プエブロの反乱
しかし後年に、多くのほかのプエブロの集団のように、ピロ・プエブロは植民地支配の重圧からますます苦痛を受けた。地域での反乱は1660年代と1670年代にいくつか起こったが、スペイン人はいつも優勢を保持した。1680年のプエブロの反乱の時には、ピロ・プエブロのコミュニティは、彼らを除いて行われた有名な反乱を辞退していた。数百人のピロ・プエブロは、南のエル・パソ・デル・ノルテ(現在のメキシコチワワ州のシウダ・フアレス)に逃げるスペイン人たちに（再び自発的にか否かに関わらず）同伴した。その他は四方に散ってほかのプエブロ集団に加わった。ピロ・プエブロ集落のいずれも、もともとの住民によって再び定住されることはなかった。