距离矩阵 在数学中 一个距离矩阵是一个各項元素為点之间距离的矩阵二维数组因此给定N个欧几里得空间中的点其距离矩阵就是一个非负实数作为元素的NN的对称矩阵距离矩阵和邻接矩阵概念相似其区别在于后者仅包含元素点之间是否有連邊并没有包含元素点之间的连通的距离的訊息因此距离矩阵可以看成是邻接矩阵的加权形式 举例来说我们分析如下二维点a至f在这里我们把点所在像素之间的欧几里得度量作为距离度量 其距离矩阵为 距离矩阵的这些数据可以进一步被看成是图形表示的热度图如下图所示其中黑色代表距离为零白色代表最大距离 在生物信息学中距离矩阵用来表示与坐标系无关的蛋白质结构还有序列空间中两个序列之间的距离这些表示被用在结构比对序列比对还有在核磁共振X射线和结晶学中确定蛋白质结构 有时候距离矩阵也被称作相似性矩阵