Tom Monaghan
Ave Maria Foundation kemudian lebih berfokus pada pendidikan tinggi, serta mendirikan universitas dan sekolah hukum. Seiring dengan perubahan fokus tersebut, banyak entitas nirlaba lain yang didirikan Ave Maria Foundation menjadi independen ataupun dalam proses melepaskan diri dari ketergantungan secara finansial pada Ave Maria Foundation.
Monaghan dikenal sebagai salah seorang anggota Opus Dei dan menggabungkan diri dengan sejumlah organisasi lain yang setia pada ajaran Katolik.
Monaghan adalah salah seorang donor Priests for Life, suatu organisasi pro-kehidupan Katolik. Ia tercatat sebagai salah seorang "knight of magistral grace" () dalam Ordo Militer Berdaulat Malta.
Ave Maria School of Law, yang sebelumnya berlokasi di Ann Arbor, Michigan, memulai kegiatan akademiknya pada tahun 2000, dan mendapat akreditasi penuh dari American Bar Association (ABA) pada tahun 2005. Ave Maria School of Law merupakan impian sejumlah profesor dari University of Detroit Mercy, yang meninggalkan institusi pendidikan tersebut karena mengizinkan beberapa anggota pro-pilihan (pendukung aborsi) dari Mahkamah Agung Michigan untuk tampil di
acara tahunan "Red Mass" yang diselenggarakan institusi tersebut. Para profesor seperti Stephen Safranek, Mollie Murphy, Richard Myers, dan Joseph Falvey, mengawalinya dengan gagasan untuk membentuk suatu sekolah hukum baru yang setia pada ajaran Katolik, menyampaikan gagasan mereka kepada Monaghan (yang sebelumnya adalah seorang pendukung kuat rencana pembukaan suatu sekolah hukum baru di Franciscan University of
Steubenville) supaya dapat memberikan pendanaan yang signifikan melalui Ave Maria Foundation. Bersama-sama mereka meminta Bernard Dobranski, dekan di sekolah hukum Catholic University of America (CUA) dan mantan dekan sekolah hukum Detroit Mercy, untuk memimpin Ave Maria School of Law sebagai dekan. Monaghan menjabat sebagai ketua Board of Governors di Ave Maria School of Law.
Dalam jajaran pengajarnya termasuk juga Hakim Robert Bork, seorang nominasi hakim agung dan akademisi hukum yang dikenal konservatif. Hakim Agung Antonin Scalia membantu pengembangan kurikulum Ave Maria School of Law, dan acara tahunan Ave Maria Lecture perdananya disajikan oleh Hakim Agung Clarence Thomas pada tahun 1999. Sekolah hukum ini bertujuan mendidik pengacara-pengacara yang kompeten secara moral, yang mampu
membawa dampak positif pada semua aspek profesi hukum dan memajukan teori hukum kodrat. Ave Maria Law School meluluskan kelasnya yang terakhir di Michigan pada musim semi tahun 2009, dan tidak lama kemudian pindah secara permanen ke Naples, Florida.
Sebagai langkah awal mewujudkan mimpinya mendirikan suatu universitas Katolik yang baru, Monaghan mendirikan Ave Maria College di Ypsilanti, Michigan. Dalam rangkaian upayanya untuk mempercepat akreditasi, Monaghan mengambil alih dan satu kampus di Nikaragua, mengganti namanya menjadi.
Karena kekurangan dana, perguruan tinggi tersebut ditutup pada tahun 2007, kendati para pengajar dan mahasiswanya memprotes keputusan ini. Tidak ada pendanaan alternatif yang disiapkan sebelumnya untuk mengantisipasi penutupan perguruan tinggi tersebut. St. Mary's College lalu beralih kepengelolaan dan saat ini berada di bawah naungan Madonna University yang terletak di dekatnya.
Pada awal tahun 2002, Monaghan berusaha mendirikan Ave Maria University di Ann Arbor, tepatnya di Domino's Farms, suatu lahan perkantoran luas yang ia miliki dan sewakan kepada Domino's Pizza. Rencananya meliputi pembangunan suatu patung salib setinggi 250 kaki, lebih tinggi dari Patung Liberty. Para pejabat pemerintah setempat menolak untuk menyetujui perubahan zonasi, memaksanya untuk mencari tempat lain bagi pembangunan
kampusnya. Akhirnya, para tokoh masyarakat di Collier County, Florida, menawarkan kepadanya sebidang tanah yang belum dikembangkan, yang letaknya 30 mil di sebelah timur Naples, untuk membangun universitas yang direncanakannya.
Bulan Februari 2006 menjadi penanda dimulainya suatu universitas dan kota Katolik yang baru, Ave Maria, Florida. Suatu perusahaan patungan, yang di dalamnya Monaghan dan pengembang Barron Collier sama-sama memiliki saham 50%, didirikan untuk mengelola semua properti selain universitas di kota tersebut, serta berencana untuk membangun 11000 rumah dan beberapa distrik bisnis. Pulte Homes telah tercantum
sebagai pihak yang membangun sebagian besar rumah hunian pribadi. Monaghan mengatakan pada tahun 2005 bahwa semua pengecer di kota tersebut tidak diizinkan menjual alat kontrasepsi ataupun pornografi, suatu pernyataan yang dikritik secara hukum oleh American Civil Liberties Union.
Karena diancam dengan tuntutan hukum, Monaghan dan para pengembang kota dikabarkan melakukan kampanye kehumasan secara nasional pada bulan Maret 2007 untuk menarik kembali gagasan bahwa ajaran Katolik dapat ditegakkan sebagai undang-undang. Organisasi Defenders of Wildlife dikabarkan juga menentang pengembangan kota tersebut, karena menurut mereka akan menghancurkan habitat puma florida yang terancam punah.
Monaghan turut berperan serta dalam pembentukan Ave Maria Mutual Funds dengan meminta temannya, George P. Schwartz dari Schwartz Investment Counsel, Inc., untuk meluncurkan Ave Maria Catholic Values Fund pada bulan Mei 2001. Saat ini terdapat lima Ave Maria Mutual Funds. Semua reksadana itu menyasar para investor yang ingin menempatkan uang mereka di perusahaan-perusahaan yang kegiatan operasionalnya selaras dengan ajaran-ajaran inti dari Gereja
Katolik. Para investornya disebut sebagai "investor-investor yang bertanggung jawab secara moral". Reksadana tersebut dapat dimiliki oleh investor perorangan dengan investasi minimal $1000.
Monaghan tergabung sebagai salah seorang anggota Catholic Advisory Board. Dewan tersebut menetapkan kriteria berbasis ajaran moral Katolik dalam rangka penyaringan perusahaan-perusahaan sebelum melakukan penempatan dana. Keterkaitan dengan kontrasepsi, program kesejahteraan karyawan bagi pasangan di luar nikah, pornografi, dan aborsi, merupakan beberapa contoh isu yang mendiskualifikasi suatu perusahaan untuk
mendapat alokasi penempatan dana. Lou Holtz, Larry Kudlow, Michael Novak, Phyllis Schlafly, dan Paul Roney termasuk di antara jajaran anggota lain Catholic Advisory Board dalam Ave Maria Mutual Funds. Kardinal Adam Maida (dari Keuskupan Agung Detroit) tercatat sebagai penasihat gerejawi dewan tersebut.
Monaghan dikatakan terlibat aktif dalam politik Partai Republik, dan merupakan salah satu pendukung utama Sam Brownback secara finansial dalam kampanye kepresidenannya pada tahun 2008.