Bibliothèque bodléienne
En 1868, Neubauer est chargé par l'Université d'Oxford de dresser un catalogue des manuscrits hébraïques dans la Bibliothèque bodléienne. Le catalogue parut en 1886, après 18 années de préparation. Le volume comprend plus de 2500 entrées et est accompagné par un portfolio de quarante fac-similés. Pendant qu'il était engagé dans cette tâche, Neubauer publia d'autres travaux d'une importance considérable.