龐巴迪公司
2005年9月7日關於中正機場捷運機電系統標總經費約260億元的投標案在上午10時截止投標前，卻傳出國際大廠之一的加拿大龐巴迪公司對外宣稱將退出競逐行列，並質疑根據高鐵局招標文件內容，未來機場線將有重大安全疑慮；高鐵局則強調一切依程序進行，要求龐巴迪公司有意願就公平競爭，沒意願就別在程序外耍小動作。不過路線「飛天遁地」的結果，導致了未來的通車的嚴重滯後。此外計畫還有變數，依交通部高速鐵路工程局原有規劃三重站－臺北車站段為高架路線，但臺北市政府認為高架路線影響都市景觀、土地利用、安全等問題，主張應以地下方式興建。經雙方協調後，臺北市政府表示願意負擔改採用地下化所增加的工程經費，交通部也同意「三重站－臺北車站」段改以地下方式興建，並委託臺北市政府捷運工程局負責該段的設計、施工與臺北市轄段土地開發，土建部份完工後，再交由交通部高鐵局續建。由於該段路線因此延後完工，因此「三重站－桃園國際機場－環北站」段預定將先行通車，而此段因為機場線通車延後，最終結果是一併通車。本段「三重站－臺北車站」段於2006年9月25日正式開工、土建工程則於2007年5月2日舉行動土典禮。藍線桃園國際機場－中壢車站段，已經整併為機場線的一部分，只行駛普通車的路段。