Wisconsin Territory
ウォキショー郡となった地域は、1834年9月にミルウォーキー郡が組織化された時点ではミシガン州に属していた。1836年7月4日、ウィスコンシン準州が形成されたが、このときは現在のミネソタ州の領域も含んでいた。1846年1月、ミルウォーキー郡の一部が分離してウォキショー郡が作られた。カーティス・リードが初代郡議長になった。郡庁所在地を決める住民投票が行われ、2票差でウォキショーがペウォーキーを抑えた。