غاليون
انتقل ليغازبي إلى باناي عام 1569 وأسس مستوطنة ثانية على ضفة نهر باناي. وفي عام 1570، أرسل ليغازبي حفيده، خوان دي سالسيدو، الذي وصل من المكسيك عام 1567، إلى ميندورو لمعاقبة قراصنة مورو المسلمين الذين كانوا ينهبون قرى باناي. دمر سالسيدو أيضًا الحصون في جزيرتي إيلين ولوبانغ، في جنوب وجنوب غرب ميندورو على التوالي. في عام 1570، غزا مارتن دي غويتي، الذي أرسله ليغازبي إلى لوزون مملكة ماينيلا (مانيلا الآن)، وهي دولة عميلة لسلطنة بروناي. ثم جعل ليغاسبي ماينيلا عاصمة الفلبين وبسط تهجيتها لمانيلا. سمت حملته أيضًا لوزون باسم نويفا كاستيلا. أصبح ليغازبي أول حاكم عام للبلاد. وسعت اليابان تجارتها في شمال لوزون عام 1573. في عام 1580، أسس الزعيم الياباني تاي فوسا ولاية ووكو تاي فوسا المستقلة في كاجايان غير المستعمرة. عندما وصل الأسبان إلى المنطقة، أخضعوا المملكة الجديدة، ما أدى إلى معارك كاجايان 1582. بمرور الوقت، انخفضت أهمية سيبو مع انتقال السلطة شمالًا إلى لوزون. كان الأرخبيل مركزًا إسبانيًا في الشرق وأصبحت مانيلا عاصمة جزر الهند الشرقية الإسبانية بأكملها. أُدارت الوصاية على إسبانيا الجديدة (المكسيك الآن) المستعمرة حتى عام 1821 عندما استقلت المكسيك عن إسبانيا. أصبحت المستعمرة محكومة مباشرةً من إسبانيا بعد عام 1821. اعتمد الاقتصاد الفلبيني خلال معظم الفترة الاستعمارية على تجارة غاليون التي افتُتحت عام 1565 بين مانيلا وأكابولكو والمكسيك. كانت التجارة بين إسبانيا والفلبين عبر المحيط الهادئ إلى المكسيك (مانيلا إلى أكابولكو)، ثم عبر البحر الكاريبي والمحيط الأطلسي إلى إسبانيا (فيراكروز إلى كاديز).