Югославская народная армия
Мостар был серьёзно поврежден в результате обстрела ЮНА во время осады. Среди разрушенных или сильно поврежденных зданий были Католический собор Девы Марии, Матери церкви, францисканская церковь и монастырь, Епископский дворец (с библиотечной коллекцией более 50 000 книг), 12 из 14 мечетей, исторический музей, архивы и ряд других культурных учреждений. Все мосты города были разрушены, остался только мост на Старом Мосте. В середине июня 1992 года, после того, как линия фронта сместилась на восток, войска Хорватского совета обороны разрушило православный монастырь Житомислич, а собор Святой Троицы сожгла неустановленная группа. Югославская народная армия обвинялась в преследовании лиц несербской национальности, а также в разграблении и поджоге собственности боснийцев и хорватов. Около 90 тысяч из 120 тысяч жителей Мостара стали беженцами. Тысячи боснийцев, покинувших Мостар во время осады, начали возвращаться в город. За ними последовало множество боснийских беженцев из других боснийских городов, захваченных Армией Республики Сербской.