عبد الله الغالب
تم تجديد مسجد ابن يوسف في عام 1563، بناءً على أوامر من سلطان المغرب السعدي عبد الله الغالب. في نفس الوقت تقريبًا، بدأ تخطيط المدينة في التغيير، مع وجود مناطق سكنية وأسواق جديدة تقع إلى الغرب، بجوار مسجد الكتبية ومسجد وجامع المواسين الجديد، مما أدى إلى تحويل مركز الجاذبية بعيدًا عن مسجد بن يوسف القديم. في مساحة فريبة، أقام السعديون كلية لاهُوتيّة جديدة كبيرة (المدرسة)، مدرسة بن يوسف في 1563-64، شرق المسجد مباشرةً، مما أعطاه حياة جديدة كمسجد للعلماء.