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林子善於2011年5月20日與女友董佩欣（Kary）開始拍拖，2017年10月16日註冊結婚，2018年4月3日則於將軍澳皇冠假日酒店補辦喜宴。2019年12月29日凌晨，其妻於沒有麻醉下順利分娩，為他誕下一名女兒，乳名小乖乖。