`missing`は「見つからない」「欠けている」という意味で使用されているかと。

なので

`Creates missing tables and indexes, and updates the current schema without dropping any tables or data. `
「テーブルやデータなどを削除することなく、現在のスキーマを更新する形で存在しないテーブルやインデックスを作成する。」
など