Гемовер событие Должено генерировать сообщение, которое меняет сцену. Либо не ждать потоки. других вариантов  не вижу.
Merge remote-tracking branch 'origin/master'

Conflicts:
	src/controller/GameOverController.java
Структура контроллеров прекрасна
Структура контроллеров прекрасна