Tools/initializeProject.bash.sh - 以下變更：

* 清理沒有版本追蹤的檔案
* Git 子模組在移除舊版本倉庫後不會保留（即使 .gitmodules 設定檔仍存在），在初始化程序中重新註冊它

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Tools/initializeProject.bash.sh - 程式碼美觀修正

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