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대정봉환 이후의 일본의 정치체제에 대해서는 제후회의에 의해 결정되었어야 했지만, 12월에 사쓰마 번 등은 정변을 일으켜 조정을 제압하고 요시노부를 배제하는 신정부 수립을 선언한다. 왕정복고(王政復古)의 대호령이다. 회의에서는 요시노부의 사관납지(辞官納地) 즉 요시노부의 내대신(内大臣) 관직 사직, 막부령(幕府領) 영토에 대한 봉납 등이 결정되었다. 요시노부는 충돌을 피하고자 아이즈 ・ 구와나 번의 병사들과 함께 오사카 성으로 물러났고, 여러 외국 공사들을 모아 자신의 정당성을 주장하였다. 요시노부는 에치젠 번(越前藩) ・ 도사 번(土佐藩)을 움직여 사관납지의 집행을 온화한 형태로, 연말에는 요시노부 자신의 의정(議定) 취임(신정부에 참여)하기로 하는 것이 거의 확정되었다.