Probando lo que decía Jahiel.

Me debería de hacer falta agregar el archivo al index. Si este commit se hace, no me ha hecho falta.

-Editado-
Me ha hecho falta añadirlo al index. Creo que el index de este programa es distinto del index del Eclipse. Pruebo cambiando el modo a "Commit mode: Selected files". Se selecciona automáticamente el playercollision.js
A ver qué pasa.