Королевская аудиенсия
Другим важнейшим государственным органом вице-королевства являлась Королевская аудиенсия Лимы (), изначально имевшая статус апелляционного суда, однако в системе управления колоний ставшая в большей степени законодательным органом с элементами представительства населения. () многократно становились временными губернаторами вице-королевства () в периоды отсутствия вице-короля. Высшей инстанцией как над аудиенсиями, так и над вице-королевствами, оставался Королевский и верховный совет Индий ().