Emilio Aguinaldo
ブライアンはキューバの独立を目指す戦争を支持していたが、パリ条約によって米国がフィリピンの支配権を得たことに憤慨していた。多くの共和党員は、米国にはフィリピンを「文明化」する義務があると考えていたが、ブライアンは米国の帝国主義に強く反対した。フィリピン併合に反対していたにもかかわらず、ブライアンは支持者にパリ条約の批准を促した。ブライアンの支持を得て、この条約は僅差の投票で批准され、米西戦争は正式に終結した。1899年初頭、エミリオ・アギナルドの指導の下、フィリピン人が列島に対するアメリカの支配を終わらせようとしたため、米比戦争が勃発した。