Multiple sclerosis
감염성 단핵구증의 가장 큰 원인이다. 비악성 전암 및 버킷 림프종, 혈구탐식성 림프조직구증, 호지킨 림프종 등의 악성 엡스타인-바 바이러스 연관 림파구증식 질병의 원인이 되기도 한다. 림프구와 무관하게 위암, 비인두암을 일으키기도 하고, 인간면역결핍 바이러스와 함께 구강모백반증이나 중추신경계통 림프종을 일으키기도 한다. 소아에게 앨리스 증후군과 급성소뇌성 실조증을 일으키며, 피부근염, 전신 홍반성 루푸스, 류머티스 관절염, 쇼그렌 증후군, 다발성 경화증 등 자가면역질환을 일으키기도 한다. 매년 20만 이상의 암이 이 바이러스로 인해 발생한다.