ニューメキシコ準州
駅馬車の旅客は、駅馬車内でもステーションにおいても、インディアンの襲撃にも直面していた。中央部を横断する駅馬車やポニー・エクスプレスのステーションでは何度かインディアンの襲撃があった。最悪の襲撃は1861年にニューメキシコ準州におけるものであった。この年の2月に発生したまでは、サンアントニオとサンディエゴを結ぶギディングス・ラインとニューメキシコ準州のアパッチ族の関係は良好であった。ニューメキシコ準州からアリゾナ準州ツーソンまでの駅馬車ステーションのほとんどの干し草は、アパッチ族が供給していた。事件後、がアパッチ族の土地から白人を追い出そうとアパッチ戦争を開始した。この結果、6台の駅馬車の乗員と旅客が死亡し、これらの馬車は焼かれ、そして1か所を除く途中のステーションが破壊されてその管理者が殺された。ゼネラルマネージャーの兄弟のジェームズ・ギディングスは、コーチーズを探し制圧しようと試みたが、さらにギディングス自身と6人の男たちが死ぬことになった。こうした被害と、南北戦争が始まったことで、南部の大陸横断ルートの駅馬車は終焉を迎えることになった。