John Wesley
kunjungan rutin ke setiap perhimpunan, yang kelak menjadi konferensi atau visitasi (kunjungan) triwulanan. Seiring dengan bertambahnya jumlah perhimpunan, Wesley tidak lagi dapat menjalin kontak secara personal, sehingga pada 1743 ia menyusun satu set Aturan Umum untuk "United Societies" itu. Peraturan tersebut merupakan inti dari "Discipline" Metodis, yang tetap menjadi landasan.
Wesley meletakkan dasar-dasar dari apa yang sekarang merupakan organisasi Gereja Metodis. Seiring berlalunya waktu, terbentuk pergeseran pola dari perhimpunan, "sirkuit", pertemuan triwulanan, konferensi tahunan, kelas, kelompok, dan perhimpunan pilihan. Di tingkat lokal, terdapat banyak perhimpunan dengan ukuran berbeda yang dikelompokkan ke dalam sirkuit-sirkuit yang di
dalamnya ditunjuk pengkhotbah-pengkhotbah keliling untuk periode dua tahun. Para pejabat sirkuit bertemu setiap tiga bulan dengan dimoderatori seorang "asisten" atau pengkhotbah keliling senior. Konferensi dengan Wesley, para pengkhotbah keliling, dan yang lainnya dihimpun setiap tahun untuk tujuan mengoordinasi doktrin dan disiplin demi hubungan keterikatan secara keseluruhan.
Kelas-kelas yang terdiri dari selusin atau lebih anggota perhimpunan bertemu setiap minggu untuk bimbingan dan persekutuan rohani di bawah kepemimpinan seorang pemuka. Pada tahun-tahun awal, terdapat sejumlah kelompok dengan anggota-anggota yang disebut memiliki karunia rohani, yang secara sadar mengejar kesempurnaan. Mereka yang dianggap telah
mencapainya dikelompokkan dalam kelompok-kelompok atau perhimpunan-perhimpunan pilihan. Pada 1744, terdapat 77 anggota dengan kategori demikian. Terdapat pula kategori peniten yang terdiri dari para ""backslider"".
Karena peningkatan jumlah pengkhotbah dan tempat berkhotbah, hal-hal administratif dan terkait doktrin perlu didiskusikan; sehingga John dan Charles Wesley, bersama empat klerikus lain dan empat pengkhotbah awam, bertemu untuk pertukaran pikiran pada 1744. Ini merupakan konferensi Metodis pertama; selanjutnya, konferensi tersebut (dengan Wesley sebagai presidennya) menjadi badan tertinggi gerakan
Metodis. Dua tahun kemudian, guna membantu para pengkhotbah bekerja secara lebih sistematis dan perhimpunan-perhimpunan menerima layanan secara lebih teratur, Wesley menunjuk para "penolong" untuk sirkuit-sirkuit. Setiap sirkuit memasukkan setidaknya 30 janji bertemu per bulan. Percaya bahwa efiensi pengkhotbah distimulasi oleh rotasinya dari satu sirkuit ke sirkuit
lainnya setiap satu atau dua tahun, Wesley menetapkan sistem berkeliling atau """" dan mensyaratkan agar para pengkhotbahnya tunduk pada peraturan tersebut.
Seiring dengan berkembangnya jumlah perhimpunan, mereka mengadopsi unsur-unsur dari suatu sistem gerejawi. Jurang pemisah antara Gereja Inggris dan Wesley semakin melebar. Pertanyaan seputar pemisahan diri dari Gereja Inggris dilontarkan oleh sejumlah pengkhotbah dan perhimpunan, namun kebanyakan ditentang keras oleh Charles saudaranya. Wesley menolak untuk meninggalkan Gereja Inggris, meyakini
bahwa Anglikanisme "dengan segala nodanya, [...] lebih mendekati rencana-rencana Alkitabiah daripada yang lainnya di Eropa". Pada 1745, Wesley menuliskan bahwa ia akan membuat konsesi apa saja sejauh nuraninya mengizinkan, agar dapat hidup dalam damai dengan para klerikus. Ia mengaku tidak dapat melepaskan doktrin tentang keselamatan batiniah yang dialami saat sekarang melalui iman;
ia tidak akan berhenti berkhotbah, tidak akan membubarkan perhimpunan, juga tidak akan mengakhiri pengkhotbahan oleh kaum awam. Sebagai seorang klerikus dari gereja resmi, ia dikatakan tidak memiliki rencana untuk melangkah lebih jauh.
Pada 1746, ketika Wesley membaca laporan seputar gereja primitif, ia menjadi merasa yakin kalau suksesi apostolik (suksesi rasuli) dapat diteruskan tidak hanya melalui para uskup ("bishop"), tetapi juga melalui para imam. Ia menuliskan bahwa ia adalah "seorang "episkopos" alkitabiah seperti halnya banyak laki-laki di Inggris." Walaupun ia pernah menyebut gagasan tentang suksesi tak terputus suatu "fabel", ia percaya akan suksesi apostolik.
