Мотагуа
Леверон начал свою карьеру в клубе «Мотагуа». 19 апреля 2009 года в матче против «Марафон» он дебютировал в чемпионате Гондураса. 17 августа в поединке против «Платенесе» Джонни забил свой первый гол за команду. В 2011 году он помог «Мотагуа» выиграть чемпионат.