嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Gamma變異株

嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Gamma變異株（英語：SARS-CoV-2 Gamma variant），別名P.1譜系（英語：Lineage P.1） ，是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）的一種變異株，於2021年1月6日首次在日本東京發現。依據世界衛生組織命名法，P.1譜系被命名為Gamma變異株，目前Gamma變異株被列為「高關注變異株」（VOC）。 Gamma變異株一共有17種氨基酸變化，其中10種發生在刺突蛋白，包括了3種特別引起關注的突變： 「N501Y」、「E484K」和「K417T」。 Gamma變異株和在巴西傳播的另一種變異株：Zeta變異株（P.2譜系）有顯著的差異，Zeta變異株只攜帶「E484K」突變，並無其他兩種突變：「N501Y」和「K417T」。 2021年1月6日，日本國立感染症研究所從四位抵達東京的旅客中檢測出Gamma變異株，他們都曾去過巴西亞馬遜州。Gamma變異株是造成2021年初2019冠狀病毒病病例在亞馬遜州首府瑪瑙斯快速增加的原因之一。 2021年1月12日，巴西－英國CADDE中心在瑪瑙斯確認13例P.1譜系病例。在2020年3月至11月期間從瑪瑙斯收集的27份樣本中沒有發現P.1譜系，然而在2020年12月15日至23日期間從同城收集到的樣本中P.1譜系占42%（n=13/31），接著在2020年12月15日至31日期間收集的樣本中P.1譜系占52.2%（n=35/67），在2021年1月1日至9日期間收集的樣本中P.1譜系更達到了85.4%（n=41/48）。從2020年12月下旬到2021年1月9日期間，P.2譜系（Zeta變異株）迅速被P.1譜系取代，瑪瑙斯P.2譜系所占比重由25.4%急劇下降到6.3%。 奧斯瓦爾多·克魯茲基金會研究人員對亞馬遜州250份基因組樣本進行了研究，他們發現相比B.1.1.28譜系和B.1.195譜系病例，P.1譜系感染可以產生大約10倍的病毒載量，傳播力為2.2倍。P.1譜系對於18歲到59歲人群和60歲以上的老年人群具有同等的傳播力，顯示P.1譜系更易在年輕人之間傳播，無性別差異。 CADDE中心的研究顯示P.1譜系傳播力比以往的變異株高兩倍，而且可以避開大約32%的獲得性免疫（比如先前感染冠狀病毒），引發再次感染的可能性。P.1譜系的病死率比以往的變異株高1.5倍。 Gamma變異株的氨基酸突變（在SARS-CoV-2的基因組上作圖） Gamma變異株包括兩個子變異株：「28-AM-1」和「28-AM-2」，它們都帶有「K417T」、「E484K」和「N501Y」突變。 Gamma變異株有10種刺突蛋白突變，包含了N501Y和E484K。 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型變異株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Alpha變異株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Beta變異株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型變異株B.1.617譜系（Delta變異株及Kappa變異株） 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Lambda變異株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Mu變異株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Omicron變異株 其他名稱包括： – 20J/501Y.V3 – 高關注變異株-202101/02（VOC-202101/02） – 巴西變種病毒（Brazilian variant、Brazil variant） Public Health England. Variants: distribution of cases data. GOV.UK. 27 February 2021 [2021-02-27]. （原始内容存档于2021-06-07） （英语）.  Covid-19: Brazil virus already in UK 'not variant of concern', scientist says. www.bbc.com. 15 January 2021 [15 January 2021]. （原始内容存档于2021-11-14）.  COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern'. news.sky.com. 15 January 2021 [15 January 2021]. （原始内容存档于2021-11-14）.  Faria, Nuno R.; Claro, Ingra Morales. Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings. Virological. 2021-01-12 [2021-01-23]. （原始内容存档于2021-05-20） （英语）.  Lineage P.1. cov-lineages.org. [2021-04-21].  Covid-19: Brazil virus already in UK 'not variant of concern', scientist says. www.bbc.com. 2021-01-15 [2021-01-15]. （原始内容存档于2021-11-14）.  COVID-19: Virologist says Brazilian coronavirus variant detected in UK is not the one 'of concern'. 天空新聞台. 2021-01-15 [2021-01-15]. （原始内容存档于2021-11-14）.  Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil. Japan Today (日本). 2021-01-11 [2021-01-14]. （原始内容存档于2021-01-11）.  Tracking SARS-CoV-2 variants. www.who.int. [2021-06-01]. （原始内容存档于2021-06-09） （英语）.  Covid-19 Genomics UK Consortium. COG-UK Report on SARS-CoV-2 Spike mutations of interest in the UK (PDF). www.cogconsortium.uk. 2021-01-15 [2021-01-25]. （原始内容存档 (PDF)于2021-04-16）.  Oliver T.R. Toovey, Kirsty N. Harvey, Paul W. Bird, and Julian Wei-Tze Wei-Tze Tang. Introduction of Brazilian SARS-CoV-2 484K.V2 related variants into the UK. Journal of Infection. 3 February 2021, 82 (5): e23–e24. PMC 7857057 . PMID 33548358. doi:10.1016/j.jinf.2021.01.025.  Danner, Chas. What We Know About the New P.1 Strain of the Coronavirus. nymag.com. 2021-01-25 [2021-01-28]. （原始内容存档于2021-11-30）.  Nascimento, Valdinete; Souza, Victor. COVID-19 epidemic in the Brazilian state of Amazonas was driven by long-term persistence of endemic SARS-CoV-2 lineages and the recent emergence of the new Variant of Concern P.1. Research Square. 2021-02-25 [2021-03-02]. doi:10.21203/rs.3.rs-275494/v1. （原始内容存档于2021-03-01）.  Andreoni, Manuela; Londoño, Ernesto; Casado, Leticia. Brazil's Covid Crisis Is a Warning to the Whole World, Scientists Say - Brazil is seeing a record number of deaths, and the spread of a more contagious coronavirus variant that may cause reinfection.. 纽约时报. 2021-03-03 [2021-03-03]. （原始内容存档于2021-03-03）.  Zimmer, Carl. Virus Variant in Brazil Infected Many Who Had Already Recovered From Covid-19 - The first detailed studies of the so-called P.1 variant show how it devastated a Brazilian city. Now scientists want to know what it will do elsewhere.. 紐約時報. 1 2021-03-01 [2021-03-03]. （原始内容存档于2021-03-03）.  请检查|date=中的日期值 (帮助) Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, Candido DS, Mishra S, et al. Genomics and epidemiology of the P.1 SARS-CoV-2 lineage in Manaus, Brazil. Science. 2021-05-21, 372 (6544): 815–821. Bibcode:2021Sci...372..815F. ISSN 0036-8075. PMC 8139423 . PMID 33853970. doi:10.1126/science.abh2644 .  GISAID - hCov19 Variants. www.gisaid.org. [2021-08-09]. （原始内容存档于2021-06-23）.  Spike Variants: Gamma variant, aka P.1, B.1.1.28.1, 20J/501Y.V3 variant, and K417T/E484K/N501Y. covdb.stanford.edu. [2021-11-29]. （原始内容存档于2021-06-30） （英语）.  PANGO lineages （页面存档备份，存于互联网档案馆）（英文）