Biomarker

Biomarker on elusorganismi teatud karakteristik (tüüpiliselt organismis leiduv molekul, nt valk või DNA lõik), mille hulk või kontsentratsioon näitab organismi füsioloogilist seisundit, sh võimaldab hinnata toksiliste ainete poolt esile kutsutud füsioloogilisi muutusi organismis. Biomarkereid kasutatakse laialdaselt farmakoloogia- ja ökoloogiaeksperimentides (eriti ökotoksikoloogias). Selles valdkonnas võimaldab biomarkerite kindlakstegemine ja analüüs anda väärtuslikku informatsiooni toksilise aine biotoime kohta. Samuti on biomarkeri mõiste muutunud eriti laialdaselt kasutatavaks meditsiini ja biokeemia valdkondades. Biomarkeid saab liigitada kas tervisliku seisundi alusel, mille olemasolu on võimalik biomarkeri alusel tuvastada (nt vähi biomarker, endometrioosi biomarker) või biomarkeri täpsema rakendusliku väärtuse alusel, näiteks: Riskimarker võimaldab hinnata teatud haiguse tekke riski. Näiteks pärilikud mutatsioonid geenides BRCA1 ja BRCA2 suurendavad oluliselt munasarja- ja rinnavähi tekke riski. Diagnostiline marker võimaldab tuvastada juba olemasolevat haigust. Näiteks anomaalselt kõrge valgu PSA kontsentratsioon veres võib anda märku eesnäärmevähi olemasolust. Ennustuslik marker (ingl k predictive biomarker) võimaldab hinnata, kas teatud teraapia võiks olla konkreetse patsiendi jaoks tulemuslik või mitte (veel enne teraapia alustamist). Näiteks östrogeeni retseptorite tuvastamisel rinnavähi biopsias on mõttekas määrata patsiendile hormoonravi. Riskimarkeriga ning ka ennustusliku markeriga mõnevõrra sarnane mõiste on prognostiline marker, mis võimaldab hinnata, kui suure tõenäosusega patsiendi haiguse kulg või ravivastus lähiajal muutub. Monitoorimise biomarker võimaldab dünaamiliselt hinnata patsiendi seisundit. Näiteks veres ringleva vähist lähtunud DNA (ingl k circulating tumor DNA) hulga alusel saab jooksvalt hinnata patsiendi vähi progresseerumist või allumist teraapiale. Nagu iga analüütilise meetodiga, kaasneb ka biomarkerite tuvastusega teatud mõõtemääramatus ning valepositiivsete ja valenegatiivsete mõõtmistulemuste risk. Vähi biomarkerid Bioindikaator Biotest Strimbu, Kyle; Tavel, Jorge A. (2010). "What are biomarkers?". Current opinion in HIV and AIDS. 5 (6): 463–466. DOI:10.1097/COH.0b013e32833ed177. ISSN 1746-6318. PMC 3078627. PMID 20978388. Walker, C. H. (27. oktoober 1995). "Biochemical biomarkers in ecotoxicology--some recent developments". The Science of the Total Environment. 171 (1–3): 189–195. DOI:10.1016/0048-9697(95)04720-6. ISSN 0048-9697. PMID 7481746. Tuvikene, A. (2003). Toksilised ained Võrtsjärves. Rmt: Võrtsjärv. Loodus, aeg, inimene, Haberman, J., Pihu, E. & Raukas, A. (teadustoimetajad). Eesti Entsüklopeediakirjastus, lk 217–223 Califf, Robert M. (2018). "Biomarker definitions and their applications". Experimental Biology and Medicine (Maywood, N.J.). 243 (3): 213–221. DOI:10.1177/1535370217750088. ISSN 1535-3699. PMC 5813875. PMID 29405771. Saare, Merli; Anderson, Kristi; Karro, Helle; Salumets, Andres; Peters, Maire (22. juuni 2017). "Otsides nõela heinakuhjast – endometrioosi biomarkerid". Eesti Arst (inglise). DOI:10.15157/ea.v0i0.13516. ISSN 2228-1665. FDA-NIH Biomarker Working Group (29. november 2021). BEST (Biomarkers, EndpointS, and other Tools) Resource Glossary (inglise). Food and Drug Administration (US). "BRCA Gene Mutations | Bring Your Brave | CDC". www.cdc.gov (Ameerika inglise). 28. september 2021. Vaadatud 21. jaanuaril 2023. "Prostate-Specific Antigen (PSA) Test - NCI". www.cancer.gov (inglise). 21. märts 2022. Vaadatud 21. jaanuaril 2023. Taneja, Pankaj; Maglic, Dejan; Kai, Fumitake; Zhu, Sinan; Kendig, Robert D.; Fry, Elizabeth A.; Inoue, Kazushi (20. aprill 2010). "Classical and Novel Prognostic Markers for Breast Cancer and their Clinical Significance". Clinical Medicine Insights. Oncology. 4: 15–34. DOI:10.4137/cmo.s4773. ISSN 1179-5549. PMC 2883240. PMID 20567632. Osumi, Hiroki; Shinozaki, Eiji; Yamaguchi, Kensei (13. juuni 2020). "Circulating Tumor DNA as a Novel Biomarker Optimizing Chemotherapy for Colorectal Cancer". Cancers. 12 (6): 1566. DOI:10.3390/cancers12061566. ISSN 2072-6694. PMC 7352651. PMID 32545750. Shaw, Pamela A.; Pepe, Margaret S.; Alonzo, Todd A.; Etzioni, Ruth (1. veebruar 2009). "Methods for Assessing Improvement in Specificity when a Biomarker is Combined with a Standard Screening Test". Statistics in Biopharmaceutical Research. 1 (1): 18–25. DOI:10.1198/sbr.2009.0002. ISSN 1946-6315. PMC 2802069. PMID 20054437. Ismail, Adel Aa (2017). "When laboratory tests can mislead even when they appear plausible". Clinical Medicine (London, England). 17 (4): 329–332. DOI:10.7861/clinmedicine.17-4-329. ISSN 1473-4893. PMC 6297641. PMID 28765408. Ekelund, Suzanne (2012). "Biomarker assessment – what to be aware of". acutecaretesting.org. Vaadatud 21. jaanuaril 2023.