「データベースの変更は、SQLスクリプトや[Liquibase|http://www.liquibase.org/]のようなマイグレーションツールのどちらかで適切なマイグレーションで管理されます。」

ユーザがスクリプト書いたりマイグレーションのツールを使うので「...される」あると違和感があります。

「データベースの変更は、SQLスクリプトや[Liquibase|http://www.liquibase.org/]のようなマイグレーションツールのどちらかで、適切にマイグレーションを管理してください。」