Lyngby Boldklub
خاض توبياس ميكلسن مسيرته مع نادي لينغبي في موسم 2004–05 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، مشاركًا في 57 مباراة سجل خلالها 11 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي بروندبي في موسم 2007–08 ولمدة موسمين، حيث شارك في 24 مباراة سجل خلالها هدفين. لينتقل بعدها إلى نادي نوردشيلاند في موسم 2009–10 في المرة الأولى ليلعب معه أربعة مواسم ثم في موسم 2015–16 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، مشاركًا طوالها في 117 مباراة سجل خلالها 18 هدفًا. ثم انتقل إلى نادي غرويتر فورت في موسم 2012–13 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 6 مباريات ولم يسجل أي هدف. هذا وانتقل لاحقًا إلى نادي روسنبورغ في موسم 2013 واستمر معه طيلة ثلاثة مواسم، مشاركًا في 80 مباراة سجل خلالها 14 هدفًا. ثم انتقل بعدها إلى نادي بريزبان رور في موسم 2018–19 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 18 مباراة سجل خلالها 3 أهداف. ليعود وينتقل من جديد، لكن هذه المرة إلى نادي هلسينغبورغ ما بين عامي 2019 و2020 لمدة موسم واحد، مشاركًا في 8 مباريات سجل خلالها هدفين.