太平洋標準時
2000年1月31日、アラスカ航空261便はマクドネル・ダグラスMD-83（機体記号：N963AS、1992年製造）で運航されていた。フライトプランではメキシコのプエルト・ヴァリャルタ国際空港を出発しサンフランシスコ国際空港経由でシアトルに向かう予定であった。13時37分（PST、アメリカ太平洋標準時）に出発した。