彌生時代
愛媛縣自舊石器時代開始就已經有人類活動，縣內的繩文時代初期遺跡則有歷史超過1萬2千年的上黑岩岩陰遺跡等地。進入繩文時代後期時，愛媛各地人類活動明顯增加，在縣內多地都發現了這一時期的遺跡。愛媛縣內的彌生時代初期遺跡很少，但在彌生時代中期之後則隨著水稻栽培開始普及而遺跡也有所增加。愛媛縣在彌生時代末期已經開始出現古墳，進入古墳時代之後古墳的數量和規模更大幅增加。愛媛縣內不僅在離島地區亦分佈有古墳，自5世紀後期開始在內陸地區也出現了古墳。