Naruto Shippuden the Movie: The Lost Tower
Yamato, Naruto Uzumaki, Sakura Haruno, dan Sai ditugaskan dalam sebuah misi untuk menangkap Mukade, seorang ninja hilang. Mereka semua memiliki pisau cakra Konoha. Mereka berangkat ke reruntuhan bersejarah Rran, sebuah kota dengan seribu menara dan terletak di tengah-tengah padang pasir. Mereka mengejar dan menyudutkan Mukade. Tujuan Mukade adalah melakukan perjalanan ke masa lalu
dan mengambil alih Lima Negara Besar Shinobi dengan kekuatan Rymyaku (Ley Line dalam bahasa Inggris), aliran cakra bawah tanah Rran kuno. Dia melepaskan kekuatan Rymyaku, yang telah disegel oleh Minato Namikaze (yang dikenal sebagai "Si Kilat Kuning Konoha"/"The Yellow Flash of the Leaf"), menyebabkan cahaya menyelubungi Naruto dan Yamato, yang mencoba untuk menghentikan Mukade. Sai menghentikan Sakura
yang hampir tersedot oleh Rymyaku dengan meraihnya ke tinta burung dan terbang ke tempat yang aman, meninggalkan Naruto dan Yamato dalam cahaya misterius. Sementara itu, Sakura hanya berteriak "Naruto". Naruto dan Yamato terkirim dua puluh tahun ke masa lalu. Ketika Naruto terbangun, ia bertemu dengan ratu Rran, Sara.
Kota ini kemudian mengungkapkan bahwa Mukade melakukan perjalanan ke 6 tahun terakhir sebelum Naruto melakukannya. Ternyata, disana terdapat Minato Namikaze, Shibi Aburame, dan Chza Akimichi. Minato Namikaze sekarang terlihat di Konoha, dan Jiraiya menunjukkan Minato bahwa ia telah menyelesaikan Rasengan. Kemudian Shizune, Might Guy, Asuma Sarutobi, dan Kakashi Hatake (yang saat itu
masih muda) sedang menunggu dalam antrian panjang pada pembukaan Bar Ramen Ichiraku. Hiruzen Sarutobi telah mendengar rencana jahat Anrokuzan, dan mengirimkan Minato Namikaze, Aburame Shibi, Chza Akimichi, dan atas permintaan Minato, Kakashi Hatake, untuk mengakhiri rencananya. Naruto kemudian datang dan bertemu dengan Minato, yang sekarang menjadi misinya. Minato memberitahu Naruto bahwa ia juga
adalah seorang ninja Konoha, dan memberitahu dia untuk kembali ke periode waktu sendiri, karena tidak aman di Rran. Dia kemudian memberitahu Naruto keadaan di Rran, dan memberikan Naruto Hirashin kunai untuk mempertahankan diri. Sementara Minato sedang berbicara dengan Naruto, Sara memiliki kilas balik ketika dia masih kecil dengan ibunya. Mereka bernyanyi sampai
Anrokuzan datang dan menikam Sramu, sementara Sara lari. Pada titik ini ia telah mengubah namanya menjadi Anrokuzan dan berfungsi sebagai menteri Rran. Dia telah membunuh ibu Sara Sramu, ratu sebelumnya, dan sekarang berusaha untuk membunuh Sara dan mengambil alih dunia. Naruto memberitahu Sara bahwa dia akan melindungi dirinya. Anrokuzan tampaknya memiliki budak-
yang adalah warga Rran- yang melakukan pekerjaan kotor. Dengan Rymyaku tersebut, Anrokuzan mampu menciptakan "Pasukan Ninja Wayang", yang dapat menyerang menggunakan cakra Rymyaku, dan dapat menggunakan senjata seperti kunai dan menangkis serangan (Naruto terlihat menggunakan cakra pisaunya untuk menyerang mereka).
