ASM Clermont Auvergne
После спада клуба летом 2007 года перешёл в стан «Клермон Овернь» в канун домашнего чемпионата мира по регби, в шести играх ему удалось вывести клуб в финал, но в финале 28 июня 2008 он уступил «Тулузе» 26:20. Сезон 2008/2009 стал для Боннэра сложным, что привело к его исключению из состава сборной на тест-матчи. В 2010 году, однако, Боннэр набрал форму, и его результаты в клубе и сборной улучшились. По окончании сезона 2016/2017 завершил игровую карьеру.