已測序的生物

已測序的生物指其基因組已經被完全測序的生物。其中部分生物的DNA序列已經被完全註釋，功能性的片段（如基因等）已作圖。 借助於基因組研究及高通量處理等技術，越來越多的生物的全部基因被人們獲得。自從1995年以來已經有150個基因組被解密，將近每個星期有新的物種添加進來。 下表是目前爲止已經被相當完全測序的生物。 Agrobacterium tumefaciens - Pflanzenpathogen（德语：pathogen）es Bakterium, tumorbildend Aquifex aeolicus - Hyperthermophiles Meeresbakterium Bacillus anthracis - Anthrax-Erreger Bacillus cereus - Erreger einer Lebensmittelvergiftung Bacillus halodurans - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt） Bacillus subtilis - Enzymproduzierendes Bakterium（Industriell genutzt） Bacteroides thetaiotaomicron - Darmbakterium Bifidobacterium longum - Darmbakterium Blochmannia floridanus - Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen（德语：Ernteameisen） Bordetella bronchiseptica（德语：Bordetella bronchiseptica） - Erreger chronischer Infektionen der Atemwege Bordetella parapertussis（德语：Bordetella parapertussis） - Erreger von mildem Keuchhusten Bordetella pertussis - Erreger von Keuchhusten Borrelia burgdorferi - Borreliose（德语：Borreliose）-Erreger Bradyrhizobium japonicum - Knöllchenbakterium der Sojabohne Brucella melitensis（德语：Brucella melitensis） - Erreger des Maltafiebers Brucella suis - potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend Buchnera aphidicola - Bakterium in Symbiose mit Blattläusen Burkholderia mallei - Erreger des Rotz（德语：Rotz）es bei Huftieren, auch humanpathogen（Einsatz als Biowaffe） Burkholderia pseudomallei - Erreger der Melioidose, vor allem in Südostasien Campylobacter jejuni - Erreger einer Lebensmittelvergiftung Caulobacter crescentus - Süßwasserbakterium Chlamydia muridarum - Atemwegsinfektionen bei Maus und Meerschweinchen Chlamydophila caviae - Augenentzündungen bei Meerschweinchen Chlamydia trachomatis - Erreger der Harnröhrenentzündung Chlamydophila pneumoniae（德语：Chlamydophila pneumoniae） - Erreger einer Bronchitis Chlorobium tepidum - Grünes Schwefelbakterium Chromobacterium violaceum - humanpathogenes Bakterium（Diarrhoe und andere Erkrankungen） Clostridium acetobutylicum - Aceton- und Butanol-produzierendes Bakterium Clostridium perfringens - Erreger Diarrhoe etc. Clostridium tetani - Tetanus-Erreger Corynebacterium diphtheriae（德语：Corynebacterium diphtheriae） - Erreger der Diphtherie Corynebacterium jeikeium（英语：Corynebacterium jeikeium） - nosokomial pathogener Hautbewohner Corynebacterium efficiens - Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a. Coxiella burnetti（英语：Coxiella burnetti） - Erreger des Q-Fieber Deinococcus radiodurans - extrem strahlungstolerantes Bakterium Desulfotalea psychrophila - extrem kältetolerantes Bakterium des arktischen Eismeer（德语：Eismeer）es Desulfovibrio vulgaris - Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling Enterococcus faecalis（德语：Enterococcus faecalis） - Darmbakterium（德语：Darmbakterien）, Modellorganismus Escherichia coli - Darmbakterium（德语：Darmbakterien）, Modellorganismus Fusobacterium nucleatum - Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag Haemophilus ducreyi - Erreger des Schanker（德语：Schanker） Haemophilus influenzae - Erreger einer Erkältung Helicobacter hepaticus - Erreger chronischer Hepatis und von Lebergeschwüren bei Mäusen. Helicobacter pylori - Erreger von Magengeschwüren Lactobacillus plantarum（英语：Lactobacillus plantarum） - Milchsäurebakterium Lactococcus lactis - Käsebakterium Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium Leptospira interrogans - Erreger der Leptospirosis Listeria innocua - nicht pathogene Listeria-Art Listeria monocytogenes - Erreger einer Lebensmittelvergiftung