Рейнская провинция
Пауль Дойссен родился в 1845 году в Обердрайсе, Рейнская провинция, в семье пастора Адама Дойссена, в которой кроме него было ещё семь детей. Обучался сначала вместе с Фридрихом Ницше в Шульпфорте возле Наумбурга. В период с 1864 по 1881 год он учился в университетах Бонна, Тюбингена и Берлина. Изучал санскрит под руководством Х. Лассена и И. Гильдемайстера, классическую филологию и теологию. В 1869 году получил звание доктора философии, защитив в Марбурге диссертацию по философии Платона. В 1869—1872 годах преподавал в гимназиях Миндена и Марбурга; в 1872—1880 годах был воспитателем в русских семьях в Женеве, Ахене и Тернах (имение князя Щербатова около Харькова). В это же время, в 1875—1879 годах, преподавал как приват-доцент санскрит и философию в Женевском университете и философию в Политехнической школе в Ахене. В 1881 году он был назначен приват-доцентом в Берлинском университете, в 1887 году — экстраординарным профессором; с 1889 по 1919 год работал в качестве ординарного профессора в университете Киля.