Battle of Fallen Timbers
ウェイン郡は1800年12月13日に、プラスキ郡とカンバーランド郡の一部を合わせて設立された。州内43番目の郡であり、郡名はアメリカ独立戦争と北西インディアン戦争の英雄である"マッド"・アンソニー・ウェイン将軍に因んで名付けられた。フォールン・ティンバーズの戦いでウェインが勝利したことにより、ケンタッキー州開拓者に対するインディアンの脅威が無くなった。