독립협회
그는 [[윤치호]]에게 [[독립신문]]을, [[이상재]], [[양기탁]], [[이승만]], [[이동녕]] 등에게는 [[독립협회]]와 [[만민공동회]]를 맡아줄 것을 간곡히 부탁하였다. 이에 [[윤치호]]는 서재필이 출국하면 [[독립협회]]나 [[만민공동회]], [[독립신문]] 등을 3년도 유지시키기 어렵다고 했는데, 그는 최소한 1년 이상은 유지시킨다면 변화가 있을 것이라며 유지가 어렵더라도 1년 이상만 협회 등을 지켜줄 것을 부탁했다.