ミヒール・デ・ロイテル
町の防衛は、漁業や商業を巡る争いから必要性を増した。1665年6月、オランダの海軍軍人ミヒール・デ・ロイテルが一時的にセントジョンズを占領する事態になった。1673年にも二度目のオランダ軍による侵略があったが、街にいた人々は国籍などを問わず防衛に参加し、防ぎきった。1689年ごろからイギリス政府は町の要塞化を進めた。フランスの航海者ピエール・ル・モイン・ディベルヴィユによる1696年の占領と破壊の後、イギリスは町を取り返し要塞建設を進めたが、1705年と1708年にもフランス軍に襲われ市街が燃える被害を受けている。七年戦争に呼応して北米で起こったフレンチ・インディアン戦争では、最後の戦闘が1762年にセントジョンズ郊外のシグナルヒルで起こり（シグナルヒルの戦い）、フランス軍が降伏した。