APAF1

APAF1（apoptotic peptidase activating factor 1）はアポトーシスに関与するタンパク質で、線虫Caenorhabditis elegansのCED-4のヒトホモログである。 APAF1遺伝子は、アポトーシス調節ネットワークの中心的なハブの1つを形成する細胞質タンパク質をコードする。APAF1タンパク質は（N末端から）CARDドメイン（英語版）、ATPアーゼドメイン（NB-ARC）、短いヘリカルドメイン、そして数個のWD40リピートドメインを含む。シトクロムcとdATPの結合に伴って、オリゴマーからなるアポトソームを形成する。アポトソームはカスパーゼ-9前駆体を結合して切断し、成熟した活性化型として放出する。この反応の正確な機構については未だ議論があるが、アポトソームはカスパーゼ-9の二量体化を誘導し、その後に自己触媒が行われることが示唆されている。活性化されたカスパーゼ-9はその後カスパーゼカスケードを刺激し、細胞をアポトーシスに従事させる。 選択的スプライシングによって、異なるアイソフォームをコードする7種類のバリアントが産生される。 APAF1は6本のヘリックスからなるグリークキーモチーフを持つCARDドメイン、ロスマンフォールド型のヌクレオチド結合ドメイン、短いヘリカルモチーフ、ウィングドヘリックス（winged-helix）ドメインを含む。 APAF1は次に挙げる因子と相互作用することが示されている。 APIP（英語版） BCL2L1（英語版） CASP9 HSPA4（英語版） NLRP1（英語版） ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000120868 - Ensembl, May 2017 ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000019979 - Ensembl, May 2017 ^ Human PubMed Reference: ^ Mouse PubMed Reference: ^ a b “Entrez Gene: APAF1 apoptotic peptidase activating factor 1”. 2021年11月7日閲覧。 ^ “Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3”. 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