По unix-соглашению (не знаю, гласному или не очень) PID файлы кладутся в /var/run с именем `<daemon-name>.pid`. Писать в `/var/run` могут только демоны, запускаемые ОС при загрузке, поэтому достаточно убрать точки в начале и дать им приличные имена, оставив расширение `.pid`.