PFC Cherno More Varna
В начале 2012 года Фернандес на правах аренды перешёл в болгарский «Черно море». В матче против «Левски» он дебютировал в чемпионате Болгарии. В поединке против «Минёра» Марлон забил свой первый гол за «Черно море».