Lucien Bonaparte
Описан голландским зоологом Конрадом Якобом Темминком в 1824 году под названием "Saxicola melanura". В 1856 году французский орнитолог Шарль Люсьен Бонапарт взял вид как типовой для описания рода скромных чеканов ("Cercomela"). По результатам молекулярно-филогенетических исследований, опубликованным в 2010 году, род "Cercomela" является полифилетическим, а типовой вид — чернохвостый скромный чекан принадлежит роду . Более подробное исследование, опубликованное в 2012 году, подтвердило ранее полученные результаты. Для создания монофилетических родов чернохвостый скромный чекан перемещён в "Oenanthe".