parameter weg. Kann sich das jemand mit Ahnung ansehen und den Link in der Vorlage anpassen. und dann auch gleich bei diesem auf https umstellen --Wurgl (Diskussion) 16:21, 3. Apr. 2018 (CEST)
replies: text: Hi Wurgl, was spräche dagegen, das Ziel der Weiterleitung zu verwenden? Grüße, --Ghilt (Diskussion) 17:02, 3. Apr. 2018 (CEST)
replies: text: (BK) Habe ich schon so umgesetzt: Spezial:Diff/175723668/175725237--Mabschaaf 17:04, 3. Apr. 2018 (CEST)
replies: text: Prima, Dankeschön und Grüße, --Ghilt (Diskussion) 17:06, 3. Apr. 2018 (CEST)
thread_title:  Problem bei merops.sanger.ac.uk 

message: Die Links, die zu den HGNC-Infos führen, zeigen ins Leere, da deren URL-Struktur geändert worden zu sein scheint. 
Beispiel: Artikel Transglutaminasen, Infobox rechts. Der Link zu F13A1 zeigt auf: http://www.genenames.org/data/hgnc_data.php?match=F13A1 -- das gibt aber einen Fehler, weil die URL so nicht (mehr) funktioniert. Der korrekte Link müsste lauten https://www.genenames.org/data/gene-symbol-report/#!/hgnc_id/HGNC:3531 bzw. alternativ die Suchergebnisseite: https://www.genenames.org/tools/search/#!/all?query=F13A1
Ich bin mir unsicher, wie man die Infobox ändert, lasse daher lieber die Finger davon und hoffe, jemand hier kann die Infobox updaten. Danke im Voraus! 
--suvidu (Diskussion) 14:34, 19. Dez. 2018 (CET)
replies: text: Danke für den Hinweis, Vorlage:HGNC habe ich auch direkt angepasst.--Mabschaaf 17:18, 19. Dez. 2018 (CET)
thread_title:  HGNC benötigt andere URLs 

message: Umseitig wird behauptet:
* Die mit dieser Farbe (   ) hinterlegten Zeilen sind Pflichtangaben und müssen angegeben werden.
Das trifft nicht zu.
* Noch nicht einmal der Name ist Pflichtparameter, denn Default wäre „Lemma des Wikipedia-Artikels“.
* Zu diversen Angaben lernte ich, dass sie überhaupt nicht für alle  Wikipedia-Artikel definiert oder inhaltlich sinnvoll wären.
* Deshalb sind sie auch pflichtwidrig nicht alle eingetragen; 1.764 Einbindungen:
** ATC-Code 1.121
** CAS 273
** EC-Nummer 673
** Kategorie 577
** Reaktionsart 479
** Substrat 552
** Produkte 509
** TCDB 124
* Sollten vielleicht besser als „empfohlen“ charakterisiert werden.
VG --PerfektesChaos 23:14, 29. Mär. 2021 (CEST)
thread_title:  Angebliche Pflichtangaben  

message: Diese Verlinkung scheint nicht mehr gültig zu sein. Kann sich das bitte mal jemand ansehen? Beispiele wären
* Tetanospasmin der Link landet hier https://pbil.univ-lyon1.fr/cgi-bin/acnuc-ac2tree?query=P04958&db=HOBACGEN = Not Found
* Urokinase http://doua.prabi.fr/cgi-bin/view-tree-srs.pl?query=HOG000237314&db=HOGENOM&ident=ACNUC32190&type=&ac=P00749&spe=none = Not Found
* Hämoglobin https://pbil.univ-lyon1.fr/cgi-bin/acnuc-ac2tree?query=P69905&db=HOVERGEN = Not Found
Ich habe jetzt nicht alle Vorlageneinbindungen getestet, sicher ist aber, dass zumindest diese URL https://pbil.univ-lyon1.fr/ = Forbidden You don't have permission to access / on this server. nicht mehr geht, eventuell so https://pbil.univ-lyon1.fr/R/ und mit anderer Zusammensetzung er Links  --Liebe Grüße, Lómelinde Diskussion 14:38, 11. Jun. 2022 (CEST)
replies: text: Das ist schon länger bekannt (→Wikipedia:Redaktion_Chemie/Knacknüsse#Links_auf_HOGENOM,_HOVERGEN_&_HOBACGEN) aber leider nach wie vor ein ungelöstes Problem.--Mabschaaf 16:46, 11. Jun. 2022 (CEST)
thread_title:  Link im Parameter Homolog_fam 

message: Hi, in :en:Template:Infobox enzyme gibt es den parameter | GO_code =  der z. B. mit 0008840 die Links https://amigo.geneontology.org/amigo/term/GO:0008840 und https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/term/GO:0008840 erzeugt. Vergleiche auch :en:Dihydrodipicolinate synthase. Wäre das für die Box nicht auch interessant? Oder gibt es den parameter schon und ich hab Ihn nicht erkannt?!? --Calle Cool (Diskussion) 16:09, 4. Nov. 2023 (CET)
replies: text: Könnte ich einfügen, aber was soll GO bringen im Vergleich zu den anderen? --Ghilt (Diskussion) 16:40, 4. Nov. 2023 (CET)
replies: text: Mehr kompatibilität zur englischen Infobox... Erleichterung für Übersetzer...--Calle Cool (Diskussion) 17:45, 4. Nov. 2023 (CET)
thread_title:  Go-code