가상 스크리닝

가상 스크리닝(영어: virtual screening, VS)은 약물 표적, 일반적으로 단백질 수용체 또는 효소에 결합할 가능성이 가장 높은 구조를 식별하기 위해 저분자 라이브러리를 검색하는 약물 발견에 사용되는 컴퓨터 기술이다. 가상 스크리닝은 컴퓨터 프로그램을 사용하여 "매우 큰 화합물 라이브러리를 자동으로 평가"하는 것으로 정의되었다. 이 정의에서 알 수 있듯이 가상 스크리닝은 1060개 이상의 상상할 수 있는 화합물의 막대한 화학 공간을 합성, 구매, 테스트할 수 있는 관리 가능한 숫자로 필터링할 수 있는 방법에 초점을 맞춘 숫자 게임이었다. 약물 표적 약물 발견 Gillet V (2013). “Ligand-Based and Structure-Based Virtual Screening” (PDF). The University of Sheffield.  Rester U (July 2008). “From virtuality to reality - Virtual screening in lead discovery and lead optimization: a medicinal chemistry perspective”. 《Current Opinion in Drug Discovery & Development》 11 (4): 559–68. PMID 18600572.  Rollinger JM, Stuppner H, Langer T (2008). 〈Virtual screening for the discovery of bioactive natural products〉. 《Natural Compounds as Drugs Volume I》. 《Progress in Drug Research. Fortschritte der Arzneimittelforschung. Progrès des Recherches Pharmaceutiques》. Progress in Drug Research 65. 211, 213–49쪽. doi:10.1007/978-3-7643-8117-2_6. ISBN 978-3-7643-8098-4. PMC 7124045. PMID 18084917.  Walters WP, Stahl MT, Murcko MA (1998). “Virtual screening – an overview”. 《Drug Discov. Today》 3 (4): 160–178. doi:10.1016/S1359-6446(97)01163-X.  Bohacek RS, McMartin C, Guida WC (1996). “The art and practice of structure-based drug design: a molecular modeling perspective”. 《Med. Res. Rev.》 16 (1): 3–50. doi:10.1002/(SICI)1098-1128(199601)16:1<3::AID-MED1>3.0.CO;2-6. PMID 8788213.  Melagraki G, Afantitis A, Sarimveis H, Koutentis PA, Markopoulos J, Igglessi-Markopoulou O (May 2007). “Optimization of biaryl piperidine and 4-amino-2-biarylurea MCH1 receptor antagonists using QSAR modeling, classification techniques and virtual screening”. 《Journal of Computer-Aided Molecular Design》 21 (5): 251–67. Bibcode:2007JCAMD..21..251M. doi:10.1007/s10822-007-9112-4. PMID 17377847. S2CID 19563229.  Afantitis A, Melagraki G, Sarimveis H, Koutentis PA, Markopoulos J, Igglessi-Markopoulou O (February 2006). “Investigation of substituent effect of 1-(3,3-diphenylpropyl)-piperidinyl phenylacetamides on CCR5 binding affinity using QSAR and virtual screening techniques”. 《Journal of Computer-Aided Molecular Design》 20 (2): 83–95. Bibcode:2006JCAMD..20...83A. CiteSeerX 10.1.1.716.8148. doi:10.1007/s10822-006-9038-2. PMID 16783600. S2CID 21523436.  Eckert H, Bajorath J (March 2007). “Molecular similarity analysis in virtual screening: foundations, limitations and novel approaches”. 《Drug Discovery Today》 12 (5–6): 225–33. doi:10.1016/j.drudis.2007.01.011. PMID 17331887.  Willett P (December 2006). “Similarity-based virtual screening using 2D fingerprints” (PDF). 《Drug Discovery Today》 (Submitted manuscript) 11 (23–24): 1046–53. doi:10.1016/j.drudis.2006.10.005. PMID 17129822.  Fara DC, Oprea TI, Prossnitz ER, Bologa CG, Edwards BS, Sklar LA (2006). “Integration of virtual and physical screening”. 《Drug Discovery Today: Technologies》 3 (4): 377–385. doi:10.1016/j.ddtec.2006.11.003. PMC 7105924.  Muegge I, Oloffa S (2006). “Advances in virtual screening”. 《Drug Discovery Today: Technologies》 3 (4): 405–411. doi:10.1016/j.ddtec.2006.12.002. PMC 7105922.  Schneider G (April 2010). “Virtual screening: an endless staircase?”. 《Nature Reviews. Drug Discovery》 9 (4): 273–6. doi:10.1038/nrd3139. PMID 20357802. S2CID 205477076.  VLS3D – list of over 2000 databases, online and standalone in silico tools