Добавляю папку с временным архивами в .gitignore
Добавление данных в бд вместе с хэшем и архивом
Изменяю константы для папок (добавляю / к концу имени папки)
Обновляю работу скрипта импорта

Теперь из базы данных берутся недостающие архивы. Устанавливается время для файлов в репозитории(согласно последней модификации архива). И многое другое...