Strait of Hormuz
2005年10月，企業號完成維修，再在近海試航訓練。到2006年5月2日，企業號再次前往阿拉伯海，並先後到訪斯普利特及蘇達灣。其時正值伊朗核問題惡化，伊朗總統艾哈邁迪內賈德剛在4月11日宣佈伊朗成功提煉濃縮鈾，企業號的部署便引來媒體猜測。企業號在6月29日通過霍爾木茲海峽，開始支援伊拉克戰事。7月5日北韓試射多枚大浦洞二型飛彈，而企業號卻在6日離開阿拉伯海，前往闊別多時的西太平洋，並先後於7月18日及27日到訪釜山及香港。8月企業號到訪新加坡及吉隆坡，然後重返北阿拉伯海執勤。11月1日企業號返航美國，在7日到里斯本休假，最後於18日返抵諾福克。