Императорская армия Японии
Мики считал, что философия должна быть прагматичной и направленной на решение конкретных социальных и политических проблем. Он писал статьи для газеты «Ёмиури симбун», комментируя актуальные события. Его твёрдое убеждение, что философия должна быть началом политики, поощряло политическую активность интеллигенции, и когда в 1937 году ему предложили возглавить культурный отдел "Showa Kenkyu Kai," аналитический центр, занимавшийся созданием интеллектуальной основы японского национализма, он охотно согласился. Он сформулировал концепцию «Великой восточноазиатской сферы процветания», но был взбешён, когда Императорская армия Японии использовал её для обоснования агрессивной экспансии в Китае и Юго-Восточной Азии. После распада "Showa Kenkyu Kai", обнаруживший себя в милитаризированном обществе, при активизации боевых действий за рубежом, Киёси Мики оказался подавлен и одинок. Он был снова арестован после того, как помог другу скрыться от властей. Мики умер в тюрьме 26 сентября 1945 в результате заболевания, вызванного плохими условиями содержания. Его смерть, в то время, когда американская оккупация Японии уже началась, глубоко расстроила японскую интеллигенцию. В результате американцы потребовали освободить всех политзаключённых. Полное собрание сочинений Киёси Мики было опубликовано издательством Iwanami Shoten.