Toei Ōedo Line
大江戶線的清澄白河站是採用2面3線島式月台的地下車站。中央線路是折返用線，兩側為月台。由於本站設有通往大江戶線車輛基地——的線路，故大江戶線有班次以本站為起訖點，並且是乘務員執行換班的地點。