Trojan Horse
Cheat Engine可以將代碼注入其他進程，因此大多數的防毒軟體會將它誤認為病毒。有一些版本可以避免這個問題，但許多功能會因此無法使用。產生這個問題的主要原因是因為Cheat Engine使用了一些與特洛伊木馬相同的rootkits以取得部分系統的權限，除非停用防毒軟體的啟發式掃描，否則將被視為可疑的程序。新版的Cheat Engine已漸漸不易被防毒軟體所阻擋，像是代碼注入的一些功能也能運作無誤。