Атлетико Букараманга
В начале 2016 года Хоан перешёл в «Индепендьенте Медельин». 31 января в матче против «Атлетико Букараманга» он дебютировал за новую команду. В этом же поединке Аранго забил свой первый гол за «Медельин».