Mannheimia succiniciproducens - symbiotisches Bakterium im Magen von Kühen Mesoplasma florum - Bakterium mit extrem kleinen Genom Mesorhizobium loti - Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten Mycobacterium leprae - Erreger der Lepra Mycobacterium bovis（德语：Mycobacterium bovis） - Erreger der Rindertuberkulose（德语：Rindertuberkulose） Mycobacterium paratuberculosis（德语：Mycobacterium paratuberculosis） - Erreger der Rinderkrankheit Johne's Desease Mycobacterium tuberculosis - Erreger der Tuberkulose Mycoplasma gallisepticum - Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung bei Geflügel Mycoplasma genitalium - Erreger von Infektionen des Genitaltraktes Mycoplasma penetrans - Erreger von Entzündungen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus（AIDS） Mycoplasma pneumoniae - Erreger einer Bronchitis Mycoplasma pulmonis - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen Neisseria meningitidis - Erreger der Meningitis（Hirnhautentzündung） Nitrisomonas europaea - Nitratbakterium Oceanobacillus iheyensis - Tiefseebakterium Pasteurella multocida（德语：Pasteurella multocida） - Erreger von Vogelcholera, Ansteckender Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei Schweinen und Menschen u.a. Photorabdus luminescens - Bakterium in Symbiose mit insektenpathogen（德语：pathogen）en Fadenwürmern Porphyromonas gingivalis（英语：Porphyromonas gingivalis） - Erreger von Parodontose Prochlorococcus marinus（德语：Prochlorococcus marinus） - Meeresbakterium Pseudomonas aeruginosa - als Opportunist（德语：Opportunist） bei geschwächtem Immunsystem pathogen Pseudomonas putida - Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchung（德语：Verseuchung）en Pseudomonas syringae - Pflanzenpathogenes Bakterium, u. a. Tomatenschädling Ralstonia solanacearum - Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke（德语：Welke） bei Hunderten verschiedener Pflanzenarten Rhodopirellula baltica - Rotes Meeresbakterium Rhodopseudomonas palustris - Purpurbakterium Rickettsia conorii - Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber Rickettsia prowazekii - Erreger des Typhus Rickettsia sibirica - Erreger von Zeckenfieber in Nordasien Rickettsia typhi - Erreger des Mäusetyphus（auch humanpathogen） Salmonella typhi（英语：Salmonella typhi） - Erreger des Typhusfieber Salmonella typhimurium（德语：Salmonella typhimurium） - Erreger des Typhusfieber bei der Maus Shewanella oneidensis - Metallabbauendes Bodenbakterium Shigella flexneria - evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod Sinorhizobium meliloti（英语：Sinorhizobium meliloti） - Knöllchenbakterium des Alfalfa（德语：Alfalfa） Staphylococcus aureus - Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks Staphylococcus epidermidis - Hautbakterium, pathogen bei Wunden Streptococcus agalactiae（德语：Streptococcus agalactiae） - Erreger von schweren Neugeborene（德语：Neugeborene）ninfektionen, Meningitis u. a. Streptococcus mutans（德语：Streptococcus mutans） - Erreger von Karies Streptococcus pneumoniae - Erreger von Lungenentzündungen, Menigitis und Blutvergiftung（德语：Blutvergiftung）en Streptococcus pyogenes - Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks u. a. Streptomyces avermitilis（英语：Streptomyces avermitilis） - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt） Streptomyces coelicolor（德语：Streptomyces coelicolor） - Antibiotikaproduzierendes Bakterium（industriell genutzt） Thermoanaerobacter tengcongensis - Bakterium aus heißen Quellen in Volksrepublik China Thermotoga maritima - sehr säureliebendes Bakterium, reinigt