Juan I dari Kastila
pemberontakan di Lisboa pada akhir November dan awal Desember. Hilangnya kemerdekaan tidak terpikirkan bagi mayoritas orang. Master Aviz, masa depan Joo I dari Portugal, menyulut pemberontakan ketika ia masuk ke istana kerajaan pada tanggal 6 Desember 1383 dan membunuh kekasih Leonor, Conde Andeiro, setelah itu rakyat biasa bangkit melawan pemerintah atas dorongan Alvaro Pais. Uskup Martinho Anes,
yang dicurigai bersekongkol dengan musuh, dilemparkan dari menara utara Katedral Lisboa ketika Lisboa dikepung oleh Kastila pada tahun 1383. Pemberontakan menyebar ke provinsi-provinsi, mengambil nyawa kepala biarawati-biarawati Benediktin di Évora, Biara Gereja Kolegiat Guimares, dan Lançarote Pessanha, Laksamana Portugal, yang dibunuh di Kastil Beja. Pemberontakan didukung
oleh borjuis tetapi tidak oleh aristokrasi. Ratu Leonor melarikan diri dengan istana Lisboa dan berlindung di Alenquer, milik ratu-ratu Portugal. Dia memohon kepada Juan I dari Kastila untuk meminta bantuan. Di Lisboa, Alvaro Pais mengusulkan agar dia dan Leonor menikah dan memerintah bersama, tetapi Leonor menolak; atas berita kedatangan raja Kastila, Master Aviz terpilih
sebagai pemangku takhta dan pembela kerajaan pada tanggal 16 Desember 1383, sebagai pembela hak putra ratu, Infante Juan. Ahli hukum terkenal Joo das Regras ditunjuk sebagai kanselir dan jenderal brilian Nuno lvares Pereira sebagai jagabaya; segera Inggris diminta untuk campur tangan. Master Aviz mencoba mengepung Leonor di Alenquer tetapi melarikan diri ke Santarém untuk
mempersiapkan pertahanan Lisboa. Di Santarém, Leonor mulai mengumpulkan tentara dan meminta bantuan dari Juan I dari Kastila, yang memutuskan untuk mengambil alih komando situasi di Portugal, dan meninggalkan dewan pemangku takhta yang terdiri dari Markis Villena, Uskup Agung Toledo dan Pelayan Raja untuk memerintah Kastila ketika ia absen. Pada bulan Januari 1384 ia memulai perjalanan ke Santarém bersama
Beatrice untuk menjawab panggilan ratu sang pemangku takhta untuk memulihkan ketertiban di Portugal. Pada tanggal 13 Januari, Raja Juan I dan Ratu Beatrice memperoleh pengabaian aturan dan pemerintah yang menguntungkan mereka, yang menyebabkan banyak ksatria dan raja kastil tunduk dan bersumpah setia kepada pasangan kerajaan tersebut. Karena Leonor bersekongkol melawan Juan sang Infante, dia dikirim ke biara
Tordesillas. Ini melayani tujuan Master Aviz untuk membenarkan pimpinannya pemberontakan; dia telah melanggar sumpah yang dia ucapkan pada Perjanjian Salvaterra de Magos.
Meskipun sebagian besar aristokrasi Portugis setia pada perjuangannya, Raja Juan I dari Kastila tidak mengulangi keberhasilan Kastila dari Perang Fernando sebelumnya ("Guerras Fernandinas") dan gagal memenangkan Coimbra dan Lisboa. Pada tanggal 3 September 1384, ia meninggalkan garnisun yang dijaga oleh para pendukungnya di antara orang-orang, dan kembali ke Kastila dan meminta bantuan dari Raja Prancis. Sementara
itu, Master of Aviz berusaha merebut tempat-tempat yang setia kepada lawan-lawannya, dan bahkan mengambil Almada dan Alenquer, tetapi gagal mengambil Cintra, Torres-Velhas (Torres Vedras) dan Torres Novas. Pada bulan Maret 1385 ia pergi ke Coimbra, dimana ia memanggil Cortes Portugis; mereka menyatakan Beatrice tidak sah dan memproklamirkan bahwa Master Aviz menjadi Raja Portugal sebagai Juan I pada tanggal 11
April. Ini pada dasarnya adalah sebuah deklarasi perang melawan Kastila dan gugatannya atas takhta Portugis. Memulihkan diri dari kekalahan terakhirnya, raja baru memulai kampanyenya untuk merebut kembali kerajaan utara, dan mengambil Viana do Castelo, Braga dan Guimares.
Juan I dari Kastila, ditemani oleh kavaleri Prancis yang bersekutu, kemudian memasuki Portugal lagi melalui Ciudad Rodrigo dan Celorico pada bulan Juli 1385 untuk menaklukkan Lisboa dan menyingkirkan Juan I dari takhta Portugis, tetapi kekalahan-kekalahan memalukan pasukan dideritanya di Trancoso dan di Pertempuran Aljubarrota pada bulan Mei dan Agustus 1385 telah mengakhiri kemungkinan
pemerintahannya sebagai raja Portugal. Dia melarikan diri ke Santarém dan dari sana menuruni Tagus untuk bertemu dengan armada dekat Lisboa. Pada bulan September armada Spanyol kembali ke Kastila, dan Joo I dari Portugal menguasai tempat-tempat yang sebelumnya diduduki oleh musuh-musuhnya. Maju dari Santarém, ia merebut wilayah di utara Duero yang kesatrianya tetap setia
kepada Beatrice dan Juan I dari Kastila: Villareal Paves, Chaves dan Bragança menyerah pada akhir Maret 1386, dan Almeida pada awal Juni 1386.
Ratu Beatrice tidak memiliki keturunan dengan suaminya, Juan I dari Kastila, meskipun seorang putra yang bernama Miguel disebutkan dalam beberapa silsilah yang ditulis belakangan dan bahkan di beberapa buku sejarah modern. Tidak ada dokumen kontemporer yang menyebutkan dia, dan ibundanya yang seharusnya berusia 10 atau 11 tahun pada kelahirannya yang terkenal. Kemungkinan besar ini adalah kekeliruan dengan cucu penguasa monarki Katolik yang dipanggil Miguel da Paz.
Raja Juan terbunuh di Alcalá pada tanggal 9 Oktober 1390, ketika ia jatuh dari kudanya saat menunggangi seekor fantasia dengan beberapa penunggang kuda yang dikenal sebagai "farfanes", yang dipasang dan diperlengkapi dalam gaya Arab. Kematiannya dirahasiakan oleh Kardinal Pedro Tenorio selama beberapa hari yang menyatakan bahwa dia hanya terluka. Karena putranya Heinrich III masih di bawah umur pada saat
itu, seorang pemangku takhta diangkat untuk memerintah atas namanya. Setelah kematiannya, jenazah Juan I dipindahkan ke kota Toledo untuk dimakamkan. Makamnya ada di Kapel Monarki Baru "(La Capilla de los Reyes Nuevos)" Katedral Toledo di Spanyol.