Gulf of Urabá
Муниципалитет Сан-Хуан-де-Ураба граничит на востоке и юго-востоке с муниципалитетом Арболетес, на западе и юго-западе — с муниципалитетом Некокли, на севере омывается водами Карибского моря. Площадь муниципалитета составляет 239 км².