삼국 동맹
1838년에는 파라과이가 미시오네스주에 사는 인디헤나의 과라니족은 파라과이의 주요한 구성 민족인 것을 이유로 미시오네스를 지배했다. 1865년에 삼국 동맹 전쟁이 발발하면서, 파라과이군은 다시 미시오네스를 침공했다. 1876년에 아르헨티나와의 평화 협정이 체결되면서, 파라과이는 미시오네스에 대한 영유권 주장을 철회했다.