真菌分类系统

真菌分类系统是关于真菌的科学分类法。19世纪至今，各学者对真菌的分类不尽相同，其中最常用的是安斯沃斯在1971年作出的分类系统。 1935年，恩斯特·贝西（Ernst Bessey）出版了美国第一本真菌学教科书。1950年，又出版了《真菌的形态和分类》一书，其中包含了他所创的“三纲一类”分类系统。 菌虫 Mycetozoa 藻状菌纲 Phycomyceteae 产子实体真菌类 Capormyceteae 子囊菌纲 Ascomyceteae 核菌 Pyrenomycetes 担子菌纲 Basidomyceteae 冬孢亚纲 Teliosporae 异担子亚纲 Heterobasidiae 层菌亚纲 Hymenomyceteae 腹菌亚纲 Gasteromyceteae 半知菌类 Imperfect Fungi 丛梗孢目 Moniliales 球壳孢目 Sphaeropsidales 黑盘孢目 Melanconiales 乔治·威拉德·马丁（George Willard Martin）继承了“三纲一类”的分类系统，并作了细化。 藻类 Algal group 菌类 Fungal group 集胞黏菌目 Acrasiales 网黏菌目 Labyrinthulales 根肿菌目 Plasmodiophorales 黏菌门 Myxomycetes 真菌门 Eumycetes 藻状菌纲 Phycomycetes 毛菌亚纲 Trichomycetes 卵菌亚纲 Oomycetes 接合菌亚纲 Zygomycetes 子囊菌纲 Ascomycetes 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae 真子囊菌亚纲 Euascomycetidae 担子菌纲 Basidiomycetes 异担子菌亚纲 Heterobasidiomycetes 同担子菌亚纲 Homobasidiomycetes 半知菌类 Fungi Imperfecti 亚历克索普洛斯（Alexopoulos）对之前混乱的分类单元名称进行了规范。其1952年的分类系统沿袭了“三纲一类”的分类系统。而1962年的分类系统开始放弃“三刚一类”的分类系统，将藻状菌纲分为6纲。 黏菌门 Myxomycophyta 黏菌纲 Myxomyceteae 根肿菌纲 Plasmodiophoreae 集胞黏菌纲 Acrasieae 真菌门 Eumycophyta 藻状菌纲 Phycomycetes 单鞭毛菌组 Uniflagellatae 双鞭毛菌组 Biflagellatae 无鞭毛菌组 Aplanatae 子囊菌纲 Ascomycetes 原子囊菌亚纲 Protoascomycetes 真子囊菌亚纲 Euascomycetes 不整子囊菌组 Plectoascomycetes 果子囊菌组 Pyenomycetes 盘子囊菌组 Disomycetes 担子菌纲 Basidiomycetes 半担子菌亚纲 Hemibasidiomycetes 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetes 半知菌类 Deuteromycetes 真菌门 Mycota 黏菌亚门 Myxomycotina 黏菌纲 Myxomycetes 真菌亚门 Eumycotina 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes 壶菌纲 Chytridiomycetes 丝壶菌纲 Hyphochytriomycetes 卵菌纲 Oomycetes 接合菌纲 Zygomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 子囊菌纲 Ascomycetes 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae 真子囊菌亚纲 Euascomycetidae 不整子囊菌 Plectomycetes 核菌 Pyrenomycetes 盘菌 Discomycetes 虫囊菌 Laboulbeniomycetes 腔囊菌亚纲 Loculoascomycetidae 担子菌纲 Basidiomycetes 异担子菌亚纲 Heterobasidiomycetidae 同担子菌亚纲 Homobasidiomycetidae 层菌 Hymenomycetes 腹菌 Gasteromycetes 半知菌纲 Deuteromycetes 真菌界 Myceteae 裸菌门 Gymnomycota 集胞裸菌亚门 Acrasiogymnomycotina 集胞菌纲 Acrasiomycets 原质体裸菌亚门 Plasmodiogymnomycotina 原柄菌纲 Protosteliomycetes 黏菌纲 Myxomycetes 鞭毛菌门 Mastigomycota 单鞭毛菌亚门 Haplomastigomycotina 壶菌纲 Chytridiomycetes 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes 双鞭毛菌亚门 Diplomastigomycotina 卵菌纲 Oomycetes 无鞭毛菌门 Amastigomycota 接合菌亚门 Zygomycotina 接合菌纲 Zygomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 子囊菌亚门 Ascomycotina 子囊菌纲 Ascomycetes 半子囊菌亚纲 Hemiascomycetidae 不整子囊菌亚纲 Plectomycetidae 层囊菌亚纲 Hemenoascomycetidae 核菌 Pyrenomycetes 盘菌 Discomycetes 虫囊菌亚纲 Laboulbeniomycetidae 腔囊菌亚纲 Loculoascomycetidae 担子菌亚门 Basidiomycotina 担子菌纲 Basidiomycetes 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetidae 层担子菌 Hemenomycetes 腹菌 Gasteromycetes 有隔担子菌亚纲 Phragmobasidiomycetidae 冬孢菌亚纲 Teliomycetidae 半知菌亚门 Deuteromycotina 半知菌形式纲 Deuteromycetes 芽孢亚纲 Blastomycetidae 丝孢亚纲 Hyphomycetidae 腔孢亚纲 Coelomycetidae 安斯沃斯分类系统采用了五界系统学说，在20世纪七八十年代广泛使用。