高等裁判所
司法に関しては東マレーシアの裁判所は、マレーシアの連邦裁判所の一部である。マレーシア憲法は同格の司法権の2つの（マラヤの高等裁判所とサバ州とサラワク州の高等裁判所（旧ボルネオ高等裁判所））があると規定している。サバ州とサラワク州の高等裁判所の現在の長官は、サバ州出身のである。その役職はマレーシアの司法制度で4番目に高い（マラヤ長官、長官、に次ぐ）。