母乳
母乳是乳酸菌的自然來源，初生嬰兒透過母乳餵養可以獲取乳酸菌，母乳也可視為是共生食物。健康母親的母乳中，正常細菌含量約為每毫升103菌落形成單位（CFU）。母乳中的菌種非常複雜。在所有母乳樣本中可檢測的超過100種可操作的中，只有9種菌類是所有樣本共有的（鏈球菌，葡萄球菌，，假單胞菌，，，丙酸桿菌，和慢生根瘤菌科），但個別母體裏的母乳細菌群落多半都是穩定的。母乳是嬰兒腸道中葡萄球菌、鏈球菌、乳酸菌、、丙酸桿菌、棒狀桿菌和其他相關革蘭氏陽性菌的來源。