Muroran Main Line
長萬部車站是室蘭本線下行方向的起站，室蘭本線在此處與函館本線交會，因此主要列車在此站皆有停靠。目前正在興建中的北海道新幹線預計會通過長萬部車站，並計畫將此站列入停車車站之一。