Eurasian jay
L'Épervier d'Europe est un important prédateur des Mésanges charbonnières, les jeunes des secondes couvées étant plus exposés, en partie à cause du besoin accru de nourriture de l'épervier pour ses propres petits en développement. Les nids sont pillés par le Pic épeiche, en particulier lorsqu'ils nichent dans certains types de nichoirs, ainsi que par le Geai des chênes. L'Écureuil gris, introduit dans certaines parties d'Europe, et la Belette d'Europe pillent également les nids et peuvent par ailleurs également attaquer les adultes en train de nicher. Enfin, le Chat domestique est également un prédateur de la Mésange charbonnière.