麻赫穆德·喀什噶里
有关喀喇汗国史的文献资料比较零碎，与其同时代的文献，如成书于11世纪的《喀什噶尔史》原书已散佚，仅在加玛勒·哈尔希（Jamal Qarshī）的《苏拉赫词典补编》中引用的其中的一部分得以保存至今。佚名作者的《博格拉汗传》（Tazkirat al-Bughrakhan）专门记载了第一位皈依伊斯兰教的萨图克·博格拉汗的史事，但后者带有明显的宗教咏史诗的色彩，或具有追述往事的传说的性质。近年，利用钱币铭文研究汗朝政治史，对汗朝世系和诸汗在位年代多有补正。但是，诸汗名字、称号时时添减变换，因而难于排列出明晰的、确切的世系，喀喇汗国汗室的起源问题也未解决。当前，学界有起源于样磨、葛逻禄（其中的炽俟部落）、葛逻禄－样磨等说。诸说各有一定道理，亦可以互相补充。近年来，葛逻禄说较占上峰，因为喀喇汗国初期版图原来主要是三姓葛逻禄的活动区域，而且喀喇汗国主力军是由三姓葛逻禄之一的炽俟构成的。但是，在9世纪上半期喀喇汗国建立前夕，九姓回鹘近支样磨部已迁入葛逻禄驻牧的部分地区，特别是占有了喀喇汗国的重要中心之一，后来东喀喇汗国的都城喀什噶尔。而且文献中也有样磨汗的称号为博格拉汗的记载，所以汗族出自样磨说也不无根据。另一方面，回鹘汗国崩溃后的部分回鹘部落的下落不明，是否进入该汗国地区（托古兹古兹即高昌回鶻与此无关）。《突厥语大词典》的作者麻赫穆德·喀什噶里即出身于喀喇汗国汗室，他称喀喇汗国汗汗室是阿弗剌昔牙卜的后人。并在其书中指出，回鹘人在东方高昌一带生活，信仰佛教。并在书中收录有喀喇汗国的诗歌，将回鹘描述为凶恶的异教徒。此外对高昌回鹘与喀喇汗国之间的关系并无涉及。