حصار لينينغراد
خلال حصار لينينغراد من قبل الجيش الألماني (سبتمبر 1941 - يناير 1944) ، المجموعات - يتم حفظها. الموظفين في بنك البذور INPI تهريبه من مدينة العينات الثمينة، ويحمي الآخرين نهب ، الباردة، والفئران التي سرب ويفضل أن يعاني من احتياطيات الأكل المجاعة الحبوب المختلفة في رعايته ،. توفي تسعة من علماء النبات الإثني عشر الذين بقوا في لينينغراد جوعا، في حين توفي أعضاء آخرون في المعهد في القتال ضد المحاصر الألماني ، أثناء حصار المدينة الروسية، يتم تجديد جزء من مخزون البذور المفقود عن طريق حصاد النباتات في الحقول المجاورة المزروعة في الربيع. في يناير 1943 ، توفي فافيلوف في سجن ساراتوف.