福井藩
一方で福井藩に残留した子孫もいるようであり、『武鑑』においては福井藩士として弘化年中や慶応年中の福井藩番頭や用人に『多賀谷舎人』が見える。前橋松平家中では松平義知の年寄に『多加谷内膳』、松平直侯の重臣に『多賀谷左近』、『多賀谷伊織』など年寄や家老級の重臣として多賀谷氏または多加谷氏がしばしば登場する。