Chronic fatigue syndrome
يمكن أن يؤدي اختلال الميكروبيوم إلى السماح للعضويات الضارة الخارجية أو الموجودة ضمن الميكروبيوم بالسيطرة على الأمعاء، وتشمل الأمراض المرتبطة بذلك: أمراض اللثة، الداء المعوي الالتهابي، متلازمة التعب المزمن، البدانة، السرطان التهاب المهبل الجرثومي، والتهاب القولون.