Эми Роуз
В сюжетной линии «Hero» Шэдоу будет помогать военной организации «Guardian Units of Nations» (G.U.N.) и персонажам из предыдущих игр серии: ёж Соник, лисёнок Тейлз, ехидна Наклз, летучая мышь Руж, ежиха Эми Роуз, робот E-123 Омега, хамелеон Эспио, крокодил Вектор и пчела Чарми. Они объединились с целью защиты земли от Эггмана и инопланетян Блэк Армсов. Лидер инопланетян, Блэк Дум следит за действиями Шэдоу с помощью своего «Глаза Дума». В сюжетной линии «Dark» Шэдоу помогает ему и доктору, каждый из которых хочет завладеть всеми Изумрудами Хаоса для своих целей.