Serbian Orthodox Church
في عام 2018 شكل أتباع الكنيسة الأرثوذكسية الشرقية 3.7% من السكان. معظمهم منتمين إلى الكنيسة الصربية الأرثوذكسية في حين ينتمي أقلية إلى الكنيسة المقدونية الأرثوذكسية وغيرها من الكنائس الأرثوذكسية. ويخضع المسيحيون الأرثوذكس الشرقيون في سلوفينيا للولاية الكنسيَّة للمتروبوليتية الأرثوذكسية الصربية في زغرب وليوبليانا.