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南通兴东机场净空条件良好、区位优势凸显，目前已有东方航空、上海航空、春秋航空、吉祥航空、深圳航空、天津航空、扬子江货运航空等航空公司在机场集中飞训。其中东方航空公司建立了飞训基地，中国民航校飞中心东方基地已选址南通兴东机场，上海中意通用航空公司在通设立了基地，华夏航空工程技术有限公司现已在机场内建立筹建处。