ウィラメット川
アメリカ合衆国国勢調査局によると、インディペンデンス市の総面積は7.30km²、そのうち陸面積が7.07km²、水面積が0.23km²である。また、ウィラメット川の支流であるアッシュ・クリークがインディペンデンス市内を流れている。