Gallia Narbonensis
Впервые "хвойник двухколосковый" был описан в 1753 году Карлом Линнеем в первом издании «Species plantarum». Типовая местность — южная Франция (Нарбонская Галлия) и Испания. Линней присвоил этому растению имя , которое используется по настоящее время.Латинское название рода является транслитерацией древнегреческого слова  — «сидящая на», которое образовано от слов  — «на», «среди» и  — «седалище», «сиденье». Так в сочинениях Плиния назывался Хвощ (), поскольку у него сегменты стеблей сидят как бы один на другом. Линней заимствовал это слово из-за внешнего сходства хвойника с хвощом.