Club Necaxa
خاض أليكس أغيناغا مسيرته مع نادي سوسيداد ديبورتيفو كيتو في موسم 1984 ليلعب معه ستة مواسم، مشاركًا في 147 مباراة سجل خلالها 38 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي نيكاكسا في موسم 1989–90 ليلعب معه أربعة عشر موسمًا، حيث شارك في 423 مباراة سجل خلالها 73 هدفًا. لينتقل بعدها إلى نادي كروز آزول في موسم 2003–04 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 13 مباراة ولم يسجل أي هدف. ثم انتقل إلى نادي إل. دي. يو. كيتو في عامي 2004-2006 ولمدة موسمين، مشاركًا في 71 مباراة سجل خلالها 9 أهداف.