Bergwerkshalden u. a. Thermus thermophilus - hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz in der PCR und anderswo. Treponema pallidum - Erreger der Syphilis Tropheryma whippley - Erreger der Whipple-Krankheit（德语：Whipple-Krankheit） Ureaplasma urealyticum - Erreger von Infektionen des Harn- und Genitaltraktes Vibrio cholerae - Erreger der Cholera Vibrio fischeri - Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird Vibrio parahaemolyticus - Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen Vibrio vulnificus - Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr von rohen Meeresorganismen führen. Wigglesworthia glossinidia - Erreger der Schlafkrankheit（德语：Schlafkrankheit） Wolinella succinogenes - Bakterium im Kuhmagen Xanthomonas axonopodis - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten Xanthomonas campestris - Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern Xylella fastidiosa - Pflanzenpathogenes Bakterium, schwerer Schädling in Obst-, Nuss（德语：Nuss）- und Kaffee-Plantagen in Nord- und Südamerika Yersinia pestis - Erreger der Pest Anabaena spec. - Fadenblaualge Gloeobacter violaceus - primitive Blaualge Synechococcus spec. - Meeres-Blaualge Synechocystis spec. - Meeres-Blaualge Thermosynechococcus elongatus - Thermophile Blaualge Leishmania infantum - 一種利什曼原蟲 Leishmania major - 一種利什曼原蟲 Plasmodium falciparum - 惡性瘧原蟲 Plasmodium yoelii yoelii - 約氏瘧原蟲，引起嚙齒動物瘧疾 Thalassiosira pseudonana - 一種海洋硅藻 Trypanosoma brucei - 一種錐體蟲 Trypanosoma congolense - 一種錐體蟲 Trypanosoma cruci - 一種錐體蟲 Trypanosoma vivax - 一種錐體蟲 Ashbya gossypii - 感染柑橘類和棉花的真菌 Aspergillus fumigatus - 煙麴黴，人類致病菌 Aspergillus nidulans - 構巢麴黴 Debaryomyces hansenii - 耐鹽的酵母 Encephalitozoon cuniculi - 一種單細胞微孢子蟲 Kluyveromyces lactis - 具有潛在藥用生産價值的酵母 Kluyveromyces waltii - 一種酵母 Magnaporthe grisea - 稻熱病菌 Neurospora crassa - 粗糙脈孢菌，橙色的麫包黴，模式生物 Phanerochaete chrysosporium - 白腐病病菌 Saccharomyces cerevisiae - 釀酒酵母，模式生物 Schizosaccharomyces pombe - 粟酒裂殖酵母 Trichoderma reesei = Hypocrea jecorina - 一種木黴 Yarrowia lipolytica - 一種酵母 Candida albicans - 白色唸珠菌，人類致病菌 物种 基因组大小和开放阅读框 文献 Sesamum indicum L. Sesame芝麻（2n = 26） 293.7 Mb, 10,656 orfs 1 Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2 Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3 Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4 Prunus persica Peach桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5 Aegilops tauschii山羊草（DD） 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6 Triticum urartu乌拉尔图小麦（AA） 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7 moso bamboo (Phyllostachys heterocycla)毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8 Cicer arietinum Chickpea 鹰嘴豆 ~738-Mb，28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740 Mb), 27,571 orfs 10 Prunus mume梅 280 Mb, 31,390 orfs 11 Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12 Gossypium hirsutum L.雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13 Citrus sinensis甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14 甜橙 367 Mb 15 Citrullus lanatus watermelon西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16 Betula nana dwarf birch，矮桦 450 Mb 17 Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻（产油藻类之一） 28.7 Mb，11,973 orfs 18 Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19 Hordeum vulgare L. barley大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb，26,159 high confidence orfs，53,000 low confidence orfs 20 Gossypium raimondii cotton雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976 orfs 21 Linum usitatissimum flax亚麻 