Chiapas F.C.
Эберт Альферес — воспитанник мексиканского клуба «Атлас». 1 октября 2006 года он дебютировал в мексиканской Примере, выйдя на замену в концовке гостевого поединка против команды «Сантос Лагуна». 15 ноября 2009 года Альферес забил свой первый гол в рамках Примеры, сравняв счёт в гостевой игре с командой «Хагуарес Чьяпас».