Сент-Джонстон
В апреле 2005 года Оуэн Койл был назначен главным тренером команды «Сент-Джонстон». В марте 2006 он получил награду «тренер месяца» в Шотландском Первом дивизионе. Под его руководством «Сент-Джонстон» победил «Рейнджерс» со счетом 0:2 на стадионе «Айброкс» и вышел в полуфинал Кубка шотландской лиги. Это была их первая победа на домашнем стадионе команды из Глазго за 35 лет. В марте 2007 Койл получил втору награду «тренер месяца» в Первом дивизионе. В этом сезоне «Сент-Джонстон» боролся за выход в Шотландскую премьер-лигу, его главным соперником был клуб «Гретна», который в последнем матче сезона обыграл «Росс Каунти» и в итоге набрал больше очков.