綾波零
在电视动画的最终话中，有一段描写另一种可能性的世界，在这个世界中，真嗣是一个普通的中学生，有一个父母健在的幸福家庭；青梅竹馬的明日香会叫他一起上学，在去学校的路上还撞倒了转学生綾波零，而葛城美里是他的老师。相同的世界設定也有使用在《新世紀福音戰士：鋼鐵戀人2nd》。真嗣也有出现在各种衍生作品中，有的会出现很大的不同，如《新世紀福音戰士：碇真嗣育成計畫》中，明日香是他的青梅竹馬而身為遠親的綾波零要住在他們家。在《福音小戰士》中，角色都變成可愛的Q版人物，描寫在「NERV學園」里溫馨、逗趣的學園生活。《新世紀福音戰士 碇真嗣偵探日記》中，碇真嗣應「加持偵探事務所」所長加持先生的要求，和他的助手渚薰一起解決事件。《新世紀福音戰士：學園墮天錄》中，原本過著平凡生活的碇真嗣，由於撿到了「核」而獲得了「EVA」，使得真嗣的日常生活起了極大的改變，之后和同班同學綾波零、明日香以及轉學生渚薰一同與出現在他們面前的「使徒」戰鬥。