Mississippi Territory
La seconde période espagnole fut relativement courte (1783-1819). La Floride devint un foyer d'immigration pour les Américains attirés par les terres offertes et les esclaves noirs en fuite. Peu de civils et de militaires espagnols étaient présents dans la colonie, dont le contrôle était théorique. Quant aux colons anglais, ils n'acceptaient pas la souveraineté espagnole : ils se révoltèrent en 1810 et fondèrent une éphémère République libre et indépendante de Floride occidentale ("Free and Independent Republic of West Florida"). Le , le président des États-Unis James Madison annexa la Floride occidentale, considérée comme faisant partie de l'achat de la Louisiane. Fulwar Skipwith et le gouvernement de la Floride occidentale refusèrent dans un premier temps cette annexion. William C. C. Claiborne fut chargé par Washington de prendre possession du territoire en décembre 1810, qui fut intégré au Territoire d'Orléans. Le district de Mobile ne fut annexé qu'en 1812 au Territoire du Mississippi alors que l'Espagne continuait de revendiquer l'ouest de la Floride. Les Amérindiens séminoles, situés en Floride orientale, commencèrent à attaquer la Géorgie aux États-Unis, ce qui provoqua des incursions de l'armée américaine. La première guerre séminole fut menée par Andrew Jackson en 1817-1818 ; peu après, les Américains contrôlaient effectivement la Floride orientale par le traité d'Adams-Onís signé le et qui prit effet en juillet 1821. Le Territoire de Floride était désormais placé sous la souveraineté américaine ; en échange, les États-Unis renonçaient à prendre le Texas et versaient cinq millions de dollars.