甲基绿 甲基绿CI 是和煌绿相关的染色阳离子后者早在世纪就用于对DNA染色它一直作为经典UnnaPappenheim染色的一部分用于染色细胞核也用于细胞核的对比染色英语Counterstain 近年来甲基绿与DNA结合时的荧光性质使其可用于活细胞核的远红外线成像荧光DNA染色通常用于预测癌症在琼脂糖英语Agarose凝胶荧光测定英语Fluorometric assays和流式细胞术中甲基绿也可作为DNA的替代染色剂它还可以用作细胞的排除活力英语Viability assay染色剂甲基绿和DNA的相互作用是非插层英语intercalation biochemistry的也就是说甲基绿没有插入DNA而是和DNA的大沟以静电相互作用 在中性水溶液中用或 nm的光激发时甲基绿就会分别在或 nm处产生荧光DNA是否存在不会影响甲基绿的荧光性质在中性水溶液中和DNA结合时甲基绿也会在远红光中发出荧光最大激发波长为 nm最大发射波长则为 nm 商业的甲基绿试剂经常有结晶紫杂质它们可以通过氯仿萃取除去