1) [doc_internal]
De pus sursele intr-un dir de genul: \\csp1\SharedDocs\Sources for External Libs\freeplane_a.b.c; unde a.b.c este versiunea. In cazul tau ar fi poate freeplane_build_2014-01-27, caci vad ca ai facut un build manual. Sugerez sa copiezi cu totul acolo (nu doar src; si ce s-a mai intamplat in timpul build, repo, etc).

2) ce licenta au librariile astea? sunt utile toate? ai sincronizat versiunea de jar cu sursele? 
3) nu cred ca trebuia sa le adaugi in classpath; pentru ca sunt puse deja in manifest; poate cele pentru SRC
4) In eclipse, referenced libs, vad o ciudatenie: org.flowerplatform.core..; si directorul lib nu se vede