「既存のデータベースは保持してスキーマの更新だけするために@update@に切り替えたくなりますが」

` existing data`は既存データぐらいで良いかと思います。また「に@update@に」にが続いて少し読みにくい気がしました。

「既存データを維持したままスキーマだけを更新するため@update@に切り替えたくなりますが」
などでどうでしょうか。