Kemudian, keempat shinobi konoha menyerang Mukade. Kemudian Anrokuzan berubah menjadi boneka raksasa, yang dapat menggunakan bagian dari menara Rran untuk memperbaiki diri dari setiap serangan, yang merupakan bagian dari teknik regenerasi dengan kekuatan Rymyaku tersebut. Naruto melawan Anrokuzan dalam pertempuran dengan menggunakan Jurus Seribu Bayangan, Rasengan dan Jurus Angin: Rasenshuriken
berkali-kali, namun gagal. Naruto akhirnya kehabisan cakra, dan tidak memiliki cara untuk melawannya. Ketika Naruto dengan cakra yang tersisa dan sudah tak berdaya, Minato datang dan menyelamatkan Naruto dan meminjamkan Naruto cakra untuk membentuk Rasengan di tangannya dan pada saat yang sama Minato membentuk Rasengan juga. Dengan memiliki cakra yang sama, Rasengan mereka
beresonasi satu sama lain sehingga rasengan mereka membesar. Mereka kemudian menggabungkan Rasengan mereka untuk membentuk Super Rasengan. Segel Sara membuat Rymyaku tidak aktif, membuat Anrokuzan tidak dapat menggunakan teknik regenerasinya. Minato pergi dan mencari titik lemah Anrokuzan itu, kemudian memberitahu Naruto bahwa ini adalah waktu untuk menyerangnya.
Naruto berhasil memukul dia dengan Super Rasengan. Anrokuzan menyatakan bahwa ini tidak akan berakhir. Seperti lantai runtuh, ia jatuh ke dalam kolam Rymyaku tersebut. Sara masih terlihat di lantai runtuh, Naruto berhasil menangkapnya, tetapi jatuh juga. Yamato, yang berpegang pada Kakashi, datang dan menggunakan Jurus Kayu untuk menangkap Naruto. Minato meminta
Naruto untuk memberikan kembali kunai-nya untuk benar-benar menutup Rymyaku tersebut. Sebuah cahaya biru terang bersinar sebagai penyegelan Rymyaku oleh Minato tersebut. Badan Naruto dan Yamato mulai bersinar. Minato mengatakan sejak Anrokuzan yang sudah mati, mantra yang membuat mereka melakukan perjalanan ke masa lalu, habis. Minato memutuskan yang terbaik untuk menghapus
semua kenangan yang dimiliki semua orang agar tidak mengubah sejarah. Naruto mengatakan Minato bahwa mereka masih perlu berbicara, dan jika tidak sekarang, maka dia tidak akan pernah memiliki kesempatan lagi. Minato mulai menempatkan segel, Naruto mulai menyadari sesuatu, tetapi terganggu oleh jawaban Minato bahwa jika ia pernah memiliki seorang anak dia ingin
agar dia dibesarkan sebagai seorang ninja seperti Naruto (setelah menyadari bahwa Naruto adalah putra masa depannya). Sara memberitahu Naruto bahwa dia tidak akan pernah melupakan apa yang telah Naruto ajarkan.
Badan Naruto dan Yamato benar-benar lenyap. Pada saat itu, Rymyaku yang dilepaskan oleh Mukade menghilang menjauh. Kejadian kembali saat Sakura masih terlihat pada burung tinta Sai dan berteriak "Naruto". Sakura dan Sai menangkap Naruto dan Yamato, yang tampaknya tidak mengingat peristiwa yang baru saja terjadi.
Ketika mereka berjalan di luar, Naruto dan kelompoknya bertemu dengan seseorang yang sangat mirip Ratu Sara- dia mengatakan bahwa dia merasakan adanya gangguan pada Rymyaku, menarik keluar pisau cakra, bahwa Naruto telah memberikan kepada Ratu Sara selama peristiwa perjalanan waktu. Pisau itu tergores dan rusak, seolah-olah telah melalui dua puluh tahun penggunaan.
Naruto secara refleks meraih selubung di punggungnya. Tapi tentu saja, ia tidak memiliki pisau. Gadis itu mengatakan bahwa itu adalah pisau yang diberikan kepada ibunya oleh "pahlawan dalam mimpi", dan bahwa kehendak ibunya tinggal di dalam dirinya saat ia berusaha untuk melindungi rakyatnya.
Saat ia berjalan pergi, Naruto merenung, dan berargumen bahwa ia mengingatkannya pada seseorang yang telah bertemu sebelumnya. Sakura kemudian meraih dan menarik telinga Naruto dan berteriak kepadanya "lamunan sesat".