Commission de l'énergie atomique des États-Unis
Après la guerre, Manley quitte Los Alamos pour servir comme secrétaire exécutif du "General Advisory Committee" qui conseille la Commission de l'énergie atomique des États-Unis. Ensuite, il retourne à Los Alamos comme directeur adjoint à la recherche. De 1951 à 1957, il enseigne la physique à l'université de Washington. En 1954, il reçoit une bourse Guggenheim.