Update MarkdownTOC.py

githubのmarkdownだと、

```
<!-- MarkdownTOC -->
- 目次
<!-- /MarkdownTOC -->
```

<!-- MarkdownTOC -->
- 目次
<!-- /MarkdownTOC -->


こうなってしまうので、

```
<!-- MarkdownTOC -->
- 目次

<!-- /MarkdownTOC -->
```


<!-- MarkdownTOC -->
- 目次

<!-- /MarkdownTOC -->

こうなるようにしました。