カイステア科

カイステア科（Kaistiaceae）はプロテオバクテリア門アルファプロテオバクテリア綱ヒフォミクロビウム目の科の一つである。 グラム陰性、非運動性、好気性及び化学有機栄養性の球菌又は桿菌である。ゲノム配列から計算されたGC含量は約64.5～67.1%であるが、文献で報告されている範囲は61.6～69.0mol%である。 タイプ属となるカイステア属（Kaistia）は2004年にImらにより公表されたが、このとき、所属科は決定されていなかった。 2007年にGarrityらによりリゾビウム科（Rhizobiaceae）に分類されたが、その理論的根拠は明らかではなかった。 2020年に、アルファプロテオバクテリア綱の16S rRNA遺伝子配列及び分類体系の解析により、当時、どの科に所属するか不確定であったBauldia属とカイステア属は表現型をほぼ同じとし、遺伝子含有量分析では分岐群をある程度支持することから、新科としてカイステア科がヒフォミクロビウム目に追加された。 2022年にVasilyevaらはプロステコミクロビウム属（Prosthecomicrobium）をこの科に分類するよう論文発表した。 ^ a b c Anton Hördt, Marina García López, Jan P Meier-Kolthoff, Marcel Schleuning, Lisa-Maria Weinhold, Brian J Tindall, Sabine Gronow, Nikos C Kyrpides, Tanja Woyke, Markus Göker (07 April 2020). “Analysis of 1,000+ Type-Strain Genomes Substantially Improves Taxonomic Classification of Alphaproteobacteria”. Frontiers in Microbiology 11. doi:10.3389/fmicb.2020.00468. PMC 7179689. PMID 32373076. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7179689/.  ^ Aharon Oren, George Garrity (30 July 2020). “List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 70 (7): 4043-4049. doi:10.1099/ijsem.0.004244.  ^ Yarza P, Yilmaz P, Pruesse E, Glöckner FO, Ludwig W, Schleifer KH, Whitman WB, Euzéby J, Amann R, Rosselló-Móra R. (2014). “Uniting the classification of cultured and uncultured bacteria and archaea using 16S rRNA gene sequences”. Nat Rev Microbiol 12 (9): 635–45. doi:10.1038/nrmicro3330. hdl:10261/123763. PMID 25118885.  ^ Yee B, Oertli GE, Fuerst JA, Staley JT. (2010). “Reclassification of the polyphyletic genus Prosthecomicrobium to form two novel genera, Vasilyevaea gen. nov. and Bauldia gen. nov. with four new combinations: Vasilyevaea enhydra comb. nov., Vasilyevaea mishustinii comb. nov., Bauldia consociata comb. nov. and Bauldia litoralis comb. nov”. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60 (Pt 12): 2960–2966. doi:10.1099/ijs.0.018234-0. PMC 3052453. PMID 20118292. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3052453/.  ^ “Notification that new names and new combinations have appeared in volume 60, part 12, of the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61 (3). (01 March 2011). doi:10.1099/ijs.0.031948-0.  ^ a b Wan-Taek Im, Akira Yokota, Myung-Kyum Kim, Sung-Taik Lee. “Kaistia adipata gen. nov., sp. nov., a novel α-proteobacterium”. The Journal of General and Applied Microbiology 50 (5): 249-254. doi:10.2323/jgam.50.249. PMID 15747229.  ^ “Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 55 (3): 983-985. (01 May 2005). doi:10.1099/ijs.0.63767-0.  ^ J. P. Euzéby. “Family Kaistiaceae”. List of Prokaryotic Names with Standing in Nomenclature. 2023年3月14日閲覧。 ^ Garrity, G. M., Lilburn, T. G., Cole, J. R., Harrison, S. H., Euzéby, J., and Tindall, B. J. (2007). “Taxonomic Outline of the Bacteria and Archaea, Release 7.7 March 6, 2007. Part 3 – the bacteria: phylum “Proteobacteria”, class Alphaproteobacteria”. East Lansing: Michigan State University. https://mbio.bas-net.by/wp-content/uploads/2012/12/Part-9.pdf.  ^ L. Vasilyeva, D. Grouzdev, V. Koziaeva, Y. Berestovskaya, A. Novikov & N. Pimenov (23 September 2022). “Prosthecodimorpha staleyi gen. nov., sp. nov., Novel Prosthecate Bacteria within the Family Ancalomicrobiaceae and Reclassification of the Polyphyletic Genus Prosthecomicrobium”. Microbiology 91: 479–488. doi:10.1134/S0026261722601105.