Escherichia coli
在水淨化和汙水處理領域，因大腸桿菌在糞便中数量极多，故常用为检查水源是否被粪便污染的标志，其測量標準爲大腸菌群指數。此外大腸桿菌多數情況下無害，不會從實驗室“逃脫”而傷害人類。利用大腸桿菌作爲糞便污染的指示物也可能產生誤導性的結論，因爲其它環境如造紙廠中，大腸桿菌也可大量存在。