赤石山脈
中央新幹線在東京至名古屋中間、山梨實驗線以西的路段需要通過日本阿爾卑斯山脈地區。然而JR東海無法就選線問題與該路段所屬的地方政府——長野縣獲得共識。在JR東海於2009年12月送交國土交通省的調查報告書中，總共列出了3條線路，分別為JR東海方面自己倡議的、直接貫穿赤石山脈（南阿爾卑斯）的「C路線」（），另外兩條則是長野縣府以促進縣內經濟為由而提出的北彎方案，其中的「A路線」行經和木曾福島，「B路線」行經及飯田。伊那谷的B路線拉的最長，使東京至名古屋的軌道距離增為346公里、車程47分鐘、要價5.74兆日圓；A路線的數據則為334公里、46分鐘及5.63兆日圓，均超過JR東海提出的C路線。2010年10月20日，運政審正式宣布JR東海的C方案勝出，並表示該方案的為1.51，而行經伊那谷的B方案僅為1.21。