International Union for Conservation of Nature
칠레바위쥐는 분포 지역이 넓고 개체수가 풍부한 것으로 추정된다. 특별한 위협 요인은 없으며, 국제 자연 보전 연맹(IUCN)이 보전 등급을 "관심대상종"으로 지정했다.