安斯沃斯分类系统与亚历克索普洛斯分类系统较相似，其区别在于建立了3个新亚门，鞭毛菌亚门、接合菌亚门和半知菌亚门，并将子囊菌分为6个纲，半知菌亚门设3个纲。 真菌界 Fungi 黏菌门 Myxomycota 集胞黏菌纲 Acrasiomycetes 黏菌纲 Myxomycetes 水生黏菌纲 Hydromyxomycetes 根肿菌纲 Plasmodiophoromyecetes 真菌门 Eumycota 鞭毛菌亚门 Mastigomycotina 壶菌纲 Chytridiomycetes 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes 卵菌纲 Oomycetes 接合菌亚门 Zygomycotina 接合菌纲 Zygomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 子囊菌亚门 Ascomycotina 半子囊菌纲 Hemiascomycetes 不整子囊菌纲 Plectomycetes 核菌纲 Pyrenomycetes 盘菌纲 Discomycetes 虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes 腔囊菌纲 Loculoascomycetes 担子菌亚门 Basidiomycotina 冬孢菌纲 Teliomycetes 层菌纲 Hymenomycetes 隔担子菌亚纲 Phragmobasidiomycetidae 无隔担子菌亚纲 Holobasidiomycetidae 腹菌纲 Gasteromycetes 半知菌亚门 Deuteromycotina 芽孢纲 Blastomycetes 丝孢纲 Hyphomycetes 腔孢纲 Coelomycetes 卡弗利尔-史密斯分类系统是最早体现出真菌是多界演化的分类系统之一。其将半知菌归入到其有性阶段的分类单元中。 原生动物界 Protozoa 菌虫 Mycetozoa 藻界 Chromista 具长短鞭毛门 Heterokonta 真菌界 Fungi 古真菌门 Archemycota 壶菌纲 Chytridiomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 接合菌纲 Zygomycetes 子囊菌门 Ascomycota 担子菌门 Basidiomycota 唐纳德·J·S·巴尔（Donald J. S. Barr）1992年提出了巴尔分类系统。 原生动物界 Protozoa 黏菌门 Myxomycota 根肿菌门 Plasmodiophoromycota 藻界 Chromista 具长短鞭毛门 Heterokonta 假菌亚门 Pseudomycotina 卵菌纲 Oomycetes 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes 网黏菌亚门 Labyrinthitina 网黏菌纲 Labyrinthiomycetes 真菌界 Fungi 壶菌门 Chytridiomycota 接合菌门 Zygomycota 子囊菌门 Ascomycota 担子菌门 Basidiomycota 2001年出版的《真菌词典》第9版分类系统，根据rDNA测序等技术对第8版分类系统进行了修订。将子囊菌门分成6个纲，55个目，291个科；担子菌门原有的32个目合并为16个目；担子菌类酵母菌划分到3个不同类群中。 原生动物界 Protozoa 黏菌门 Myxomycota 网柱黏菌纲 Dictyosteliomycetes 黏菌纲 Myxomycetes 原柱黏菌纲 Protosteliomycetes 根肿菌门 Plasmodiophoromycota 根肿菌纲 Plasmodiophoromycetes 藻界 Chromista 丝壶菌门 Hyphochytriomycota 丝壶菌纲 Hyphochytridiomycetes 网黏菌门 Labyrinthumycota 网黏菌纲 Labyrinthumycetes 卵菌门 Oomycota 卵菌纲 Oomycetes 真菌界 Fungi 壶菌门 Chytridiomycota 壶菌纲 Chytridiomycetes 尾体菌纲 Rumpomycetes 接合菌门 Zygomycota 接合菌纲 Zygomycetes 毛菌纲 Trichomycetes 子囊菌门 Ascomycota 子囊菌纲 Ascomycetes 新床菌纲 Neolectomycetes 肺炎菌纲 Pneumocyctidomycetes 酵母菌纲 Saccharomycetes 裂殖酵母菌纲 Schizosaccharomycetes 外囊菌纲 Taphrinomycetes 担子菌门 Basidiomycota 担子菌纲 Basidiomycetes 锈菌纲 Urediniomycetes 黑粉菌纲 Ustilaginomycetes 2008年出版的《真菌詞典》第10版分類系統，對第9版的分類系統做了很大的調整，收錄了2001年～2008年之間的研究成果。