Khanate of Bukhara
Von den Scheibaniden überlebte lediglich der Enkel Abu'l-Chairs, Mohammed Scheibani, der ein Leben als Freibeuter führte und 1488 bis 1500 Vasall der Mogul-Khane war, die ihm vorher bei seinen Feldzügen in Transoxanien geholfen hatten. Danach gewann er an Unabhängigkeit, zog gegen die timuridischen Nachfolgestaaten wie Samarkand und Buchara – und gründete das Usbeken-Khanat. Scheibanis Hauptgegner waren der Timuride Babur und der persische Schah Ismail. 1506 wurde aus dem Usbeken-Khanat das Khanat von Buchara. Nach einer Niederlage 1510 in einer Schlacht bei Merw gegen den Safawiden Ismail, in der Mohammed Scheibani fiel, gewann Babur vorübergehend die Herrschaft über Buchara und Samarkand zurück.