Prince of Portugal
سيباستياو كان الابن الوحيد لـ جواو مانويل، أمير البرتغال وزوجته خوانا من إسبانيا، يعتبر سيباستياو حفيد جواو الثالث من البرتغال وحفيد الإمبراطور روماني مقدس كارل الخامس (كارلوس الأول) وإيزابيلا أفيز شقيقة جواو الثالث.