National Security Council
由於政府組織精簡，楊永明成為最後一任中華民國行政院新聞局局長。卸任新聞局長後，楊永明重回國安體系，於2012年5月底再度任命為國家安全會議諮詢委員。2012年8月，楊永明獲任命為國家安全會議副秘書長。2013年7月12日，楊永明拜會基隆市議會議長黃景泰時表態參選基隆市市長，並說總統馬英九已經核准他辭任國家安全會議副秘書長。7月17日總統府發布總統令，任命駐美代表處副代表張大同為國安會副秘書長，8月1日生效。10月11日，對外宣告退出基隆市長初選。