Киотский университет
Нагата родился в 1927 году, в 1947 году поступил в Нагойский университет, где был учеником Тадаси Накаямы. В 1950 году окончил университет и некоторое время работал ассистентом и лектором в Нагойском университете, а затем перешёл в Киотский университет, в 1963 году получив должность профессора, и оставался на этой должности до ухода на пенсию в 1990 году.