Kerajaan Amanatun
pantai selatan Fatu Mean/Amanatun, tetapi pihak VOC menolak dan tidak menyetujui permintaan ini dengan alasan keamanan.
Pada waktu terjadi perang Penfui pada tanggal 11 November 1749 maka kerajaan Amanatun menjadi sekutu Portugis. Salah satu alasan terjadi perang Penfui karena para Raja yang pro kepada Portugis tidak menghendaki adanya pembagian wilayah di Timor khususnya wilayah Timor Barat antara Belanda dengan Portugis, karena akan berakibat kepada semakin jauhnya jarak yang harus ditempuh ke Gereja
Noemuti kalau raja-raja ini ingin untuk beribadah (kalau ingin membawa hulu hasil ke Gereja Katolik Noimuti).
Pembagian pulau Timor tahun 1859 Noimuti seakan merupakan suatu wilayah dunia Portugis di tengah-tengah wilayah Belanda. Gereja Noimuti yang sejak ratusan tahun dijadikan tempat sakral-pemali dan keramat. Raja-raja Timor Katolik yang merawat Gereja Noimuti ini, Uskono mengirim dua suku Tnane- Metkono, Oematan mengirim suku Bani-Aot dan Arin-Kosat, dan Raja Amanatun mengirimkan
Sasi-Panmissa. Setiap tahun pada perayaan pesta paska maka raja-raja tersebut selalu mengirimkan LILIN untuk gereja Noimuti. Di Noimuti terdapat pula empat "tobe" untuk bunga panen atau "maus sufa".
Tahun 1701 Padre M de Santo Antonio sebagai misionaris di Timor dan menjadi Uskup Malaka yang kemudian menetap di Timor hingga tahun 1722. Setelah itu barulah Pater Gerado de San Jose menjadi misionaris di Timor hingga tahun 1782.Dikenal dalam sumber-sumber kuno menyebutkan bahwa pada tahun 1711 pemimimpin Toppas Dominggus da Costa bersama Dom Francisco de Taenube telah terjadi pertengkaran dengan Raja Dom Pedro atau Raja
Tomenu Sonbay dari Oenam berhubungan dengan gereja Abi dan gereja Musi.Sedangkan Raja Sonbai Kecil pada waktu itu adalah Bawwo Leu tahun 1717.
Data VOC 2933,tahun 1758 the National Archief Den Haag yang ditulis oleh Arnoldus Van Este (ayah dari W.A.Van Este) seorang Oppermester di Pos Belanda Kupang yang dilindungi oleh Commpany selama dua puluh lima tahun mencatat tentang Timorese kings yakni;
Sumber VOC tahun 1765 menjelaskan tentanng ditahannya temukung Nai Nokkas karena Nai Nokkas melindungi budak-budak belian (ate sossa) dari Kupang oleh Opperhof Ter Herbruggen mengakibatkan Raja Bab'i Banu Naek dari Amanatun mengirim orang-orangnya sebagai utusannya ke Dewan Belanda untuk membebaskan temukung Nai Nokkas karena Raja Amanatun berkeyakinan bahwa Nai Nokkkas tidak
bersalah. Raja Banunaek harus menebus dan melepaskan kembali temukung Nai Nokkas dengnan memberi 3.50 pikul lili, 4 orang budak, dan dua puluh ikat kain tenun kapas ke Ter Herbruggen.
Perdagangan terbuka yang menjual beli budak diTimor sesuai catatan Tung Hsi Kau tahun 1618 sudah mulai dilakukan. Diceritakan bahwa raja di Timor saat melakukan suatu kunjungan maka di dalam rombongan raja selalu disertakan juga hamba sahayanya (Ata atau Ate) selain permaisuri raja, anak-anaknya, dan gundik-gundiknya. Pigafetta mencatat Atapupu sebagai pasar
hamba sahaya. Sedangkan Atambua katanya berasal dari kata Atan atau Ata (hamba sahaya) dan Buan (Suanggi).
Zaman Portugis dan Belanda pulau Timor cukup dikenal sebagai gudang budak-budak. Prof P.J.Veth dalam tulisannya Het eiland Timor menyatakan bahwa residen Van Este di Kupang tahun 1789 memiliki ribuan budak- hamba sahaya. Tahun 1751 residen Van de Burg melaporkan keadaan Perang Penfui tahun 1749 dan sebagai lampiran dikirim juga tujuh puluh orang budak yakni 35 orang budak
dibeli dari orang Cina The Tinko dan 35 orang lainnya dibeli dari orang Cina Oeijn Panko dengan harga rata-rata fl.62.
Pada masa residen Ter Herbruggen (1761) ada kebiasaan bahwa kalau seorang petugas hendak pergi ke Batavia untuk sesuatu urusan maka terlebih dahulu ia masuk ke kampung-kampung sekitar Kupang dengan membawa anjing pemburu untuk memburu dan menangkap manusia. Orang-orang yang ditangkap itu di bawa ke Batavia sebagai hadiah bagi atasan dan kenalan serta kerabat, dan yang lain dijual untuk mendapatkan uang.
