イリ川
グルバンテュンギュト砂漠は、天山山脈によって、イリ川流域、トルファン盆地、新疆南部のタリム盆地から隔てられている。砂漠の南にある人口の多い地域は蘭新線に沿っていて（最大都市はウルムチ）、天山山脈の氷河からの川から水を供給されている。21世紀の最初の10年間に建設されたイルティシュ・カラマイ運河は砂漠の北西端を囲んでいて、 イルティシュ・ウルムチ運河は砂漠の中心部を南へ横切っている。