Yuan Shikai
Membuat aliansi politik dengan Janda Kaisar, dan menjadi seteru abadi Kaisar Guanxu, Yuan meninggalkan ibukota pada tahun 1899 untuk penunjukkannya sebagai Gubernur Shandong. Selama tiga tahun masa kepemimpinannya, Pemberontakan Boxer pecah, ia memastikan penindasan Boxer di provinsi, meskipun pasukkannya tidak mengambil peran apa-apa di luar Shandong. Yuan memihak pihak pro-faksi luar negeri di
pengadilan kekaisaran, bersama dengan Pangeran Qing, Li Hongzhang dan Ronglu, ia menolak untuk memihak pada kaum Boxer dan menyerang pasukan AliansiDelapan Bangsa, bergabung gubernur-gubernur Tiongkok yang lain yang mengomandoi pasukan modern seperti Zhang Zhidong yang tidak memihak Pemberontakan Boxer. Ia dan Zhang membiarkan Janda Kaisar Cixi mendeklarasikanperang melawan kekuatan luar negeri dan melanjutkan
penindasan terhadap pemberontakan. Dalam rangka untuk menghindari pertempuran denganpasukan AliansiDelapan Bangsadan menindas Boxer di Shandong, Yuan dan pasukannya (Divisi Keadilan) juga membantupasukan AliansiDelapan Bangsamembantai sepuluh dari ribuan orang dalam kampanye anti Boxer di Zhili setelahpasukan Aliansimenguasai Beijing.
Ia juga mendirikan sebuah sekolah (Shandong College, cikal bakal Shandong University) di Jinan, yang dalam kurikulumnya mengadaptasi pemikiran barat.
Pada Juni 1902 ia dipromosikan menjadi Raja Muda Zhili, dan Komisioner untukUrusan Dagang Tiongkok Utara, dan Menteri Beiyang (), kekuasaannya mencakup wilayah yang saat ini disebut sebagai Liaoning, Hebei, dan Shandong. Ia memperoleh penghargaan dari khalayak luar negeri setelah membantu penumpasan Pemberontakan Boxer, ia dengan sukses memperoleh pinjaman besar untuk
memperbesar Pasukan Beiyang miliknya menjadi pasukan yang paling kuat di Tiongkok. Ia membuat 2000 pasukan polisi untuk menjaga ketenteraman di Tianjin, pembentukan polisi ini adalah yang pertama kalinya dalam sejarah Tiongkok, sebagai hasil dari Protokol Boxer yang melarang pasukan bersenjata mendekati Tianjin. Yuan juga terlibat dalampengambil alihankendali jaringan rel kereta api
dari Sheng Xuanhuai. Ia lalu memimpin perusahaan perkeretaapiandan konstruksi-konstruksinya menjadi sumber yang besar untuk pajak. Yuan memainkan peran aktif dalam masa-masa akhir Dinsati Qing, termasuk membuat Kementerian Pendidikan () dan Kementerian Polisi (). Ia lalu menganjurkan persamaan derajat etnis Manchu dan Han.
pada tahun 1905, berdasarkan masehat Yuan, Janda Kaisar Cixi mengeluarkan dekret yang berisi tentang perintah untuk mengakhiri sistem ujian Konfusius pada tahun 1906 dan memerintahkan Kementerian Pendidikan untuk mengimplemetasikan sistem pendidikan yang berdasar pada kurikulum yang berjalan berdasarkan amanat pemerintah. Sistem ini diadopsi dari apa yang dilakukan Jepang pada Masa
Meiji. Pada 27 Agustus 1908, Pengadilan Qing mengumumkan "Asas-Asas untukKonstitusi", dimana disana Yuan membantu dalam membuat drafnya. Dokumen ini dikenal sebagai pemerintah konstitusional dengan monarki yang kuat, dirancang berdasarkan apa yang dilakukan oleh Meiji di Jepang dan Otto van Bismarck di Jerman dengan konstitusi yang dikeluarkan pada 1916 dan sebuah pembentukan parlemen pada tahun 1917.
Janda Kaisar dan Kaisar Guangxu meninggal pada November 1908. danberbagai sumber mengindikasikan bahwa keinginan Kaisar yang paling diinginkannya adalah ingin Yuan segera diesekusi. Meskipun demikian, untuk menghindari hukuman mati, di Januari 1909 Yuan Shikai melepas semua jabatannya kepada, Prince Chun. Yuan beralasan bahwa ia mengundurkan diri karena ingin kembali ke rumahnya di Desa Huanshang (), yang pada masa kini menjadi Kota prefektur Anyang, karena penyakit kaki.
