スフィンゴモナス属

スフィンゴモナス属（Sphingomonas）はグラム陰性の非芽胞形成好気性桿菌。スフィンゴモナス目スフィンゴモナス科に属し、それらのタイプ属である。タイプ種はスフィンゴモナス・パウシモビリス（Sphingomonas paucimobilis）である。属名は、細胞壁を構成するスフィンゴ脂質に因む。GC含量は59から64。 水中や土壌に生息する。かつてはシュードモナス目シュードモナス科のシュードモナス属に分類されていたが、細胞壁がリポ多糖ではなくスフィンゴ脂質でできていることから細分類されて本属ができた。2001年に発表された系統分析結果によりスフィンゴビウム属（Sphingobium）、ノボスフィンゴビウム属（Novosphingobium）及びスフィンゴピクシス属（Sphingopyxis）が分離された。スフィンゴ脂質の生産のために産業用に培養されるほか、バイオレメディエーションへの利用が研究されている。 2023年現在、正式には158種が承認されている。 スフィンゴモナス・アバシー Sphingomonas abaci Busse et al. 2005 スフィンゴモナス・アドハエシバ Sphingomonas adhaesiva Yabuuchi et al. 1990 スフィンゴモナス・アエロラータ Sphingomonas aerolata Busse et al. 2003 スフィンゴモナス・アエロフィラ Sphingomonas aerophila Kim et al. 2014 スフィンゴモナス・アエスツアリイ Sphingomonas aestuarii Roh et al. 2009 スフィンゴモナス・アグリ Sphingomonas agri Siddiqi et al. 2017 スフィンゴモナス・アルバ Sphingomonas alba Siddiqi et al. 2023 スフィンゴモナス・アルバーテンシス Sphingomonas albertensis Tambong et al. 2022 Sphingomonas aliaeris Heidler von Heilborn et al. 2021 Sphingomonas alpina Margesin et al. 2012 Sphingomonas anseongensis Siddiqi et al. 2023 スフィンゴモナス・アンタルティカ Sphingomonas antarctica Huang et al. 2017 スフィンゴモナス・アクアティカ Sphingomonas aquatica Choi et al. 2017 スフィンゴモナス・アクアティーリス Sphingomonas aquatilis Lee et al. 2001 Sphingomonas aracearum Wang et al. 2019 Sphingomonas arantia Jia et al. 2016 スフィンゴモナス・アレナエ Sphingomonas arenae Dong et al. 2022 スフィンゴモナス・アサッカロリティカ Sphingomonas asaccharolytica Takeuchi et al. 1995 Sphingomonas astaxanthinifaciens Asker et al. 2008 スフィンゴモナス・アウランティアカ Sphingomonas aurantiaca Busse et al. 2003 スフィンゴモナス・アゾティフィゲンス Sphingomonas azotifigens Xie and Yokota 2006 Sphingomonas baiyangensis Wei et al. 2022 スフィンゴモナス・ブレビス Sphingomonas brevis Siddiqi et al. 2023 スフィンゴモナス・カナデンシス Sphingomonas canadensis Abraham et al. 2013 スフィンゴモナス・カンナビナ Sphingomonas cannabina Jeon et al. 2022 スフィンゴモナス・カロティニファシエンス Sphingomonas carotinifaciens Madhaiyan et al. 2017 Sphingomonas carri Lee et al. 2017 スフィンゴモナス・カベルナエ Sphingomonas cavernae Zhu et al. 2022 Sphingomonas changbaiensis Zhang et al. 2010 Sphingomonas changnyeongensis Park et al. 2020 Sphingomonas chungangi Akter and Huq 2020 スフィンゴモナス・シトリ Sphingomonas citri Feng et al. 2022 Sphingomonas citricola Feng et al. 2022 Sphingomonas colocasiae Lin et al. 2018 Sphingomonas corticis Li et al. 2020 スフィンゴモナス・クレメア Sphingomonas cremea Park et al. 2023 スフィンゴモナス・クロコディリ Sphingomonas crocodyli Sheu et al. 2019 スフィンゴモナス・クルスティコーラ Sphingomonas crusticola Zhang et al. 2017 スフィンゴモナス・サイナラエ Sphingomonas cynarae Talà et al. 2013 Sphingomonas daechungensis Huy et al. 2014 スフィンゴモナス・デゼルティ Sphingomonas deserti Liu et al. 2019 Sphingomonas desiccabilis Reddy and Garcia-Pichel 2007 スフィンゴモナス・ディフィシリス Sphingomonas difficilis Feng et al. 2017 スフィンゴモナス・ドクドンエンシス Sphingomonas dokdonensis Yoon et al. 2006 スフィンゴモナス・エキノイデス Sphingomonas echinoides (Heumann 1962) Denner et al. 1999 スフィンゴモナス・エダフィ Sphingomonas edaphi Kim et al. 2020 Sphingomonas endophytica Huang et al. 2012 スフィンゴモナス・ファエニ Sphingomonas faeni Busse et al. 2003 スフィンゴモナス・ファウシウム Sphingomonas faucium Liu et al. 2016 Sphingomonas fennica Wittich et al. 2007 スフィンゴモナス・フラバ Sphingomonas flava corrig. Du et al. 2015 Sphingomonas flavalba Zhou et al. 2019 Sphingomonas floccifaciens Fan et al. 2019 スフィンゴモナス・フォリイ Sphingomonas folii Feng et al. 2022 スフィンゴモナス・フォンティコーラ Sphingomonas fonticola Sheu et al. 2015 スフィンゴモナス・フォモセンシス Sphingomonas formosensis Lin et al. 2012 Sphingomonas frigidaeris Lee and Jeon 2017 Sphingomonas gei Zhu et al. 2015 Sphingomonas gellani Madhaiyan et al. 2021 Sphingomonas gilva Zhu et al. 2019 Sphingomonas gimensis Feng et al. 2014 Sphingomonas ginkgonis Cha et al. 2019 Sphingomonas ginsengisoli An et al. 2013 Sphingomonas ginsenosidimutans Choi et al. 2011 Sphingomonas glacialis Zhang et al. 2011 Sphingomonas gotjawalisoli Lee et al. 2017 Sphingomonas guangdongensis Feng et al. 2014 Sphingomonas haloaromaticamans Wittich et al. 2007 Sphingomonas hankookensis Yoon et al. 2009 Sphingomonas hankyongi Siddiqi et al. 2023 Sphingomonas hengshuiensis Wei et al. 2015 スフィンゴモナス・ホミニス Sphingomonas hominis Zhang et al. 2021 Sphingomonas hylomeconis Akbar et al. 2015 スフィンゴモナス・インスラエ Sphingomonas insulae Yoon et al. 2008 スフィンゴモナス・ジャポニカ Sphingomonas japonica Romanenko et al. 2009 Sphingomonas jaspsi Asker et al. 2007 Sphingomonas jatrophae Madhaiyan et al. 2017 Sphingomonas jeddahensis Wübbeler et al. 2017 スフィンゴモナス・ジェジュエンシス Sphingomonas jejuensis Park et al. 2012 スフィンゴモナス・ジンジュエンシス Sphingomonas jinjuensis Chung et al. 2011 Sphingomonas kaistensis Kim et al. 2007 スフィンゴモナス・コーリエンシス Sphingomonas koreensis Lee et al. 2001 Sphingomonas kyeonggiensis corrig. Son et al. 2014 Sphingomonas kyungheensis Son et al. 2013 Sphingomonas lacunae Sheu et al. 2020 スフィンゴモナス・ラクス Sphingomonas lacus Kim et al. 2015 Sphingomonas laterariae Kaur et al. 2012 スフィンゴモナス・レイデイ Sphingomonas leidyi (Poindexter 1964) Chen et al. 2012 Sphingomonas lenta Feng et al. 2019 Sphingomonas limnosediminicola Lee et al. 2017 スフィンゴモナス・ルテア Sphingomonas lutea Lee et al. 2016 Sphingomonas lycopersici Gao et al. 2023 スフィンゴモナス・マリ Sphingomonas mali Takeuchi et al. 1995 スフィンゴモナス・メロニス Sphingomonas melonis Buonaurio et al. 2002 スフィンゴモナス・メソフィラ Sphingomonas mesophila Li et al. 2019 Sphingomonas metalli Feng et al. 2016 スフィンゴモナス・モルスコルム Sphingomonas molluscorum Romanenko et al. 2007 Sphingomonas montana Manandhar et al. 2018 Sphingomonas montanisoli Xu et al. 2020 Sphingomonas montis Chaudhary et al. 2019 Sphingomonas morindae Liu et al. 2015 Sphingomonas mucosissima Reddy and Garcia-Pichel 2007 Sphingomonas naasensis Kim et al. 2014 Sphingomonas naphthae Chaudhary and