とりあえずWPで書いたらこんなかんじに

bloginfoで各種URL取得
メニューはテンプレタグで
index.phpでheader.phpを読み込み
まだ動かしてない…
細かな修正

メニューの出力部分の変更など
masterの変更点の取り込み、そして各テンプレートファイルの作成

Merge branch 'master' into WordPress
複数cssをstyle.css(wpテーマに必須)でimportして読み込み
フッターやサイドバーを分割
WordPress上で動かしました
functions.phpの追加など

footerを固定させるjsが動かないと思ったら、ただのパスミス
Merge branch 'master' into WordPress
とりあえず、変更点の適用

トップページ用のテンプレの作成
ブログの記事部分の作成

サイドバー部分(最新記事や、アーカイブ)はまだです
WPから吐いたhtmlをおいてます(リンクとか色々汚いですが…)
ブランチをmasterに統合します。衝突するようだったら元に戻します
WordPressブランチをmasterにマージ

分けていると面倒かもしれないので(今更ですが…)
もし衝突するようなら戻します