Pada tahun 1785 Opperhoof Tuan Willem Adrian Van Este mengirim surat kepada Raja Tubani untuk segera mengembalikan tanah yang sudah diduduki di wilayah Amanatun. Data VOC 3701 hal 500 pada tahun 1785 ini menceriterakan bahwa ketika resident (Opperhoof) Timor W.A.Van Este di Fort Concordia Kupang menulis bahwa Raja Amanuban yang anti VOC yakni Raja Tubani menyerang kerajaan Amanatun yang ada hubungan dengan VOC dan
ia berhasil menduduki sebagian wilayah Amanatun. Di zaman itu ada dua kekuatan di kerajaan Amanuban.
Residen J A Hazart merupakan residen Timor kelahiran Timor 8 Agustus 1773. Saat resident Hazart menjadi residet di Timor maka raja Amanatun pada saat itu adalah raja Muti Banunaek I (atau biasa disebut Raja Kusat Muti). Residen Hazart memerintah tahun 1810-1811, dimana pada tahun 1811 Nusantara diserahkan ke Inggris dan baru dikembalikan kepada Belanda tahun 1816 dan kembali residen Hazart
berkuasa kembali. Banyak hal yang diperbuat Hazart saat menjadi residen Timor seperti:- Daerah pertahanan VOC di pantai utara Timor (Manulae hingga Pariti) pada tahun 1819 dipenuhi oleh orang-orang Rote yang didatangkan oleh Belanda sebagai pagar hidup Belanda untuk mencegah serangan dari raja-raja Timor sepeti Amarasi, Amanuban, Amakono, Amanatun.
Orang-orang Rote yang didatangkan Belanda ke Timor juga untuk menjadi tenaga kerja- budak Belanda untuk mengerjakan daerah-daerah subur/aluvial di sepanjang pantai sekitar 2000-3000 Ha untuk menghasilkan beras. Pada tahun 1822 Belanda juga mendatangkan lagi orang-orang Sabu ke Timor sebagai pasukan pembelah Belanda namun jumlah orang Sabu tidak sebanyak jumlah orang Rote karena karakter
orang Sabu yang suka memberontak. Kemudian Hazart menjadikan Kupang sebagai pelabuhan terbuka/pintu gerbang Timor. Kemudian residen Hazart juga merebut Atapupu.Tahun 1842 Resident Hazart juga berhasil membuka lalulintas jalan ke Pariti dan pada tahun 1879 dibuka lagi jalan Kupang- Teno.
Sumber pendapatan raja pada saat itu adalah jagung, cendana dan lilin, dimana setengah hasil cendana dan lilin digunakan oleh raja untuk mendapatkan emas. Pada tahun 1870 dicatat jumlah penduduk di kerajaan Amanatun sudah melebihi 12000 jiwa.
Disebut kerajaan Amanatun kerena Rajanya yakni Banunaek yang bernama lengkap Raja Tnai Pah Banunaek)- Ukuran alam, badannya emas dan semua peralatannya juga terbuat dari emas. Amanatun terdiri dari dua suku kata yaitu Ama dan Mnatu. "Ama" berarti "Bapak" dan "Mnatu" berarti "emas". Jadi Amanatun berarti "Bapak Emas". Mal Noni adalah Cap Emas
Raja Banunaek. Raja Amanatun yakni Banunaek tetap menetap di Tun Am (Amanatun) menjaga kampung halaman Tufe Ba Noni Fae Ba Noni- Tun Am Fatu Mean, sedangkan Liuray kemudian ke bagian Timur pulau Timor (matahari terbit) Nao Neu Neno Pean Neno Bolan dan kemudian dikenal dengan Raja Belu, sedangkan Sonbay ke bagian barat pulau Timor (matahari terbenam) Nao Neu Neno Tesan Neno Mofun es Mutis Bab Nae Pae Neno Oenam dan kemudian dikenal dengan Raja Molo/Oenam.
Nama Raja pertama di pulau Timor adalah Liuray/Liu Lay/Riyu Ray/Mean/Maromak Oan, Sonbay/Boynoni/Istana Kapal, Banunaek/Luku Neno. Raja] Pertama di daratan Timor ini adalah bangsawan dengan keluarganya serta rombongannya tiba pertama kali di pelabuhan NOE FANU, pelabuhan yang termasyur dalam sejarah penghuni dataran pulau Timor dan pulau-pulau
sekitarnya. Ketiga bangsawan bersaudara pertama yang adalah raja pertama Timor ini datang bersama dengan ayah ibu mereka.
Bangsawan ini memiliki gelar menurut ilmu pengetahuan tak ada taranya pada masa itu. Ilmu yang dimiliki bangsawan ini luar biasa luasnya. Dari Noe Fanu mula-mula mereka mengunjungi Raymas/Laynu Belu.Dari laynu mengunjungi Raymea-Laymea- Belu kemudian balik mengunjungi tempat Noe Fanu. Dari Noe Fanu mengunjungi Tun Am " Persembahan di Amanatun". Di sini dinyatakan pokok ilmunya itu yaitu