대한제국
일본육사를 졸업한 이듬해에 러일 전쟁이 발발했다. 근위 보병대에서 견습사관으로 복무하던 김기원도 대한제국 육군 보병 참위로 러일 전쟁에 참전했다. 이후 대한제국 육군무관학교 교관에 임명된 것을 시작으로 대한제국 무관으로 복무했다. 1907년 대한제국 군대 해산 때까지 육군 공병 참령과 시위공병대장 등을 역임했다.