チャールズ川
ウォータータウン市は (42.37139, -71.18194)に位置している。市の北にはベルモント通り沿いにベルモント町、南はチャールズ川を境としてニュートン市とブライトン町と接している。町の中核であるウォータータウンスクエアでは、町の境界線が南のチャールズ川を超え、ケイシー遊技場を囲む地区にまで広がっている。東にはケンブリッジ市があり、その市境は良く知られるマウントオーバーン墓地であり、その大半は通常信じられているのとは異なり、ウォータータウン市内にある。西にはウォルサム市が広がるが、2つの市をわける地形的な特徴あるものは無い。