독립협회
서재필은 [[1896년]] 초부터 서울 영천에 있는 [[영은문]]이 [[청나라]] 사신을 영접하기 위해 사용되었던, 치욕스러운 존재라고 하여 [[영은문]]을 헐고 그 자리에 독립문을 세울 것을 건의하였다. 이 일을 위해 [[1896년]] [[7월 2일]] [[이완용]]을 비롯 [[남궁억]]·[[박영효]]·[[김가진]]·[[안경수]] 등과 함께 정부 관료 중심의 [[독립협회]]를 결성하였다. [[독립협회]]의 지도자는 [[윤치호]], [[이상재]], [[박정양]], [[양기탁]], [[이승만]], [[이동녕]] 등이었다. 그 중에서도 서재필은 [[독립협회]] 고문에 선출되어 윤치호와 함께 협회의 제반사무를 총괄하였다. [[윤치호]]는 [[미국]]에서 서재필을 만났을 때 혹시나 조선의 정국이 변한다고 해도 서재필이 아픈 기억을 되살리고 싶지 않아 귀국하지는 않을 것으로 내다봤다. 그런데 뜻밖에도 2년 후 한성 정동에서 재회하게 되자 윤치호는 놀라워했다. 그리고 [[윤치호]]와 서재필은 [[독립협회]]에서 의기투합하여 활동했다.