진언종
코바야시 요시노리는 자신의 책에서 "어머니는 태평양 전쟁 종전 당시에 12세였다."라고 자신만 아는 가족의 내용을 기재했는데 그의 어머니는 이르면 1932년 8월 15일 이후, 늦어도 1933년 8월 15일 사이에 태어난 것으로 추정된다. 코바야시 요시노리의 어머니는 진언종 사원의 딸이었고 외증조부는 메이지 시대에 청일 전쟁, 러일 전쟁에 참전한 근위병이었다. 이 때문에 이상주의적인 공산주의 사상을 지지했던 아버지와 현실주의적인 불교 사상을 지지했던 어머니 간의 사상 갈등이 있었다고 한다.