Индианский университет в Блумингтоне
Он продолжал работать над диссертацией по лингвистике в Йельском университете с Эдвардом Сепиром, а затем преподавал в университете ДеПау, прежде чем в 1941 году поступил на работу в Индианский университет в Блумингтоне в качестве первого профессора антропологии этого университета. Во время своего пребывания в Индиане он руководил крупнейшей в США программой специализированной подготовки армии США по иностранным языкам. В 1944 году он убедил руководство Университет Индианы разместить у себя редакцию "International Journal of American Linguistics" ( "IJAL" ), который перестал публиковаться в 1939 году, незадолго до смерти своего первого редактора Франца Боаса. Вёглин много лет был редактором "IJAL".