FSB
Pornind de la criza de ostatic din Moscova în 2002, Rusia se confrunta cu niveluri crescute de terorism islamist. FSB, fiind principala agenție responsabilă cu operațiunile de combatere a terorismului, se afla pe primul loc în lupta împotriva terorismului. În timpul asediului teatrului de la Moscova și asediul școlii Beslan, unitățile Spetsnaz ale FSB, Alpha Group și Vympel, au jucat un rol-cheie în operațiunile de eliberare a ostaticilor. Cu toate acestea, performanța lor a fost criticată din cauza numărului mare de victime ale ostaticilor. În 2006, FSB a obținut un mare succes în eforturile sale de combatere a terorismului, când la ucis cu succes pe Shamil Basayev, conducătorul din spatele tragediei din Beslan și alte câteva acte teroriste de mare amploare. Potrivit FSB, operațiunea a fost planificată pe parcursul a șase luni și a fost posibilă din cauza activităților sporite ale FSB în țările străine care furnizau arme teroriștilor. Basayev a fost urmărit prin supravegherea acestui trafic de arme. Basayev și alți militanți se pregăteau să efectueze un atac terorist în Ingusheția, când agenții FSB i-au distrus convoiul; 12 militanți au fost uciși. În ultimii ani ai celei de-a doua președinții a lui Vladimir Putin (2006-2008), atacurile teroriste din Rusia au scăzut, scăzând de la 257 în 2005 la 48 în 2007. Analistul militar Vitaly Shlykov a apreciat eficacitatea agențiilor de securitate din Rusia, Cecenia și Daghestan au fost cheia succesului. În 2008, revista americană Carnegie Endowment's Policy Policy a numit Rusia drept "cel mai rău loc de a fi terorist" și a subliniat în special disponibilitatea Rusiei de a acorda prioritate securității naționale asupra drepturilor civile. Până în 2010, forțele ruse, conduse de FSB, au reușit să elimine conducerea de vârf a insurgenței cecene, cu excepția lui Dokka Umarov.