Yersinia pestis
在珍珠港事件後的戰爭的最初幾個月，日本曾計劃用細菌武器對付美軍。在1942年3月的巴丹半島戰役，日軍曾考慮在十個不同的地方釋放大約200斤（約1.5億）的攜帶鼠疫桿菌的跳蚤，但美軍在該戰役投降後日軍便取消此計劃。之後1944年7月的塞班島戰役，日軍曾想過重施此計，但攜帶跳蚤的潛艇被美軍的於父島擊沈。而在硫磺島戰役期間日軍亦有嘗試使用生物武器，飛行員松本彰一後來憶道他在計劃中為和另一飛行員駕駛攜帶病原體的滑翔機在戰鬥中釋放這些病原體，並理應從日本本土飛往哈爾濱平房區的機場作攻擊準備，但計劃從未實行。