Team Fortress Classic
就像以前的系列作一樣，《雷神之錘4》可以被大幅的修改。這讓《雷神之錘4》有和前作類似的遊戲模組，例如 Rocket Arena和 Quake 4 Fortress （雷神之錘版的絕地要塞2）。不過 Quake 4 Fortress 在完成以前就被放棄了，但是製作者釋出了內含完整原始碼的 alpha 版。