Arabidopsis thaliana
Scheres befasst sich mit der Entwicklungsbiologie von Pflanzen und dem Vergleich zu der von Tieren, wobei er viele Ähnlichkeiten entdeckte. Dabei benutzte er die Acker-Schmalwand als Versuchspflanze. Unter anderem entdeckte er die Rolle von Stammzellen beim Wachstum und der Formentwicklung der Wurzeln. Dabei schaltete er gezielt einzelne Zellen mit einem Laser aus und blockierte einzelne Gene, um deren Rolle in der Entwicklung zu erkunden.