Bertahun-tahun kemudian, "Irenicon" karya Edward Stillingfleet membuatnya memutuskan bahwa penahbisan (dan ketiga jenjang imamat) dapat dianggap valid atau sahih jika dilakukan oleh seorang presbiter (imam), tidak hanya oleh seorang uskup. Meskipun demikian, beberapa pihak meyakini bahwa Wesley telah secara diam-diam ditahbiskan sebagai uskup pada 1763 oleh Erasmus
dari Arkadia, seorang uskup Ortodoks Yunani, dan Wesley dianggap tidak dapat mengumumkan tahbisan episkopalnya secara terbuka karena ancaman pidana berdasarkan.
Pada 1784, ia percaya kalau ia tidak dapat lagi menunggu Uskup London untuk menahbiskan seseorang bagi kaum Metodis Amerika Serikat, yang berada dalam keadaan tanpa pelayanan sakramen setelah Perang Kemerdekaan Amerika Serikat. Gereja Inggris telah dibubarkan di Amerika Serikat, tempatnya pernah menjadi gereja negara di sebagian besar koloni selatan. Gereja Inggris belum menunjuk seorang
uskup Amerika Serikat untuk memimpin jemaat yang kelak menjadi Gereja Episkopal Protestan di Amerika Serikat. Wesley menahbiskan Thomas Coke sebagai "" kalangan Metodis di Amerika Serikat melalui penumpangan tangan, kendati Coke telah menjadi imam tertahbis dalam Gereja Inggris. Ia juga menahbiskan Richard Whatcoat dan Thomas Vasey sebagai presbiter. Whatcoat dan Vasey berlayar ke Amerika Serikat bersama Coke. Wesley
bermaksud agar Coke dan Francis Asbury (yang Coke tahbiskan sebagai superintenden sesuai arahan Wesley) semestinya menahbiskan yang lainnya dalam Methodist Episcopal Church yang baru terbentuk di Amerika Serikat. Pada 1787, Coke dan Asbury meyakinkan kalangan Metodis Amerika Serikat agar menyebut mereka sebagai uskup, bukan superintenden, mengabaikan keberatan-keberatan Wesley terhadap perubahan tersebut.
Saudaranya, Charles, mengkhawatirkan penahbisan-penahbisan tersebut dan evolusi pandangan Wesley seputar hal itu. Charles memohon agar Wesley berhenti sebelum ia "benar-benar menghancurkan jembatan" dan supaya tidak menjadikan pahit saat-saat terakhir Charles di dunia ini, juga supaya tidak "meninggalkan satu noda yang tak terhapuskan pada ingatan kami." Wesley menjawab bahwa ia tidak
terpisah dari gerejanya, juga tidak berniat demikian, namun ia merasa harus dan akan menyelamatkan jiwa sebanyak yang ia mampu selagi masih hidup di dunia ini, "tanpa perlu berhati-hati mengenai apa yang mungkin terjadi ketika saya mati." Kendati Wesley merasa gembira bahwa kalangan Metodis di Amerika Serikat bebas, ia menyarankan agar para
pengikutnya dari Inggris tetap berada dalam gereja resmi dan ia sendiri meninggal dunia di dalamnya.
, seorang akademisi Wesley abad ke-20, dalam pengantarnya atas kumpulan karya "John Wesley" tahun 1964 berpendapat bahwa Wesley mengembangkan teologinya menggunakan suatu metode yang oleh Outler disebut. Dalam metode tersebut, Wesley meyakini bahwa inti dari Kekristenan yang hidup terwahyukan dalam Kitab Suci; dan Alkitab merupakan sumber pokok satu-satunya dalam pengembangan
teologis. Kesentralan Kitab Suci dirasa sedemikian penting oleh Wesley sehingga ia menyebut dirinya "seorang laki-laki dari satu buku"-yang berarti Alkitab-kendati ia tergolong orang yang banyak membaca dibandingkan dengan orang lain pada masanya. Bagaimanapun, ia percaya bahwa doktrin harus selaras dengan tradisi ortodoks Kristen. Dengan demikian, tradisi dipandang sebagai aspek kedua dalam Quadrilateral.
Wesley berpendapat bahwa sebagian metode teologis melibatkan iman yang berdasarkan pengalaman. Dengan kata lain, kebenaran dihidupkan dalam pengalaman personal umat Kristen (secara keseluruhan, bukan individual), jika itu sungguh kebenaran. Dan semua doktrin harus dapat dipertahankan secara rasional. Ia tidak memisahkan iman dari akal (daya pikir). Menurutnya, tradisi, pengalaman, dan daya pikir tunduk