エドマンド・カービー・スミス
戦後のジョンソンは教職に戻り、同じく南軍の将軍だったエドマンド・カービー・スミスと共にナッシュビル大学の教授かつ共同総長（1870年）となった。1875年、健康の悪化と共に大学を辞して、イリノイ州ブライトンの農園に退き、そこで1880年に死んだ。当初はブライトンに近いマイルズステーションに埋葬されたが、1975年にナッシュビル旧市墓地の妻のメアリーの墓の隣に移葬された。