ヒッタイト語
退官してからヒッタイト語、リュキア語、トカラ語に関する著作を公刊した。ペデルセンはフェルディナン・ド・ソシュールやヘルマン・メラーの喉音理論の早くからの数少ない賛成者であり、のちにイェジ・クリウォヴィチがヒッタイト語によって喉音理論を発展させると歓迎した。晩年のヒッタイト語の著作では独自の喉音理論を立てた。