ホーリー・ロッホ
オーバーホールは1968年6月28日に完了し、アレクサンダー・ハミルトンはオーバーホール後の公試、検査および整調訓練を10月に行う。11月に再びロタに向かい、12月30日到着すると哨戒を再開した。続く4年にわたって第16潜水戦隊に所属し哨戒を続け、第31回目の哨戒が完了するとアレクサンダー・ハミルトンは1972年11月にチャールストンに帰還、1973年1月に2度目のオーバーホールに入る。このオーバーホールはニューポート・ニューズ造船所で行われ、ポセイドンミサイル運用のための改修も施された。作業は2年におよび、1975年4月に完了、同年の残りは整調、訓練および整調後の公試に費やされた。1976年初旬に任務に復帰、32回目と33回目の哨戒を行う。その後ホーリー・ロッホを拠点として哨戒は続けられ、36回目の哨戒でフロリダ州ケープカナベラル、コネチカット州ニューロンドンに向かい、サウスカロライナ州チャールストンで活動を完了した。1977年3月から4月にかけて修理および回復訓練を行い、7月にチャールストンを出航、9月にホーリー・ロッホに到着した。