Systema Naturae
除了將自然界系統地分為動物界、植物界和礦物界外，《自然系統》還為二名法的創立奠定了基礎，而二名法現被用於學名命名。他1753年出版的《植物種志》和1758年出版的《自然系統》第10版被認為是命名法的發端。作為命名動植物的先驅，他提供的學名後來都優先採用。唯一的例外是1757年卡爾·亞歷山大·克萊克出版的《瑞典蜘蛛》，該書中的命名優先於林奈的命名。他的天才吸引了許多年輕學生慕名而來，林奈將他們送往國外幫助自己收集植物，這使得他的著作比同輩人更加有影響力。