Qinhuai River
548年（太清2年）に侯景の乱が起こると、11月に蕭確は父の蕭綸の下で京口を出立して鍾山に布陣した。蕭確は奮戦して、侯景をひとたび撤退させた。侯景が軍を返して再び決戦を挑んできたが、このとき趙伯超が怠戦したため、鍾山の戦いは蕭綸の敗北に終わり、蕭確は蕭綸とともに京口に撤退した。12月、蕭確は鄱陽世子蕭嗣や羊鴉仁・李遷仕らとともに秦淮河を渡り、侯景側の東府城の前柵を攻撃して、陥落させた。建康を包囲していた侯景が梁の諸侯たちにさらに大きく包囲されて危地に陥ると、侯景は時間稼ぎのために講和を申し出た。梁の武帝は侯景との和解を決めたものの、後難を憂慮して、蕭確を南中郎将・広州刺史に任じ、建康に入城させようとした。蕭確は侯景との和約が偽りのものと見抜き、建康の陥落は間違いないと考え、南方へ逃れようとしていた。蕭綸がこれを聞いて蕭確に入城を迫ったが、蕭確が聞き入れないので、趙伯超を派遣して刃を突きつけて蕭確を脅した。蕭確はやむなく建康に入城した。侯景はやはり和約を守らず、建康の包囲を続け、549年（太清3年）3月に建康を陥落させた。蕭確が武帝に城の陥落を報告すると、武帝に「なお一戦できるか」と訊ねられたので、蕭確は不可能であると答えた。