荷兰东印度公司
马六甲在荷兰人的统治下，港口地位不曾有所恢复，主要是荷兰人抽取比葡萄牙更为沉重的关税，而且变动不定，甚至所徵收的税会因国别而有所不同。同时，荷兰人在马六甲海峡巡逻，实行贸易垄断政策，规定錫米、胡椒和松香等货物不课税，但必须廉价卖给荷兰东印度公司，这些政策都足以令商人卻步。因此，进入马六甲的商品极少，主要是荷兰东印度公司需要的货物和糧食，停泊的商船也只为了食水補给，並不在此起卸货物。结果导致马六甲财政经常入不敷出，必须依赖巴達維亞的津贴；荷兰东印度公司也不会为无法获利的地方消耗大量金钱，港口面对泥沙淤积，也沒有进行疏浚，导致大船无法驶入，沦为只能停泊小船的小码头。