加拿大省
上下加拿大於1841年結合為加拿大省，而京士頓則同時獲選為加拿大省的首府，但不到三年就因为“規模太小並缺乏配套設施”、“過於接近美國邊界令其難以抵禦美軍入侵”等原因失去了这个头衔。加拿大省首府從1844年起在蒙特利尔、多伦多和魁北克城之間輪替，到1857年則由英女皇維多利亞的一纸诏书宣布渥太华为首都，再於1866年正式遷都渥太華。京士頓的重要性隨之大減，市内發展亦大為放緩。縱雖如此，京士頓仍保留其五大湖區主要港口之一的地位，並於19世紀末和20世紀初成為工業重鎮，主要產物包括船艦和火車機車。