Dinasti Qing di Asia Dalam
administrasi pemerintahan Tibet, yang berlangsung sampai jatuhnya dinasti Qing pada tahun 1912, meskipun wilayah mempertahankan tingkat otonomi politik di bawah Dalai Lama. Qing kaisar ditunjuk imperial warga yang dikenal sebagai Ambans ke Tibet, yang memerintahkan lebih dari 2000 tentara yang ditempatkan di Lhasa dan dilaporkan ke Lifan Yuan.
Di beberapa tempat seperti di Lhasa, Batang, Dartsendo, Lhari, Chamdo, dan Litang, Hijau Standar pasukan yang ditempatkan di seluruh Dzungaria perang. Standar Hijau Tentara pasukan dan Pasukan Manchu keduanya bagian dari Qing kekuatan yang berjuang di Tibet dalam perang melawan Dzungaria. Ia mengatakan bahwa Sichuan panglima Yue Zhongqi (keturunan dari Yue Fei) masuk Lhasa pertama ketika 2000 Standar Hijau tentara dan 1000
tentara Manchu "Sichuan rute" disita Lhasa. Menurut Mark C. Elliott, setelah 1728 Qing digunakan Standar Hijau Tentara pasukan untuk pria garnisun di Lhasa daripada Pasukan. Menurut Evelyn S. Rawski kedua Standar Hijau Tentara dan Pasukan yang terdiri Qing garnisun di Tibet. Menurut Sabine Dabringhaus, Standar Hijau tentara Cina berjumlah lebih dari 1300 ditempatkan oleh Qing di Tibet untuk mendukung 3000 kuat tentara Tibet.
Dari 1640 untuk 1724, bagian besar dari daerah yang sekarang Qinghai berada di bawah kendali Khoshut Mongol, yang secara nominal diakui mereka setia kepada dinasti Qing. Namun, setelah Dzungaria invasi yang berakhir Khoshut Khanate di Tibet dan selanjutnya Qing penaklukan dari Tibet pada tahun 1720, Atas Mongol yang dipimpin oleh penguasa pangeran Lubsan Danzaan di Qinghai memberontak terhadap dinasti Qing di bawah Kaisar
Yongzheng tahun 1723. Lubsan Danzaan juga membuat kontak dengan Dzungaria Khanate di Xinjiang sebelum pemberontakan. 200.000 Tibet dan Mongol di Qinghai menyerang Xining, meskipun Tibet Tengah tidak mendukung pemberontakan. Bahkan, Polhanas yang berbasis di Tibet Tengah diblokir pemberontak mundur dari Qing pembalasan. Cina komandan seperti Nian Gengyao dikirim untuk menekan pemberontakan. Akhirnya
pemberontakan itu secara brutal ditekan, yang ditandai timbulnya langsung Qing aturan di Qinghai. Lubsan Danzaan melarikan diri ke Urumqi Khanate dan kemudian ditangkap oleh orang Manchu pada tahun 1755 selama Qianlong Kaisar's kampanye ke Xinjiang. Sebagian besar yang hadir hari Qinghai diletakkan di bawah kendali Menteri Xining Penanganan Urusan (Cina: , juga dikenal sebagai
Xining Amban) yang terletak di Xining pada tahun 1724 oleh Qing, meskipun Xining itu sendiri diatur oleh Gansu provinsi selama periode tersebut. Hal ini berlangsung sampai akhir dinasti Qing.
Daerah yang disebut Dzungaria di masa sekarng Xinjiang adalah dasar dari Kekhanan Zunghar. Dinasti Qing memperoleh kontrol atas wilayah timur Xinjiang sebagai hasil dari sebuah perjuangan panjang dengan Dzungaria yang dimulai pada abad ke-17. Pada tahun 1755, dengan bantuan Oirat nobel Amursana, Qing menyerang Ghulja dan ditangkap Dzungaria khan. Setelah Amursana permintaan dapat dinyatakan
Dzungaria khan pergi terjawab, ia memimpin pemberontakan melawan dinasti Qing. Selama dua tahun berikutnya, Qing tentara menghancurkan sisa-sisa Dzungaria khanate. Asli Dzungaria Oirat Mongol menderita berat dari kampanye brutal dan simultan cacar epidemi. Setelah kampanye melawan Dzungaria pada tahun 1758, dua Altishahr bangsawan, Khoja saudara Burhn al-Dn () dan Khwja-aku Jahn (),
memulai pemberontakan terhadap Kekaisaran Qing. Namun, itu hancur oleh pasukan Qing oleh 1759, yang menandai awal dari seluruh Xinjiang di bawah aturan Qing. Yang Kumul Khanate dimasukkan ke dalam Kekaisaran Qing sebagai semi-otonom bawahan dalam Xinjiang. Para Kaisar Qianlong dibandingkan prestasinya dengan yang dari Han dan Tang usaha ke Asia Tengah. dinasti Qing menempatkan seluruh
Xinjiang di bawah kekuasaan Jenderal Ili yang mendirikan pusat pemerintahan di benteng Huiyuan (yang disebut "Manchu Kuldja", atau Yili), barat dari Ghulja (Yining). Ini dibawa sebelumnya dua wilayah yang terpisah, Dzungaria di utara dan Tarim Basin (Altishahr) di selatan di bawah pemerintahannya sebagai Xinjiang.