Putumayo Department
Муниципалитет расположен в западной части департамента. Граничит на северо-западе с территорией департамента Путумайо, на востоке — с муниципалитетом Ла-Чоррера, на юго-востоке — с муниципалитетом Эль-Энканто, на востоке — с муниципалитетом Ла-Педрера. Южная и западная административные границы совпадают с участком государственной границы Колумбии и Перу и проходят по реке Путумайо. Абсолютная высота поселения Пуэрто-Алегрия — 144 метра над уровнем моря.