European eel
魚類環境上、マイン川は、ブリーム地域あるいはバーベル地域に属す。観察できる魚類は、ヨーロッパウナギ()、バーベル()、ブリーム()、チャブ("Leuciscus cephalus")、パーチ("Perca fluviatilis")、シルバーブリーム("Blicca bjoerkna")、デイス("Leuciscus leuciscus")、ノーザンパイク()、コイ()、ネイズ("Chondrostoma nasus")、アスピウス・アスピウス("Aspius aspius")、ローチ()、ラッド()、テンチ()、ブリーク("Alburnus alburnus")、ヨーロッパオオナマズ()、パイクパーチ()である。一方、まだ戻ってきていない魚もあり、タイセイヨウサケとチョウザメがその代表的存在である。2020年までにライン水系にサケが棲息で来る生活環境を回復することを目標としたLachs 2020（Lachs=サケ）というプロジェクトが創設された。その活動は、河原の草地や川筋を改良し、適切な産卵場所を設けようというものである。マイン川水系でのこうした場所には、以前サケが棲息していた川、たとえばローダッハ川やキンツィヒ川が候補になっている。