معهد وايزمان للعلوم
قُبلت يونات في مدرسة تيشون هادش الثانوية على الرغم من عدم قدرة والدتها على دفع الرسوم الدراسية، إذ أعطت دروسًا في الرياضيات للطلاب في المقابل. قالت إنها استمدت الإلهام في صغرها من ماري كوري، العالمة البولندية ذات الجنسية الفرنسية. على أي حال، صرحت يونات لاحقًا أن كوري التي فُتنت بها عندما كانت طفلة نتيجة قراءتها سيرة مكتوبة بطريقة جيدة، لم تكن «قدوةً لها». عادت إلى القدس بهدف الدراسة الجامعية، وتخرجت من الجامعة العبرية في القدس بعد حصولها على درجة البكالوريوس في الكيمياء عام 1962، وشهادة الماجستير في الكيمياء الحيوية عام 1964. حازت على درجة الدكتوراه من معهد وايزمان للعلوم عام 1968 عن دراستها البلورات المكونة للكولاجين باستخدام الأشعة السينية، تحت اشراف مستشار الدكتوراه ولفي تراوب.