속도 제한
말로닐-CoA는 지방산 생합성에서 고도로 조절되는 분자이다. 말로닐-CoA는 그 자체로 지방산의 β 산화에서 속도 제한 단계에서 이를 조절하는 저해제역할을 한다. 말로닐-CoA는 카르니틴 팔미토일 트랜스퍼레이스 1를 조절하여 지방산이 카르니틴과 결합하는 것을 억제함으로써 지방산의 산화 및 분해가 일어나는 미토콘드리아로 지방산이 들어가지 못하게 한다.