Selama tiga tahun ia mengasingkan diri, Yuan tetap berhubungan dengan sekutu-sekutu dekatnya, termasuk Duan Qirui, yang melapor kepadanya secara rutin tentang pasukannya, karena kesetiaan Pasukan Beiyang masih untuknya.Memiliki dukungan militer yang strategis, membuat Yuan memegang kuasa yang seimbang pada pihak revolusioner (seperti Sun Yat-sen) dan pihak Pengadilan Qing. Kedua pihak tersebut menginginkan Yuan disisi mereka.
Revolusi Wuchang dimulai pada 10 Oktober 1911 di Provinsi Hubei. Provinsi-provinsi selatan Tiongkok mendeklarasikan kemerdekaannya dari Pengadilan Qing, namun provinsi-provinsi di utara bersikap melawan gerakan ini. Pengadilan Qing dan Yuan sepakat bahwa Tentara Beiyang adalah satu-satunya pasukan yang mampu menumpas revolusi ini. Pengadilan meminta Yuan untuk kembali
pada27 Oktober, namun iaberulang kali menolak tawaran Pengadilan Qing agar ia kembali. Tawaran itu di antaranya adalah menjadi Raja Muda Huguang, dan Perdana Menteri Kabinet Kekaisaran. Waktu berada di pihak Yuan, sementara Yuan terus menunggudengan alasan "penyakit kaki"nya.
Setelah beberapa tawaran selanjutnya dari Pengadilan Qing, Yuan setuju dan segera meninggalkan desanya lalu menuju ke Beijing pada 30 Oktober. Ia lalu menjadi Perdana Menteri pada1 November 1911. Setelah itu ia memerintahkan Pangeran Chun untuk mundur dari segala jabatan politiknya.Pengunduran diri Zaifeng ini memberi jalan pada Yuan untuk membuat kabinet yang didominasi oleh orang dari etnis Tiongkok Han,
yang hanya terdiri dari satu orang Manchu, yang memegang jabatan Menteri Jajahan. Selain itu, karena kesetiannya kepada pengadilan, Janda Kaisar Longyu memberi Yuan gelar bangsawan Marquis Peringkat Pertama (), sebuah gelar yang sebelumnya pernah diberikan kepada Jenderal Zeng Guofan bersama Tentara Xiangnya dalam menumpas Pemberontakan Taiping.
Sementara itu, dalam Pertempuran Yangxia, berhasil mengambil alih kembali Hankou dan Hanyang dari revolusioner. Yuan tahu bahwa penumpasan total terhadap revolusi akan mengakhiri kegunaannya dalam rezim Qing. Setelah menyerang Wuchang, ia mulai bernegosiasi dengan pihak revolusioner.
Kaum revolusioner telah memilih Sun Yat-Sen sebagai presiden sementara pertama, namun pemerintahan ini lemah dalam dukungan militernya, maka dari itu mereka mulai berunding dengan Qing, untuk menggunakan Yuan sebagai penengah. Yuan lalumenyusun keputusan untuk penurunan takhta Kaisar Kecil Puyi (atau Kaisar Xuantong) untuk bisa meraih jabatan Presiden. Yuan tidak hadir dalam dekret penurunan takhta yang dikeluarkan oleh Janda Kaisar Longyu pada 12 Februari 1912.
Sun menyetujui kepresidenan Yuan setelah beberapa perselisihan selesai, namun ia juga meminta bahwa ibukota harus dipindahkan ke Nanjing. Yuan, di sisi lain, menginginkan keuntungan secara geografis untuk memiliki ibukota yang tidak jauh dari basis kekuatan militernya. Cao Kun, salah satu komandan Tentara Beiyang kepercayaannya, melakukan kudetadi Beijing dan
Tianjin, berdasarkan perintah Yuan, untuk memberikan alasan untuk Yuan agar ia tidak meninggalkan lingkungan pengaruhnya di Zhili (saat ini provinsi Hebei). Kaum revolusioner akhirnya mengalah, dan ibukota republic baru ini tetap berada di Beijing. Yuan Shikai dipilih sebagai Presiden Sementara RepublikTiongkokoleh Senat Sementara Nanjingpada 14 Februari 1912, dan diambil sumpahnya pada 10 Maret pada tahun yang sama.
Pada Februari 1913, pemilihan umum demokratis diadakan untuk memilih anggota Majelis Nasional dimana Partai Nasionalis Tiongkok (Kuomintang atau KMT) mendapat kemenangan telak. Song Jiaoren dari Partai KMT secara giat mendukung sistem kabinetdan menjadi kandidat kuat untuk menjadi Perdana Menteri.
Salah satu tujuan politik utama Song adalah memastikan bahwaindependensi Parlemen Tiongkok bisa terlindung dari pengaruh kepresidenan. Program Song untuk mengurangi kewenangan presiden bertentangan dengan sikap Yuan, yang pada pertengahan 1912, secara jelas mendominasi cabinet sementaradan mengisyaratkan adanya keinginan untuk memegang kuasa lebih. Song kemudian melakukan perjalanan ke seluruh Tiongkok pada