Frontier Airlines
Sebagai bagian dari rencananya untuk memfokuskan diri di bisnis penerbangan regional melalui kontrak dengan maskapai besar, maka pada bulan Januari 2012, Republic Airways Holdings pun mengumumkan rencananya untuk memisahkan ataupun menjual Frontier. Pada tanggal 26 Januari 2012, Republic Airways Holdings akhirnya menunjuk mantan CEO US Airways dan Gate Gourmet, David Siegel sebagai Presiden dan CEO baru Frontier Airlines. Republic juga menambahkan beberapa petinggi senior baru di divisi keuangan dan
komersial Frontier. Para petinggi Frontier pun juga dipindahkan ke kantor pusat lama Frontier di Denver, untuk menyediakan ruang bagi Frontier untuk menata perusahaannya selama proses pemisahannya dari Republic.
Pada bulan November 2012, Frontier membuka rute baru dari Bandara Orlando ke Bandara Trenton-Mercer di Trenton, New Jersey, yang pada saat itu tidak melayani satupun penerbangan berjadwal. Frontier lalu membuka rute baru dari Trenton ke beberapa destinasi lain, sehingga pada bulan Juni 2014, Frontier telah terbang dari Trenton ke 17 destinasi berbeda. Frontier saat ini juga menyimpan tiga pesawatnya di Trenton. Bandara ini terletak kurang lebih di tengah-tengah Bandara Philadelphia dan Bandara Newark.
Pada bulan Juli 2013, Frontier juga membuka rute baru dari Bandara New Castle di Wilmington, Delaware, ke lima destinasi berbeda. Walaupun terletak di Delaware, Frontier lebih memilih untuk memasarkan bandara ini dengan nama Wilmington/Philadelphia. Bandara ini sebelumnya juga tidak melayani satupun penerbangan berjadwal. Bandara ini terletak kurang lebih 30 mil dari Bandara Philadelphia dan 75 mil dari Bandara Baltimore-Washington.
Frontier memasarkan kedua bandara ini sebagai bandara alternatif yang lebih murah dan lebih sepi. Frontier juga tetap menjadi satu-satunya maskapai komersial yang terbang ke kedua bandara tersebut
Pada bulan Januari 2015, Frontier Airlines menghentikan beberapa penerbangan dari Wilmington dan Trenton. Frontier juga kembali membuka rutenya ke Philadelphia, sehingga menimbulkan keraguan tentang kelangsungan penerbangannya dari Trenton dan Wilmington. Pada akhir bulan Juni 2015, Frontier akhirnya mengumumkan penghentian seluruh penerbangannya dari ataupun ke Wilmington, dengan alasan tidak memberikan keuntungan yang berarti.
Pada bulan Oktober 2013, Republic Airways Holdings resmi menandatangani perjanjian dengan Indigo Partners untuk menjual Frontier Airlines dengan harga $145 juta. Menurut Indigo, transaksi ini akan membuat Frontier menjadi maskapai berbiaya rendah yang lebih baik lagi. Pada bulan Desember 2013, Indigo Partners LLC, melalui sebuah afiliasi, akhirnya menyelesaikan pembelian Frontier Airlines dari Republic Airways Holdings. Kantor pusat Frontier akan tetap berada di Denver. Republic Airlines pun tidak lagi menerbangkan Embraer 190 miliknya dengan nama Frontier, mulai tanggal 1 Januari 2014.
Pada tahun 2014, Frontier mengumumkan bahwa mereka akan berevolusi menjadi maskapai berbiaya ekstra rendah. Frontier juga berencana untuk menutup beberapa rute dan merumahkan sejumlah pegawai di penghubungnya di Denver. Pada tanggal 16 Januari 2015, Frontier mengumumkan bahwa mereka akan menutup layanan call centernya di Denver dan Milwaukee, sehingga 1300 pegawai harus dirumahkan. Frontier lalu menyewa Sitel, sebuah perusahaan penyedia call center untuk menggantikannya.
Pada bulan Mei 2015, Indigo dan Frontier mengumumkan berhentinya David Siegel sebagai CEO. Ia sebelumnya juga telah menyerahkan jabatan presidennya ke Barry Biffle, mantan petinggi di Spirit Airlines. Tetapi, Frontier tidak langsung menunjuk pengganti Siegel dan lebih memilih untuk membagi tugas Siegel ke Biffle dan Bill Franke, direktur Indigo. Biffle menyatakan bahwa hal ini disebabkan adanya masalah operasional akibat berhentinya Siegel.
