Chipper Jones
には三塁の定位置を新鋭チッパー・ジョーンズに譲ってフロリダ・マーリンズに移籍。同年は打率.290、14本塁打を記録。皮肉にも、ペンドルトンがいなくなったブレーブスはワールドシリーズ優勝を果たした。翌シーズン途中の8月に交換トレードでブレーブスに移籍（復帰）。この時、ブレーブスは右翼手で打線の中核であるデビッド・ジャスティスを故障で欠き、さらに正遊撃手ジェフ・ブラウザーが故障した。チッパー・ジョーンズを遊撃手で起用し、三塁手としてペンドルトンを起用するための復帰であった。交換相手はプロスペクトのルーズベルト・ブラウン（のちにオリックス・ブルーウェーブに在籍）であった。同年ブレーブスはワールドシリーズ進出。自身5度目のワールドシリーズ出場となったが、ニューヨーク・ヤンキースに敗退。はシンシナティ・レッズと契約するが、3度にわたる故障者リスト入りもあってシーズン途中に解雇された。翌、キャリア初のアメリカンリーグとなったカンザスシティ・ロイヤルズを最後に現役引退。