「文章化エンジンではセクション名が重複すると、警告が表示されます。」

好みかもしれませんが、素直に「文章化エンジン」を主語とした文で、そのような語尾のほうが読みやすい気がします。

「文章化エンジンはセクション名が重複していた場合に警告を表示します。」