Ненене, так не работает. Команды разделяются символом точки с запятой. Пробелы не разделяют команды, но разделяют аргументы команды.
```
java -cp out ru.fizteh.fivt.students.belousova.shell.MainShell cd test; cp 1.txt 2.txt
Exception in thread "main" java.util.NoSuchElementException: No line found
	at java.util.Scanner.nextLine(Scanner.java:1585)
	at ru.fizteh.fivt.students.belousova.shell.CommandCd.execute(CommandCd.java:16)
	at ru.fizteh.fivt.students.belousova.shell.StringHandler.handle(StringHandler.java:19)
	at ru.fizteh.fivt.students.belousova.shell.BatchMode.work(BatchMode.java:6)
	at ru.fizteh.fivt.students.belousova.shell.MainShell.main(MainShell.java:17)
```