Kim 2016 スフィンゴモナス・オレイ Sphingomonas olei Chaudhary and Kim 2017 スフィンゴモナス・オレイボランス Sphingomonas oleivorans Chen et al. 2018 Sphingomonas oligoaromativorans Han et al. 2014 スフィンゴモナス・オリゴフェノリカ Sphingomonas oligophenolica Ohta et al. 2004 Sphingomonas oryziterrae Chung et al. 2011 Sphingomonas paeninsulae Geng et al. 2019 スフィンゴモナス・パルマエ Sphingomonas palmae Madhaiyan et al. 2021 スフィンゴモナス・パルストリス Sphingomonas palustris Lee et al. 2017 スフィンゴモナス・パナシス Sphingomonas panacis Singh et al. 2017 Sphingomonas panacisoli Maeng et al. 2021 Sphingomonas panaciterrae Sukweenadhi et al. 2017 スフィンゴモナス・パニー Sphingomonas panni Busse et al. 2005 スフィンゴモナス・パラパウシモビリス Sphingomonas parapaucimobilis Yabuuchi et al. 1990 スフィンゴモナス・パウシモビリス Sphingomonas paucimobilis (Holmes et al. 1977) Yabuuchi et al. 1990 スフィンゴモナス・ファイロスファエラエ Sphingomonas phyllosphaerae Rivas et al. 2004 Sphingomonas piscinae Chen et al. 2016 Sphingomonas piscis Hyun et al. 2022 スフィンゴモナス・ピテュイトサ Sphingomonas pituitosa Denner et al. 2001 Sphingomonas pokkalii Menon et al. 2021 Sphingomonas polyaromaticivorans Luo et al. 2012 スフィンゴモナス・ポプリ Sphingomonas populi Li et al. 2020 Sphingomonas prati Manandhar et al. 2016 Sphingomonas profundi Yang et al. 2020 スフィンゴモナス・プルーニ Sphingomonas pruni Takeuchi et al. 1995 Sphingomonas pseudosanguinis Kämpfer et al. 2007 Sphingomonas psychrolutea Liu et al. 2015 Sphingomonas psychrotolerans Luo et al. 2022 Sphingomonas qilianensis Piao et al. 2016 Sphingomonas quercus Shen et al. 2022 Sphingomonas radiodurans Liu et al. 2022 スフィンゴモナス・リゾフィラ Sphingomonas rhizophila Yan et al. 2018 スフィンゴモナス・ロセイフラバ Sphingomonas roseiflava corrig. Yun et al. 2000 スフィンゴモナス・ルブラ Sphingomonas rubra Huo et al. 2011 Sphingomonas sabuli Kang et al. 2021 スフィンゴモナス・サングイニス Sphingomonas sanguinis corrig. Takeuchi et al. 1993 Sphingomonas sanxanigenens Huang et al. 2009 Sphingomonas sediminicola An et al. 2013 Sphingomonas segetis Lee and Whang 2020 Sphingomonas silvisoli Ko et al. 2017 Sphingomonas sinipercae Hyun et al. 2022 Sphingomonas solaris Tanner et al. 2020 スフィンゴモナス・ソリ Sphingomonas soli Yang et al. 2006 Sphingomonas spermidinifaciens Feng et al. 2017 Sphingomonas suaedae Zhang et al. 2020 Sphingomonas tabacisoli Zhou et al. 2018 スフィンゴモナス・テゥルエペリ Sphingomonas trueperi Kämpfer et al. 1997 Sphingomonas turrisvirgatae Thaller et al. 2018 Sphingomonas vulcanisoli Lee et al. 2015 スフィンゴモナス・シンジャンゲンシス Sphingomonas xinjiangensis An et al. 2011 スフィンゴモナス・ヤブウチアエ Sphingomonas yabuuchiae Li et al. 2004 Sphingomonas yantingensis Huang et al. 2014 スフィンゴモナス・ユンナンエンシス Sphingomonas yunnanensis Zhang et al. 2005 スフィンゴモナス・ジアエ Sphingomonas zeae Kämpfer et al. 2015 Sphingomonas zeicaulis Gao et al. 2016 [脚注の使い方] ^ a b Eiko Yabuuchi, Ikuya Yano, Hiroshi Oyaizu, Yasuhiro Hashimoto, Takayuki Ezaki, Hiroyuki Yamamoto (February 1990). “Proposals of Sphingomonas paucimobilis gen. nov. and comb. nov., Sphingomonas parapaucimobilis sp. nov., Sphingomonas yanoikuyae sp. nov., Sphingomonas adhaesiva sp. nov., Sphingomonas capsulata comb, nov., and Two Genospecies of the Genus Sphingomonas”. Microbiology and Immunology 34 (2): 99-119. doi:10.1111/j.1348-0421.1990.tb00996.x.  ^ a b “Validation of the Publication of New Names and New Combinations Previously Effectively Published Outside the IJSB”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 40 (3): 320-321. (01 July 1990). doi:10.1099/00207713-40-3-320.  ^ M. Takeuchi, F. Kawai, Y. Shimada, A. Yokota (July 1993). “Taxonomic Study of Polyethylene Glycol-Utilizing Bacteria: Emended Description of the Genus Sphingomonas and New Descriptions of Sphingomonas macrogoltabidus sp. nov., Sphingomonas sanguis sp. nov. and Sphingomonas terrae sp. nov.”. Systematic and Applied Microbiology 16 (2): 227-238. doi:10.1016/S0723-2020(11)80473-X.  ^ Guang-Da Feng, Song-Zhen Yang, Xiong Xiong, Hua-Ping Li, Hong-Hui Zhu (01 July 201). “Sphingomonas spermidinifaciens sp. nov., a novel bacterium containing spermidine as the major polyamine, isolated from an abandoned lead–zinc mine and emended descriptions of the genus Sphingomonas and the species Sphingomonas yantingensis and Sphingomonas japonica”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (7): 2160-2165. doi:10.1099/ijsem.0.001905. PMID 28691655.  ^ Aharon Oren, George Garrity (01 October 2017). “Notification that new names of prokaryotes, new combinations, and new taxonomic opinions have appeared in volume 67, part 7, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 67 (10): 3689-3691. doi:10.1099/ijsem.0.002285.  ^ Anton Hördt Marina García López, Jan P. Meier-Kolthoff, Marcel Schleuning, Lisa-Maria Weinhold, Brian J. Tindall, Sabine Gronow, Nikos C. Kyrpides, Tanja Woyke, Markus Göker (07 April 2020). “Analysis of 1,000+ Type-Strain Genomes Substantially Improves Taxonomic Classification of Alphaproteobacteria”. Frontiers in Microbiology 11: 468. doi:10.3389/fmicb.2020.00468.  ^ Aharon Oren, George Garrity (30 July 2020). “Notification of changes in taxonomic opinion previously published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (7): 4061-4090. doi:10.1099/ijsem.0.004245.  ^ M Takeuchi, K Hamana, A Hiraishi (01 July 2001). “Proposal of the genus Sphingomonas sensu stricto and three new genera, Sphingobium, Novosphingobium and Sphingopyxis, on the basis of phylogenetic and chemotaxonomic analyses”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 51 (4): 1405-17. doi:10.1099/00207713-51-4-1405. PMID 11491340.  ^ Jean P. Euzéby, Aidan C. Parte. “Genus Sphingomonas”. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. 2023年8月26日閲覧。