ЛДУ Кито
Интриаго — воспитанник клуба ЛДУ Кито. 25 января 2014 года в матче против «Манты» он дебютировал в эквадорской Примере. 30 августа 2015 года в поединке против «Машук Руна» Джефферсон забил свой первый гол за ЛДУ Кито. В том же году он помог клубу завоевать серебряные медали.