Red Nacional de los Ferrocarriles Españoles
En 1941, con la nacionalización de los ferrocarriles de ancho ibérico, las instalaciones pasaron a integrarse en la Red Nacional de los Ferrocarriles Españoles (RENFE). A partir de la década de 1960 el complejo ferroviario de San Juan del Puerto inició su declive con el cierre paulatino de los ferrocarriles de Buitrón y Riotinto, que posteriormente serían desmantelados.