World Medical Association
Seit 1981 ist Henke Mitglied der Kammerversammlung der Ärztekammer Nordrhein, seit 1985 in deren Kammervorstand, seit November 2011 als Präsident. 1995 wurde er erstmals in den Vorstand der Bundesärztekammer gewählt. Seit 1991 bekleidet er den Posten des ersten Vorsitzenden des Landesverbandes Nordrhein-Westfalen/Rheinland-Pfalz im Marburger Bund. Am 10. November 2007 wurde Henke als Nachfolger von Frank Ulrich Montgomery zum Vorsitzenden des Marburger Bundes gewählt. Er stand bis Oktober 2019 als Erster Vorsitzender an dessen Spitze. Henke ist weiterhin deutscher Delegierter des Weltärztebund es. Am 26. Oktober 2013 wurde Henke zum dritten Mal wiedergewählt.