Alternative splicing
SRタンパク質はpre-mRNA転写産物の選択的スプライシングによって、ナンセンス変異依存mRNA分解機構（NMD）の標的となるコドンをmRNAへ組み込むことができる。細胞内でのNMDの最も一般的な標的は選択的スプライシングを受けたｍRNAである。pre-mRNAに重複した5'スプライス部位が存在し、SRタンパク質が過剰発現している場合に、NMDはアップレギュレーションされる。スプライシングの際にNMDコドンを含むスプライスバリアントが選択されやすくなり、さらに下流の翻訳過程はNMDに対して感受性が高くなる。選択的スプライシングを受けたmRNAの30%近くがNMDによって分解されていると推定されている。SRタンパク質の細胞内濃度は、SRタンパク質のpre-mRNA中のNMDコドンによって自己調節されている。例えば、SRタンパク質SC35は選択的スプライシングによってNMDコドンがmRNAに組み込まれる。pre-mRNA鎖のどの部位にSRタンパク質が結合するか、そしてどのSRタンパク質が結合するかによって細胞内でのNMD活性が決定される。