ハプログループR (mtDNA)

ハプログループR (mtDNA) はユーラシアを中心に広く分布するミトコンドリアDNAハプログループである。このグループは約70,000年前の出アフリカ後の移住に関連している。ハプログループNを親系統に持ち、B、F、R0、JTなどの子系統を生み出した。 Soares et al. (2009)はハプログループRの誕生を66.8±14.2 kya (95% CI)（およそ80,000 - 50,000年前、おそらく65,000年前）と推定した。 このグループの分布は、現生人類の東アフリカから西、南、東南アジアへの移住と一致する。 およそ70,000年から60,000年前の間に、ハプログループM、N、およびRの初期の下位系統が出現したと考えられる。特に南アジアの先住民で幅広い多様性と古さを示しており、インド西部と南部のトライブとカーストは他の地域よりも多様性が高く、おそらく彼らの自生の地位を示唆している。シベリアのウスト・イシム人はハプログループR*に属している。 ハプログループRとその子孫は、オーストラリア、南北アメリカ、東南アジア、南アジア、中央アジア、西アジア、東アジア、ヨーロッパ、北アフリカ、アフリカの角に分布しているが、パラグループR*は、ソコトラ（1.2％）、北東アフリカ（1.5％）、中東（0.8％）、近東（0.8％）、アラビア半島（0.3％）に見られるため、このあたりが発祥地と考えられる。 ^ a b Soares, Pedro; Ermini, Luca; Thomson, Noel; Mormina, Maru; Rito, Teresa; Röhl, Arne; Salas, Antonio; Oppenheimer, Stephen et al. (2009). “Correcting for Purifying Selection: An Improved Human Mitochondrial Molecular Clock”. The American Journal of Human Genetics 84 (6): 740–59. doi:10.1016/j.ajhg.2009.05.001. PMC 2694979. PMID 19500773. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2694979/.  ^ Van Oven, Mannis; Kayser, Manfred (2009). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–94. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. https://semanticscholar.org/paper/60a61b8075898492176ba307b87e81481112f981.  ^ Larruga, Jose M (23 May 2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5442693/.  ^ Karmin, Monika (2005). Human mitochondrial DNA haplogroup R in India: dissecting the phylogenetic tree of South Asian-specific lineages (M.Sc. Thesis). University of Tartu. hdl:10062/567. OCLC 692161090 [要ページ番号] ^ Palanichamy, Malliya Gounder; Sun, Chang; Agrawal, Suraksha; Bandelt, Hans-Jürgen; Kong, Qing-Peng; Khan, Faisal; Wang, Cheng-Ye; Chaudhuri, Tapas Kumar et al. (2004). “Phylogeny of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India, Based on Complete Sequencing: Implications for the Peopling of South Asia”. The American Journal of Human Genetics 75 (6): 966–78. doi:10.1086/425871. PMC 1182158. PMID 15467980. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1182158/.  ^ Maji, Suvendu; Krithika, S.; Vasul, T.S. (2008). “Distribution of Mitochondrial DNA Macrohaplogroup N in India with Special Reference to Haplogroup R and its Sub-Haplogroup U”. International Journal of Human Genetics 8 (1–2): 85–96. doi:10.1080/09723757.2008.11886022. http://www.krepublishers.com/02-Journals/IJHG/IJHG-08-0-000-000-2008-Web/IJHG-08-1-2-001-256-2007-Abst-PDF/IJHG-08-1-2-085-08-336-Maji-S/IJHG-08-1&2-085-08-336-Maji-S-Tt.pdf.  ^ Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Larruga, Jose M; Cabrera, Vicente M (2016). “Carriers of human mitochondrial DNA macrohaplogroup M colonized India from southeastern Asia”. BMC Evolutionary Biology 16 (1): 246. doi:10.1186/s12862-016-0816-8. PMC 5105315. PMID 27832758. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5105315/.  ^ Larruga, Jose M; Marrero, Patricia; Abu-Amero, Khaled K; Golubenko, Maria V; Cabrera, Vicente M (2017). “Carriers of mitochondrial DNA macrohaplogroup R colonized Eurasia and Australasia from a southeast Asia core area”. BMC Evolutionary Biology 17 (1): 115. doi:10.1186/s12862-017-0964-5. PMC 5442693. PMID 28535779. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5442693/.  ^ Černý, Viktor (2009). “Out of Arabia—the settlement of island Soqotra as revealed by mitochondrial and Y chromosome genetic diversity”. American Journal of Physical Anthropology 138 (4): 439–447. doi:10.1002/ajpa.20960. PMID 19012329. オリジナルの6 October 2016時点におけるアーカイブ。. https://web.archive.org/web/20161006125303/http://ychrom.invint.net/upload/iblock/f30/Cerny%202009%20Out%20of%20ArabiarusThe%20Settlement%20of%20Island%20Soqotra%20as%20Revealed%20by%20Mitochondrial%20and%20Y.pdf 13 June 2016閲覧。.  表示 編集