O GII para YII2 estava travado para usar apenas o templates default para geração, impossibilitando que se pudesse duplicar e personalizar o meu próprio, pois o mesmo não iria aparecer no select box "Code Template" da forma que estava implementado.

Básicamente foi mudado para que se possa pegar todas as pastas dentro do diretório base seguindo as recomendações da arquitetura.