Левадиакос
С 2008 по 2010 год Эрнандес работал в Греции, заняв с «Арисом» в чемпионате страны шестое место и доведя до вылета «Левадиакос». При этом ранее, во второй половине сезона 2006/2007, испанец уже занимал пост главного тренера «Ариса». Летом 2011 года Эрнандес вернулся на родину, возглавив «Уэску», выступавшую в Сегунде.