Livonie suédoise
Alexeï Mikhaïlovitch Ridiger est né à Tallinn, en Estonie. Son père, Mikhaïl von Ridiger (1902-1962), né à Saint-Pétersbourg était un descendant d'une famille de la noblesse germano-balte de Courlande dont un ancêtre le capitaine Heinrich Nicolaus (Nils) Rüdiger, commandant de la forteresse de Dünamünde (rebaptisée aujourd'hui Daugavgrīva) en Livonie suédoise avait été anobli par Charles XI de Suède en 1695. Après que l'Estonie suédoise et la Livonie suédoise furent incorporées à l'empire russe au lendemain de la Grande Guerre du Nord au début du , un autre ancêtre d'Alexis II, le baron Friedrich Wilhelm von Rüdiger (1780-1840) se convertit à la religion orthodoxe sous le règne de Catherine II de Russie. De son mariage avec Daria Fiodorovona Yerjemskaïa naquit le futur arrière-grand-père du patriarche, Yegor (Georges) von Rüdiger (1811-1848).