X染色體
因決定橘毛色與非橘毛色的基因位於X染色體上（導致白毛色的基因在常染色體上），且雌貓於胚胎發育期間會經歷X染色體去活化的過程，某些細胞會表現出父系X染色體的特徵，某些表現出母系X染色體的特徵，所以若雌貓的兩條X染色體各擁有橘與非橘的基因，某些區塊的毛色會因帶有非橘基因的X染色體失去活性而表現為橘色，反之為非橘色。由於正常情況下僅有雌貓擁有兩條X染色體，因此絕大部分三色貓都為雌性。