United States Department of Agriculture
1948 trat Gates eine Stelle als Professor und Leiter des Instituts für Biologie an seiner alten Universität an, dem Colby College in Maine. Dort blieb er bis 1951, begann aber schon 1950 eine Zusammenarbeit mit dem Landwirtschaftsministerium der Vereinigten Staaten. Von 1951 bis 1952 war er Guggenheim Fellow. Mitte der 1960er Jahre wurde Gates wissenschaftlicher Mitarbeiter der Tall Timbers Research Station bei Tallahassee in Florida, arbeitete aber meist in seinem Haus in Bangor, Maine.