多重序列比對 多重序列比對Multiple sequence alignmentMSA是對三個以上的生物學序列biological sequence如蛋白質序列DNA序列或RNA序列所作的序列比對一般來說是輸入一組假定擁有演化關係的序列從MSA的結果可推導出序列的同源性而種系發生關係也可引導出這些序列共同的演化始祖如右圖般的視覺化敘述可描繪出各種突變事件例如點突變的單格變化或是如刪除突變與插入突變可使各個序列之間產生鴻溝MSA常用來研究序列的保守性或是蛋白質結構域的三級結構與二級結構甚至是個別的氨基酸或核苷酸