Zmena adresárovej štruktúry, zjednodušenie nastavovania Makefile-ov

- klientská aplikácia a jej moduly budú odteraz v adesári: src/client_application/core alebo src/client_application/modules/NAZOV_MODULU
- zjednotenie ciest ku zdrojovým kódom a objektovým súborom v Makefile-och