表面流出
グレートバリアリーフが直面する別の脅威には、公害と水質汚染がある。北東オーストラリアの河川は熱帯性の洪水を起こす。これによってサンゴ礁に汚染が広がるが、この現象の90％は農場における表面流出が要因である。そしてその背景には、、肥料や殺虫剤の過剰使用がある。