Сам по себе вред, причинённый паразитом хозяину, может варьировать в очень широких пределах. Это могут быть механические повреждения, вызванные закупоркой различных каналов, что случается если скопления паразитов могут закупорить кишечник или же протоки различных желез. Паразиты или их яйца могут тромбировать лимфатические сосуды, при этом вызывая вздутия в разных частях тела. Аналогично этому некоторые паразиты или продукты их жизнедеятельности могут вызывать эмболию кровеносных сосудов, приводящую к сердечной недостаточности, а закупорка капилляров приводит к их разрыву и возникновению кровоизлияний, эмболизация сосудов в жизненно важных участках организма в свою очередь приводит к смерти зараженного. Зачастую паразиты, распространяясь по организму, проникают в ткани и органы или прогрызают их, например, в результате в такие отверстия (например, проделанные скребнями (Acanthocephala) в стенке кишечника) проникают бактерии, и развиваются болезни, такие как, например, перитонит. Паразиты также способны питаться тканями тела: так, в частности, возбудитель амёбной дизентерии Entamoeba histolytica переваривает клетки слизистой, образуя открытые раны, называемые амёбными язвами.
Какие болезни возникают при механических повреждениях кишечника?