基因型分型 基因型分型英語genotyping又称基因分型是利用生物檢定法检测某一个体DNA序列的过程同时可将目标序列比对另一个体序列或参考序列来确定个体基因型差异常用于显示该个体等位基因从其父母遗传而来的情况通常基因型分型利用DNA序列定义群体信息而不涉及定义该个体的基因 目前的基因型分型方法包括限制性片段長度多態性识别法英语restriction fragment length polymorphismRFLPI多态随机扩增检测法RAPD扩增片段長度多态性识别法AFLPD聚合酶链式反应PCRDNA测序等位基因专有低核苷酸探针检测法探针检测法英文allele specific oligonucleotide ASO probes以及基因微阵列混合法基因型分型对于研究与疾病相关的基因和基因变体极其重要但囿于目前技术几乎所有的基因型分型都只能部分完成每个个体仅有一小部分的基因型被分型新的大规模DNA测序技术  保证未来我们可以获得全基因组基因分型 基因型分型广泛用微生物例如病毒与细菌 均可被基因型分型由此我们通常可以追溯疾病暴发的源头以更好的控制病原体的传播 此领域常被命名为分子流行病学并与法医学与微生物学息息相关 对于人类的基因型分型亦有重要意义例如如需追溯某个体的遗传学父亲或母亲只需十至二十段基因组区间即可如单核苷酸多态性英語SNP相比于人类全基因组多达三十亿的核苷酸这是极小的一部分 当对转基因有机体进行基因型分型时通常只需检测一段基因组区间即可一个聚合酶链式反应常常足以完成转基因小鼠的分型这对当今哺乳动物的医学实验极其重要 常用的基因型分型算法和工具包括GATK  Mach 等其中适用于家族研究的工具包括FamLDCaller LDIV 等