RB Leipzig
Karena klub gagal promosi, Peter Pacult dari Rapid Wien ditunjuk sebagai kepala pelatih baru untuk musim 2011-12 season pada 4 Mei 2011. Hampir bersamaan, direktur olaharaga Thomas Linke dilepas dari posisinya, setelah bekerja hanya 10 minggu, dari Februari 2011. Berbagai media mencurigai koneksi antara kedatangan Pacult dan kepergian Linke.
Serta, beberapa pemain meninggalkan tim, diantaranya Lars Müller, Sven Neuhaus, Thomas Kläsener dan Nico Frommer, semua ikut dalam final Saxony Cup. Dengan Daniel Rosin, Timo Rost dan Benjamin Bellot, hanya tiga pemain dalam tim Oberliga yang tersisa untuk musim 2011-12 Regionalliga, sementara mantan pemain internasional Ingo Hertzsch sebagai pemain keempat yang tersisa di klub. Hertzsch pensiun setelah musim 2010-11, namun bergabung dalam tim cadangan, RB Leipzig II, dan operasi bisnis RB Leipzig.
Pada 29 Juli 2011, RB Leipzig membuat debutnya di DFB Pokal, didepan 31.212 penonton di Red Bull Arena. Leipzig mampu mengalahkan juara Bundesliga VfL Wolfsburg pada ronde pertama, dengan skor 3-2 setelah hat-trick oleh Daniel Frahn. Leipzig gagal ke ronde selanjutnya, dengan kekalahan 0-1 dari FC Augsburg.
Musim 2011-12 Regionalliga mencatat kemenangan terbesar dalam sejarah klub, mengalahkan SV Wilhelmshaven 8-2 pada 19 Februari 2012. Setelah hasil menentukan 2-2 melawan VfL Wolfsburg II pada minggu ke-3, Leipzig kembali gagal promosi di Regionalliga, menduduki tempat ketiga. Musim 2012-13 dalam pembaruan liga Regionalliga Nordost dimulai dengan perubahan personel yang besar. Mantan pelatih kepala Schalke 04 Ralf Rangnick ditunjuk sebagai direktur olahraga
baru. Bertepatan dengan kedatangannya, ia mengganti pelatih kepala Peter Pacult dengan mantan pelatih SG Sonnenhof Großaspach Alexander Zorniger. Musim itu terbukti lebih sukses dari 2 musim sebelumnya. Leipzig memenangkan gelar "Herbstmeister" 2 minggu sebelum babak pertama musim itu, mengalahkan FSV Zwickau 1-0 di kandang lawan. Mereka lalu mengamankan tempat pertama pada musim 2012-13 Regionalliga Nordost di pertandingan ke-18, setelah tim tempat
kedua FC Carl Zeiss Jena kalah melawan Berliner AK 07 pada 7 Mei 2013, yang mana mereka tidak dapat menyusul poin RB.
Kesuksesan lainnya adalah Saxony Cup 2012-. Mereka mencapai final untuk kedua kalinya dalam sejarah klub, dan seperti tahun 2011, lawannya adalah Chemnitzer FC. Leipzig menang 4-2 pada 15 Mei 2013 didepan 16864 penonton di Red Bull Arena. Jumlah penonton juga menetapkan rekor baru untuk final Saxony Cup final, memecahkan rekor tahun 2011. Dengan ini, Leipzig ikut serta dalam DFB Pokal 2013-14.
Sebagai pemenang 2012-13 Regionallig Nordost, RB Leipzig mendapat tempat kualifikasi untuk 3. Liga. Klub bermain melawan Sportfreunde Lotte dari Regionalliga West. RB Leipzig memenangkan leg pertama pada 29 Mei 2013, 2-0. Pertandingan itu dimainkan di Red Bull Arena didepan 20104 penonton, jumlah yang menetapkan rekor baru untuk pertandingan divisi keempat.
Leg kedua dimainkan pada 2 Juni 2013 dan berakhir 2-2 setelah 2 gol RB Leipzig ketika "extra time". Dengan demikan, RB Leipzig akhirnya promosi ke 3. Liga, setelah 3 musim di Regionalliga.
Pada musim 2013-14, RB Leipzig tampil pertama kali di 3. Liga dalam sejarah klub. Mereka mendatangkan Anthony Jung dari FSV Frankfurt, Tobias Willers dari Sportfreunde Lotte, Joshua Kimmich dari VfB Stuttgart U19, André Luge dari FSV Zwickau, Christos Papadimitriou dari AEK Athens, Yussuf Poulsen dari Lyngby BK dan Denis Thomalla dari TSG 1899 Hoffenheim ketika transfer musim panas.
