가. 원고는 2006. 8. 2. C에 의해 도서출판업, 도소매업 등을 사업목적으로 설립된 회사이고, 피고는 2006년경부터 2014. 6. 3.경까지 원고 회사에서 자금관리 업무 담당 전무로 근무하였던 사람이다. 또한, 주식회사 D(이하 ‘D'라 한다)는 피고의 동생인 E이 운영하던 회사이고, F은 피고의 배우자이다.
나. 원고의 계정별원장 등 회계장부에는 ① ‘원고가 D에게 2013. 11. 19. 5,000,000원, 2013. 11. 21. 499,000원, 2013. 12. 11. 6,000,000원의 합계 11,499,999원(이하 ‘D 지급금액'이라 한다)을 송금하다‘는 내용 및 ② ‘원고가 2013. 12. 13. 아래 표의 기재와 같이 6개 거래처로부터 합계 21,463,760원(이하 ‘이 사건 수금액'이라 한다)을 현금으로 입금받았다‘는 내용이 각 기재되어 있다(갑 제1. 2호증).

다. 원고의 회계장부에는 ③ '2008. 7. 24.부터 2014. 5. 27.까지 F 등 10명의 대주들(이하 ‘이 사건 대주들'이라 한다)로부터 대여한 합계 290,000,000원(이하 ‘F 대여금'이라 한다)에 대한 연 24%의 약정이자로 합계 126,000,000원을 위 대주들에게 지급하였다‘는 내용, ④ '2010. 8. 31. F에게 퇴직금으로 2,977,083원(이하 'F 퇴직금‘이라 한다)을 지급하였다'는 내용, ⑤ '2012년경부터 2013년경까지 원고의 전 대표이사였던 M로부터 130,000,000원(이하 'M 대여금‘이라 한다)을 차용하고, M에게 그 원리금 137,600,000원을 변제하였다'는 내용 및 ⑥ ‘원고 계좌에서 M 가수금상환 명목으로 2010. 12. 10. 20,000,000원, 2011. 1. 3. 10,000,000원의 합계 30,000,000원(이하 'M 가수금‘이라 한다)이 인출되어 N 대여금으로 사용되었다'는 내용 등이 각각 기재되어 있다(갑 제3 내지 5호증).
라. 한편, 피고 명의 은행계좌에 전주 G출판 명의로 2013. 12. 21. 1,500,000원, 2014. 4. 25.경 1,500,000원 합계 3,000,000원 및 국립도서관 및 국회도서관 명의로 2015. 4.경부터 2016. 1.경까지 납본보상금 명목으로 합계 728,000원이 각각 입금되었다(갑 제10호증, 이하 위 각 입금액을 합하여 ‘피고 계좌 입금액'이라 한다).