原生生物分類表

Tubulinea Arcellinida Leptomyxida Tubulinida 目未定及环境样本 Pelobiontea Pelobiontida Entamoebea Entamoebida Flabellinea Dactylopodida Dermamoebida Himatismenida Vannellida Myxomycetes Echinosteliales Liceales Physarales Trichiales Stemonitales 目未定 Dictyosteliomycetes Dictyosteliales Protosteliomycetes Protosteliales 纲未定及环境样本 Aconoidasida Haemosporida Piroplasmorida Conoidasida Archigregarinorida Eugregarinorida Neogregarinorida 目未定及环境样本 Coccidiasina Agamococcidiorida Eucoccidiorida Ixorheorida Protococcidiorida 目未定及环境样本 纲未定及环境样本 Diphyllatea Diphylleida Thecomonadea Ancyromonadida Apusomonadida Hemimastigida 纲未定及环境样本 Ascetosporea Claustrosporida Haplosporida Paramyxida Gromiidea Gromiida Phytomyxea Phagomyxida Plasmodiophorida 目未定 Imbricatea Euglyphida Thaumatomonadida Sarcomonadea Cercomonadida Metopiida 目未定 Thecofilosea Cryomonadida Tectofilosida Chlorarachnea Chlorarachniida Proteomyxidea Heliomonadida Leucodictyida Pseudosporida Reticulosida Spongomonadea Spongomonadida 纲未定及环境样本 Mesostigmatophyceae Mesostigmales 环境样本 Klebsormidiophyceae Klebsormidiales Zygnematophyceae Zygnematales Desmidiales Charophyceae Charales Coleochaetophyceae Coleochaetales 纲未定及环境样本 Chlorophyceae Chaetopeltidales Chaetophorales Chlorococcales Chlorocystidales Microsporales Oedogoniales Sphaeropleales Tetrasporales Volvocales 目未定及环境样本 Mamiellophyceae Mamiellales 目未定 Nephroselmidophyceae Nephroselmiales Pedinophyceae Pedinomonadales Scourfieldiales 目未定 Pleurastrophyceae Chlorodendrales Prasinococcales Pseudoscourfieldiales Pyramimonadales 目未定及环境样本 Trebouxiophyceae Chlorellales Oocystales Prasiolales Trebouxiales 目未定及环境样本 Ulvophyceae Acrosiphoniales Bryopsidales Chlorocystidales Cladophorales Dasycladales Ignatiales Oltmansiellopsidales Scotinosphaerales Trentepohliales Ulotrichales Ulvales 目未定及环境样本 纲未定及环境样本 Aphelidea Choanoflagellata Choanoflagellida Corallochytrea Corallochytrida Cristidiscoidea Ministeriida Nucleariida Mesomycetozoea Amoebidiales Dermocystida Eccrinales Ichthyophonida 目未定 纲未定 Chromeraceae Chromera Vitrellaceae Vitrella 纲未定 Colpodea Bryometopida Bryophryida Bursariomorphida Colpodida Cyrtolophosidida Sorogenida 目未定及环境样本 Litostomatea Cyclotrichida Haptorida Pleurostomatida Entodiniomorphida Trichostomatida Vestibuliferida 目未定及环境样本 Nassophorea Microthoracida Nassulida Synhymeniida 目未定 Oligohymenophorea Apostomatida Astomatophorida Pilisuctorida Astomatida Hymenostomatida Peniculida Mobilida Sessilida Philasterida Pleuronematida Thigmotrichida 目未定及环境样本 Phyllopharyngea Cryptogemmida Exogemmida Chlamydodontida Dysteriida Hypocomatida Rhynchodida Endogenida Evaginogenida Exogenida 目未定及环境样本 Plagiopylea Odontostomatida Plagyopylida 环境样本 Prostomatea Prorodontida Prostomatida 环境样本 Spirotrichea Choreotrichida Tintinnida Euplotida Kiitrichida Halteriida Oligotrichida Strombidiida Protocruziida Plagiotomida Sporadotrichida Stichotrichida Urostylida Armophorida Clevelandellida Odontostomatida Phacodiniida 目未定及环境样本 Heterotrichea Heterotrichida Licnophorida 环境样本 Karyorelictea Loxodida Protoheterotrichida Protostomatida 目未定及环境样本 纲未定及环境样本 Cryptomonadea Cryptomonadales Pyrenomonadales Tetragonidiales Goniomonadea Goniomonadales Katablepharidophyceae Katablepharidales 纲未定及环境样本 Blastodiniophyceae Blastodiniales Dinophyceae Dinophysiales Gymnodiniales Ptychodiscales Gonyaulacales Peridiniales Prorocentrales Chytriodiniales Desmocapsales Dinamoebales Dinocloniales †Hystrichosphaerida Phytodiniales Suessiales Thoracosphaerales Zooxanthellales 目未定 Noctiluciphyceae Noctilucales Syndiniophyceae Syndiniales Apicomonadea Colpodellida 目未定及环境样本 Colponemea Colponemida Ellobiopsea Ellobiopsida Perkinsea Perkinsorida 目未定 †Acritarcha †Acanthomorphitae †Diacromorphitae †Dinetromorphitae †Disphaeromorphitae †Herkomorphitae †Netromorphitae †Oomorphitae †Platymorphitae †Polygonomorphitae †Prismatomorphitae †Pteromorphitae †Sphaeromorphitae †Stephanomorphitae †Versimorphitae 目未定 纲未定及环境样本 Diplonemea Diplonemida Euglenoidea Euglenida Peranemida Petalomonadida