Utsman bin 'Affan
menghindari pertumpahan darah Muslim oleh Muslim. Sayangnya bagi Utsman, kekerasan masih terjadi. Gerbang-gerbang rumah Utsman ditutup dan dijaga oleh prajurit yang terkenal, Abd-Allah bin al-Zubayr. Putra-putra Ali, Hasan ibn Ali, dan Husayn ibn Ali, juga menjadi salah satu penjaga.
Pada tanggal 17 Juni 656, ketika menemukan gerbang rumah Utsman yang dijaga ketat oleh para pendukungnya, pemberontak Mesir memanjat dinding belakang dan merayap masuk, meninggalkan para penjaga di gerbang yang tidak tahu apa yang sedang terjadi di dalam. Para pemberontak memasuki kamarnya dan memukul kepalanya. Naila, istri Utsman, melemparkan dirinya ke tubuhnya untuk
melindunginya dan mengangkat tangannya untuk membelokkan pedang. Dia memiliki jari-jarinya dipotong dan disingkirkan. Pukulan berikutnya membunuh Utsman. Beberapa budak Uthman menyerang balik, salah satunya membunuh pembunuh bayaran itu dan pada gilirannya dibunuh oleh para pemberontak.
Para perusuh mencoba memenggal mayat Uthman, tetapi dua janda, Nailah dan Umm al-Banin, melemparkan diri mereka ke tubuh dan berteriak, memukul wajah mereka dan merobek pakaian mereka, sampai para perusuh itu terhalang. Sebaliknya, mereka menjarah rumah, bahkan merenggut cadar wanita. Para pemberontak meninggalkan rumah dan para pendukung Utsman di gerbang mendengar mereka dan masuk, tetapi sudah terlambat.[ butuh rujukan ]
Setelah mayat Utsman sudah ada di rumah selama tiga hari, Naila, istri Utsman, mendekati beberapa pendukungnya untuk membantu penguburannya, tetapi hanya sekitar selusin orang yang menjawab. Ini termasuk Marwan, Zayd ibn Thabit, 'Huwatib bin Alfarah, Jubayr ibn Mut'im, Abu Jahm bin Hudaifa, Hakim bin Hazam dan Niyar bin Mukarram. Tubuh diangkat saat senja,
dan karena blokade, tidak ada peti mati yang bisa diperoleh. Tubuh tidak dicuci, karena ajaran Islam menyatakan bahwa tubuh para martir tidak seharusnya dicuci sebelum dimakamkan. Dengan demikian, Utsman dibawa ke kuburan di pakaian yang dia kenakan pada saat pembunuhannya.
Tubuhnya dikuburkan oleh Hassan, Hussein, Ali dan lainnya, namun; beberapa orang menyangkal bahwa Ali menghadiri pemakaman Naila mengikuti pemakaman dengan lampu, tetapi untuk menjaga kerahasiaan lampu itu harus dipadamkan. Naila ditemani oleh beberapa wanita termasuk putri Uthman, Aisha.
Mayat itu dibawa ke Jannat al-Baqi, kuburan Muslim. Tampaknya bahwa beberapa orang berkumpul di sana, dan mereka menolak penguburan Utsman di kuburan kaum Muslim. Para pendukung Utsman bersikeras bahwa tubuh harus dimakamkan di Jannat al-Baqi. Mereka kemudian menguburkannya di kuburan orang Yahudi di belakang Jannat al-Baqi. Beberapa dekade kemudian, para penguasa Umayyah menghancurkan
tembok yang memisahkan dua kuburan dan menggabungkan pemakaman Yahudi ke pemakaman Muslim untuk memastikan bahwa makamnya kini berada di dalam pemakaman Muslim.
Doa pemakaman dipimpin oleh Jabir bin Muta'am, dan mayat itu diturunkan ke dalam kubur tanpa banyak upacara. Setelah dimakamkan, Naila janda Utsman dan Aisha putrinya ingin berbicara, tetapi mereka disarankan untuk tetap diam karena bahaya yang mungkin dari para perusuh.
Alasan sebenarnya untuk gerakan anti-Utsman diperdebatkan di kalangan Muslim Syiah dan Sunni. Menurut sumber-sumber Sunni, tidak seperti pendahulunya, Umar, yang mempertahankan disiplin dengan tangan yang keras, Utsman kurang teliti terhadap kekuasaan yang ia pegang dan lebih fokus pada kemakmuran ekonomi. Di bawah Utsman, orang-orang menjadi lebih makmur
secara ekonomi dan di bidang politik mereka datang untuk menikmati kebebasan yang lebih besar. Tidak ada lembaga yang dirancang untuk menyalurkan kegiatan politik, dan, dengan tidak adanya institusi semacam itu, kecemburuan dan persaingan kesukuan pra-Islam, yang telah ditekan di bawah khalifah sebelumnya, meletus sekali lagi. Dalam pandangan kebijakan lunak yang diadopsi
oleh Utsman, orang-orang mengambil keuntungan dari kebebasan seperti itu, yang akhirnya memuncak dalam pembunuhan Utsman.
Menurut Wilferd Madelung, selama pemerintahan Utsman, "keluhan terhadap tindakannya yang sewenang-wenang itu substansial menurut standar waktunya. Sumber-sumber sejarah menyebutkan catatan panjang tentang kesalahan yang dituduhkan padanya... Hanya kematiannya yang kejam yang datang untuk membebaskannya. dalam ideologi Sunni dari ahath dan membuatnya menjadi martir dan Khalifah Ketiga
yang Dipandu. " Menurut Keaney Heather, Utsman, sebagai seorang khalifah, hanya mengandalkan kemauannya sendiri dalam memilih kabinetnya, yang menyebabkan keputusan yang memunculkan resistensi dalam komunitas Muslim. Memang, gaya pemerintahannya membuat Utsman salah satu tokoh paling kontroversial dalam sejarah Islam.
Perlawanan terhadap Utsman berawal karena dia lebih menyukai anggota keluarga daripada yang lain dalam memilih gubernurnya, dengan alasan bahwa dengan melakukan ini, dia akan dapat memberikan pengaruh lebih pada bagaimana kekhalifahan itu dijalankan dan akibatnya memperbaiki sistem kapitalis yang dia usahakan untuk didirikan. Kebalikannya ternyata benar dan orang yang
ditunjuknya lebih memiliki kendali atas bagaimana dia menjalankan bisnis daripada yang semula ia rencanakan. Mereka melangkah lebih jauh untuk memaksakan otoritarianisme atas provinsi-provinsi mereka. Memang, banyak surat kaleng yang ditulis kepada teman-teman terkemuka Muhammad, mengeluh tentang dugaan tirani gubernur yang ditunjuk Uthman. Selain itu, surat-surat dikirim
ke para pemimpin opini publik di berbagai provinsi terkait pelecehan kekuasaan yang dilaporkan oleh keluarga Utsman. Ini berkontribusi pada kerusuhan di kekaisaran dan akhirnya Utsman harus menyelidiki masalah ini dalam upaya untuk memastikan keaslian gosip tersebut. Wilferd Madelung mendiskreditkan dugaan peran Abdullah bin Saba dalam pemberontakan melawan Utsman dan mengamati bahwa beberapa jika ada sejarawan modern akan menerima legenda Sayf tentang Ibnu Saba.