A Lyga
La saison 1999 du Championnat de Lituanie de football était la de la première division lituanienne. Les 10 meilleurs clubs du pays sont regroupés en une poule unique où chaque équipe rencontre deux fois ses adversaires, à domicile et à l'extérieur. Cette saison sert de transition afin de permettre au championnat de passer au rythme des championnats nordiques, de mars à novembre.