基礎生産
透明度が低いことは、水中に到達する太陽光が少ないことを意味する。そのため、透明度は、例えば、植物プランクトンや水草（沈水性植物）や海藻などの水中で光合成を行う生物と密接な関係にある。海洋の場合、透明度は海洋生物の基礎生産を担う植物プランクトンと負の相関がある。つまり、基礎生産の高い（水産資源量の多い）海は、植物プランクトンが多いことにより着色した海であり、透明度は低い海である。