Mycobacterium tuberculosis
肺結核感染始於結核桿菌感染肺泡，結核桿菌可侵入肺泡並在其巨噬細胞的核內體中複製。巨噬細胞辨認結核桿菌為異己並嘗試以吞噬作用清除。在此過程中，結核桿菌被巨噬細胞包裹并暫時儲存於吞噬體中，即一種膜連型囊泡。之後吞噬體與溶酶體結合，形成吞噬溶酶體。在吞噬溶酶體中細胞嘗試使用活性氧類及酸來殺死細菌，但結核桿菌有一層蠟狀的厚層構成的囊狀結構，以此保護其自身免於毒性物質的侵害。因此結核桿菌可以在巨噬細胞里複製并最終殺死巨噬細胞。