Бейра-Мар
Карьеру завершил в 1996 году, в возрасте 39 лет, в роли играющего тренера «Санжуаненсе». С 1997 по 2004 года тренировал «Бейра-Мар», с которым в сезоне 1998/99 выиграл Кубок Португалии, одолев Кампомайоренше в финале со счётом 1-0. Также Соуза тренировал «Риу Аве» (2005/06), «Пенафиел» (2007/08), «Бейра-Мар» (2008/09) и «Трофенсе» (2011).