جامعة بيزا
في عام 1656 دعاه فرديناند الثاني من توسكانا لتولي منصب أستاذ الطب النظري في جامعة بيزا، وهناك لمع نجمه وجمعته علاقات وثيقة مع عدد كبير من الأطباء، تساءل مالبيكي عن طرق التدريس المُتَّبعة في جامعة بيزا والتعاليم الطبية السائدة فيها، فدعم التجربة وحاول إعادة صياغة المواضيع التشريحية والفيزيولوجية من جديد، ولكنَّ مشكلات عائلية وضعف صحته أجبراه على العودة إلى جامعة بولونيا عام 1659، وهناك استمرَّ في التدريس وإجراء الأبحاث والتجارب باستخدام المجاهر، وفي عام 1661 اكتشف ووصف الأوعية الشعريَّة الصغيرة التي تربط بين الشرايين والأوردة وهي الحلقة المفقودة في نظرية ويليام هارفي عن الدورة الدموية ويعتبر اكتشافه هذا واحداً من أهم الاكتشافات الرئيسية في تاريخ الطب وأكثرها تأثيراً.