# [C23] 科博の統合データベース:
科学系博物館のデータベースの一例として

大野理恵 1 ), 細矢剛 1 ), 真鍋真 1)

1) 国立科学博物館 標本資料センター, 〒305-0005 つくば市天久保 4-1-1

E-mail: ohno.archen@gmail.com
## Integrated Database for Natural History Specimens and Scientific Objects in National Museum of Nature and Science \\ OHNO Rie ${ ^{1)}$, HOSOYA Tsuyoshi ${ }^{1)}$, MANABE Makoto ${ }^{1)}$ \\ 1) Collection Center, National Museum of Nature and Science, 4-1-1 Amakubo, Tsukuba, Ibaraki 305-0005 Japan}

## 【発表概要】

国立科学博物館では 2019 年 4 月現在、470 万点以上の自然史系および理工系の標本資料を管理・保管している。館内の膨大な数かつ多種多様な分野にまたがる標本資料を一元的に管理し、 またその情報を一般市民に公開するため、当館では標本資料統合データベース（以下統合 DB） を管理・運用している。統合 DB に登録されている自然史系標本のデータは、S-Net（サイエンス・ミュージアムネット）やGBIF（地球規模生物多様性情報機構）、ジャパンサーチに提供され、公開されている。本発表では、統合 DB の概要と利用状況について紹介するとともに、統合 DB が有する様々な課題について報告する。

## 1. はじめに

国立科学博物館は日本で唯一の国立の総合科学博物館である。所蔵している標本資料の数は国内ではトップクラスの 470 万点以上 $(2$ 019 年 4 月現在）にものぼり、分野も動植物標本から地学系標本、理化学資料、人類学標本まで多岐にわたる。

こうした多種多様な分野にまたがる標本資料を一元的に管理し、全体像を把握するため、当館では標本資料統合データベース（以下統合 DB）を管理・運用している[1]。統合 DB の情報の多くは科博内の研究者のみならず、 ウェブサイト(http://db.kahaku.go.jp/webmu seum/）を通じて国内外の研究者や一般市民も閲覧することができる（図 1）。

## 2. 1 データの公開と利用

統合 DB は 2020 年 2 月現在、動物分野、植物分野、地学分野、人類学分野、理工学分野を合わせて 60 のデータセットがあり、約 215 万件のデータが公開されている。このうち約 176 万件は国立科学博物館に収蔵されている標本のデータ、約 7 万件は附属植物園で維持している生植物のデータ、約 32 万件は附属自然教育園で維持している植物の観察データである。統合 DB のデータは CSV ファイルでダウンロードすることが可能である。標本デー タのうち、画像データを伴うものは約 28 万件 （標本データ全体の約 16\%）ある。統合 DB には英語版ページもあり、標本情報を英語で検索・閲覧することも可能である。

図 1. 統合 DB のホームページ
統合 DB のホームページには毎日 100 回以上のアクセスがあり、通常 1 日に数十〜百数十回の検索がなされている。データダウンロ一ドの頻度は月当たり数十回程度である。日本語ページに比べると数は少ないものの、海外からのアクセス（800～1000 回/月）やデー タダウンロード（数回〜数十回/月）も行われている。

## 2. 2 外部データベースとの連携

統合 DB に登録されている標本資料データ

のうち、動物標本、植物標本、および古生物標本のデータは、日本国内の自然史標本に関する情報を集約し、日本語で公開する $\mathrm{S}-\mathrm{Net}$ (サイエンス・ミュージアムネット http://s cience-net.kahaku.go.jp/）[2]や世界の生物多様性情報を集約している GBIF（地球規模生物多様性情報機構 https://www.gbif.org/ja/) [3]、ジャパンサーチ  [4]に提供され、公開されている。

