Церковь Шотландии
В 1892 году в приграничных с Индией общинах начали служение сотрудники Скандинавского миссионерского альянса. Вскоре к ним присоединились миссионеры Сантальской миссии; служение проводилось среди санталов при поддержке Северной евангелической церкви. Уже в XX веке Церковь Шотландии создала несколько школ в западном Бутане (в том числе институт в Джакаре); после объединения в 1970 году преемником миссии стала Церковь Северной Индии. Сантальская миссия, поддерживаемая норвежскими, шведскими и финскими лютеранами, внесла большой вклад в развитие здравоохранения Бутана, открыв ряд медицинских клиник в восточной части страны. Несмотря на широкое социальное служение, традиционные протестантские миссии не добились успеха в христианизации Бутана.