美国国家科学奖章
1988年埃利恩与喬治·H·希欽斯和詹姆士·W·布拉克共享諾貝爾生理學或醫學獎，其他奖项包括1991年获得的美国国家科学奖章和1997年获得的Lemelson-MIT终身成就奖。1991年，她成为了第一位入选的女性。