以巴冲突
由於以巴冲突和宗教因素，巴基斯坦不予承認以色列的外交地位，而護照上亦註明「此護照在除以色列外的世界各國有效」。因此，持有巴基斯坦護照雖然可申請該國簽證，但需要事先獲得以色列外交部批准，而在該國亦不能享有巴基斯坦的領事服務。