鼠疫桿菌
对于黑死病是鼠疫之说，在歷史紀錄對於黑死病的特徵紀錄中，有一些關於“淋巴腺腫”的描述，與19世紀起源於清朝云南地区的淋巴腺鼠疫相似（第三次鼠疫大流行），這使得科學家與歷史學家相信自14世紀開始的黑死病，與鼠疫相同，皆是由一種稱為鼠疫桿菌的細菌所造成。這些細菌是寄生於跳蚤身上，並藉由黑鼠（"Rattus rattus"）等動物來傳播。也有研究认为病源可能來自亞洲的小沙鼠。第二次鼠疫大流行時，9座城市中有7座透過人類身上衣物的跳蚤與頭蝨傳播。不過由於其他疾病也有可能產生淋巴腺腫，因此也有人提出其他不同的觀點。