罗布泊
罗布泊是塔里木盆地中最低的洼地，在干涸之前塔里木的地表水会向这里汇集，而随水而来的盐分也因封闭的地形不断积累，使得罗布泊成为塔里木盆地形成以来长期的地集水和集盐中心。这使得罗布泊和周围地区形成，盐壳和盐土占罗布泊平原地区面积的三分之一还多。罗布泊气候干旱且常年刮东北风，并且时常发生沙尘暴，这使得保护区内土壤有较为严重的风蚀、沙化现象。在楼兰古城一带风蚀沟深度可达3到5米。除此之外，因孔雀河、塔里木河下游存在着河湖相沉积物，主要以粉沙、细沙为主，当植被遭到破坏或其他原因，加之大风的因素，沙被吹起形成沙丘。保护区平原的土壤类型主要是荒漠土壤，如棕漠土、风沙土等，部分地区分布有草甸土、盐土等。保护区山地分布有棕钙土、高寒荒漠土。