器官捐贈
2008年，柯文哲與李志元於澄清醫護管理雜誌，聯名發表〈無心跳者器官捐贈的法律倫理問題〉，其中提到在1998年至2006年間，台大醫院共有26名器官捐贈者，在已宣告心跳停止的狀況下，進行葉克膜輔助的器官移植手術，共摘取52個腎臟和1個肝臟來進行移植，所施行的器官移植手術成果良好。但因可能衍生毀壞屍體等法律爭議，台大醫院決定暫停執行無心跳者器官捐贈，等待國內完成相關立法後，再重新開始。