コロナウイルス科

コロナウイルス科（コロナウイルスか、Coronaviridae）とは、ウイルスの分類においてエンベロープを持つ一本鎖プラス鎖RNAウイルスの科の一つ。2019年のICTVの分類では、ニドウイルス目コルニドウイルス亜目（Cornidovirineae）に属する。 「コロナウイルス（Coronavirus）」とは、コロナウイルス科（Coronaviridae）とオルトコロナウイルス亜科（Orthocoronavirinae）の通称で、Coronavirinaeという表記もある コロナウイルス科のウイルスゲノムの長さは約26 – 32キロベースで、RNAウイルスとしては最大級である。プラナリアで発見された41キロ塩基のニドウイルスに次いで2番目となる。 2018年のICTVの分類では、コロナウイルス科は、2亜科、5属、23亜属、約40種で構成されていた。 2019年のICTVの分類では、2亜科、5属、26亜属、46種となった。 Cornidovirineae（コルニドウイルス亜目） Coronaviridae（コロナウイルス科） Letovirinae（レトウイルス亜科） Alphaletovirus（アルファレトウイルス属） Milecovirus（マイルコウイルス亜属） Microhyla letovirus 1 Orthocoronavirinae（オルトコロナウイルス亜科） Alphacoronavirus（アルファコロナウイルス属） Colacovirus（コラコウイルス亜属） Bat coronavirus CDPHE15 Decacovirus（デカコウイルス亜属） Bat coronavirus HKU10 Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013 Duvinacovirus（ドゥヴィナコウイルス亜属） Human coronavirus 229E Luchacovirus（ルチャコウイルス亜属） Lucheng Rn rat coronavirus Minacovirus（ミナコウイルス亜属） Mink coronavirus 1 Minunacovirus（ミヌナコウイルス亜属） Miniopterus bat coronavirus 1 Miniopterus bat coronavirus HKU8 Myotacovirus（マイオタコウイルス亜属） Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011 Nyctacovirus（ニクタコウイルス亜属） Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013 Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398 Pedacovirus（ペダコウイルス亜属） Porcine epidemic diarrhea virus Scotophilus bat coronavirus 512 Rhinacovirus（ライナコウイルス亜属） Rhinolophus bat coronavirus HKU2 Setracovirus（セトラコウイルス亜属） Human coronavirus NL63 NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b Soracovirus（ソラコウイルス亜属） Sorex araneus coronavirus T14 Sunacovirus（スナコウイルス亜属） Suncus murinus coronavirus X74 Tegacovirus（テガコウイルス亜属） Alphacoronavirus 1 Betacoronavirus（ベータコロナウイルス属） Embecovirus（エンベコウイルス亜属） Betacoronavirus 1 China Rattus coronavirus HKU24 Human coronavirus HKU1 Murine coronavirus Myodes coronavirus 2JL14 Hibecovirus（ヒベコウイルス亜属） Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 Merbecovirus（メルベコウイルス亜属） Hedgehog coronavirus 1 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus Pipistrellus bat coronavirus HKU5 Tylonycteris bat coronavirus HKU4 Nobecovirus（ノベコウイルス亜属） Eidolon bat coronavirus C704 Rousettus bat coronavirus GCCDC1 Rousettus bat coronavirus HKU9 Sarbecovirus（サルベコウイルス亜属） Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus Deltacoronavirus（デルタコロナウイルス属） Andecovirus（アンデコウイルス亜属） Wigeon coronavirus HKU20 Buldecovirus（ブルデコウイルス亜属） Bulbul coronavirus HKU11 Common moorhen coronavirus HKU21 Coronavirus HKU15 Munia coronavirus HKU13 White-eye coronavirus HKU16 Herdecovirus（ヘルデコウイルス亜属） Night heron coronavirus HKU19 Gammacoronavirus（ガンマコロナウイルス属） Brangacovirus（ブランガコウイルス亜属） Goose coronavirus CB17 Cegacovirus（セガコウイルス亜属） Beluga whale coronavirus SW1 Igacovirus（イガコウイルス亜属） Avian coronavirus Avian coronavirus 9203 Duck coronavirus 2714 — ICTV,2019年 Letovirinae（レトウイルス亜科） Alphaletovirus（アルファレトウイルス属） Milecovirus（マイルコウイルス亜属） Microhyla letovirus 1（マイクロハイラレトウイルス1） Orthocoronavirinae（オルトコロナウイルス亜科） Alphacoronavirus（アルファコロナウイルス属） Colacovirus（コラコウイルス亜属） Bat coronavirus CDPHE15 Decacovirus（デカコウイルス亜属） Bat coronavirus HKU10 Rhinolophus ferrumequinum alphacoronavirus HuB-2013 Duvinacovirus（ドゥヴィナコウイルス亜属） Human coronavirus 229E（ヒトコロナウイルス229E） Luchacovirus（ルチャコウイルス亜属） Lucheng Rn rat coronavirus Minacovirus（ミナコウイルス亜属） Mink coronavirus 1 Minunacovirus（ミヌナコウイルス亜属） Miniopterus bat coronavirus 1（ミニオプテルスコウモリコロナウイルス1） Miniopterus bat coronavirus HKU8（ミニオプテルスコウモリコロナウイルスHKU8） Myotacovirus（マイオタコウイルス亜属） Myotis ricketti alphacoronavirus Sax-2011 