Escherichia coli
قد تكون الأنهار الكبيرة ملوثة بمياه الصرف الصحي، الجريان السطحي أو الملوثات الصناعية من مصادر بعيدة المنبع . ومع ذلك حتى الأنهار الصغيرة والينابيع والآبار قد تكون ملوثة عن طريق المخلفات الحيوانية والمسببات المرضية . وجود حيوانات نافقة على منبع النهر هو أمر غير مألوف . في معظم أنحاء العالم قد تكون المياه ملوثة بالبكتيريا والديدان الطفيلية أو من الفضلات البشرية والحيوانية أو مسببات الأمراض التي تستخدم الكائنات الحية الآخرى على أنها المضيف المتوسط . كما أن السلالات المسببة للأمراض من بكتيريا إشريكية قولونية تبقى على قيد الحياة لفترة قصيرة خارج الجسم لتصيب عوائل جديدة .