長末端重複序列 長末端重複序列Long terminal repeat簡稱LTR是真核生物基因組中某些反轉錄轉座子內源性反轉錄病毒或反轉錄病毒序列兩端長數百bp的成對序列最早由AP Czernilofsky和約翰沙恩英语John Shine於年在家禽白血病病毒英语Avian sarcoma leukosis virus序列中發現此類元件通常可編碼反轉錄酶與整合酶以將其自身序列複製後再插入基因組中人類基因組中即有至的序列為帶有長末端重複序列的內源性反轉錄病毒在病毒插入基因組時成對的長末端重複序列應為相同並隨時間逐漸發生變異因此成對長末端重複序列的差異可被用於分子演化研究以測定該元件插入基因組的時間但基因轉換等機制可能影響此方法測定年代的結果 以HIV為例其長末端重複序列長bp可細分為UR與U三個區域在宿主基因組中端的長末端重複序列可作為啟動子與多種轉錄因子結合端的長末端序列則可作為切割與多腺苷酸化的訊號此外還編碼一輔助蛋白Nef