Konflik Chad-Libya
Komunitas internasional (khususnya Perancis dan Amerika Serikat) bereaksi keras terhadap serangan yang didukung Libya. Pada hari yang sama setelah jatuhnya Faya, Menteri Luar Negeri Perancis, Claude Cheysson memperingatkan Libya bahwa Perancis tidak akan tetap "acuh tak acuh" terhadap intervensi baru Libya di Chad, dan pada tanggal 11 Juli pemerintah Perancis kembali menuduh Libya sebagai
pihak yang memberikan dukungan langsung militer terhadap para pemberontak. Pengiriman senjata Perancis dilanjutkan pada tanggal 27 Juni, dan pada tanggal 3 Juli kontingen pertama yang terdiri dari 250 orang Zaire tiba untuk memperkuat Habré. Sementara itu, Amerika Serikat mengumumkan pada bulan Juli bantuan militer dan makanan senilai 10 miliar dolar. Di sisi lain, Gaddafi juga mengalami kegagalan diplomatik di Organisasi
Kesatuan Afrika, karena organisasi tersebut secara resmi mengakui pemerintahan Habré dan meminta semua pasukan asing untuk meninggalkan Chad dalam sebuah pertemuan yang diadakan pada bulan Juni.
Dengan bantuan dari Amerika Serikat, Zaire dan Perancis, Habré dengan cepat mereorganisasi pasukannya (sekarang disebut Angkatan Bersenjata Nasional Chad atau FANT) dan bergerak ke utara untuk menyerang GUNT dan Libya. Mereka bertempur di sebelah selatan kota Abéché. Habré membuktikan kemampuannya dan berhasil menghancurkan pasukan Goukouni. Ia lalu memulai sebuah serangan balasan yang berhasil merebut kembali Abéché, Biltine, Fada dan, pada tanggal 30 Juli, Faya-Largeau.
Gaddafi merasa bahwa kehancuran GUNT akan merusak martabatnya. Ia juga khawatir bahwa Habré akan menyediakan bantuan kepada semua oposisi Gaddafi, sehingga ia melancarkan intervensi, terutama mengingat bahwa sekutu Chadnya tidak dapat memperoleh kemenangan tanpa bantuan Libya.
Semenjak jatuhnya Faya-Largeau, kota tersebut menjadi sasaran bombardmen udara yang menggunakan Su-22 dan Mirage F-1 dari lapangan udara Aouzou, bersama dengan pengebom Tu-22 dari Sebha. Dalam waktu sepuluh hari, pasukan darat dalam jumlah yang besar telah dikumpulkan di timur dan barat Faya-Largeau. Pertama-tama pasukan, kendaraan lapis baja dan artileri diangkut lewat
udara ke Sabha, Al Kufrah, dan lapangan udara Aouzou, dan lalu dengan jarak yang lebih pendek diangkut oleh pesawat ke daerah konflik. Pasukan Libya yang jumlahnya mencapai 11000 orang dan 80 pesawat tempur turut serta dalam serangan ke Chad. Namun, peran Libya tetap sama seperti sebelumnya, yaitu memberikan dukungan senjata api (dan kadang-kadang serangan tank) kepada GUNT dalam serangan-serangannya, dan jumlah tentara GUNT sendiri mencapai 3000- 4000 orang.
GUNT dan Libya pada tanggal 10 Agustus menyerang oasis Faya-Largeau. Habré telah berkubu dengan sekitar 5000 tentara di tempat tersebut. Dengan menggunakan peluncur roket, artileri dan tank serta serangan udara berkelanjutan, garis pertahanan FANT dihancurkan ketika GUNT melancarkan serangan terakhir, dan hanya menyisakan 700 pasukan FANT. Habré melarikan diri dengan sisa pasukannya ke ibukota tanpa dikejar orang Libya.
Tindakan ini ternyata merupakan sebuah kesalahan, karena intervensi baru Libya telah menakutkan Perancis. Habré kembali meminta bantuan militer Perancis pada tanggal 6 Agustus. Perancis (yang juga mendapat tekanan dari Amerika dan Afrika) mengumumkan pada tanggal 6 Agustus bahwa tentara Perancis akan kembali ke Chad sebagai bagian dari Operasi Manta, yang dimaksudkan untuk menghentikan serangan GUNT dan Libya
dan melemahkan kekuasaan Gaddafi di Chad. Tiga hari kemudian beberapa ratus tentara Perancis dikirim ke N'Djamena dari Republik Afrika Tengah, dan jumlahnya kelak bertambah hingga 2700 orang, dengan beberapa skuadron pesawat tempur dan pengebom Jaguar. Operasi ini merupakan operasi pasukan terbesar yang pernah dilakukan Perancis di Afrika setelah Perang Kemerdekaan Aljazair.
