系统发生学 系统发生学 系统发生学英語phylogenetics又称种系发生学谱系发生学亲缘关系学简称谱系学或發生學是研究及推理生物个体或群体例如物种或种群间演化史及关系的科学方法属于系统分类学的一部分 系统发生学的推理方法通常在性状演变的特定模型下评估可观察到的遗传性状例如DNA序列或生物形态来假定这些生物间的关系这种分析推理方法的结果就是系统发生phylogeny也称为系统发生树phylogenetic tree可显示一群生物演化史的关系图解假说系统发生树的尖端可以是生物体或化石且代表演化谱系中的现今生物或末端生物 利用系统发生学来分析种系的基本原则是两个演化支具有相同的性状状态是它们对于共有祖先同一状态的保留而现存生物的性状就是演化史的纪录可作为重建演化史的依据由系统发生分析的原则建构了支序分类学的基本逻辑而系统发生分析已成为理解生物多样性演化生态学和基因组的核心 系统发生学这个概念不单止用于生物种系的发生與发展还会用在系统分类学各个层面的分类单元上面它也会被用到某一性状在种系发生过程中的演化这一方面