쇼난 신주쿠 라인
운행 초기에는 낮에만 25왕복이 편성되었으며, 그 중 우쓰노미야 선·다카사키 선 직결 운행 열차는 18왕복을 운행했고, 그 외 신주쿠 시종착 도카이도 본선·요코스카 선의 열차가 있는 정도에 그쳐 도쿄 및 우에노 시종착 열차에 대한 보조적 역할이 강했다. 이는 이케부쿠로 역 구내의 배선 관계 상 다수 증편이 어려웠기 때문이지만 개업 전부터 계획된 개량 공사가 완성된 2004년 10월 16일의 시간표 개정에 따라 쇼난 신주쿠 라인 전 열차가 남북 직결 운전을 시작하여 운행 편수가 64편으로 증가하였다. 우쓰노미야 선 ~ 요코스카 선의 계통과 다카사키 선 ~ 도카이도 선의 계통 열차가 번갈아 운행되고 있어 오미야 ~ 오후나 간의 운행 편수는 낮에는 보통 시간당 4편, 아침에 시간당 6편이 운행되고 있으며 열차는 2층 특실(그린샤) 차량이 딸린 E231계 전동차와 E233계 전동차가 운용되고 있다.