Fridtjof Wedel-Jarlsberg Nansen
satu sama lain; setelah bergerak lebih dekat, Jackson bertanya: "Apakah kau Nansen?", dan ia menjawab "Ya, saya Nansen." Johansen kemudian membawanya, dan keduanya dibawak ek Tanjung Flora dimana mereka dipulihkan selama berpekan-pekan berikutnya. Nansen kemudian menyatakan bahwa ia "masih sangat menggigil" saat mengalami keberuntuhan dadakan tersebut; bukan
karena serangan walrus yang menyebabkan penundaan, namun karena kedua belah pihak tak menyadari keberadaan satu sama lain.
Pada 7 Agustus, Nansen dan Johansen menumpangi kapal suplai Jackson "Windward", dan berlayar menuju Vard dimana mereka datang pada tanggal 13. Mereka disambut oleh Hans Mohn, originator teori perjalanan kutub, yang sedang berada di kota tersebut. Dunia dengan cepat diberitahukan melalui telegram tentang kepulangan Nansen dengan selamat, namun tak ada kabar soal "Fram". Menumpangi kapal uap surat mingguan di kawasan
selatan, Nansen dan Johansen mencapai Hammerfest pada 18 Agustus, dimana mereka mengetahui bahwa "Fram" telah tampak. Kapal tersebut berlayar dari utara es ke barat Spitsbergen, sesuai predisi Nansen, dan sekarang sedang berjalan menuju Troms. Kapal tersebut tak melintasi kutub, maupun mencapai markah utara Nansen. Tanpa menunda-nunda, Nansen dan Johansen berlayar ke Troms, dimana mereka bertemu lagi dengan para rekan mereka.
Perjalanan pulang menuju Christiania diwarnai serangkaian penyambutan di setiap pelabuhan. Pada 9 September, "Fram" sampai ke pelabuhan Christiania dan disambut oleh kerumunan terbesar dari kota tersebut yang pernah terlihat. Para kru disambut oleh Raja Oscar, dan Nansen, yang bertemu lagi dengan keluarnya, singgah di istana selama beberapa hari sebagai tamu istimewa. Tribut-tribut berdatangan dari
seluruh dunia; terutama tribut yang datang dari pendaki Inggris Edward Whymper, yang menuliskan bahwa Nansen telah menjadi "hampir sebesar kemajuan yang diikuti oleh seluruh perjalanan lainnya pada abad kesembilan belas yang dilakukan bersama".
Tugas pertama Nansen saat kepulangannya adalah menuliskan catatan perjalanannya. Hal ini ia lakukan dengan cepat, menghasilkan 300.000 kata dari teks Norwegia pada November 1896; terjemahan bahasa Inggrisnya yang berjudul "Farthest North" diluncurkan pada Januari 1897. Buku tersebut cepat meraih kesuksesan, dan memberikan keuangan jangka panjang bagi Nansen. Nansen menulis tanpa komentar pada salah
satu kritikan signifikan yang dimajukan pada jabatatannya, yang dikatakan oleh Greely, yang menulis dalam "Harper's Weekly" tentang keputusan Nansen untuk meninggalkan "Fram" dan menjelajahi kutub: "Ini melewatkan pemahaman tentang bagaimana Nansen menyimpang dari tugas paling suci yang terjadi pada komandan ekspedisi angkatan laut."
Pada 20 tahun setelah kepulangannya dari Arktik, Nansen mencurahkan sebagian besar energinya untuk karya saintifik. Pada 1897, ia menerima gelar profesor dalam bidang zoologi di Universitas Kerajaan Frederick, yang memberikannya sebuah pangkal dari dimana ia mengambil tugas besar dalam menyunting laporan-laporan dari hasil saintifik ekspedisi "Fram". Ini merupakan tugas yang lebih rumit
ketimbang menulis penjelasan ekspedisi. Hasilnya kemudian diterbitkan dalam enam volume, dan menurut ilmuwan kutub pada masa berikutnya, Robert Rudmose-Brown, "adalah untuk oseanografi Arktik dari apa yang dihasilkan dari ekspedisi Challenger telah menjadi oseanografi dari samudera-samudera lainnya."
