ダニエル・パサレラ
現役引退後にアルゼンチンに戻ると、CAチャカリタ・ジュニアーズやAAアルヘンティノス・ジュニアーズの下部組織の監督を務め、さらにチリのCSDコロコロでも同じポジションに就いた。1994年、アルゼンチンサッカー協会 (AFA) からU-17とU-20世代のアルゼンチン代表監督就任オファーを受けた。この年代の主要大会で主要な功績を挙げていたわけではないため、ペケルマンへのオファーはちょっとした驚きであったが、ウーゴ・トカーリやエドゥアルド・ウルタスンとチームを組んで世代別代表監督に就任した。ペケルマンの在任期間中に、U-20アルゼンチン代表はFIFAワールドユース選手権で3度優勝。カタールで行われた1995年大会、マレーシアで行われた1997年大会、自国開催となった2001年大会で優勝したことから、ペケルマンの愛犬3匹にはそれぞれの国名が付けられた。南米ユース選手権では1997年大会と1999年大会で優勝した。1998 FIFAワールドカップ後にアルゼンチンA代表のダニエル・パサレラ監督が辞任すると、ペケルマンは後任監督のオファーを受けたが、時期尚早であるとして辞退し、代わりに代表全カテゴリーのゼネラル・マネージャー (GM) のポジションに就いた。ペケルマンの推薦によりマルセロ・ビエルサがA代表の監督に就任し、ビエルサ監督は2004年のアテネオリンピックで金メダルを獲得した。