Coppermine River
Множество рек и озёр обусловлено недавно образованным и продолжающим формироваться водоразделом территории под воздействием эффекта пост-ледникового восстановления. Все реки в Нунавуте, расположенные в материковой части, впадают или в Гудзонов залив (Телон, Казан и Дубонт), или в Ледовитый океан (Блэк и Коппермайн). Реки часто разливаются, образуя озёра, крупнейшим из которых является озеро Дубонт. На острове Баффинова земля реки, в основном, текут на запад. Кроме того, здесь расположены озёра Неттиллинг — крупнейшее озеро всего Нунавута, и Амаджуак — третье по величине озеро территории. Крупные озёра есть и на острове Элсмир — в частности, озеро Хейзен, являющееся самым большим по объёму озером в мире за Полярным кругом.