Pada 1900, Nansen menjadi direktur Laboratorium Internasional untuk Riset Laut Utara yang berbasis di Christiania, dan membantu pendirian Dewan Internasional untuk Penjelajahan Laut. Melalui hubungannya dengan Dewan Internasional untuk Penjelajahan Laut, pada musim panas tahun 1900, Nansen melakukan kunjungan pertamanya ke perairan Arktik sejak ekspedisi "Fram", mengarungi Islandia dan Tanah Jan Mayen memakai kapal riset oseanografi
"Michael Sars", yang mengambil nama dari ayah Eva. Tak lama setelah ia pulang, ia mengetahui bahwa catatan "Farthest North" buatannya dipakai oleh para anggota ekspedisi Italia pimpinan Adipati Abruzzi. Mereka mencapai 86°34′N pada 24 April 1900, dalam sebuah upaya untuk mencapai Kutub Utara dari Tanah Franz Josef. Nansen menanggapi kabar tersebut dengan berkata: "Apa nilai dari
tujuan-tujuan bagi mereka sendiri? Mereka semua lenyap... itu adalah sebuah pertanyaan waktu." Nansen sekarang dianggap penyuara bagi seluruh penjelajah dari kawasan kutub utara dan selatan. Abruzzi telah menyarankannya, seperti halnya Adrien de Gerlache dari Belgia, agar melakukan ekspedisi ke Antarktika. Meskipun Nansen menolak bertemu penjelajah sejawat dan
senegaranya sendiri Carsten Borchgrevink (yang ia anggap curang), ia memberikan nasehat kepada Robert Falcon Scott tentang perlengkapan dan transportasi kutub, sebelum Ekspedisi Penemuan tahun 1901-04. Pada satu titik. Nansen benar-benar dianggap memimpin ekspedisi Kutub Selatannya sendiri, dan membujuk Colin Archer untuk merancang dua kapal. Namun, rencana tersebut masih dalam tahap perancangan.
Pada 1901, keluarga Nansen bertambah anggotanya. Seorang putri, Liv, telah lahir sebelum "Fram" berangkat; seorang putra, Kre lahir pada 1897 disusul oleh seorang putri, Irmelin, pada 1900 dan kemudian seorang putra bernama Odd pada 1901. Rumah keluarga tersebut, yang Nansen bangun pada 1891 dari laba buku ekspedisi Greenland-nya, sekarang menjadi terlalu kecil. Nansen mengakuisisi
sebauh petak lahan di distrik Lysaker dan membangun sebuah rumah besar rancangannya sendiri yang mengkombinasikan beberapa karakteristik rumah manor Inggris dengan fitur-fitur dari renaisans Italia. Rumah tersebut siap diduduki pada April 1902; Nansen menyebutnya "Polhgda" (artinya "dataran tinggi kutub"), dan masih menjadi rumahnya pada sisa masa hidupnya. Anak kelima dan terakhirnya, seorang putra bernama Asmund, lahir di Polhgda pada 1903.
Persatuan antara Swedia dan Norwegia, yang dihimpun oleh Kekuatan-Kekuatan Besar pada 1814, telah beradal di bawah gonjang-ganjing sepanjang 1890an, masalah utamanya adalah pertanyaan soal hak asasi Norwegia terhadap layanan konsuler-nya sendiri. Meskipun tak berniat menjadi politikus, Nansen telah berbicara terbuka soal masalah tersebut beberapa kali dalam
membela kepentingan Norwegia. Pada awal abad ke-20, perjanjian antar dua negara tersebut makin terpampang, namun harapan kandas saat negosiasi diurungkan pada Februari 1905. Pemerintahan Norwegia jatuh, dan digantikan oleh pemerintahan pimpinan Christian Michelsen, yang programnya adalah salah satu dari perpecahan dari Swedia.
Pada Februari dan Maret, Nansen menerbitkan serangkaian artikel surat kabar yang menempatkannya pada pihak separatis. Perdana menteri baru ingin Nansen berada di kabinet, namun Nansen tak memiliki ambisi politik. Namun, atas permintaan Michelsen, ia datang ke Berlin dan kemudian ke London dimana, dalam sebuah surat kepada "The Times", ia menghadirkan kasus hukum Norwegia untuk layanan konsuler terpisah di
negara-negara pemakai bahasa Inggris. Oada 17 Mei 1905, Hari Konstitusi Norwegia, Nansen menyampaikan pernyataan kepada sebuah kerumunan besar di Christiania, dengan berkata: "Sekarang semua jalan retret telah ditutup. Sekarang, hanya masih ada satu wadah, jalan kedepan, mungkin melalui kesulitan dan kerja keras, namun kedepan bagi negara kita,
untuk Norwegia merdeka". Ia juga menulis sebuah buku, "Norwegia dan Persatuan dengan Swedia", yang secara khusus mempromosikan kasus Norwegia di luar negeri.
Pada 23 Mei, Storting mengesahkan Undang-Undang Konsulat yang mendirikan sebuah layanan konsuler terpisah. Raja Oscar menolak penyerahannya; pada 27 Mei, kabinet Norwegia mengundurkan diri, namun raja tak mengakui langkah tersebut. Pada 7 Juni, Storting secara unilateral mengumumkan bahwa persatuan dengan Swedia ditiadakan. Dalam keadaan tegang, pemerintah Swedia menyepakati permintaan Norwegia