(doc) Кратко покомментировал файлы. Т.е. вначале изменившихся файлов были добавлены краткие описания, того, для чего эти файлы нужны.
Agent.js, config.template.js, files.js, help.js, tortuga.js, vm/Tortoise.js, vm/TortoiseRunner.js, vm/vm.js