基因共表达网络 基因共表达网络是一种无向图每个节点代表基因如果二者存在明显的共表达关系就用一个边连接两个节点 对不同的样本或者不同的实验条件建立基因表达谱后可以通过查看不同样本间产生相似表达模式的基因对建立基因共表达网络原因是两个共表达基因在不同的样本中应以相同模式变化共同表达的基因是由同一转录控制程序控制功能相关同一通路或蛋白结构的组成部分所以基因共表达网络具有生物学意义 基因共表达网络不指定共表达关系的方向和类型然而在基因调控网络中边是有方向的代表着反应变换互作激活或者抑制的生化过程而基因共表达网络并不尝试判定因果关系边只代表基因之间的相关或者依赖关系有类似功能或参与统一生物功能的基因会产生很多相互作用在基因共表达网络中会体现为模块或连接丰富的子图 基因共表达网络一般是用高通量基因表达谱技术如微阵列和RNA测序生成的数据集建立的