Estudiantes Tecos
Алаторре — воспитанник клуба «Эстудиантес Текос» из своего родного города. 7 сентября 2005 года в матче против «Веракрус» он дебютировал в мексиканской Примере. 28 января 2010 года в поединке против перуанского «Хуан Аурич» Марсело дебютировал в Кубке Либертадорес.