Махатхир Мохамад
В 1970-х годах, после окончания Индонезийско-малайзийской конфронтации, отношения между странами улучшились. Правительства обеих стран стали сотрудничать в рамках АСЕАН. Новый формат отношений подкреплялся этническим родством двух народов, религией, культурой и схожим языком. Сохранялись и негативные моменты: незаконные индонезийские иммигранты в Малайзии, опасения Индонезии по поводу экспорта радикальных исламских аудиокассет из Малайзии, но развитие торговли между странами способствовало налаживанию хороших отношений. Однако, к концу 1980-х годов правительства Индонезии и Малайзии дистанцировались друг от друга, поскольку они видели различные подходы к решению проблем по взаимодействию со своими основными торговыми партнерами, в частности Малайзия некорректно вмешалась в развивающиеся отношения между Сингапуром и Индонезией. В 1992 году Индонезия в АСЕАН выразила неприятия Малайзийской системы Восточноазиатской экономической группы, что подчеркнуло различный взгляд этих двух стран на будущее АСЕАН. Например, на саммите Движения неприсоединения премьер-министр Малайзии Махатхир Мохамад выступал резко с проазиатскими и происламскими лозунгами, что сильно отличалось от умеренной позиции президента Индонезии Сухарто.