甘丹寺
1447年，根敦朱巴得到桑主则宗本乃穹吉巴·班觉桑布资助，在桑珠则之旁兴建了扎什伦布寺，寺成即任该寺赤巴。1434年，甘丹寺住持克珠杰圆寂，寺内教务乏人主持，1450年寺僧派人来请根敦朱巴前往继任甘丹寺赤巴，根敦朱巴说：“我不能去，若才建此寺即离去，恐不坚稳”，他推举了克珠杰之弟拔梭·曲结坚赞前往甘丹寺担任了第四任赤巴。根敦朱巴广泛研习哲学和佛教经典，精通密显教法，成为当时西藏著名的佛教学者，故称“大班哲达根敦朱”。著作有《戒经疏》《正理庄严论》。