시트르산
시트르산 회로는 트라이카복실산 회로(tricarboxylic acid cycle, TCA 회로) 또는 크렙스 회로(Krebs cycle)라고도 한다. 산소가 있으면, 해당과정으로부터 생성된 피루브산으로부터 아세틸-CoA가 생성된다. 아세틸-CoA가 생성되면, 산소 호흡이 일어날 수 있다. 산소가 있으면, 미토콘드리아는 시트르산 회로를 거쳐 산소 호흡을 진행시킨다. 그러나 산소가 없으면, 발효가 일어난다. 산소가 있으면, 생성된 아세틸-CoA는 미토콘드리아 기질에 있는 시트르산 회로로 들어가서 CO2로 산화되고, 이 과정에서 방출되는 에너지로 NAD+를 NADH로 환원시킨다. NADH는 산화적 인산화에 의한 ATP 합성에 사용되기 위해 전자전달계에서 사용될 수 있다. 포도당 1분자를 완전히 산화시키기 위해서는 2분자의 아세틸-CoA가 시트르산 회로에 의해 대사되어야 한다. 시트르산 회로에서 H2O와 CO2가 부산물로 생성된다.