Atrato River
Парк состоит из пойм около реки Атрато, составляющих 47 % его территории, и небольших холмов высотой от 250 до 600 метров, являющихся частью цепи Серранья-дель-Дарьен и занимающих оставшуюся площадь парка. Поймы подразделяются на высокие террасы, которые почти не затоплены, и на аллювиальные террасы, затопленные на протяжении большей части года. Река Атрато считается одной из самых быстрых в мире, поскольку её расход воды у впадения в Карибское море составляет около 4900 м³/с. В почвы горных районов парка поступает намного меньше воды, поэтому земля там значительно менее плодородна, чем на равнинах.