污水處理
第二期工程分為甲乙兩期，甲於2009年展開，預計於2014年年底竣工。屆時可以將位於香港島北、西及南共8個污水處理廠的污水運輸往昂船洲污水處理廠集中淨化，昂船洲污水處理廠的每日污水處理量將會由目前的每日170萬立方米增加至245萬立方米，工作亦會改善上述8座污水處理廠。屆時，《淨化海港計劃》將會完全覆蓋維多利亞港兩岸，污水處理量，水質淨化後，維多利亞港的海水含氧量將會比較第一期工程前增加13%、大腸桿菌含量將會銳減99%、淤泥將會減少1,000公噸。