Operation Weserübung
1940年4月，格奈森瑙號參與了入侵丹麥和挪威的威瑟演習作戰，並和沙恩霍斯特號一起與英艦聲望號交戰，格奈森瑙號的前砲塔和主砲指揮儀受到了損壞，但兩艘德艦很快地從這場戰鬥中脫離了。5月5日，格奈森瑙號於離港口海域21公尺處觸雷（磁性水雷），受到了破壞而喪失航行能力18分鐘，直到5月21日於基爾修復。英軍於6月8日撤出挪威，而當天下午4點，格奈森瑙號和沙恩霍斯特號撞見了英國艦隊，並展開攻擊，英國皇家海軍的、驅逐艦和均被擊沉，但在被擊沉前，阿卡司塔號仍發射了一枚魚雷重創了沙恩霍斯特號，造成船身內部淹水。而格奈森瑙號於20日和希佩爾海軍上將號重巡洋艦前往冰島一帶做佯動誘敵航行，以掩護沙恩霍斯特號駛回德國的途中，遭到英國潛艇的魚雷攻擊受創，因而兩艦也經由挪威特倫汗，同沙恩霍斯特號駛回德國。