John II of Portugal
1385年，隨着阿勒祖巴洛特戰役，創立第二王朝；阿維什騎士團首領若昂繼承王位，成為若昂一世。若昂一世加入十字末端飾有百合花型紋章，代表騎士團的阿維什十字在紅邊上，因此城堡數目減少至十二個（三個各以Ｌ字型據一角），而每個藍色Quina盾上的比占減少至七個。這面旗幟使用百年，直到1485年若昂一世的曾孫若昂二世改變了它的風格，其中重要的變化—移除阿維什十字，重新設計Quina讓它看起來平滑且寬，並確定把比占的數目減到每個quina盾上五個，並排成聖安德魯十字形，花邊上城堡的數量則減至七個，並沿用到現在。若昂二世的國旗是最後使用紋章旗幟作為「國旗」者。在1495年他去世後，繼承人徹底地改變了國旗的樣式。