Premio Abel
Atiyah recibió la Medalla Fields en 1966, la Medalla Copley en 1988 y el Premio Abel en 2004. Fue condecorado con la Orden del Mérito del Reino Unido. En el año 1981, la Accademia dei Lincei le otorgó el Premio Feltrinelli. Gran Medalla de la Academia de Ciencias de Francia en 2010.