Virus hepatitis B
Genom HBV terbentuk dari DNA sirkuler, tetapi genomnya tak biasa karena DNA tidak sepenuhnya berunting rangkap. Satu ujung unting panjang penuh terpaut dengan DNA polimerase virus. Genom memiliki panjang 3020-3320 nukleotida (untuk unting panjang penuh) dan 1700-2800 nukleotida (untuk unting pendek).
Unting bermakna negatif (bukan pengode) berkomplementer dengan RNA duta virus. DNA virus ditemukan pada nukleus segera setelah menginveksi sel. DNA berunting rangkap parsial berubah menjadi unting rangkap penuh akibat penyelesaian unting bermakna (+) oleh DNA polimerase sel (DNA polimerase virus digunakan untuk tahap berikutnya) serta penghilangan molekul protein dari unting bermakna (-) dan sekuens RNA
pendek dari unting bermakna (+). Basa bukan pengode dihilangkan dari ujung unting bermakna (-) dan ujung tersebut digabung kembali.
Gen virus ditranskripsi oleh RNA polimerase II sel di dalam inti sel dari cetakan DNA sirkuler tertutup secara kovalen (cccDNA). Dua enhanser bernama enhanser I (EnhI) dan enhanser II (EnhII) telah diidentifikasi di dalam genom HBV. Kedua enhanser menampilkan aktivitas yang lebih besar pada sel asal hati, dan bersama mereka menjalankan dan meregulasi ekspresi transkripsi virus
penuh. Terdapat empat gen diketahui yang dikodekan oleh genom disebut C, P, S, dan X. Protein inti dikodekan oleh gen C (HBcAg), dan kodon mulainya diawali oleh kodon mulai AUG dalam bingkai menghulu dari tempat protein prainti diproduksi. HBeAg diproduksi oleh proses proteolitik protein prainti. DNA polimerase dikodekan oleh gen P. Gen S merupakan gen
yang mengkode antigen permukaan (HBsAg). Gen HBsAg ini memiliki satu bingkai pembacaan terbuka yang panjang, tetapi memuat tiga kodon "mulai" (ATG) di dalam bingkai yang membagi gen ke dalam tiga bagian, pra-S1, pra-S2, dan S. Karena kodon mulai ganda ini, tiga polipeptida dengan ukuran berbeda disebut besar, sedang, dan kecil
(pra-S1 + pra-S2 + S, pra-S2 + S, dan S) diproduksi. Fungsi protein yang dikodekan oleh gen X belum sepenuhnya dipahami, tetapi beberapa bukti mengacu bahwa fungsi protein ini sebagai transaktivator transkripsi.
Sejumlah unsur RNA bukan pengode telah diidentifikasi di dalan genom HBV, yaitu: PRE-alfa HBV, PRE-beta HBV, dan RNA sinyal enkapsidasi epsilon HBV.
Perbedaan genotipe setidaknya 8% dari sekuens yang membedakan penyebaran geografi dan perbedaan ini telah dihubungkan dengan sejarah antropologi. Subtipe genotipe telah dideskripsikan, berbeda 4-8% dari genom.
Kemungkinan genotipe baru "I" telah dideskripsikan, tetapi penerimaan notasi ini tidak universal.
Dua genotipe lebih jauh telah dikenali. Daftar saat ini (2014) memuat A hingga J. Beberapa subtipe juga telah dikenali, setidaknya terdapat 24 subtipe.
Tipe F yang berdivergen dari genom lainnya sebesar 14% merupakan tipe paling berdivergen yang diketahui. Tipe A pada umumnya ditemukan di Eropa, Afrika, dan Asia Tenggara, termasuk Filipina. Tipe B dan C mendominasi di Asia; tipe D umum ditemukan di wilayah Mediterania, Timur Tengah, dan India; tipe E terlokalisasi di Afrika sub-Sahara; tipe F (atau H) terbatas pada Amerika Selatan dan Tengah. Tipe G
telah ditemukan di Prancis dan Jerman. Genotipe A, D, dan F mendominasi Brazil dan semua genotipe terdapat di Amerika Serikat dengan frekuensi bergantung pada etnisitas.
