The Mysterious Island
Seit 2000 trugen die "X-Men"-Verfilmungen zu Stewarts internationaler Bekanntheit bei, in denen er die Hauptrolle des Professors Charles Francis Xavier spielte. In der Verfilmung des Jules-Verne-Romans "Die geheimnisvolle Insel" spielte Stewart 2005 erneut einen Captain. Seit 2005 spricht er die optisch an ihn angelehnte Figur des Avery Bullock in der Serie "American Dad". Seit dieser Zeit übernahm er auch weitere Sprechrollen, etwa in Zeichentrickserien oder Computerspielen.