Henry Halleck
ボーリガードはテネシー州に派遣され、アルバート・ジョンストン将軍が戦死したシャイローの戦いで南軍の指揮を執った。初日、1862年4月6日の戦闘はうまく行ったが、北軍が既に敗れたと見なして時期尚早に攻撃を止めさせてしまった。2日目、北軍のユリシーズ・グラント将軍が援兵を受けて反撃に出た後で、ボーリガードは後退を強いられた。後にコリンスの包囲戦でも、北軍のヘンリー・ハレック少将の部隊によって、南軍の補給基地からの撤退を余儀なくされた。その後南軍の指揮はアラバマ州出身のブラクストン・ブラッグ将軍に取って代わられた。これには、南部連合の大統領デイヴィスとの折り合いが悪く、逆にブラッグがデイヴィスのお気に入りであったことも関連している。