Confederate States of America
بين عامي 1859 و1891، عمل بيرس في فترات متقطعة في مجالات علمية مختلفة، وذلك من خلال عمله في وكالة المسح الساحلي للولايات المتحدة الأمريكية، وخليفتها وكالة المسح الساحلي والأرضي للولايات المتحدة الأمريكية، إذ تمتع بحماية أبيه شديد النفوذ حتى وفاة الأخير عام 1880. أعفى هذا العمل بيرس من المشاركة في الحرب الأهلية الأمريكية؛ إذ كان من غير الملائم أن يفعل ذلك. تعاطف بيرس مع الولايات الكونفدرالية الأمريكية كما فعلت نخبة مدينة بوسطن.