プランクトミケス門

プランクトミケス門 (Planctomycetes、プランクトマイセス門) は、グラム陰性細菌の門で、幾つかの水生従属栄養細菌を含む。系統的にはウェルコミクロビウムやクラミジアに近縁で、合わせてPVC群（またはプランクトバクテリア）に属する。 タイプ属のPlanctomycesは、ギリシャ語のπλαγκτός（プランクトス/漂う）+μύκες（ミュケス/菌）をラテン語化したもので、「（水中で）浮遊する菌」との意を持つ。 原核生物の中では最も複雑な構造と生活環を持つグループの1つである[要出典]。形状は大まかに卵形であるが、柄を持つなど変わったところがあり、出芽によって増殖する点でも特異である。細胞壁は通常の細菌と異なりペプチドグリカンを含まないと考えられてきたが、最近になってプランクトミケス門細菌の細胞壁にもペプチドグリカンが存在することが確認された。また、細胞内に核膜のような構造を形成することでも知られる。原核生物においてこの構造は、プランクトミケスを含むPVC系統と、古細菌であるIgnicoccusにしか発見されていない。Gemmata obscuriglobusなどでは特に顕著で、細胞壁<細胞膜<paryphoplasm<内細胞膜<リボプラズマ<核様態と高度に分画されている上、エンドサイトーシスに似たタンパク質の取り込み機構が報告されている。これらの観測から、真核生物の起源にプランクトミケス門の生物が関与していたとする仮説も存在する。 これまでに知られている種は殆どが好気性の従属栄養生物であるが、プランクトミケス門の中で最初期に分岐したグループ（Brocadiales）は嫌気性で、嫌気的アンモニア酸化（Anammox）を行うことが知られている。この細菌類は亜硝酸を電子受容体としてアンモニアを窒素に酸化する特異な代謝系を備えている。また、ラデランという特殊な環状化合物からなる脂質分子が細胞膜を構成している。暫定的な系統分類としてBrocadia, Kuenenia, Anammoxoglobus, Scalindua, Jetteniaの5属約20種が提案されている。Anammox細菌は出芽ではなく分裂により増殖する点、細胞質内にエネルギー代謝を行う細胞内小器官アナモキソソームを有する点でも他のプランクトミケス門細菌と異なっている。 近年では水系だけでなく、土壌などからもプランクトミケス門の16S rRNA配列が見つかっている。 ピキスパエラ綱 Phycisphaerae ピキスパエラ目 Phycisphaerales ピキスパエラ科 Phycisphaeraceae Phycisphaera プランクトミケス綱 Planctomycetacia プランクトミケス目 Planctomycetales Gemmataceae - Fimbriiglobus - Gemmata- Telmatocola - Zavarzinella - Isosphaeraceae - Aquisphaera - Isosphaera - Paludisphaera - Singulisphaera - Tundrisphaera プランクトミケス科 Planctomycetaceae Blastopirellula - Bythopirellula - Candidatus Anammoximicrobium - Fuerstia - Gimesia - Mariniblastus - Pirellula - Planctomycrobium - Planctomyces - Planctopirus - Rhodopirellula - Roseimaritina - Rubinisphaera - Rubripirellula - Schresneria - Thermogutta - Tuwongella Candidatus Brocadiales Candidatus Brocadiaceae Candidatus Anammoxoglobus - Candidatus Brocadia - Candidatus Jettenia - Candidatus Kuenenia - Candidatus Scalindua Jenkins C, Kedar V, Fuerst JA (2002). “Gene discovery within the planctomycete division of the domain Bacteria using sequence tags from genomic DNA libraries”. Genome Biol 3 (6). PMID 12093378.  Fuerst JA (1995). “The planctomycetes: emerging models for microbial ecology, evolution and cell biology”. Microbiology 141: 1493-506. PMID 7551018.  ^ Wagner, Michael; Horn, Matthias (2006-06). “The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance” (英語). Current Opinion in Biotechnology 17 (3): 241–249. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0958166906000644.  ^ Jeske, Olga; Schüler, Margarete; Schumann, Peter; Schneider, Alexander; Boedeker, Christian; Jogler, Mareike; Bollschweiler, Daniel; Rohde, Manfred et al. (2015-05-12). “Planctomycetes do possess a peptidoglycan cell wall” (英語). Nature Communications 6 (1). doi:10.1038/ncomms8116. ISSN 2041-1723. PMC 4432640. PMID 25964217. http://www.nature.com/articles/ncomms8116.  ^ Lonhienne, Thierry G. A.; Sagulenko, Evgeny; Webb, Richard I.; Lee, Kuo-Chang; Franke, Josef; Devos, Damien P.; Nouwens, Amanda; Carroll, Bernard J. et al. (2010). “Endocytosis-like protein uptake in the bacterium Gemmata obscuriglobus”. Proceedings of the National Academy of Sciences 107 (29): 12883–12888.  ^ Devos, Damien P (2021-07-06). “Reconciling Asgardarchaeota Phylogenetic Proximity to Eukaryotes and Planctomycetes Cellular Features in the Evolution of Life”. Molecular Biology and Evolution 38 (9): 3531–3542. doi:10.1093/molbev/msab186. ISSN 1537-1719. PMC 8382908. PMID 34229349. https://doi.org/10.1093/molbev/msab186.  ^ Sinninghe Damsté, Jaap S.; Strous, Marc; Rijpstra, W. Irene C.; Hopmans, Ellen C.; Geenevasen, Jan A. J.; van Duin, Adri C. T.; van Niftrik, Laura A.; Jetten, Mike S. M. (2002-10). “Linearly concatenated cyclobutane lipids form a dense bacterial membrane” (英語). Nature 419 (6908): 708–712. doi:10.1038/nature01128. ISSN 0028-0836. http://www.nature.com/articles/nature01128.  ^ Oshiki, Mamoru; Satoh, Hisashi; Okabe, Satoshi (2016-01-18). “Ecology and physiology of anaerobic ammonium oxidizing bacteria” (英語). Environmental Microbiology 18 (9): 2784–2796. doi:10.1111/1462-2920.13134. ISSN 1462-2912. http://doi.wiley.com/10.1111/1462-2920.13134.  ^ van Niftrik, Laura (2013-08-09). “Cell biology of unique anammox bacteria that contain an energy conserving prokaryotic organelle” (英語). Antonie van Leeuwenhoek 104 (4): 489–497. doi:10.1007/s10482-013-9990-5. ISSN 0003-6072. http://link.springer.com/10.1007/s10482-013-9990-5.  Ignicoccus - 核膜の様な構造を持つ古細菌 表示 編集