Indiana State University
終戦後の1946年、ウッデンはインディアナ州立大学に着任し、バスケットボール及び野球の指導を行い、体育局長も務めた。また、教育学の修士号も修得している。ウッデン率いるバスケットボール部は1947年に州タイトルを制し、全米大学バスケットボール協会 (NAIA) 主催の全米トーナメントに招待されたが、黒人選手の出場を禁止するというNAIAの規定に抗議し、参加を辞退した（当時チームには黒人選手が1人在籍していた）。同年、ウッデンは母校パデュー大学からヘッドコーチ就任のオファーを受けたが断っている。翌1948年、チームは2年連続で州タイトルを制した。NAIAはこの年に黒人選手を禁じる規定を取り消したため、ウッデンは全米トーナメントへの参加を受諾した。インディアナ州立大学は決勝まで進出したがルイビル大学に敗れた。なお、これはウッデンが指導したチームがチャンピオンシップゲームで敗退した唯一の大会となった。