Conan O'Brien
tanggal 11 Oktober 2005, Conan menjadi tahu bahwa dirinya terkenal di Finlandia, dan kemudian memulai sebuah lelucon yang berlangsung cukup lama bahwa dirinya sangat mirip dengan wajah presiden wanita pertama negara tersebut, Tarja Halonen. Setelah beberapa bulan melakukan lelucon ini (termasuk adanya segmen "Conan O'Brien Benci Negara Saya" yang muncul berulang kali dan dukungan Conan atas kampanye
Tarja Halonen sebagai presiden), Conan berkunjung ke Finlandia dan tampil di beberapa acara televisi serta bertemu dengan Presiden Halonen. Perjalanan ini direkam dan ditayangkan sebagai sebuah acara spesial.
Conan berseloroh mengenai sebuah situs internet fiksi "hornymanatee.com" pada tanggal 4 Desember 2006 menyusul sebuah sketsa komedi mengenai sebuah maskot Manatee fiktif dan tindak-tanduknya di depan kamera komputer yang tidak senonoh. NBC memilih untuk membeli alamat situs tersebut dengan harga 159 dollar karena situs tersebut ternyata tidak ada sebelumnya. Perusahaan
televisi itu waswas kalau sampai seseorang membeli alamat situs tersebut dan menayangkan isi-isi yang tidak diinginkan oleh NBC. Kini NBC memiliki alamat situs www.hornymanatee.com untuk selama 10 tahun akibat ulah Conan. Menurut Conan, akhirnya diputuskan bahwa semenjak NBC memiliki situs tersebut, mereka lebih baik membuat situs website-nya sekaligus. Conan bersama tim-nya
sejak itu membuat sebuah situs yang benar-benar ada yang kini telah dikunjungi oleh jutaan pengunjung, mencapai 4 juta halaman terbaca selama empat hari. Orang-orang mengirimkan karya-karya seni "horny manatee", puisi dan hal-hal lainnya. Menurut sistem posisi website Alexa, hornymanatee.com telah dikunjungi oleh lebih dari 10 juta pengunjung.
Sebuah sandiwara komedi pendek populer yang sering muncul di acara ini adalah "Pale Force", atau kekuatan pucat, sebuah serial episode animasi dimana pelawak Jim Gaffigan dan Conan adalah para pahlawan dengan kekuatan luar biasa yang berperang melawan kejahatan dengan "kepucatan" mereka. Setiap kali Gaffigan membuka sandiwara ini di tiap episode barunya, Conan selalu memprotes atas penggambaran dirinya yang tampil pengecut, lemah dan tidak mampu menahan diri.
Semenjak bulan Oktober 2005, "Late Night with Conan O'Brien" selama sebelas tahun berturut-turut telah menarik penonton sejumlah rata-rata 2.5 juta penonton per episodenya.
Pada tahun 2004, Conan ditunjuk sebagai pengganti Jay Leno saat Leno meninggalkan acara "The Tonight Show" pada tahun 2009. Leno menyatakan dalam salah satu episode acaranya bahwa ia ingin menghindari kontroversi dan perasaan tidak enak akibat terpilihnya dirinya oleh NBC sebagai pembawa acara "The Tonight Show" dan bukannya David Letterman.
Pada tahun 2008, Conan berpura-pura berkelahi dengan Jon Stewart dan Stephen Colbert dari stasium televisi Comedy Central mengenai siapa yang paling berhak menyatakan bahwa dirinya yang menyebabkan naiknya pamor Mike Huckabee dalam kampanyenya sebagai calon presiden dari Partai Republik Amerika Serikat. Perkelahian ini berlangsung di tiga acara televisi dan dua stasiun televisi.
Pada tanggal 13 Juni 2008, Conan hanya berjalan lalu saja pada saat pembukaan acaranya dan tidak melakukan hal-hal yang penuh semangat seperti biasanya. Ia terlihat sangat terganggu secara emosi saat mengumumkan kepada para penonton di studionya bahwa dirinya baru saja menerima berita mengenai kematian mendadak teman baik, rekan kerja di NBC dan tamu acaranya yang sering
diundang, Tim Russert. Conan tidak melakukan monolognya dan menggunakan waktu yang ada untuk menayangkan dua cuplikan dari episode-episode favorit-nya bersama Tim Russert.
Salah satu kawan lama Conan adalah Romo Paul B. O'Brien, seorang imam Katolik yang mendirikan "Labels Are For Jars", yakni sebuah organisasi anti-kelaparan yang bermarkas di kota Lawrence, Massachusetts. Keduanya tidak ada hubungan keluarga.
Conan bertemu dengan Elizabeth Ann 'Liza' Powell pada tahun 2000 ketika ia tampil di acara "Late Night with Conan O'Brien" dalam sebuah tampilan iklan. Keduanya kemudian berpacaran selama satu setengah tahun sebelum mereka menikah pada tanggal 12 Januari 2002 di kota asal Liza, Seattle. Keduanya memiliki seorang putri bernama Neve (lahir 14 Oktober 2003) dan seorang putra bernama Beckett (9 November 2005).
Conan dulunya pernah memacari bintang serial televisi "Friends" Lisa Kudrow. Ia berulang kali menegaskan darah Irlandia-Katolik dalam dirinya di acaranya. Ia memiliki tinggi 193 cm dan berat sekitar 84 kg. Saudara sepupunya lewat pernikahan, Denis Leary, adalah juga seorang pelawak dan aktor yang sukses.
Pada bulan Januari 2008, Conan membeli sebuah rumah mewah di Los Angeles, California. Alasan pembelian ini adalah karena ia akan pindah kesana pada tahun 2009 dari New York untuk menjadi pembawa acara baru The Tonight Show.