Хорошо темперированный клавир
Маргулис занимался исследованием философско-символических смыслов музыки Баха и Бетховена. Его труд «„Хорошо темперированный клавир“ Баха и визуальная церковная символика» получил широкий резонанс в профессиональной среде. Книга «Об интерпретации фортепианных произведений Бетховена» была издана в 1991 г. в Москве. В 2003 г. опубликовал сборник афоризмов «Багатели» (), представляя который, Марта Аргерих писала: