ハプログループD (mtDNA)

ハプログループD (mtDNA)（ハプログループD (ミトコンドリアDNA)、英: Haplogroup D (mtDNA)）とは、分子人類学で用いられる、人類のミトコンドリアDNAハプログループ（型集団）の分類のうち、ハプログループMを祖先に持ち「4883 5178A 16362」により定義されるものである。 ハプログループDは48000年前に東アジアで誕生し、東アジア・東南アジア・北アジア・中央アジアそしてアメリカ大陸に至るまで広範囲に観察される。形質人類学におけるモンゴロイドの分布域と概ね重なる。日本人の約41%-42%がこの系統に属する、D4は日本人の30%以上が属す最も高頻度のグループとなっているが、D5は僅か5％程度となっている。長寿の傾向がある遺伝子とされている。 中国中部が起源とされるハプログループDは、35%以上の日本人が該当する最大のグループである。 日本以外では中国や朝鮮半島にも多く、東アジア集団を特徴づけるグループといえる。 「稲作の民」の祖先は、中国中部で原始的な稲作を開始し、その技術とともに日本へやって来たことで 弥生時代の到来に貢献したと考えられている。 大別すると「D4」と「D5・D6」という2つの系統がある。 D D4 (3010, 8414, 14668)　:日本人で最も多いグループであり、北東アジアでよくみられ、日本人、朝鮮民族などでは最も高頻度で観察されるタイプであり、とりわけ日本人に於いてその頻度が高い。 ウィルタ、ブリヤート、カルムイク人、テレンギト人などでも最もよく見られるタイプである。中国・中国西部・中央アジア、アメリカ先住民で広く観察される。パレオ・インディアンやロシア沿海州（悪魔の門）及び中国東北部の新石器時代初期の遺跡（吉林省大安市にあるホウタオムガ遺跡、内モンゴル自治区通遼市にあるハミンマンハ遺跡等）でも最も頻繁に見られるハプログループである。 D5・D6 (16189)　: D5はD4よりも長い歴史を持ち、3万7千年から3万2千年前頃に誕生したとされており、D5'6 (16189) は主に東アジアと東南アジア、特に中国、韓国、日本で見られます。 D5a2a2 サブクレードが流行しているが、アメリカ大陸への移動には参加していないようであり、中央アジア、北アジア、南アジアでの頻度は一般的に低い (57/423 = 13.48%) [51] )ヤクートの中で、歴史的にモンゴル拡大の圧力の下でシベリアに移住したテュルク語を話すグループ。。主に韓国、日本、中国南部で見られ、特に漢民族で観察頻度が高い、他は東南アジアでも見られる。英語版 。中央アジア、インド東部でも低頻度で見られるが、下位系統のD5a2a2がシベリアのヤクートでよくみられる。D5の有名人はAAAの西島隆弘、上田晋也、濱田龍臣、糸井重里。 ^ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). "Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation". Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. Retrieved 2009-05-20. ^ hmong.wiki. “ハプログループ D (mtDNA)” (英語). www.asianprofile.wiki. 2022年3月9日閲覧。 ^ "Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock Supplementary material" (PDF). 2009. pp. page89. ^ a b Asari, M (2007). “Utility of haplogroup determination for forensic mtDNA analysis in the Japanese population”. Leg Med 9 (5): 237–240. doi:10.1016/j.legalmed.2007.01.007. PMID 17467322.  ^ a b Umetsu, Kazuo; Tanaka, Masashi; Yuasa, Isao (2005). “Multiplex amplified product-length polymorphism analysis of 36 mitochondrial single-nucleotide polymorphisms for haplogrouping of East Asian populations”. Electrophoresis 26 (1): 91–98. doi:10.1002/elps.200406129. PMID 15624129.  ^ a b Maruyama, Sayaka; Minaguchi, Kiyoshi; Saitou, Naruya (2003). “Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population”. Int J Legal Med 117 (4): 218–225. doi:10.1007/s00414-003-0379-2. PMID 12845447.  ^ a b c d e f 篠田謙一『新版 日本人になった祖先たち―DNAが解明する多元的構造 (NHKブックス No.1255)』NHK出版、2019年3月25日。  ^ a b c d e f 篠田謙一「第7章」『DNAで語る 日本人起源論 (岩波現代全書)』岩波書店、2015年9月19日。  ^ a b c d e f “いつでもLOUPE:「現代日本人のもつDNA」”. blog.livedoor.jp. 2022年3月9日閲覧。 ^ a b c d “我々はどこから来たのか-最新研究からわかる弥生時代～古墳時代のヤポネシア人のDNAについて | にっぽん ってどんな国？”. にっぽん　ってどんな国？. 2022年3月9日閲覧。 ^ a b c d enki-eden. “古代史とミトコンドリア（ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａ）”. 古代史探訪. 2022年3月9日閲覧。 ^ a b c d “篠田謙一さんが語る、ミトコンドリアDNAでたどる人類の起源（1/2）”. BIG ISSUE ONLINE. 2022年3月9日閲覧。 ^ a b Derenko, M; Malyarchuk, B; Denisova, G; Perkova, M; Rogalla, U (2012). “Complete Mitochondrial DNA Analysis of Eastern Eurasian Haplogroups Rarely Found in Populations of Northern Asia and Eastern Europe”. PLoS ONE 7 (2): e32179. doi:10.1371/journal.pone.0032179. PMC 3283723. PMID 22363811. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3283723/.  ^ East Asian mtDNA haplogroup determination in Koreans: haplogroup-level coding region SNP analysis and subhaplogroup-level control region sequence analysis ^ Kong, Qing-Peng; Yao, Yong-Gang; Liu, Mu (2003). “Mitochondrial DNA sequence polymorphisms of five ethnic populations from northern China”. Hum Genet 113 (5): 391–405. doi:10.1007/s00439-003-1004-7. PMID 12938036.  ^ Zheng, H-X; Yan, S; Qin, Z-D; Wang, Y; Tan, J-Z (2011). “Major Population Expansion of East Asians Began before Neolithic Time: Evidence of mtDNA Genomes”. PLoS ONE 6 (10): e25835. doi:10.1371/journal.pone.0025835. PMC 3188578. PMID 21998705. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3188578/.  ^ Derenko, Miroslava; Malyarchuk, Boris; Grzybowski, Tomasz (2007). “Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations”. Am. J. Hum. Genet. 81 (5): 1025–1041. doi:10.1086/522933. PMC 2265662. PMID 17924343. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2265662/.  ^ Malhi, Ripan S.; Breece, Katherine E.; Schultz Shook, Beth A.; Kaestle, Frederika A. (2004). “Patterns of mtDNA Diversity in Northwestern North America”. Human Biology 76 (1): 33–54. doi:10.1353/hub.2004.0023. PMID 15222679.  ^ Malhi, Ripan S.; Mortensen, Holly M.; Eshleman, Jason A. (2003). “Native American mtDNA Prehistory in the American Southwest”. American Journal of Physical Anthropology 120 (2): 108–124. doi:10.1002/ajpa.10138. PMID 12541329.  ^ Wen, Bo; Li, Hui; Gao, Song (2005). “Genetic Structure of Hmong-Mien Speaking Populations in East Asia as Revealed by mtDNA Lineages”. Mol. Biol. Evol. 22 (3): 725–734. doi:10.1093/molbev/msi055. PMID 15548747.  ^ Hill, Catherine; Soares, Pedro; Mormina, Maru (2006). “Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians”. Mol. Biol. Evol. 23 (12): 2480–2491. doi:10.1093/molbev/msl124. PMID 16982817.  ^ Catherine Hill, Pedro Soares, Maru Mormina et al., "A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia", Am. J. Hum. Genet. (2007);80:29–43. ^ Kaewsutthi, Supannee; Phasukkijwatana, Nopasak; Joyjinda, Yutthana (Jul 2011). “Mitochondrial Haplogroup Background May Influence Southeast Asian G11778A Leber Hereditary Optic Neuropathy”. Invest Ophthalmol Vis Sci 52 (7): 4742–8. doi:10.1167/iovs.10-5816. PMID 21398275.  ^ Volodko, Natalia V.; Starikovskaya, Elena B.; Mazunin, Ilya O. (2008). “Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas”. The American Journal of Human Genetics 82 (5): 1084–1100. doi:10.1016/j.ajhg.2008.03.019. PMC 2427195. PMID 18452887. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2427195/.  ^ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC524407/ ^ “第10回 | いま注目の最先端研究・技術探検！ | 中高生と“いのちの不思議”を考える─生命科学DOKIDOKI研究室”. www.terumozaidan.or.jp. 2022年3月9日閲覧。 ^ Tanaka M et al. 2004, Mitochondrial Genome Variation in Eastern Asia and the Peopling of Japan Genome Res. 2004. 14: 1832-1850 ^ Peng, Min-Sheng; He, Jun-Dong; Liu, Hai-Xin; Zhang, Ya-Ping (2011). “Tracing the legacy of the early Hainan Islanders - a perspective from mitochondrial DNA”. BMC Evolutionary Biology 2011 (11): 46. doi:10.1186/1471-2148-11-46. PMC 3048540. PMID 21324107. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3048540/.  ^ Tabbada, Kristina A.; Trejaut, Jean; Loo, Jun-Hun (2010). “Philippine Mitochondrial DNA Diversity: A Populated Viaduct between Taiwan and Indonesia?”. Mol. Biol. Evol. 27 (1): 21–31. doi:10.1093/molbev/msp215. PMID 19755666.  ^ Fedorova, Sardana A; Reidla, Maere; Metspalu, Ene (2013). “Autosomal and uniparental portraits of the native populations of Sakha (Yakutia): implications for the peopling of Northeast Eurasia”. BMC Evolutionary Biology 2013 (13): 127. doi:10.1186/1471-2148-13-127. PMC 3695835. PMID 23782551. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3695835/.  ^ “mtDNA D5系統 - 有名人のハプログループ”. famousdna.wiki.fc2.com. 2022年3月9日閲覧。 表示 編集