Swiss Super League
야킨은 1995년 그의 고향인 FC 바젤에서 축구 경력을 시작하였으며, 그라스호퍼 클럽 취리히, FC 장크트갈렌을 거친 뒤 2001년 자신의 친정팀인 FC 바젤로 복귀하여 친형인 무라트 야킨과 함께 뛰어난 활약을 하였다. 특히 2002-03 시즌 UEFA 챔피언스리그에서 리버풀 FC와 FC 스파르타크 모스크바를 제치고 소속팀을 2라운드로 이끌어, 사상 최초로 스위스 슈퍼리그 팀이 UEFA 챔피언스리그 2라운드에 진출하는 데 크게 기여하였다. 그러나 파리 생제르맹 FC, VfB 슈트트가르트, 갈라타사라이 SK 등 해외 축구팀으로 이적한 뒤에는 스위스에서의 활약상을 전혀 보여주지 못한 채 서서히 빛을 잃어 갔다.