가. 원고는 토목건축 공사업 등을 목적으로 하는 회사이고, 피고는 부동산개발 및 개발관리업 등을 목적으로 하는 회사이다.
나. 원고는 2014. 8월경 피고와 사이에, 피고가 시행하는 동두천시 D 외 3필지 지상 ‘E' 신축공사(이하 ‘이 사건 공사'라고 한다)에 관하여 공사대금 141억 1,300만원(부가세 포함, 이하 부가세에 관하여 별도의 기재가 없는 한 부가세를 포함한 것으로 본다), 공사기간 2014. 10. 1.부터 2015. 12. 31.까지로 정하여 공사도급계약을 체결하였다. 그 후 원고와 피고는 2015. 7. 31. 이 사건 공사에 관하여 공사대금을 152억 3,060만원으로 증액하고, 공사기간을 2014. 10. 1.부터 2016. 10. 31.까지로 변경하는 내용의 공사도급변경계약(이하 위 공사도급계약과 공사도급변경계약을 통칭하여 ‘이 사건 공사계약'이라고 한다)을 체결하였다.
다. 원고는 2014. 10. 6. 원고보조참가인에게 이 사건 공사 중 토목공사를 공사대금 4억 7,000만원으로 정하여 하도급해 주었다.
라. 한편, 원고는 2015. 11. 30. 이 사건 공사를 중단하였는데, 이후 2016. 8. 8.경 피고와 기성고 공사대금에 관하여 ‘피고가 중도금대출 및 진행중인 PF 자금으로 공사비를 현금 정산하되, 총 정산금액은 25억으로 하며 추후 실제 공사비로 정산처리한다'는 내용으로 정산합의를 하였다.
마. 피고는 2016. 10. 21. 원고에게 기성고 공사대금에 관하여 다음과 같은 내용의 확인서를 작성하였다.

바. 원고는 2016. 12. 5. 피고에게 기성고 공사대금을 2,319,739,682원(부가세 별도)으로 산정한 정산내역서를 송부하였고, 같은 날 재차 기성고 공사대금을 2,245,779,049원(부가세 별도)로 산정한 정산내역서를 송부하였다. 이후 원고는 2016. 12. 12. 기성고 공사대금을 1,996,800,000원(부가세 별도)으로 산정한 정산내역서를 송부하였다.