Pemerintah Perancis lalu menetapkan batasan yang disebut garis merah. Garis yang terletak di paralel ke-15 ini yang terbentang dari Mao sampai Abéché. Perancis juga memperingatkan bahwa mereka tidak akan menolerir serangan apapun ke sebelah selatan garis ini baik oleh pasukan Libya mauapun GUNT. Baik Libya dan Perancis tetap bertahan di wilayah mereka masing-masing. Perancis enggan membantu Habré
merebut kembali daerah utara, sementara Libya tidak ingin memulai konflik melawan Perancis dengan menyerang garis tersebut. Maka dari itu negara Chad terbagi secara "de facto", dan Libya menguasai seluruh wilayah di sebelah utara garis merah.
Keadaan sempat menjadi tenang, walaupun perundingan yang disponsori oleh Organisasi Kesatuan Afrika pada bulan November gagal untuk mendamaikan faksi Chad yang saling bertikai; pemimpin Ethiopia Mengistu Haile Mariam mencoba mendamaikan oposisi di Chad pada awal tahun 1984, namun ia juga tidak berhasil. Setelah kegagalan Mengistu, GUNT melancarkan serangan ke pos FANT di Ziguey pada tanggal 24 Januari
yang didukung oleh kendaraan lapis baja Libya dengan tujuan agar Perancis dan negara-negara Afrika mau meneruskan perundingan. Perancis menanggapi pelanggaran ini dengan melancarkan serangan udara, mengirim pasukan baru ke Chad dan secara sepihak mengubah garis batas ke garis paralel ke-16.
Untuk mengakhiri kebuntuan, Gaddafi mengusulkan penarikan pasukan Perancis dan Libya dari Chad. Usul ini diajukan pada tanggal 30 April. Presiden Perancis, François Mitterrand, menerima tawaran itu, dan pada tanggal 17 September mereka berdua mengumumkan bahwa pasukan Perancis dan Libya akan mulai mundur pada tanggal 25 September dan penarikan pasukan akan diselesaikan pada tanggal 10 November. Persetujuan ini pada awalnya dipuji oleh media
sebagai bukti kecakapan diplomatik Mitterrand dan kemajuan dalam upaya untuk menyelesaikan krisis di Chad.
Perancis menghormati batas waktu yang telah ditetapkan, tetapi Libya hanya menarik beberapa pasukan dan tetap mempertahankan 3000 pasukan di Chad Utara. Tindakan Libya tidak hanya mempermalukan Perancis, tetapi juga mengakibatkan tuduh menuduh di antara Perancis dan Chad.
Menurut Nolutshungu, persetujuan bilateral tahun 1984 antara Perancis dan Libya mungkin telah memberikan kesempatan kepada Gaddafi untuk mencari jalan keluar dari permasalahan Chad sembari memperkuat martabatnya di dunia internasional. Selain itu, persetujuan ini memberi kesempatan baginya untuk memaksa Habré agar ia mau menerima perjanjian perdamaian yang melibatkan boneka-boneka Libya. Gaddafi
salah membaca tindakan mundurnya pasukan Perancis sebagai kesediaan untuk menerima kehadiran militer Libya di Chad dan aneksasi seluruh prefektur BET secara "de facto" oleh Libya. Kesalahan besar Gaddafi akan menjerumuskannya karena tindakannya malah memicu pemberontakan GUNT melawan Gaddafi dan ekspedisi baru Perancis pada tahun 1986.
Tidak ada pertempuran besar terjadi dari tahun 1984 hingga 1986. Pada masa itu, Habré berhasil memperkuat posisinya berkat dukungan dari Amerika Serikat dan pelanggaran persetujuan Perancis-Libya tahun 1984 oleh Gaddafi. Faktor lain yang juga menjadi penting adalah perselisihan di antara faksi-faksi di dalam tubuh GUNT yang berlangsung semenjak tahun 1984,
khususnya perselisihan di antara Goukouni dan Acheikh ibn Oumar terkait dengan kepemimpinan organisasi.
Pada periode ini, Gaddafi memperluas kekuasaannya atas Chad utara, membangun jalan baru dan mendirikan lapangan udara Ouadi Doum dengan tujuan untuk mempermudah operasi darat dan udara di luar Jalur Aouzou. Ia juga mengirim bala bantuan tambahan pada tahun 1985 dan menambah jumlah pasukan Libya di Chad menjadi 7000 pasukan, 300 tank dan 60 pesawat tempur. Ketika hal ini terjadi, banyak anggota GUNT yang membelot ke pemerintahan Habré sebagai bagian dari kebijakan akomodasi Habré.