テキサス併合
1841年、モアヘッドはアメリカ合衆国上院議員に指名され、同年3月4日から1847年3月3日まで務めた。この期間にインディアン問題上院委員会や経費節減上院委員会の議長を務めた。また連邦銀行法を弁護し、テキサス併合に反対したが、米墨戦争が始まった後はそれを支持した。同じケンタッキー州選出のヘンリー・クレイに対してはしっかりとした支持者でもあった。