Anwar al-Awlaki
ورث أوباما حرب العراق، وحرب أفغانستان، ومختلف جوانب الحرب الأمريكية على الإرهاب، والتي بدأت كلها خلال إدارة بوش. أشرف على الخفض التدريجي لجنود الولايات المتحدة في العراق، الذي تُوج بانسحاب شبه كامل لجنود الولايات المتحدة من العراق في ديسمبر 2011. بعد زيادة الوجود العسكري الأمريكي في أفغانستان خلال فترة ولايته الأولى، سحب أوباما جميع الجنود باستثناء نحو 8,400 جندي من أفغانستان خلال فترة ولايته الثانية. في عام 2011، أشرف أوباما على مهمة أدت إلى مقتل أسامة بن لادن، المنظم لهجمات أحداث 11 سبتمبر 2001. انخفض عدد السجناء في معتقل غوانتانامو بشكل كبير أثناء ولاية أوباما، ولكن على الرغم من آمال أوباما بإغلاق المعتقل، فقد ظل نحو 41 سجينًا في معتقل غوانتانامو بحلول الوقت الذي ترك فيه أوباما منصبه. زادت إدارة أوباما من استخدام ضربات الطائرات دون طيار، وخاصة في باكستان، التي استهدفت زعماء تنظيم القاعدة مثل أنور العولقي. في عام 2013، كشف إدوارد سنودن عن وجود برنامج مراقبة حكومي واسع النطاق يعرف باسم بريسم، والذي دافع عنه أوباما باعتباره «نظامًا محدودًا وضيق النطاق، وموجهًا نحو قدرتنا على حماية شعبنا».