Tipe B memiliki dua persebaran geografis berbeda: Bj/B1 ('j'-Jepang) dan Ba/B2 ('a'-Asia). Tipe Ba selanjutnya terbagi lagi menjadi empat klad (B1-B4).
Tipe C memiliki dua subtipe geogragis: Cs (C1) di Asia Tenggara dan Ce (C2) di Asia Timur. Subtipe C dibagi ke dalam lima klad (C1-C5). Klad keenam (C6) telah terdeskripsi di Filipina, tetapi hanya terdapat di satu isolat sampai saat ini. Tipe C1 diasosiasikan dengan Vietnam, Myanmar, dan Thailand; tipe C2 dengan Jepang, Korea, dan Republik Rakyat Tiongkok; tipe C3 dengan Kaledonia Baru
dan Polinesia; C4 dengan Australia; serta C5 dengan Filipina. Subtipe lebih jauh telah terdeskripsi di Papua, Indonesia.
Tipe F terbagi ke dalam 4 subtipe (F1-F4). F1 lebih lanjut terbagi menjadi 1 a dan 1b. Di Venezuela, subtipe F1, F2, dan F3 ditemukan di Amerindian Timur dan Barat. Di Amerindian Selatan hanya F3 yang ditemukan. Subtipes Ia, III, dan IV menunjukkan persebaran geografi yang terbatas (secara berurutan Amerika Tengah, Utara Amerika Selatan, dan Selatan Amerika Selatan) sementara klad
Ib dan II ditemukan pada seluruh Amerika kecuali berturut-turut pada Utara Amerika Selatan dan Amerika Utara.
Siklus hidup virus hepatitis B cukup kompleks. Hepatitis B merupakan satu dari beberapa virus nonretroviral diketahui yang menggunakan transkriptase balik sebagai bagian dari proses replikasi.
PenempelanVirus memperoleh pintu masuk ke dalam sel dengan berikatan ke reseptor pada permukaan sel dan masuk dengan endositosis dimediasi oleh klatrin atau kaveolin-1. HBV pada awalnya berikatan ke proteoglikan heparin sulfat. Segmen pra-S1 dari protein L HBV kemudian berikatan dengan kuat ke reseptor permukaan sel polipeptida kotranspor natrium taurokolat (NTCP), dikodekan oleh
gen SLC10A1. NTCP umumnya ditemukan pada membran sinusoidal sel hati. Keberadaan NTCP pada sel hati berkorelasi dengan spesifisitas jaringan infeksi HBV. PenetrasiSetelah endositosis, membran virus berfusi dengan membran sel inang, melepaskan nukleokapsid ke dalam sitoplasma. PembukaanKarena virus memperbanyak melalui RNA yang dibuat oleh enzim sel inang, DNA genom virus dikirim menuju inti
sel. Proses ini terjadi dengan mentranspor kapsid pada mikrotubulus ke pori inti. Protein inti berdisosiasi dari DNA virus berunting rangkap parsial, yang kemudian dibuat unting rangkap penuh (oleh DNA polimerase inang) dan bertransformasi menjadi DNA sirkuler tertutup secara kovalen (cccDNA) yang menyediakan cetakan untuk transkripsi empat RNA duta virus. ReplikasiRNA duta terbesar,
lebih panjang dari genom virus, digunakan untuk membuat salinan genom baru dan membuat protein inti kapsid serta DNA-polimerase-bergantung-RNA-virus. PerakitanEmpat transkrip virus ini melalui proses tambahan dan bergabung untuk membentuk virion turunan yang kemudian dilepaskan dari sel atau kembali menuju inti dan membentuk siklus kembali untuk memproduksi lebih banyak salinan. PelepasanRNA duta panjang kemudian ditranspor kembali ke sitoplasma dengan virion protein P menyintesis DNA melalui aktivitas transkriptase balik.