基因簇 基因簇Gene cluster是指生物基因組中數個排列成簇且通常屬於同一基因家族的基因可編碼功能相似但不完全相同的蛋白質基因簇中的各個基因通常距離接近不超過數個kb這些基因可能是最早是由同一基因經基因重複而產生因有另一副本的基因表現正常蛋白質重複基因的突變受到的選汰壓力較小經許多世代後累積許多變異而與編碼和原本基因功能有關但不完全相同的蛋白質基因簇中的基因數目可由數個至數十個不等但通常不超過個同源異形基因Hox即為典型案例此類基因為動物發育過程所需經常在動物基因組中排列成基因簇例如黑腹果蠅基因組中有個Hox基因皆在其號染色體右臂排列成觸足複合群英语Antennapedia和雙胸複合群英语Bithorax complex兩組基因簇前者包含個基因控制頭部與胸部的發育後者則包含個基因控制胸部與腹部的發育另外人類基因組中編碼血紅素β次單元β球蛋白英语βglobin組蛋白以及生長激素的數個基因也分別組成基因簇 基因簇與串連重複基因英语Tandemly arrayed genesTAG性質類似兩者差異在於基因簇中數個基因雖距離接近但彼此距離均不同基因可能順向排列或反向排列基因功能通常有差異且其間的間隔序列也不同串連重複基因則為整段基因數次重複形成其中基因序列排列方向與功能通常相同例如核糖體DNA基因基因簇與串連重複基因中的基因都會發生基因轉換使其序列趨於相似此外串連重複基因還會因減數分裂時不均等的互換重組而改變其重複數目並使序列一致化基因簇則較少發生不均等重組基因簇可能發生變異而逐漸轉為串連重複基因反之串連重複基因也可能變異形成基因簇