Karakter-karakter dan Faksi dalam seri Black Ops
misinya menjadi untuk membunuh Dragovich, Kravchenko dan Steiner sendiri. Doktor Daniel Clarke- (Gary Oldman) Ilmuwan Inggris komunis yang membelot ke Soviet karena ditentang di negara asalnya. Ia membantu Steiner dalam membuat Nova 6 menjadi senjata mematikan, tetapi setelah selesai, Dragovich berusaha membunuhnya. Clarke kabur ke Kowloon dan meneliti Nova 6 sendirian, Hudson dan Weaver
menangkapnya dan menginterogasinya untuk menggali informasi tentang Nova 6 dalam misi 'Numbers'. Clarke menjelaskan tentang Steiner dan fasilitas Nova 6 di gunung Yamantau, tetapi Spetsnaz yang dikirim Dragovich datang dan mereka bertiga bersekutu untuk kabur ke tempat ekstrasi. Clarke rupanya sudah mempersiapkan pelarian ini, karena sepanjang perjalanan, ia mempunyai setidaknya 3 tempat
persenjataan, matras di balkon (untuk tempat mendarat ketika melompat dari atap) dan bom C4 di laboratoriumnya yang ia ledakkan untuk mencegah penelitiannya jatuh ke tangan Dragovich. Ia memberitahukan lokasi Steiner di sebuah lab rahasia di Gunung Yamantau, tetapi sebelum bisa menyebutkan nomor penyiaran untuk serangan Nova 6, ia tewas tertembak di kepala dan jatuh dari ketinggian.
Carlos- (Gustavo Rex) Teman dari Mason, Woods dan Bowman. Ia dan anak buahnya menyerang Tropas di lapangan udara untuk mengecoh perhatian anak buah Castro dari tim Operasi 40. Ia kemudian mengendarai pesawat untuk membantu tim Op. 40 kabur. Mason kemudian megorbankan diri, menyelamatkan Woods, Bowman dan Carlos dengan mengatasi musuh. Mereka bertiga selamat, meskipun Mason ditangkap dan ditahan di Vorkuta. Fidel Castro-
(Gustavo Rex) Sasaran dari Operasi 40. Woods dan Mason berhasil membunuhnya dan isterinya di rumah pribadinya. Tetapi ketika Mason ditangkap setelah menyelamatkan timnya, Castro ternyata masih hidup (yang tewas adalah penirunya) dan menyerahkan Mason kepada Dragovich dan Kravchenko. Sergei Kozin- (Travis Willingham) Dikenal sebagai 'Monster dari Magadan'. Lidahnya dipotong oleh
Dragovich, penyebab kebisuannya. Sergei membantu Reznov dan Mason kabur, tetapi tewas tertembak saat menahan pintu angkat, mengorbankan dirinya untuk Mason yang akhirnya membuka pintu tersebut. Interogerator Spetsnaz- (Dimitri Diatchenko) Ia ditugaskan menyiksa Mason, Woods dan Bowman. Bowman menolaknya dan ketika ia meludahinya, sang interogator membunuhnya dengan brutal. Ia
kemudian kabur ketika Mason dan Woods berhasil selamat. Sang Interogator akhirnya dibunuh oleh Mason atau Woods, membalas dendam atas kematian Bowman. Pesuruh Vietkong- (Kevin Trang) Anak buah dari sang interogator Spetsnaz. Ia memaksa Mason, Bowman dan Woods bermain Russian Roulette. Ia kemudian dibunuh Mason dengan satu-satunya peluru dalam revolver yang ia berikan. Unit 45- DIbentuk dari Tentara
Merah setelah Perang Dunia Kedua pada misi "Project Nova" untuk mencari Nova 6, gas beracun yang dibuat oleh Nazi yang direncanakan akan dikirim ke kota-kota besar Sekutu melalui laut, tetapi tertahan oleh es di Lingkaran Arktik. Juga untuk menangkap Doktor Freidrich Steiner, orang yang membuat Nova 6. Dipimpin oleh Mayjen Nikita Dragovich.  Tvelin, Velov dan Bikharev- Anggota Unit 45 yang loyal
kepada Reznov. Mereka bertiga ikut dengan Reznov dan Dimitri untuk mencari roket V2 yang diisi oleh Nova 6. Tetapi setelah ditemukan, mereka berlima dan Nevski dimasukkan kedalam 2 ruangan kedap udara (Velov dan Bikharev bersama Dimitri, sementara Tvelin bersama Reznov dan Nevski). Velov, Bikharev dan Dimitri tewas digas, tetapi sisanya lolos karena pasukan Inggris datang
menyerbu, mereka bertiga keluar dan Reznov memasang bom di roket Nova 6, dan keluar. Tetapi Tvelin tewas dibunuh pasukan Inggris, Reznov ditangkap dan Nevski selamat. Nevski- (Daniel Gamburg) Anggota Unit 45 yang loyal kepada Reznov. Ia, Dimitri dan Reznov menuruni bukit dan menaiki truk kelompok mereka dan sampai di markas tentara Jerman di dekat kapal. Kemudian, ia, Reznov, Tvelin, Dimitri, Velov dan
Bikharev dimasukkan kedalam 2 ruangan kedap udara (masing-masing 3 orang). Ketika Dimitri, Velov dan Bikharev tewas digas, ruang satunya terbuka oleh pasukan Inggris yang menyerbu. Nevski, Tvelin dan Reznov keluar dan bertarung, Reznov memasang bom dan mereka bertiga kabur. Bom berhasil meledak, menenggelamkan kapal dan Nevski selamat, meski Reznov tertangkap oleh anak buah Dragovich dan
Tvelin tewas dibunuh pasukan Inggris.  Yared- Anggota Unit 45 yang loyal kepada Dragovich dan Kravchenko. Pertama terlihat ketika ia memegangi senjata Kravchenko ketika sedang mengeksekusi 6 tentara Jerman yang menyerah. Kemudian Yared menyerahkan pisaunya kepada Kravchenko untuk membunuh yang terakhir. Ia sendiri yang memegangi Dimitri untuk dimasukkan kedalam ruangan kedap udara untuk digas. Yared terbunuh oleh kelompok Reznov maupun tentara Inggris dalam pertempuran terakhir.
