Davao City
두테르테는 1945년 3월 28일 필리핀 남서부 레이테 주 마신에서 태어났다. 그의 가족은 중화인민공화국 푸젠성 샤먼시 출신의 이민자였으며, 1951년에는 민다나오 섬 세부 주의 다바오에 정착했다. 아버지 비센테 두테르테(Vicente G. Duterte)는 변호사였고, 어머니 솔레다드 두테르테(Soledad Duterte)는 교사이자 시민단체 대표였다. 아버지는 변호사 활동 이후 정치인으로 나서 다바오 시장으로 당선되었다. 이후 다바오 시가 다아보 주에서 분리되기 전 다바오 주지사를 지냈다. 1965년에는 페르디난드 마르코스의 행정비서관으로 중앙 정계에 진출했으며, 마르코스 대통령은 1972년 계엄령 선포로 독재정치를 휘두르게 된다. 사촌인 두테르테 로날드는 1983년부터 1986년까지 세부 주 세부 시의 시장을 지냈다.