>Тред переходит в "несфокусированный" режим только при переключении вкладки или минимизации окна, что лично мне было не очень удобно, потому что я обычно переключаюсь с браузера на другие окна через Alt+Tab и при этом хочу, чтоб работал индикатор новых сообщений в треде.

Вот поэтому.