아래 사실은 당사자 사이에 다툼이 없다.
가. 원고는 피고 산하 조달청이 2016. 6. 23. 입찰 공고한 ‘B기관 (이전신축) 전시설계 및 전시물 제작설치 계약체결 요청' 건의 입찰에 참가하여 낙찰을 받아 2016. 9. 8. 피고와 물품계약을 체결하였다(이하 ‘이 사건 물품계약'이라고 한다).
나. 이 사건 물품계약의 납품기한은 당초 2019. 5. 31.까지였는데, 2019. 4. 11. 이를 2019. 8. 31.까지로 변경하는 수정계약이 체결되었고, 2019. 8. 29. 이를 2020. 1. 31.까지로 연장하는 수정계약이 체결되었으며, 2019. 12. 27. 특기사항란에 "납품기한: 2019. 8. 31.(단, 천체관 주관측실 천체망원경 경통에 한해 2020. 1. 31.까지 납품"이라고 기재된 수정계약이 체결되었다(이하 각 ‘수정계약'이라고 하고, 체결일자로 특정한다).
다. 원고는 2019. 9. 25. 천체망원경 경통을 제외한 전시체험물(1차 납품, 물품액 4,386,569,000원)을, 2020. 2. 6. 천체망원경 경통(2차 납품, 물품액 1억 3,030만 원)을 각 납품하였고, 피고는 원고에게 ⑴ 1차 납품에 대하여 84,222,120원(= 4,386,569,000원 × 지체일수 24일 × 지체상금율 0.08%, 10원 미만 버림), ⑵ 2차 납품에 대하여 625,440원(1억 3,030만 원 × 지체일수 6일 × 지체상금율 0.08%), 합계 84,847,560원의 지체상금을 부과하고 이를 원고에게 지급할 물품대금에서 상계한 후 나머지 금액을 지급하였다.