San Luis de Quillota
Пинарес — воспитанник клуба «Коло-Коло» из своего родного города. В 2009 году он дебютировал в чилийской Примере. В январе 2010 года Сесар подписал контракт с итальянским «Кьево». Из-за высокой конкуренции Пинарес не смог дебютировать за основной состав и в 2011 года на правах аренды перешёл в клуб «Триестина». В 2011 году Сесар на правах аренды вернулся на родину в «Сан-Луис Кильота». 28 июля в матче против «Магальянес» он дебютировал в чилийской Примере B. 26 октября в поединке против «Ньюбленсе» Пинарес забил свой первый гол за «Сан-Луис Кильота».