Copa de Dinamarca
Tras la partida de Kevin Conboy al NEC, Knudsen se estableció como la primera opción en el lateral izquierdo. En la temporada 2012-13, el equipo de Esbjerg terminó cuarto en la Superliga de Dinamarca y ganó la Copa de Dinamarca, y Knudsen extendió su contrato en abril de 2013.