Rhabdomonadida 目未定 Kinetoplastea Bodonida Trypanosomatida Postgaardea Postgaardida 纲未定及环境样本 Allogromioidia Allogromiida Athalamea Biomyxida †Fusulinidia †Fusulinida Miliolidia Miliolida Rotalidia Carterinida Globigerinida †Involutinida Lagenida Robertinida Rotaliida Silicoloculinida Spirillinida Textularidia Astrorhizida Textulariida Xenophyophorea †Paleodictyida Psamminida Stannomida 纲未定及环境样本 Glaucophyceae Cyanophorales Glaucocystales Gloeochaetales 目未定及环境样本 Jakobea Jakobida Malawimonadea Malawimonadida Carpediemonadea Carpediemonadida Anaeromonadida Trimastigida Oxymonadida Retortamonadea Retortamonadida Trepomonadea Enteromonadida Distomatida Giardiida Trichomonadea Lophomonadida Spirotrichonymphida Trichomonadida Trichonymphea Trichonymphida 纲未定及环境样本 Prymnesiophyceae Coccolithales Coccosphaerales Isochrysidales Phaeocystales Prymnesiales Syracosphaerales Zygodiscales †Arkhangelskiales †Discoasterales †Eiffelithales †Podorhabdales †Stephanolithiales †Watznaueriales Pavlovophyceae Pavlovales 纲未定及环境样本 Hyphochytriomycetes Hyphochytriales Labyrinthulomycetes Labyrinthulales Thraustochytriales 目未定及环境样本 Opalinea Slopalinida Bicosecophyceae Bicosoecales Pirsoniales Peronosporomycetes Albuginales Olpidiopsidales Peronosporales Pythiales Rhipidiales Leptomitales Salilagenidiales Saprolegniales Sclerosporales Anisolpidiales †Galtierella Lagenidiales Lagenismatales Myzocytiopsidales Rozellopsidales 目未定及环境样本 Chrysophyceae Chromulinales Chrysamoebidales Chrysapiales Chrysocapsales Chrysosphaerales Hibberdiales Hydrurales Ochromonadales Phaeothamniales Rhizochrysidales Thallochrysidales 目未定及环境样本 Eustigmatophyceae Eustigmatales 目未定及环境样本 Phaeothamniophyceae Phaeothamniales Pleurochloridellales 目未定及环境样本 Raphidophyceae Raphidomonadales 目未定及环境样本 Synurophyceae Synurales 目未定及环境样本 Phaeophyceae Ascoseirales Chordariales Cutleriales Desmarestiales Dictyosiphonales Dictyotales Durvillaeales Ectocarpales Fucales Laminariales Scytosiphonales Scytothamnales Sphacelariales Sporochnales Tilopteridales 目未定 Xanthophyceae Chloramoebales Heterogloeales Mischococcales Rhizochloridales Tribonematales Vaucheriales 目未定及环境样本 Chrysomerophyceae Chrysomeridales Actinochrysophyceae Actinophryida Ciliophryida Pedinellales Rhizochromulinales Dictyochales 目未定及环境样本 Pelagophyceae Pelagomonadales Sarcinochrysidales 目未定及环境样本 Bolidophyceae Bolidomonadales Coscinodiscophyceae Thalassiosirales Chrysanthemodiscales Melosirales Paraliales Aulacoseirales Orthoseirales Coscinodiscales Ethmodiscales Asterolamprales Arachnoidiscales Stictodiscales Stictocyclales Triceratiales Biddulphiales Hemiaulales Anaulales Lithodesmiales Corethrales Cymatosirales Rhizosoleniales Leptocylindrales Chaetocerotales 目未定及环境样本 Fragilariophyceae Fragilariales Tabellariales Licmophorales Rhaphoneidales Ardissoneales Toxariales Thalassionematales Rhabdonematales Striatellales Cyclophorales Climacospheniales Protoraphidales 目未定及环境样本 Bacillariophyceae Eunotiales Lyrellales Mastogloiales Dictyoneidales Cymbellales Achnanthales Naviculales Thalassiophysales Bacillariales Rhopalodiales Surirellales 目未定及环境样本 Xanthomonadophyceae Blastocystae Blastocystida 纲未定及环境样本 Heterolobosea Acrasida Lyromonadida Schizopyrenida 目未定及环境样本 Percolatea Percolomonadida Pseudociliatida Acantharea Arthracanthida Chaunacanthida Holacanthida Symphyacanthida 目未定及环境样本 Phaeodarea Phaeocalpida Phaeoconchida Phaeocystida Phaeodendrida Phaeogromida Phaeogymnocellida Phaeosphaerida Polycystina †Albaillellaria Archaeospicularia Collodaria Entactinaria †Latentifistularia Nassellaria Spumellaria 目未定及环境样本 Sticholonchea Taxopodida 环境样本 纲未定及环境样本 Rhodophyceae Bangiales Goniotrichales Porphyridiales Ahnfeltiales Pihiellales Corallinales Rhodogorgonales Hildenbrandiales Acrochaetiales Balbianiales Balliales Batrachospermales Colaconematales Nemaliales Palmariales Bonnemaisoniales Ceramiales Gelidiales Gigartinales Gracilariales Halymeniales Nemastomatales Plocamiales Rhodymeniales 目未定及环境样本 Cyanidiophyceae 纲未定及环境样本 其余的原生生物种类（包括早期原生生物种类及混合生物片段、X细胞寄生物）