LTR反轉錄轉座子 LTR反轉錄轉座子LTR retrotransposon是生物基因組中一類編碼區兩端具有長末端重複序列LTR的反轉錄轉座子長度介於bp至kb之間其mRNA可被反轉錄成DNA後再插入基因組中作用機制類似反轉錄病毒特別是反轉錄病毒目英语Ortervirales的病毒但相較於反轉錄病毒可形成病毒顆粒離開細胞LTR反轉錄轉座子僅能在原本的細胞中複製增殖LTR反轉錄轉座子在植物基因組中占比很高如小麥基因組有高達的序列為LTR反轉錄轉座子 LTR反轉錄轉座子可依序列分為Tycopia類Tygypsy類與BELPao類分別與假病毒科轉座病毒科和Belpaoviridae的反轉錄病毒相似前兩者均存在於動物植物真菌與其他真核生物基因組中後者則僅見於部分動物基因組此類元件通常具有gag與pol英语Pol HIV兩基因兩者均編碼多聚蛋白轉譯後需經蛋白酶進一步切割gag編碼的蛋白可在細胞中形成類病毒顆粒英语Viruslike particlepol則編碼蛋白酶反轉錄酶RNA酶H與整合酶可在類病毒顆粒中將轉座子的mRNA反轉錄LTR反轉錄轉座子由宿主細胞的RNA聚合酶轉錄產生包含gag與pol的mRNA有些轉座子的gag與pol融合成單一開放閱讀框有些則在中間具有可致核糖體移碼的序列因僅有部分核糖體轉譯完gag的序列後發生移碼而繼續轉譯pol的序列生成的gag蛋白數量將多於pol蛋白不過大部分LTR反轉錄轉座子已因累積大量突變而不能表現這些蛋白因此失去轉位能力可表現者通常也只在宿主發育的某些階段表現 LTR反轉錄轉座子與脊椎動物的內源性反轉錄病毒ERV區別是後者具有編碼包膜蛋白env的基因前者則無但文獻中經常有混用的狀況且許多內源性反轉錄病毒丟失了編碼蛋白的序列有些LTR反轉錄轉座子新獲得類似env蛋白的序列使兩者差異更趨模糊LTR反轉錄轉座子獲得env基因後可能轉變為內源性反轉錄病毒如黑腹果蠅的gypsy LTR反轉錄轉座子即多出了類似env編碼膜蛋白的基因而具感染其他細胞的能力成為一反轉錄病毒反之內源性反轉錄病毒丟失env後也可能轉為LTR反轉錄轉座子LTR反轉錄轉座子與內源性反轉錄病毒在人類細胞中大多不活躍表現但皆可能影響宿主細胞的基因表現調控異常時甚至可能激活免疫反應而造成自體免疫疾病有些LTR反轉錄轉座子與內源性反轉錄病毒融入宿主基因組後漸演化出新功能衍生成為宿主的新基因 有些LTR反轉錄轉座子還具有編碼其他蛋白的開放閱讀框其功能尚不清楚有些LTR反轉錄轉座子則失去了編碼gag與pol蛋白的開放閱讀框例如植物的微型末端重复反转录转座子TRIM需仰賴其他移動元件編碼的反轉錄酶等酵素才能複製增殖