카를 루트비히
프란츠 페르디난트는 1863년 그라츠에서 프란츠 요제프 1세의 동생 카를 루트비히 폰 외스터라이히 대공과 그의 두 번째 아내 마리아 안눈치아타 디 보르보네두에시칠리에의 아들로 태어났다. 어머니를 폐결핵으로 잃은 그는 어려서부터 병약하였으며 이로 인해 자주 요양을 해야 했다. 그러나 사촌형인 루돌프 황태자의 자살로 그는 제위 계승권을 포기한 아버지를 제치고 오스트리아-헝가리 제국의 후계자가 되었다. 어른이 된 뒤에도 군 복무 수행을 띄엄띄엄 해야 할 만큼 건강이 좋지 않았고, 이로 인해 황제를 비롯한 궁정 인사들은 그의 장래에 대해 회의적이었다.