Battle of Perryville
南北戦争の開始時点の1861年4月で、マクックは第1オハイオ歩兵連隊の大佐になった。第一次ブルランの戦いに参戦し、1861年の冬はケンタッキー州で1個旅団を指揮し、1862年初期にはテネシー州とミシシッピ州で1個師団を指揮し、同年10月には第1軍団指揮官としてペリービルの戦いに参戦したが、この戦いではその軍団がほとんど崩壊寸前まで行った。同年11月と12月はテネシー州ナッシュビルで指揮を執り、ストーンズリバーの戦いに参戦して、再びその軍団は崩壊した。1863年夏、チカマウガの戦いに繋がる方面作戦で再びその軍団を率い、これで3度目かつ最後となる軍団の崩壊を経験した。その後軍法会議に掛けられたが、有罪とはならなかった。戦争の残り期間、前線で実戦に携わる機会は無かった。