Croatia Open
El año empezó en Chennai, donde perdió contra Simon Greul en primera ronda. Antes del Open de Australia, jugó la previa del Torneo de Auckland, sin embargo, Gilles Muller le impidió jugar el cuadro principal. En el Abierto de Australia perdió frente al sacador Ivo Karlovic, quien lo derrotó en 3 mangas por 3-6 4-6 4-6. Tanto en Viña del Mar como en Buenos Aires cayó en sendas segundas rondas, consiguiendo ganar a Alberto Martín y Gastón Gaudio respectivamente y perdiendo frente a Paul Capdeville y David Nalbandian. En el Torneo de Costa do Sauipe sucumbió en primera ronda ante el polaco Łukasz Kubot por 6-7 6-1 3-6. Dani marchó al Torneo de Acapulco, donde realizó un gran torneo, perdiendo en cuartos de final ante el murciano Nicolás Almagro habiendo ganado en rondas anteriores a Lappenti y Montañés. Su siguiente torneo ATP fue sobre la tierra batida de Houston, donde ganó a Máximo González y perdió contra Yevgueni Koroliov. 14 días más tarde, en el ATP World Tour 500 de Barcelona pasó la previa y ganó en primera ronda a Fabio Fognini por un contundente 6-1 6-3 para perder en la siguiente ronda frente al argentino Juan Mónaco. También consiguió pasar la previa del ATP World Tour Masters 1000 de Roma perdiendo ante el ruso Mijaíl Yuzhny en primera ronda. También fue su verdugo el ruso en la primera ronda del torneo 250 de Kitzbühel. Antes del torneo austriaco perdió en primera ronda del torneo de Estoril ante su compatriota David Ferrer. En el Grand Slam parisino, por segunda vez consecutiva consiguió llegar a la segunda ronda, venciendo en primera ronda a Yevgueni Koroliov que se retiró cuando Daniel ganó el primer set por 6-4. En segunda ronda, Tommy Robredo le derrotó por 4-6 4-6 3-6. En el torneo londinense de Queens perdió en primera ronda frente a Frederico Gil, a quien había derrotado una semana antes en el Challenger de Prostejov. En el Grand Slam de Wimbledon de 2009, Daniel Gimeno-Traver obtuvo su primera victoria hasta la fecha (04/07/2013) en un Grand Slam sobre hierba, derrotando a Taylor Dent por 7-5 7-6 4-6 6-7 6-4. En segunda ronda Viktor Troicki le derrotó por 7-6 0-6 6-1 3-6 5-7. En el ATP World Tour 250 de Bastad pasó la previa, volvió a derrotar a Frederico Gil en primera ronda y perdió ante el austriaco Jurgen Melzer. En el torneo sobre tierra batida del Torneo de Umag sucumbió ante el entonces top-10 Nikolái Davydenko por un marcador de 2-6 2-6. En el último Grand Slam del año perdió en primera ronda ante otro top-10, Gilles Simon, quien lo derrotó por 4-6 6-7 3-6. Después de ello, Daniel afrontaría su mejor temporada en el circuito Challenger, llegando a cuartos de final en el de Sevilla (lo derrotó Pere Riba), ganando los torneos de Challenger de Banja Luka (ganando a Maric, Krajinovic, Robert, Kamke y Reister) y Tarragona (venciendo en esta ocasión a Scukin, Cipolla, Brizzi, Hajek y Lorenzi), y llegando a la final del de Asunción, cayendo en la final frente al paraguayo Ramón Delgado. En el torneo ATP World Tour 250 de Bucarest perdió en primera ronda frente a Fabio Fognini y en el ATP World Tour 500 de Valencia perdió ante Andy Murray. En 2009, Daniel Gimeno acabó en la posición 72 delranking ATP.