Fix for specinfra 2.0.0beta18

週末に specinfra 色々変えたので、それに合わせて書き換えてみました。

また、chown や chmod も specinfra 側で実装したので、それも使うようにしてます。

コミットログだけだと意図が伝わらないと思うので、これからコミットにコメントつけて説明しますー。

テストこけるところがあるけど、Vagrantに対して実行する部分はOKでした。
specinfra 側で `change_file_mode` というメソッドを実装したので、それを呼び出してます。