後ろまで読むと分かりますが、たくさんトラフィックを流し続けると時間が経過すると発生する問題です。
バックアップでトラフィックがたくさん流れていたが、そのときには「あの問題」は起こらなかったが、
あともう少しというところまでは来ていたということでしょう。
訳としては基本的に合っていますが、もう少し分かりやすくするとしたら、

意訳が入っていますが、こんな感じでしょうか。
ignore it の it は「あの問題」でしょう。問題を無視できない、ということは、
問題が起こってしまう、ということなので、そのようにしてみました。
exactly は when にかかっているはずなので、強調するために「行われている最中」としてみました。

「「あの問題」（今では我々はこの障害をこう呼んでいる）はバックアップが行われている最中には起こらなかったが、
  （数時間たっていて）「あの問題」を無視できない状況になるまであと少しのところだった。」