Марбургский университет
Карл Гютер — сын Карла Кристофа Гютера, заведующего кафедрой хирургии и акушерства Марбургского университета. Брат Виктор Гютер — профессор гинекологии в Гёттингенском университете. В 1854 году поступил учиться в Марбургский университет. В 1859 году защитил докторскую диссертацию.