## 3. 統合 DB の問題点

## 3. 1 データの偏り

世界には多種多様な生物が存在しており、全ての生物のデータを満遍なく登録することが望ましい。しかし、当館に所属する研究者が専門外の生物については、標本収集そのものや標本データの登録が遅れたり、手薄になる場合がある。また、専門の研究者が存在しない地域の標本についてもデータ数が少なくなってしまう。その結果、生物の種類及び採集地域において情報量に偏りを生じてしまう。

## 3. 2 表記ゆれ

表記ゆれとは、一つの物事に対して複数種類の表現が存在している状態を指す。表記ゆれが存在すると、検索したい標本が検索されず、データ数の過小評価につながる場合がある。例えば、採集地が「アメリカ」となっているデータ A、「USA」となっているデータ B、「アメリカ合衆国」となっているデータ $\mathrm{C}$ の 3 つの標本データは全てアメリカ産である。 しかし、データの検索者がアメリカ産の標本データを検索するため採集地を「アメリカ」 として検索すると、データ A およびデータ C
は検索結果に表示されるが、データ B は表示されない。つまり、アメリカ産のデータが 3 件あるにもかかわらず、検索者は 2 件のデー 夕にしかアクセスできず、ここでデータ件数の過小評価が生じる。

統合 DB のデータにみられる表記ゆれの例としては、地名表現が挙げられる。市区町村の統廃合や世界情勢の変化により、ある特定の場所を示す地名は時とともに変化していく。 これにより、標本データの作成時期によって、同じ場所が異なる表現の地名で表記されるケ一スがある。例えば、栃木県上都賀郡は 2011 年 4 月に栃木市に編入され、上都賀郡の名前は消滅した[5]。この場合、2011 年 4 月の前後に登録された標本データでは、同所であっても、郡市区町村名が「栃木市」とされたものと「上都賀郡」とされたものの両方が存在しうる。また、標本ラベルに記載された旧地名が現在の複数の地名の範囲にまたがっている場合があり、現在の地名に変換できない場合もある。

また、属や科など、分類群の名称にも表記ゆれが見られる。生物の学名は、研究の成果によって所属する分類群が変わってしまう場合がある。例えば、ネコ科の動物ユキヒョウはかつて Uncia 属とされ、「Uncia uncia」という学名が付されていたが、研究の結果ユキヒョウは Panthera 属となり [6]、2000 年代後半からは「Panthera uncia」とされるようになった。しかし、研究者によって支持する分類が異なる場合もあり、その結果一種類の生物に対して複数の学名表現がなされる場合がある。また、和名と学名が必ずしも一対一で対応していない場合があり、これも表記ゆれが生じる原因となっている。

## 4. 今後の展望

統合 DB は総合科学系博物館のデータベー スとしては日本有数の規模を誇るが、様々な問題を抱えている。こうした問題を解決できれば、統合 DB は今まで以上に様々な研究に利用可能な有力なデータソースとなり得る。

今後はデータベースの有効性を強調してよ

り。また統合 DB が抱える問題やこれによって生じる不利益について館内の研究者と共有し、またデータ入力の研修会を行う事によって、問題点を改善していくことを目指す。

## 参考文献

[1] 標本・資料統合データベース. http://db.k ahaku.go.jp/webmuseum/(閲覧 2020/2/10). [2] サイエンスミュージアムネット. http://sci ence-net.kahaku.go.jp/ (閲覧 2020/2/10).

[3] GBIF | Global Biodiversity Informatio n Facility. https://www.gbif.org/ja/ (閲覧 20
20/2/10)

[4] ジャパンサーチ(BETA). https://jpsearch. go.jp/(閲覧 2020/2/10).

[5] 公益財団法人国土地理協会. 公益財団法人国土地理協会 -市町村変更情報 : 今後の市町村変更情報一. 2019/5/7. http://www.kokudo.o r.jp/marge/index.html (閲覧 2020/2/10).

[6] Johnson, Warren E. et al. The Late Miocene Radiation of Modern Felidae: A Genetic Assessment. Science. 2006, vol. 3 11, no. 5757, p. 73-77.

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