アメリカ合衆国財務省
2001年1月20日にジョージ・W・ブッシュ政権が発足するとガイトナーはアメリカ合衆国財務省を離れ、外交問題評議会に国際経済担当の上級研究員として加わった。同年ガイトナーは国際通貨基金へ移り、2003年まで政策企画審査局で局長を務めた。2003年にニューヨーク連邦準備銀行総裁に就任。