克隆氏症
大多數案例是由於手術切除了大部分的小腸所造成。這類手術主要是因為成年人的克隆氏症和幼兒的壞死性小腸結腸炎。其他原因包括小腸的損傷，以及出生時有異常的短腸。短腸症候群它通常不易發現，小腸長度通常為6.1米，一般要到長度不到2米（6.6英尺）時才會發現到。