Cubs de l'Iowa
Geovany Soto est sélectionné par les Cubs de Chicago au du repêchage du baseball en 2001 ( global). Après quatre saisons en ligues mineures, il fait ses débuts en Ligue majeure le face aux Astros de Houston pour son seul match de la saison. En 2006, il joue avec les Cubs de l'Iowa de la Ligue de la côte du Pacifique, puis est de nouveau appelé en fin de saison pour 11 matchs en Ligue majeure en septembre.