Stockholm Open
2009年全豪オープンでは、準優勝した年以来3年ぶりの4回戦まで勝ち進んだが、第3シードのノバク・ジョコビッチに1-6, 6-7(1), 7-6(5), 2-6 で敗れる。この後全仏オープンで初戦敗退し、直後のオルディナ・オープン大会の2回戦を途中棄権したため、ウィンブルドン選手権を欠場する。ウィンブルドン終了後、バグダティスの世界ランキングは151位まで落ちた。それからしばらく男子ツアーの下部大会を転戦し、3大会を制して徐々に世界ランキングを戻していったバグダディスは、10月のストックホルム・オープン決勝でオリビエ・ロクスを破り2年ぶりのツアー3勝目を挙げた。年間最終ランキングは42位まで持ち直した。