G protein
GAP はGタンパク質共役受容体ファミリーと深く関連している。Gタンパク質は、GTP を結合しているときに活性化状態となる。GTP の結合によって、Gタンパク質の活性が変化し、阻害サブユニットが解離することでその活性は向上する。この活性化状態のとき、Gタンパク質は他のタンパク質を結合し、下流の標的因子へシグナル伝達を行う。GAPは、このプロセスを調節しており、Gタンパク質の活性を低下させる。