ホレイショ・ゲイツ
1777年9月、リンカーンはサラトガの近くに居たホレイショ・ゲイツの部隊に合流しサラトガの戦いに参戦した。しかし、踵にマスケット銃の弾を受けて傷ついたために第二次サラトガの戦いでは大きな役割を果たせなかった。この時の傷がもとで、その後は片足が短いままとなった。この傷が癒えるとリンカーンは1778年9月に南部方面軍の指揮官に指名された。リンカーンは1779年10月9日のジョージアのサバンナ攻撃に参加し、サウスカロライナのチャールストンへ撤退を余儀なくされた。リンカーンにとっては運が悪いことに、チャールストン市内に追い込まれて包囲された。