波士顿南站
最初的大开掘规划还包括，意在将波士顿南站及北站两座重要火车站连接在一起。该项目在麥可·杜卡基斯在任期间被国家交通部否决。隧道内行驶柴油机车需要更强大的通风系统，增加工程预算。与政府协商后，最终达成共识将新海港隧道挖得更深，增加机械通风，拓宽车道。与之相对应的，地下不再有更多空间留给铁路隧道。