Pénitencerie apostolique
Il entreprend également de réformer la Curie romaine. Il modifie la "daterie", chargée de la concession des bénéfices ecclésiastiques, et la Pénitencerie apostolique. En 1569, Il met fin à la controverse sur la primauté de construction des deux basiliques du Latran et du Vatican en accordant celle-ci à l'église du Latran.