[UPD] CTeNFePHP.class.php - getProtocol

Substituído o $i por 0 em $d->getElementsByTagName('infProt')->item($i) para que ele possa pegar os demais valores quando tiver maiss de elemento "protCTe". Os demais ajustes são somente para organizar um pouco melhor o cód.
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[UPD] CTeNFePHP.class.php - getProtocol