ボゴール植物園
1968年にオランダ領東インドに渡り、ボゴール植物園（当時の名称はLands Plantentuin te Buitenzorg）の園長となった。1876年にボイテンゾルグから少し離れた、Tjikeumeuhに農業試験農園を設立し、大規模な有用植物の栽培実験を行い、同年、植物園の紀要、"Annales du Jardin Botanique de Buitenzorg"を発行した。1876年に 農業学校（landbouwschool te Buitenzorg）を設立し、この学校はボゴール植物園の次の園長、メルヒオール・トロープによって、Landbouw Hogechool（農業専門学校）となり現在のボゴール農科大学となった。スヘッフェルは植物園の学芸員、ヨハネス・エリアス・テイスマンが作り始めたチボダス高山植物園を完成させた。在職中の1880年に現地で没した。