Barakzai dynasty
18世紀、カンダハールにドゥッラーニー朝が起こり、マザーリシャリーフはその版図に組み込まれた。その後、ドゥッラーニー朝は一族のバーラクザイ朝に滅ぼされた。19世紀に入るとロシアの南下政策に対抗するために、イギリス軍がアフガニスタンへの進駐を要求し、三次にわたってアフガン戦争が勃発した。1839年に始まった第一次アフガン戦争では王子が活躍した。1878年に始まった第二次アフガン戦争では、国王のシール・アリー・ハーンがカブールを追われてバルフで死去した。王子や国王の墓はマザーリシャリーフのブルーモスクにあると言う。またこの時代、マザーリシャリーフとバルフの中間に位置するカライジャンギ（英語: Qala-I-Jangi）に、西洋式の星形要塞が作られた。