Valentinian II
В 392 году западный император Валентиниан II умер при подозрительных обстоятельствах; считалось, что он был убит военным магистром Арбогастом. Новым императором при поддержке Арбогаста был провозглашён ритор Евгений. Вероятно, Феодосий назначил другого префекта, Аподемия, на место Флавиана сразу после известия о смерти Валентиниана. Однако Евгений, ко двору которого прибыл Флавиан, утвердил его в должности. В свою очередь Флавиан всеми силами поддерживал Евгения, и будучи авторитетом в авгуральной дисциплине, заявлял, что жертвы указывали на победу в предстоящей войне. Отправляясь на войну с Феодосием, Флавиан и Арбогаст грозились после своего возвращения завербовать христианское духовенство в армию и превратить главную церковь Медиолана в конюшню. Однако их войска потерпели поражение в решающей битве при Фригиде против армии Феодосия (5 сентября 394 года); отряд, в котором находился Флавиан попал в засаду и сдался, а сам он покончил жизнь самоубийством.