ファイル配置の整理

redmine, jenkinsのファイルについて、コピー元とコピー先が対応するように整理した。
暫定処置：jenkinsのredmineプラグインインストールが失敗する

redmineディレクトリが存在すると、jenkinsのredmineプラグインの
インストールが失敗するため、カレントディレクトリを変更して処理する
ようにした。
submodule移動（リポジトリをクローンし直したほうがよい）
[WIP] apache設定ファイルを整理

ファイルの場所を移動しただけ。
現状はOS毎になっているが、2.2系と2.4系になるように整理する。
`redmine.conf` から `passenger.conf` を分割

* `passenger.conf` の内容は `passenger-install-apache2-module --snippet`
  で生成するようにした。
* OS環境依存の排除するためアプリケーションディレクトリ内でbundlerにより
  管理しているpassengerを使用するようにした。
  * passengerは `redmine/Gemfile.local` の設定で `bundle install` により
    インストールされている。
  * `mod_passenger.so` をアプリケーションディレクトリ内に生成するように
    変更した。