CIA- Faksi protagonis utama dalam bagian Perang DIngin. Kembali dari permainan pertama, CIA terlibat dalam usaha untuk memutus jaringan narkoba oleh Kartel Menendez dari Nikaragua. Dalam usahanya, CIA terlibat dalam beberapa pertempuran nyata, seperti pada Perang Saudara Angola, Pendudukan Soviet di Afghanistan dan Operasi Just Cause di Nikaragua. Tetapi CIA gagal karena pengkhianatan Manuel Noriega. US Navy
SEALs- Faksi protagonis utama pada bagian 2025. Dalam bagian ini, Navy SEALs berusaha untuk menumpas ancaman Cordis Die dan mencegah berkembangnya SDC, sebuah aliansi militer yang dipimpin oleh Tiongkok. Pasukan Perlindungan Panama- Panamanian Defense Forces (PDF), pasukan pribadi Jenderal Manuel Noriega yang berperan penting dalam misi "Time and Fate". Mereka membantu tim CIA menangkap Menendez di rumahnya di Nikaragua.
Tetapi diam-diam, Noriega membebaskan Menendez setelah memastikan tidak ada saksi, ia juga menolong Menendez yang diperkirakan tewas dalam operasi yang berujung kepada kematian adik Menendez. Mujahidin- Sebuah jaringan gerilya, pasukan perlawanan Afghanistan yang salah satu kelompoknya dipimpin oleh Mullah Rahman. CIA membantu mereka untuk mengusir Soviet yang mendukung
pemerintah Afghanistan. Tetapi, kelompok Rahman ternyata juga berpihak kepada Raul Menendez, setelah berhasil menumpas serangan Soviet, Rahman menyuruh anak buahnya menangkap mereka dan membuangnya ke padang pasir, ditinggalkan untuk tewas karena Menendez mengatakan bahwa mereka harus menderita. Tetapi tanpa sepengetahuan mereka, tim CIA diselamatkan oleh seseorang. Tentara Yaman- 'Musuh'
Farid dalam bagian pertama misi "Achilles' Veil", ia terpaksa melawan mereka dalam menyamar sebagai salah satu anggota Cordis Die. Tentara Yaman menyerbu pertemuan Cordis Die di Sokotra, membantu Navy SEALs mencari dan menangkap Menendez. Dalam bagian kedua, Tentara Yaman membantu Section menangkap Menendez diujung pulau. Tiongkok- Tiongkok dan Amerika Serikat terlibat Perang Dingin Kedua, setelah serangan Cordis Die ke pasar
saham Tiongkok yang memakai armada tak berawak AS yang dibajak Menendez. Di sisi lain, Tian Zhao, pemimpin SDC, aliansi militer yang dipimpin Tiongkok, berusaha memasukkan India, Pakistan, Afghanistan dan Rusia kedalam SDC, meskipun pemerintah melarang Zhao. Mereka meminta bantuan AS untuk mengatasi Zhao, sebagai gantinya Perang Dingin Kedua berakhir dengan pertemanan AS dan Tiongkok. Tergantung pemain, jika pemain
berhasil membunuh Zhao, Tiongkok dan AS bekerja sama untuk menyelamatkan U.S.S. Obama dan menangkap Menendez, mengakhiri Perang Dingin. Tetapi jika tidak, U.S.S. Obama tenggelam, dan pasukan AS harus menangkap Menendez sendirian.
MPLA- Antagonis utama dalam misi "Pyrrhic Victory". Pemain (sebagai Mason) bersama UNITA dan Jason Hudson melawan mereka dalam salah satu pertempuran dalam Perang Saudara Angola di Provinsi Cunene yang berujung kemenangan telak UNITA. Di pedalaman, tentara MPLA menjaga sebuah kapal kargo di sungai Cubango dan melawan Mason dan Hudson. Mereka juga menjaga sebuah desa yang digunakan sebagai markas Raul