Pada bulan Februari 2015, Frontier mengumumkan bahwa mereka akan mulai melayani penerbangan dari Atlanta dan menambahkannya sebagai kota fokus. Pada bulan Juli 2015, Frontier juga mulai mengurangi penerbangannya dari Bandara Washington Dulles dan mencabut statusnya sebagai kota fokus. Pada bulan Agustus 2015, Frontier Airlines mengikuti jejak Spirit dan Allegiant untuk menghentikan layanan pelanggan bebas pulsanya. Pada awal tahun 2016, Frontier mengumumkan ekspansi besar-besaran dengan membuka rute baru ke Atlanta, Chicago, Cincinnati, Cleveland, Orlando, dan Philadelphia.
Pada tahun 1997, Maverick Airways melakukan perjanjian codeshare dengan Frontier, dengan menggunakan pesawat de Havilland Canada DHC-7 Dash 7, untuk melayani rute dari Denver (DEN), Grand Junction (GJT), dan Steamboat Springs (SBS). Tetapi, penerbangan ini tidak dapat bertahan lama, karena Maverick mengalami masalah finansial dan lalu harus menghentikan operasinya.
Chautauqua Airlines mengoperasikan hingga 12 unit Embraer 135 dan 145 dari Milwaukee untuk Frontier. Baru pada musim semi tahun 2011, Frontier memasarkan penerbangan Chautauqua ini dengan nama Frontier Express. Dengan ditutupnya penghubung Frontier di Milwaukee, satu-satunya rute yang tetap dipertahankan adalah rute ke Rhinelander, dengan menggunakan ERJ-145. Tetapi, rute ini akhirnya juga ditutup pada tanggal 3 Januari 2013. Chautauqua pun memindahkan seluruh pesawatnya dari Milwaukee untuk melayani maskapai lain.
Pada bulan Februari 2002, Frontier meluncurkan maskapai regional barunya, dengan nama Frontier JetExpress, yang awalnya dioperasikan oleh Mesa Airlines dengan menggunakan Bombardier CRJ200. Frontier JetExpress ini ditujukan untuk melayani rute dari dan ke Denver yang tidak terlalu menguntungkan jika dilayani dengan pesawat terkecil milik Frontier, Airbus A318, namun masih cukup menguntungkan jika dilayani dengan pesawat yang lebih kecil.
Kemitraan JetExpress dengan Mesa berakhir pada bulan Januari 2004, saat Frontier menunjuk Horizon Air untuk menggantikan Mesa. Horizon menggunakan pesawat yang lebih besar daripada Mesa, yakni Bombardier CRJ700. Pada bulan Agustus 2006, Frontier dan Horizon akhirnya mengakhiri kemitraan ini.
Pada tanggal 6 September 2006, Frontier membentuk divisi baru bernama Lynx Aviation, untuk mengoperasikan Bombardier Q400 mulai bulan Mei 2007. Pada tanggal 5 Desember 2007, Lynx Aviation akhirnya menerima sertifikat operasi dari FAA. Lynx pun mulai mengangkut penumpang pada tanggal 6 Desember 2007.
Setelah itu, Lynx juga membuka rute ke Albuquerque, Aspen, Billings, Bozeman, Colorado Springs, Durango, Fargo, Jackson Hole, Oklahoma City, Rapid City, Tulsa, Wichita, Omaha, dan Salt Lake City.
Pada tahun 2012, operasi Lynx Aviation digabung ke anak usaha Republic Airways Holdings, Republic Airlines. Pesawat Q400 inipun tidak lagi digunakan untuk melayani penerbangan regional Frontier, tetapi digunakan untuk melayani penerbangan regional United Airlines yang juga dioperasikan oleh Republic.
Frontier Airlines adalah salah satu pengguna pertama Airbus A318, tetapi seluruh A318 miliknya telah dipensiunkan pada tahun 2013. Pada Paris Air Show tahun 2011, Republic Airways Holdings memesan 60 unit Airbus A320neo dan 20 unit A319neo untuk Frontier.