Совет Европейского союза
Имя Юста Липсия носит в Брюсселе, в котором до 2017 года заседал Совет Европейского союза. Изображение Липсия было помещено на памятную монету 10 евро Бельгии 2006 года, выпущенную к 400-летию кончины учёного.