Faith and Order Commission
Nygren unterstützte den Kampf der Bekennenden Kirche gegen den Nationalsozialismus in Deutschland und wurde dafür 1955 mit dem Bundesverdienstkreuz geehrt. Bei der Gründung des Lutherischen Weltbundes 1947 wurde er zum Vorsitzenden gewählt (bis 1952). Auch in anderen ökumenischen Organisationen war Nygren aktiv, besonders in der Kommission für Glauben und Kirchenverfassung des Ökumenischen Rates der Kirchen (ÖRK). 1949 wurde Nygren Bischof im Bistum Lund.