花旗松
小阿普爾蓋特河流域主要被溫帶針葉林覆蓋，約佔流域總面積64%。流域的常見樹種包括花旗松、西黃松、、等，而灌木叢及一些熊果屬植物則生長在較乾燥的濃密常綠闊葉灌叢帶。流域還生長了數種珍貴稀有植物，包括貝母屬"Fritillaria gentneri"、景天屬"Sedum oblanceolatum"、、、火焰草屬"Castilleja schizotricha"。土地管理局的科研人員亦在流域內尋得七種有害雜草，包括三種、、金雀花、貫葉連翹、新疆千里光。