United States Central Command
海军舰队受海军总部领导。有的国家海军舰队在作战上归战区司令部指挥。例如，美国陆海空军军事行动受各个战区的联合作战司令部指挥，部署在印度洋波斯湾的美国海军舰艇的作战行动受美国中央司令部（USCENTCOM）指挥，在印度洋的美国海军第五艦隊无作战指挥权。中国人民解放军海军與南越海軍在1974年爆發的西沙海战，也是由广州军区直接指挥参战舰艇编队的海上指挥所，南海艦隊、榆林海军基地都没有指挥权。