該版將真菌界劃分7個門，底下分36綱、140目、560科、8283屬、97861種： 真菌界 Fungi 壶菌门 Chytridiomycota 尾体菌纲 Rumpomycetes 壶菌纲 Chytridiomycetes 單毛壺菌綱 Monoblepharidomycetes（新） 芽枝霉門 Blastocladiomycota（新） 芽枝霉綱 Blastocladiomycetes（新） 新美鞭菌門 Neocallimastigomycota（新） 新美鞭菌綱 Neocallimastigomycetes（新） 球囊菌門 Glomeromycota（新） 球囊菌綱 Glomeromycetes（新） 接合菌门 Zygomycota 毛菌纲 Trichomycetes 接合菌纲 Zygomycetes 地位未定 Incertae sedis（亞界） 虫霉菌亚门 Entomophthoromycotina 梳霉亞門 Kickxellomycotina 毛霉菌亚门 Mucoromycotina 捕虫霉菌亚门 Zoopagomycotina 子囊菌门 Ascomycota 子囊菌纲 Ascomycetes 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina） 星裂菌綱 Arthoniomycetes（新） 座囊菌綱 Dothideomycetes（新） 散囊菌綱 Eurotiomycetes（新） 虫囊菌纲 Laboulbeniomycetes（新） 茶漬菌綱 Lecanoromycetes（新） 錘舌菌綱 Leotiomycetes（新） 異極菌綱 Lichinomycetes（新） 圓盤菌綱 Orbiliomycetes（新） 盤菌綱 Pezizomycetes（新） 糞殼菌綱 Sordariomycetes（新） 酵母菌亚门 Saccharomycotina 酵母菌纲 Saccharomycetes 外囊菌亚门 Taphrinomycotina 新床菌纲 Neolectomycetes（又譯無絲盤菌綱） 肺炎菌纲 Pneumocystidomycetes 裂殖酵母菌纲 Schizosaccharomycetes 外囊菌纲 Taphrinomycetes 担子菌门 Basidiomycota 担子菌纲 Basidiomycetes 锈菌纲 Urediniomycetes 伞菌亚门 Agaricomycotina 伞菌纲 Agaricomycetes（新） 花耳纲 Dacrymycetes（新） 银耳纲 Tremellomycetes（新） 柄锈菌亚门 Pucciniomycotina 伞型束梗孢菌纲 Agaricostilbomycetes（新） 小纺锤菌纲 Atractiellomycetes（新） Classiculomycetes Classiculomycetes（新） 隱菌寄生菌纲 Cryptomycocolacomyctes（新） 囊擔子菌綱 Cystobasidiomycetes（新） 小葡萄菌纲 Microbotryomycetes（新） 混合菌纲 Mixiomycetes（新） 柄锈菌纲 Pucciniomycetes（新） 黑粉菌亚门 Ustilaginomycotina（新） 黑粉菌纲 Ustilaginomycetes 地位未定 Incertae sedis（亞門） 節擔菌綱 Wallemiomycetes（新） 真菌界 Fungi 子囊菌门 Ascomycota 盤菌亞門 Pezizomycotina（=子囊菌亞門 Ascomycotina） 地舌菌綱 Geoglossomycetes（參自地舌菌科 Geoglossaceae，譯名待查） 黑粉菌亚门 Ustilaginomycotina 根腫黑粉菌綱 Entorrhizomycetes 外擔子菌綱 Exobasidiomycetes 真菌主题 真菌分類表（待更新） 贺运春. 真菌学. : 65–71.  賀新生. 〈《菌物字典》第10版菌物分類新系統簡介〉. 《中國食用菌》. 2009, 28 (6): 頁59-61.  王征、戴玉成. 〈真菌生命之樹項目(Assembling the Fungal Tree of Life)和美國真菌系統學研究現狀〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁878-887.  陳今朝、圖力古爾. 〈無絲盤菌屬——中國無絲盤菌綱一新記錄屬〉. 《菌物學報》. 2009, 28 (6): 頁857-859.  Schoch CL, Wang Z, Townsend JP, Spatafora JW, 2009. Geoglossomycetes cl. nov., Geoglossales ord. nov. and taxa above class rank in the Ascomycota Tree of Life. Persoonia 22, 129-138.[1] （页面存档备份，存于互联网档案馆） Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based on multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2006, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.  Begerow D, Stoll M, Bauer R. A phylogenetic hypothesis of Ustilaginomycotina based upon multiple gene analyses and morphological data. Mycologia. 2007, 98 (6): 906–16. PMID 17486967. doi:10.3852/mycologia.98.6.906.