Sudan People's Liberation Movement
En 1977, al-Numeiry fue reelegido presidente, y en 1980, Sudán queda reorganizado en 6 regiones, las cuales poseen cierto nivel de autonomía y un gobierno regional. En octubre de 1982, Sudán consolida una estrecha relación con Egipto, tras la firma de una "Carta de Integración". Sin embargo, durante la primera sesión del Parlamento del Valle del Nilo, en la que parlamentarios egipcios y sudaneses firmaron el reemplazo del código penal por la ley sharia, y por lo que provocó nuevas revueltas en las provincias del sur, ya que eran mayoritariamente cristianas y animistas, por lo que se dio inicio a la Segunda Guerra Civil Sudanesa, que finalizará en 2005. Este conflicto generó la deserción de numerosos altos mandos del ejército que eran cristianos, y en el sur surgió el Ejército de Liberación del Pueblo de Sudán (EPLS), por lo que la guerra alcanzó a gran escala.