Benutzerkontensteuerung
Das Programm bietet dem Benutzer die Möglichkeit, den Startmodus des Betriebssystems einzustellen. Hierbei ist ein "Diagnosesystemstart" wählbar, bei dem nur die nötigsten Geräte und Dienste geladen werden; diese Option wird meist zum Beheben von Startproblemen verwendet. Des Weiteren können die Systemstarts anderer Betriebssysteme verwaltet werden, ebenso kann auch ein Start ohne grafische Benutzeroberfläche (GUI) veranlasst werden. Ein Menüpunkt befasst sich mit der Verwaltung für automatisch zu startende Programme und Dienste. Des Weiteren stellt Msconfig Programmverknüpfungen für verschiedene Windowseinstellungen bereit, etwa die Benutzerkontensteuerung oder das Windows-Sicherheitscenter.