Nyctacovirus（ニクタコウイルス亜属） Nyctalus velutinus alphacoronavirus SC-2013 Pipistrellus kuhlii coronavirus 3398 Pedacovirus（ペダコウイルス亜属） Porcine epidemic diarrhea virus（豚流行性下痢ウイルス） Scotophilus bat coronavirus 512 Rhinacovirus（ライナコウイルス亜属） Rhinolophus bat coronavirus HKU2 Setracovirus（セトラコウイルス亜属） Human coronavirus NL63（ヒトコロナウイルスNL63） NL63-related bat coronavirus strain BtKYNL63-9b Soracovirus（ソラコウイルス亜属） Sorex araneus coronavirus T14 Sunacovirus（スナコウイルス亜属） Suncus murinus coronavirus X74 Tegacovirus（テガコウイルス亜属） Alphacoronavirus 1（アルファコロナウイルス1） Betacoronavirus（ベータコロナウイルス属） Embecovirus（エンベコウイルス亜属） Betacoronavirus 1（ベータコロナウイルス1） Human coronavirus OC43（ヒトコロナウイルスOC43）（亜種Subspecies） China Rattus coronavirus HKU24 Human coronavirus HKU1（ヒトコロナウイルスHKU1） Murine coronavirus（ネズミ亜科コロナウイルス） Myodes coronavirus 2JL14 Hibecovirus（ヒベコウイルス亜属） Bat Hp-betacoronavirus Zhejiang2013 Merbecovirus（メルベコウイルス亜属） Hedgehog coronavirus 1 Middle East respiratory syndrome-related coronavirus（MERS-CoV, MERSコロナウイルス） Pipistrellus bat coronavirus HKU5（アブラコウモリコロナウイルス HKU5） Tylonycteris bat coronavirus HKU4（タケコウモリコロナウイルスHKU4） Nobecovirus（ノベコウイルス亜属） Eidolon bat coronavirus C704 Rousettus bat coronavirus GCCDC1（ルーセットコウモリコロナウイルスGCCDC1） Rousettus bat coronavirus HKU9（ルーセットコウモリコロナウイルスHKU9） Sarbecovirus（サルベコウイルス亜属） Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus（SARSr-CoV, SARS関連コロナウイルス） Severe acute respiratory syndrome coronavirus（SARS-CoV, SARSコロナウイルス） Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2（SARS-CoV-2, 新型コロナウイルス (2019年-)） Deltacoronavirus（デルタコロナウイルス属） Andecovirus（アンデコウイルス亜属） Wigeon coronavirus HKU20（ヒドリガモコロナウイルスHKU20） Buldecovirus（ブルデコウイルス亜属） Bulbul coronavirus HKU11（ヒヨドリコロナウイルスHKU11） Common moorhen coronavirus HKU21（バンコロナウイルスHKU21） Coronavirus HKU15（コロナウイルスHKU15） Munia coronavirus HKU13（ムニアコロナウイルスHKU13） White-eye coronavirus HKU16（メジロコロナウイルスHKU16） Herdecovirus（ヘルデコウイルス亜属） Night heron coronavirus HKU19（ゴイサギコロナウイルスHKU19） Gammacoronavirus（ガンマコロナウイルス属） Brangacovirus（ブランガコウイルス亜属） Goose coronavirus CB17（ガチョウコロナウイルスCB17） Cegacovirus（セガコウイルス亜属） Beluga whale coronavirus SW1（シロイルカコロナウイルスSW1） Igacovirus（イガコウイルス亜属） Avian coronavirus（トリコロナウイルス） Avian coronavirus 9203（トリコロナウイルス9203） Duck coronavirus 2714（アヒルコロナウイルス2714） 未分類（Unclassified Coronaviridae）以下のものがあるがこれら以外にも多数ある。 Asian leopard cat coronavirus Guangxi/F230/2006 Bat coroanvirus HpBtCoV/3740-1 Bat coroanvirus MfulBtCoV/3709 Chinese bamboo rat coronavirus Guangxi/B305/2005 Coronavirus Hare_CoV/La06_377/Lep_gra/ESP/2006 ^ a b c d e f g h i j k l m Virus Taxonomy: 2019 ReleaseICTV ^ “2017.012-015S” (xlsx) (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (October 2018). 14 May 2019時点のオリジナルよりアーカイブ。24 January 2020閲覧。 ^ “ICTV Taxonomy history: Orthocoronavirinae” (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). 24 January 2020閲覧。 ^ a b “Coronavirus - an overview | ScienceDirect Topics”. www.sciencedirect.com. 2020年4月2日閲覧。 ^ a b “A planarian nidovirus expands the limits of RNA genome size”. PLOS Pathogens 14 (11): e1007314. (November 2018). doi:10.1371/journal.ppat.1007314. PMC 6211748. PMID 30383829. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6211748/.  ^ “Virus Taxonomy: 2018 Release” (英語). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (October 2018). 24 January 2019閲覧。 ^ アメリカ国立生物工学情報センター. “Human coronavirus OC43”. www.ncbi.nlm.nih.gov. 2020年4月24日閲覧。 ^ 以下、All Species Search ResultVIPR,2020.4.22.閲覧 Virus Pathogen Database and Analysis Resource (ViPR): Coronaviridae[リンク切れ] 表示 編集 表示 編集