自由能微扰 自由能微扰 英語Free Energy Perturbation 縮寫FEP是用来计算自由能的一种常用方法最早由R W Zwanzig在年提出以正则系综为例从状态A到状态B的自由能变化可以由下式算出 Δ F  A  B   F B  F A   k B T ln   exp    H B  H A k B T   A displaystyle Delta FArightarrow BFBFAkBTln leftlangle exp leftfrac HBHAkBTrightrightrangle A 其中T为温度 H A displaystyle HA 和 H B displaystyle HB 分别为状态A和状态B的哈密顿量 k B displaystyle kB 为玻尔兹曼常数   displaystyle langle rangle  表示在状态A的系综中取系综平均简单而言为了计算状态A与状态B之间的自由能差只需通过在状态A的系综中对两状态之间的能量差采样然后求平均即可采样可以使用分子动力学或者蒙特卡洛方法模拟