Major histocompatibility complex
تتكون اللقاحات المبنية على أساس الببتيد عادة من محددات مستضدية معينة للسرطان وغالبًا ما تتطلب مادة مساعدة (على سبيل المثال، العامل المنبه لمستعمرات المحببات والبلاعم) لتحفيز الجهاز المناعي وتعزيز مولد الضد.  تتضمن أمثلة هذه المحددات المستضدية الببتيدات ( Her2)، مثل ( GP2) و ( NeuVax) ومع ذلك، يتطلب هذا النهج التصنيف المعتمد على معقد التوافق النسيجي الكبير للمريض بسبب تقييد معقد التوافق النسيجي الكبير. يمكن التغلب على الحاجة إلى التصنيف المعتمد على معقد التوافق النسيجي الكبير باستخدام ببتيدات أطول ("ببتيدات طويلة اصطناعية") أو البروتين المُنقّى، والتي تُعالَج بعد ذلك في المحددات المستضدية التابعة للخلايا المقدِّمة للمستضد.