Amédée Courbet
4月14日双方开始谈和，令孤拔解除對台封鎖。4月15日，法軍正式解除封鎖。但于和约订下为止都仍占领澎湖。隨後法國政府與清朝展開談判，清軍與法軍未再爆發戰事，但五月與六月之間澎湖流行瘟疫，法軍病死若干，甚至司令孤拔也罹患赤痢，並快速惡化成貧血。