Bodleian Library
Au moment de sa mort, Malone travaille sur une nouvelle édition in-octavo de Shakespeare et la laisse, inachevée, au jeune James Boswell qui la complète et la publie en 1821 en 21 volumes (connue sous le nom de "Third Variorum edition"). L'ouvrage, accompagné d'un mémoire de Malone, est reconnu comme l'édition standard des travaux de Shakespeare pendant plus d'un siècle. Lord Sunderlin (1738 - 1816) présenta une grande partie des livres de Edmond Malone à la Bibliothèque bodléienne, qui acheta par la suite nombre de ses notes manuscrites et de ses correspondances ; le British Museum possède également certaines de ses lettres et sa copie annotée du Dictionnaire de Johnson.