グラスゴー大学
トムソンは、グラスゴーで、グラスゴー大学の化学の教授であった同名の父トマス・トムソンの息子として生まれた。1839年にグラスゴー大学で M.D. の資格を得、1839年12月21日にに外科医助手 (Assistant Surgeon) として配属された。