连锁不平衡 群体遗传学中 连锁不平衡英語linkage disequilibriumLD是指给定种群中不同基因座位点上的等位基因之间的非随机关联性当两个位点的不同等位基因的关联频率高于或低于独立随机关联的条件下的期望频率时就称两者是连锁不平衡的对于那些重组后位点或者基因型的频率等于预期时称之为连锁平衡这些位点既可能在同一条染色体上也可以在不同的染色体上连锁不平衡性也被称作配子水平的不平衡性或配子不平衡性从另一个角度讲连锁不平衡是等位基因或者遗传标记在一个种群中表现出高于或低于由等位基因的随机频率而预测的单模标本的频率连锁是指染色体上的两个或者多个位点进行有限的组合但连锁不平衡性不等同于遗传连锁 连锁不平衡的程度取决于多方面的因素包括遗传连锁自然选择基因重组的概率突变率英语mutation rate遗传漂变婚配制度选型交配以及种群结构因此基因组中连锁不平衡的模式是构建它的群体遗传过程的一个强有力的信号 尽管名字叫连锁不平衡但不同位点上不存在遗传连锁的等位基因之间可能存在连锁不平衡且与等位基因频率是否处于平衡无关不随时间变化此外连锁不平衡有时被称为配子相英语gametic phase不平衡但是该概念同样适用于无性生物因此不依赖于配子的存在