五島列島
長崎縣的舊石器時代遺跡有佐世保市的福井洞窟、泉福寺洞窟；雲仙市的百花台遺跡群；平戶市的日之岳遺跡等地。長崎縣內的繩文時代代表性遺跡則有南島原市的原山支石墓群、諫早市的有喜貝塚、五島列島的白濱貝塚等地。