Нортгемптон Сэйнтс
Дэвис начинал играть в составе региональной команды «Лланелли», дебютировав на профессиональном уровне за команду «Лланелли Скарлетс» даже раньше, чем собственно за клуб «Лланелли». Дебют за «алых» состоялся 11 августа 2006 года в матче против «Нортгемптон Сэйнтс». 28 сентября 2007 года, в своём шестом матче за команду «Скарлетс» Джонатан занёс первую попытку, положив её в зачётку «Коннахта».