Arabidopsis thaliana
Sowohl vor seiner Beschäftigung mit der Aufklärung der dreidimensionalen Struktur des Photosynthesereaktionszentrums wie auch danach arbeitete Deisenhofer an zahlreichen weiteren Molekülen. Dabei handelte es sich sowohl um Biomoleküle humanem Ursprungs wie auch anderer Organismen wie etwa der Fruchtfliege "Drosophila melanogaster" oder der Acker-Schmalwand ("Arabidopsis thaliana").