Spanish Armada
翌年、"ボナヴェンチャー"はの指揮の下、アルマダの海戦に参戦した。この戦闘で"ボナヴェンチャー"は総積載可能量の8%に相当する51.5トンの兵器を輸送した。1588年9月25日に実施された点検では、"ボナヴェンチャー"がアルマダ海戦で受けた損傷は僅かに帆の一部のみに「銃で撃たれたいくつかの穴」がみとめられる程度であった。