RB Leipzig gugur di babak pertama DFB-Pokal 2013-14 setelah kalah 0-2 dari FC Augsburg pada 2 Agustus 2013 di Red Bull Arena. Kekalahan itu mengakhiri catatan tidak terkalahkan di pertandingan kompetitif selama setahun. Musim 2013-14 3. Liga memiliki start yang lebih menjanjikan. Leipzig memenangkan pertandingan pertamanya, bertandang melawan Hallescher FC 1-0 pada 19 Juli 2013 dan tidak terkalahkan hingga 31 Agustus 2013, ketika kalah 1-2, bertandang melawan tim tempat pertama, SV Wehen Wiesbaden.
Pada 5 Oktober 2013, RB Leipzig kembali bertemu dengan tim tempat pertama. SV Wehen Wiesbaden merelakan tempatnya diduduki 1. FC Heidenheim, seminggu setelah kekalahannya dari RB Leipzig. 1. FC Heidenheim lalu mempertahankannya hingga akhir musim. RB Leipzig mengalahkan 1. FC Heidenheim 2-0 setelah performa meyakinkan di Voith-Arena dan merangkak ke posisi ketiga. Ketika transfer musim dingin, Christos Papadimitriou, Juri Judt, Carsten
Kammlott dan Bastian Schulz meninggalkan tim. Sebagai gantinya, mereka didatangi oleh Diego Demme dari SC Paderborn 07, Federico Palacios Martinez dari VfL Wolfsburg, Mikko Sumusalo dari HJK Helsinki dan Georg Teigl dari FC Red Bull Salzburg.
Setelah kalah 1-2 bertandang ke MSV Duisburg pada 1 Februari 2014, Leipzig tidak terkalahkan hingga akhir musim. Duel menegangkan dengan SV Darmstadt 98 muncul, dengan kedua tim berjuang untuk mendapat tempat kedua. Keduanya bertemu pada minggu ke-35, pada 19 April 2014. RB Leipzig mengalahkan SV Darmstadt 98 1-0 didepan 39.147 penonton diRed Bull Arena. RB Leipzig mengamankan tempat kedua dan promosi langsung ke 2. Bundesliga 2 minggu
kemudian, setelah mengalahkan tim juru kunci 1. FC Saarbrucken 5-1 di Red Bull Arena yang hampir terjual habis pada 3 May 2014. Sebanyak 42.713 penonton mencatat rekor baru klub.
Dengan finis ditempat kedua, RB Leipzig memenangkan promosi ke 2. Bundesliga dan menjadi tim pertama sejak perkenalan 3. Liga untuk promosi ke 2. Bundesliga setelah hanya satu musim.
Ketika promosi ke 2. Bundesliga, organisasi yang bertanggungjawab untuk lisensi bukan lagi DFB, melainkan Liga Sepak Bola Jerman (DFL). DFL mengumumkan keputusan pertama untuk proses lisensi pada 22 April 2014. RB Leipzig diberikan lisensi untuk musim 2014-15 untuk 2. Bundesliga, namun dalam kondisi tertentu. Kritik menupuk bahwa klub kurang berpartisipasi, bahwa manajemen klub terlalu terpusat pada beberapa
orang dan klub tidak terlalu independen dari Red Bull GmbH. Untuk memastikan independen dan meningkatkan partisipasi, DFL memberi 3 syarat untuk memperoleh lisensi musim 2014-15 untuk 2. Bundesliga. Salah satu syaratnya adalah mendesain ulang logo klub, sebagaimana terlalu mirip dengan logo perusahaan Red Bull GmbH. Syarat kedua adalah mengganti komposisi badan organisasi klub. Syarat ketiga
untuk mengurangi biaya keanggotaan dan membuka persatuan untuk anggota baru. Majalah hukum Jerman "Legal Tribune Online" menilai ketiga syarat yang dibuat oleh DFL perlu dipertanyakan secara hukum.
RB Leipzig mengajukan banding pada 30 April 2014. Direktur olahraga Ralf Rangnick muncul di media dan menunjukkan kesediaan untuk mencapai kesepakatan dengan DFL, mengatakan yang penting bukan apa yang tertulis di jersey, melainkan apa yang ada didalamnya.
Banding itu ditolak dalam keputusan kedua oleh DFL pada 8 Mei 2014. Pemilik Red Bull GmbH Dietrich Mateschitz berbicara pada media, mengkritik keputusan DFL. Mengatakan syarat itu sebagai "permintaan pemenggalaan" dan menolak musim berikutnya di 3. Liga secara mentah-mentah, akhirnya mengancam untuk mengakhiri proyek di Leipzig bila lisensi tidak diberikan.
RB Leipzig mengajukan banding kedua kalinya pada 12 Mei 2014. Komite lisensi DFL bersiap memberikan keputusan pada banding itu pada 15 Mei 2014, sebelum membuat keputusan final pada 28 Mei 2014. Direktur olahraga Ralf Rangnick memastikan klub masih dalam pembicaraan dengan DFL dan optimis dengan masalah lisensi. Pada 15 Mei 2014 kompromi diumumkan. Kompromi itu maksudnya bahwa klub akan mendesain ulang logonya dan memastikan bahwa manajemen klub independen dari Red Bull GmbH.