Kure Atoll
5月下旬から6月上旬にかけてのミッドウェー作戦における「神川丸」は、第十一航空戦隊（司令官藤田類太郎少将）を基幹とする航空隊（千歳、神川丸、駆逐艦早潮、第35号哨戒艇〔旧駆逐艦蔦〕、海軍陸戦隊1個小隊）として参加する。航空隊は、ミッドウェー島占領に向かう輸送船団と護衛隊（指揮官田中頼三第二水雷戦隊司令官）の対潜・対空警戒およびキューア島（クレ環礁、ミッドウェー島北西方向）の占領、作戦成功後のミッドウェー島水上機基地建設という任務を与えられた。