Empereur romain
De 1639 à 1653, le frère Joseph de Cupertino loge au couvent d'Assise, séjour contraint sur ordre du Saint-Office qui enquête sur ses extases. À l'occasion de la visite d'Éléonore de Nevers-Mantoue, épouse du Saint Empereur romain Ferdinand III, en avril 1653, un petit appartement lui est aménagé (dont certains souvenirs de l'époque sont encore conservés), adjacent à la salle capitulaire.