Federated Malay States
在1896年7月，英政府進一步把馬來半島的雪蘭莪、森美蘭、霹靂和彭亨四個州合組為馬來聯邦，並以海峽殖民地總督兼任英國駐馬來亞高級專員一職。可是，海峽殖民地總督與輔政司遠在新加坡辦公，因此聯邦事務是由位於吉隆坡辦公的馬來聯邦總駐紮官（1911年改稱馬來聯邦布政司，1936年再改稱聯邦司）掌控。新設立的馬來聯邦總駐紮官與海峽殖民地輔政司互不從屬，但兩者性質類似，轄下四州各置有一名駐紮官，但馬來聯邦總駐紮官在日常事務中代表高級專員作出實質管治，因此實權相對上比海峽殖民地的輔政司更大。