302 mb (81%), 43,384 orfs 22 Musa acuminata banana香蕉 472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs 23 Cucumis melo L. melon甜瓜 375 Mb（83.3%）27,427 orfs 24 Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli梨（砀山酥梨） 512.0 Mb (97.1%), 42,812 orfs 25,26 Solanum lycopersicum番茄 760/900 Mb，34727 orfs 27 S. pimpinellifolium LA1589野生番茄 739 Mb Setaria狗尾草属（谷子、青狗尾草） 400 Mb，25000-29000 orfs 28,29 Cajanus cajan pigeonpea木豆 833 Mb，48,680 orfs 30 Nannochloropis gaditana一种海藻 ~29 Mb, 9,052 orfs 31 Medicago truncatula蒺藜苜蓿 350.2 Mb, 62,388 orfs 32 Brassica rapa白菜 485 Mb 33 Solanum tuberosum马铃薯（DM） 725 Mb,39031 orfs 34 Thellungiella parvula条叶蓝芥 13.08 Mb 29,338 orfs 35 Arabidopsis lyrata lyrata玉山筷子芥? 183.7 Mb, 32670 orfs 36 Fragaria vesca野草莓 240 Mb，34,809 orfs 37 Theobroma cacao可可 76% of 430 Mb, 28,798 orfs 38 Aureococcus anophagefferens褐潮藻 32 Mb, 11501 orfs 39 Selaginella moellendorfii江南卷柏 208.5 Mb, 34782 orfs 40 Jatropha curcas Palawan麻疯树 285.9 Mb, 40929 orfs 41 Oryza glaberrima光稃稻（非洲栽培稻） 206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs（>70% coverage） 42 Phoenix dactylifera棕枣 380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs 43 Chlorella sp. NC64A小球藻属 40000 Kb, 9791 orfs 44 Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs 45 Malus domestica (Malus x domestica) 苹果 742.3 Mb 46 Volvox carteri f. nagariensis 69-1b 一种团藻 120 Mb, 14437 orfs 47 Brachypodium distachyon 短柄草 272 Mb，25,532 orfs 48 Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆 1.1 Gb, 46430 orfs 49 Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana Tripsacum dactyloides var. meridionale 无法下载附表 50 Zea mays mays cv. B73玉米 2.06 Gb, 106046 orfs 51 Cucumis sativus 9930黄瓜 243.5 Mb, 63312 orfs 52 Micromonas pusilla金藻 21.7 Mb, 10248 orfs 53 Sorghum bicolor高粱 697.6 Mb, 32886 orfs 54 Phaeodactylum tricornutum三角褐指藻 24.6 Mb, 9479 orfs 55 Carica papaya L. papaya番木瓜 271 Mb (75%), 28,629 orfs 56 Physcomitrella patens patens小立碗藓 454 Mb, 35805 orfs 57 Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115 葡萄 504.6 Mb, 29585 orfs 58 Vitis vinifera PN40024 葡萄 475 Mb 59 Ostreococcus lucimarinus 绿色鞭毛藻 13.2 Mb, 7640 orfs 60 Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻 100 Mb, 15256 orfs 61 Populus trichocarpa 黑三角叶杨 550 Mb, 45000 orfs 62 Ostreococcus tauri 绿藻 12.6 Mb, 7892 orfs 63 Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 360.8 Mb, 37544 orfs 64 Thalassiosira pseudonana硅藻 25 Mb, 11242 orfs 65 Cyanidioschyzon merolae 10D红藻 16.5 Mb, 5331 orfs 66 Oryza sativa ssp. japonica粳稻 420 Mb, 50000 orfs 67 Oryza sativa L. ssp. Indica籼稻 420 Mb, 59855 orfs 68 Guillardia theta 蓝隐藻 551 Kb, 553 orfs 69 Arabidopsis thaliana Columbia 拟南芥 119.7 Mb, 31392 orfs 70 Anopheles gambiae - 冈比亚按蚊 Apis mellifera - 意蜂 Bos taurus cattle - 牛 Caenorhabditis briggsae - 一種線蟲 Caenorhabditis elegans - 秀麗隱桿線蟲，模式生物 Canis lupus familiaris dog- 狗 Ciona intestinalis - 玻璃海鞘 Ciona savignyi - 海鞘 Drosophila melanogaster - 黑腹果蠅，模式生物 Fugu rubripes - 河豚 Gallus gallus - 雞 Homo sapiens - 人 Mus musculus - 小鼠，模式生物 Pan troglodytes - 黑猩猩 Rattus norvegicus - 大鼠 Schistosoma haematobium - 埃及血吸虫 Culex quinquefasciatus - 库蚊 Solenopsis invicta - 火蚁 Nasonia vitripennis - 金小蜂 Linepithema humile - 阿根廷蚁 1 Zhang, H. et al. Genome sequencing of the important oilseed crop Sesamum indicum L. Genome Biology 14, 401 (2013). 2 Chen, J. et al. Whole-genome sequencing of Oryza brachyantha reveals mechanisms underlying Oryza genome evolution. Nat Commun 4, 1595 (2013). 3 Collén, J. et al. 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