Continental Congress
汉考克任职期间，经历了独立战争中最黑暗的时刻。1776年，英国人把华盛顿从纽约和新泽西赶走，迫使大陆会议逃往巴尔的摩。1777年3月，汉考克和大陆会议回到费城，但6个月后，英国，汉考克和大陆会议被迫再度逃亡。汉考克给殖民地的官员写了无数封信，为华盛顿的军队筹集资金、补给和兵员。他担任海军委员会（Marine Committee）主席，帮助建立了一支小型护卫舰舰队，其中包括以他的名字命名的。