Battle of Stones River
トーマスはローズクランズの下で、新たにカンバーランド軍と改名された軍の中央軍の指揮を任され、ストーンズリバーの戦いでは退却する北軍の中央を固めて再度ブラッグ軍の勝利を阻止し、印象的な働きを残した。1863年6月22日から7月3日に掛けてのタラホーマ方面作戦では、デシャードからチャタヌーガに向けた操軍で最も重要な部分を担当し、テネシー川を渡った。9月19日のチカマウガの戦いでは、第14軍団の指揮を執り、北軍右翼が崩壊する中でブラッグ軍の猛攻を受ける絶望的な防御戦を再度守り抜いた。トーマスは突破され散り散りになった北軍兵をホースシューリッジで掻き集め、北軍が望みのなくなるまで崩壊するような重大な敗北から救った。カンバーランド軍の野戦士官で、後に大統領になったジェームズ・ガーフィールドが戦闘中にトーマスを訪れ、ローズクランズからの撤退命令を伝えた。トーマスが全軍の安全が確保されるまで守り抜くと言うと、ガーフィールドはローズクランズの所に戻って、トーマスは「岩のように立っている」と伝えた。