ウェストバージニア大学
チャールストンはウェストバージニア大学の医学部・歯学部の附属病院を抱えている。学生は本部キャンパスのあるモーガンタウンで授業を受けるが、実習はモーガンタウンかチャールストンのいずれかで行うことになる。また、市内には小規模な私立大学であるチャールストン大学もキャンパスを構える。また近郊にはウェストバージニア州立大学、マーシャル大学の大学院もある。