National Committee for a Free Germany
С самого начала своего пребывания в плену Мюллер начал активно участвовать в антифашистской деятельности. 3 августа 1944 года он стал членом Национального Комитета Свободная Германия и Союза Германских Офицеров. Часто выступал с комментариями в передачах радиостанции «Свободная Германия» и одновременно писал статьи в газете «Фрайес Дойчланд». В конце 1944 года он вместе с генералом Рудольфом Бамлером посещал специальные курсы антифашистов. 8 декабря 1944 года Мюллер подписался под воззванием НКСГ (так называемом обращении 50 генералов) в адрес германской группы армий «Север».