双子座计划
水星计划完成后，航空航天局启动了双子座计划，目标是同时将两位宇航员送入太空。水星-宇宙神10号取消发射后，航空航天局选定谢泼德担任双子座计划首次载人任务的指令长，托马斯·斯塔福德和他一同完成任务。谢泼德在1963年末却开始出现重度头晕、恶心的症状，行动不协调，还伴有左耳严重耳鸣。他担心病情曝光后不能再执行任务，试图隐瞒自己的状况，但意识到如果自己以当前状态进入太空将会酿成致命危险。他此前居住于維珍尼亞海灘，这时已经搬到德克萨斯州休斯敦居住。一次在休斯敦讲课时，谢泼德突然头晕发作，靠人搀扶才勉强走下讲台，于是他向时任飞行任务主任迪克·斯雷顿坦白了自己的病情，请航空航天局医生为自己诊治。