Вашингтонский университет
В 1929 году Эймс был удостоен Столетней медали Сельскохозяйственного общества Массачусетса, в 1935 году получил медаль имени Джорджа Роберта Уайта. В 1938 году Вашингтонский университет присвоил ему почетную степень доктора.