Plot Naruto
untuk menghabisi kakaknya itu. Ketika Itachi berhasil menemui Naruto, Sasuke muncul dan berusaha menyerangnya. Karena perbedaan kekuatan, Sasuke kalah karena mendapat serangan genjutsu kematian klan Uchiha. Naruto hampir diculik jika Jiraiya tidak muncul dan menyelamatkannya dari Kisame dan Itachi.
Saat hiruk pikuk Ujian Chuunin selesai, posisi Hokage menjadi kosong akibat pengorbanan Hokage Sarutobi. Jiraiya sebagi Sannin ditawarkan untuk menjadi Hokage, tetapi dia menolak dan mengajukan satu nama, Tsunade, mantan rekan Jiraiya dan Orochimaru. Dia mengajak serta Naruto dan sambil mencari informasi dia mengajari jutsu super sulit level A yaitu Rasengan.
Jiraiya dan Naruto para akhirnya berhasil menemukan Tsunade yang penampilnya sama sekali tidak mencirikan fisik seorang nenek seperti yang dibayangkan Naruto. Tetapi Orochimaru sudah mendahului Jiraiya dan memberikan tawaran yang menarik pada Tsunade. Akhirnya Naruto menantang Tsunade berduel untuk membalas ucapan Tsunade yang menjelek-jelekkan Hokage dan
Konoha. Naruto berani bertaruh dengan tantangan Tsunade bahwa ia tidak akan bisa menguasai jurus Rasengan dalam beberapa waktu. DIa teringat adiknya ketika melihat kegigihan Naruto.
Tsunade lalu menemui Orochimaru untuk menyembuhkan tangannya yang terkena Sinjutsu Shikifujin. Akan tetapi Tsunade menolak dan bertarung melawan Orochimaru dan Kabuto dibantu Jiraiya dan Naruto. Pertarungan antar sannin berlangsung sengit, masing-masing mengeluarkan kuchiyose andalnnya Tsunade dengan Katsuyu, Jiraiya dengan Gamabunta, dan Orochimaru dengan Manda. Disini
naruto berhasil menyempurnakan Rasengan miliknya dan menghajar Kabuto. Orochimaru pun mundur karena kalah jumlah dan kondisinya sudah sangat parah. Tsunade pun akhirnya mau mengisi posisi Hokage kelima dan memberikan kalung warisan Hokage Pertama pada Naruto karena kalah bertaruh.
Sejak Sasuke merasa Naruto semakin kuat, karena bisa mengalahkan Gaara, ninja yang tidak bisa dia kalahkan, Sasuke menganggap dirinya sendiri seorang pecundang dan menaruh kedengkian terhadap Naruto. Dia lalu menantang Naruto di atap rumah sakit dan mengajaknya berduel. Disaat keduanya hampir beradu nyawa, Kakashi menghentikan mereka. Sasuke lalu
didatangi oleh utusan Orochimaru dan ditawari untuk menjadi lebih kuat. Dia menerimanya dan dimasukkan ke segel peti mati. Mendengar kabar tersebut, Hokage Kelima memerintahkan pengejaran yang dipimpin Chuunin Shikamaru dengan anggota Naruto Uzumaki, Kiba Inuzuka, Neji Hyuga, dan Choji Akimichi. Mereka mengejar Sasuke, tetapi mereka terdesak karena kemampuan para ninja Oto yang
sangat kuat serta kemunculan Kimimaro. Ketika keadaan semakin sulit, Rock Lee, Kankuro, Temari dan Gaara datang membantu dan berhasil mengalahkan mereka. Akhirnya Naruto dan Sasuke saling berhadapan di lembah kematian (Valley of The End) yang pernah dijadikan tempat pertarungan hidup-mati antara Senju Hashirama (Hokage Pertama) dan Uchiha Madara. Setelah pertarungan yang sengit, akhirnya Naruto menggunakan
chakra Kyuubi berekor satu dan Sasuke menggunakan Level Utama Segel Gaib Orochimaru yang membuat dia mempunyai dua sayap berbentuk tangan. Sasuke menggunakan Chidori dan Naruto menggunakan Rasengan. Terjadi ledakan dahsyat akibat terbenturnya Chidori dan Rasengan. Merekapun teringat masa lalu dan bertarung dengan kekuatan seimbang, meski Naruto hanya berhasil mengggores ikat kepala Sasuke sementara
dia pingsan akibat mendapat hantaman di dada dari pukulan Sasuke. Meski semula berniat untuk menghabisi Naruto untuk menepati pemintaan Itachi, Sasuke menolak mengikuti cara kakaknya itu lalu lebih memilih meninggalkan Naruto sendiri di tepi air terjun dan menuju ke tempat Orochimaru dan meninggalkan Ikat Kepala Konoha miliknya.
Naruto dan kawan-kawannya yang selamat dibawa kembali ke Konoha dan dirawat. Bahkan keadaan Neji dan Chouji sangat kritis, tetapi berhasil diatasi. Naruto yang kesal karena tidak bisa membawa kembali Sasuke diajak mengembara juga berlatih bersama Jiraiya sambil menunggu kabar tentang pergerakan Akatsuki.
Sebagai informasi, saking berhasilnya Naruto di Jepang, sampai dibuat versi anime dan juga versi layar lebarnya, bahkan dibuat juga permainan video ("video game") nya seperti di PlayStation, PlayStation 2, Game Boy Advance dan Nintendo DS. Manganya sendiri sudah berkembang sangat jauh, kompleks, dan sangat menarik.
Dalam perkembangannya naruto dibagi menjadi 2 chapter, yaitu chapter sebelum dan sesudah naruto meninggalkan Konoha bersama Jiraiya untuk berlatih.