Bendungan Atatürk
Karena seluruh kawasan GAP merupakan tempat yang dahulu adalah bagian dari beberapa peradaban bersejarah seperti Hittite, Assyria, Medes, Persia, Yunani, Romawi, Arab, serta Turki Usmani, sehingga kaya akan peninggalan sejarah, warisan kebudayaan yang ada di kawasan tersebut merupakan sesuatu yang dipertimbangkan dalam GAP. Topik mengenai penyelamatan warisan
kebudayaan menjadi hal yang penting, terutama setelah tergenangnya kota kuno Samosata/Samsat. Pada tahun 1989, kota kuno Samsat, ibu kota dari kerajaan kuno Commagene yang berada di Provinsi Adyaman tergenangi oleh Waduk Atatürk. Sebuah kota baru dengan nama Samsat didirikan dan dihuni oleh sekitar 2000 warga.
Sekitar 90% dari debit tahunan Sungai Eufrat berasal dari Turki, sementara sisanya berasal dari Suriah serta dapat pula Irak. Secara umum, debit sungai bervariasi dari tahun ke tahun dan juga dipengaruhi musim. Contohnya, debit tahunan di perbatasan antara Turki dengan Suriah berkisar dari tahun 1961 hingga tahun 1963.
Salah satu dari peraturan perundangan yang terpenting mengenai Sistem Sungai Eufrat-Tigris adalah persetujuan yang disahkan pada tahun 1946 yaitu Perjanjian Persahabatan dan Hubungan Kebertetanggaan Baik antara Irak dan Turki. Persetujuan tersebut mengizinkan pengendalian dan pengaturan Sungai Eufrat dan Tigris berdasarkan pengaturan debit di sumber-sumber aliran sungai di Turki. Turki sepakat untuk
memulai pengawasan di kedua sungai lintas negara tersebut dan untuk memberitahu data-data apa yang berkaitan dengan sungai tersebut kepada Irak. Pada tahun 1980, Turki dan Irak merinci definisi dari persetujuan tersebut dengan membangun komite gabungan mengenai masalah-masalah teknis yang berkaitan, yang juga disertai Suriah yang bergabung pada tahun 1982. Turki secara
sepihak menjamin aliran sebanyak 15.75 km3/tahun (500 m3/s) melintasi perbatasan ke Suriah tanpa persetujuan resmi apapun mengenai pembagian di Sungai Eufrat.
Pada pertengahan Januari 1990, ketika fase pertama pembangunan bendungan selesai, Turki menahan seluruh aliran Sungai Eufrat selama sebulan untuk memulai pengisian waduk. Turki telah mengumumkannya kepada Suriah dan Irak pada bulan November 1989 mengenai pengisian waduk selama sebulan dengan menjelaskan hal-hal teknis serta memaparkan rincian program untuk mengganti aliran yang hilang. Suriah dan Irak dengan
tegas tidak menyetujui hal ini. Saat itu, Bendungan Atatürk telah memotong aliran dari Sungai Eufrat pada sekitar sepertiganya.
Suriah dan Irak mengaku mengalami kekurangan air yang ekstrem akibat pengembangan Proyek GAP. Kedua negara menuduh bahwa Turki dengan sengaja menahan suplai air untuk negara-negara tetangganya tersebut, mengubah air menjadi senjata. Turki membantah klaim-klaim tersebut dan menekankan bahwa Turki tetap menyuplai air ke kedua negara tersebut minimal. Turki meragukan bahwa Irak dan Suriah
benar-benar memanfaatkan air dari pembendungan Eufrat karena Turki melindungi ketiga negara tersebut dari kekeringan dan banjir musiman.
Kekecewaan Suriah terhadap Proyek GAP merupakan faktor utama terhadap keputusannya pada pertengahan 1990-an untuk mendukung Partai Pekerja Kurdistan (PKK) di Turki. Didorong oleh rasa tidak senang dengan kondisi Orang Kurdi di Turki, PKK berkembang menjadi ancaman terhadap Turki.