Se mueve layout App a extensión layouts
Se junta app.js y mantenedor.js en app.js (aun se debe revisar el código)
Se mueven configuraciones de la aplicación a la configuración del proyecto comentadas, esto hace que sea más fácil la configuración y no tener que andar buscando configuraciones en las extensiones. Aquellas configuraciones que solo se deben especificar cuando se usa la extensión sowerphp/app han sido comentadas debidamente.