Update 01-06-01-Vagrant.md

Vagrant kütüphanelerin değil uygulamaların aynı olması için. Kütüphaneler için package manager kullanılıyor.

Ayrıca kafa karışıklığını önlemek için küçük bir örnek ekledim.
Merge pull request #10 from Aristona/patch-5

Update 01-06-01-Vagrant.md