連邦党
1824年、クレイトンはデラウェア州下院議員に選任された。クレイトンは1826年12月から1828年10月までデラウェア州州務長官を務めた。クレイトンは連邦党の中でも保守派の流れを汲み、ジョン・クインシー・アダムズを支持する派閥の長となった。クレイトンは連邦党の伝統的政治思想である「小さな政府」を志向した。連邦党は1820年代初頭から分裂をはじめたが、クレイトンは「アメリカ体制」論を打ち出したヘンリー・クレイらとともに国民共和党を結成し、民主共和党の「大きな政府」志向に対抗した。