Entrenador del Año de la NBA
En la temporada 1997-98 dejó a los Pacers para fichar por los Philadelphia 76ers, llevándolos en cinco de sus seis años a los playoffs, la primera de las cuales hizo historia al convertirse en el primer entrenador de la NBA en llevar a seis equipos diferentes a la ronda final por el campeonato. En la temporada 2000-01 consiguió 56 victorias, la mejor marca de la franquicia desde 1985, siendo el mejor balance tanto de la División Atlántico como de la Conferencia Este. Tras eliminar a Indiana, Toronto y Milwaukee, los Sixers se plantaron en las Finales, siendo la primera vez en 18 temporadas que lo lograba Brown. Allí se encontraron con los Lakers de Shaquille O'Neal y Kobe Bryant, que les derrotaron 4-1. A pesar de ello, Brown fue nombrado Entrenador del Año de la NBA.