Magyar Kupa
Dos años después de haber regresado de la NBII, en 1996-97, el MTK FC ganó su vigésimo campeonato y, a la vez, el club sumó su décima Copa de Hungría bajo el mandato del entrenador Jozsef Garami tras una igualada final ante el Újpest FC por un gol a cero. En la Liga de Campeones de la UEFA 1997-98, el MTK Hungária FC entró en la primera ronda previa contra el Pyunic Yerevan de Armenia, al que eliminó por un global de 6–3. En segunda ronda previa se midió al Rosenborg BK noruego, con el que cayó por un global de 1–4. El MTK continuó en la Copa de la UEFA, donde en la fase de clasificación apeó al Alania Vladikavkaz por un global de 4–1 y fue eliminado por el Crotia Zagreb (1-0 y 0-2). En 1999 ganó su campeonato 21º de Hungría y en 2000 su 12ª Copa de Hungría. En el siglo XXI volvió a conquistar las ligas de 2003 y 2008.