Steller's sea eagle
Bedingt durch das überwiegend kühle Klima hat der Zoo sich in den letzten Jahren auf Säugetiere und Vögel konzentriert, dennoch finden sich im "Discovery Centre" (Entdeckerzentrum) noch einige Reptilien und Amphibien. Der Zoo zeigt die einzigen Koalas und seit 2011 die einzigen Großen Pandas Britanniens. Er ist außerdem bekannt für seine umfangreiche Sammlung an Pinguinen, so zum Beispiel die Königspinguine, die zweitgrößte Pinguinart der Welt, die Eselspinguine und die Felsenpinguine. Die ersten Pinguine kamen durch eine Walfangexpedition im Januar 1914 nach Edinburgh. Einer der Pinguine im Zoo, Sir Nils Olav II, ist das Maskottchen der Garde des Norwegischen Königs im symbolischen Rang eines Brigadegenerals. Weitere Arten sind der Helmkasuar, der Riesenseeadler, der Schwarzstorch und die Fächertaube.