Натрон
Крупнейшая гнездовая колония малого фламинго находится на озере Натрон в Танзании, с ней связано более 75 % общей численности вида. На некоторых водных потоках, питающих озеро, было запланировано строительство электростанции и дамбы, которая могла существенно изменить уровень воды в озере. Кроме того, на озере планируется добыча соды, что является серьёзной угрозой для выживания всего вида; возможно, содовый завод будет перенесён в район в 50 км от озера, что окажет заметно меньшее влияние на колонию малого фламинго. Планируется строительство автомагистрали через национальный парк Серенгети, что также окажет влияние на птиц на озере Натрон, так как не позволит птенцам беспрепятственно передвигаться по территории. В 1980—2010 годы численность малого фламинго в Танзании снизилась на 20—40 %. Танзания является единственной страной, в которой существует квота на отлов малого фламинго. В 1997—2003 годы было поймано 612 птиц.