Molucca Sea
12月31日、パイクは2回目の哨戒でセレベス島方面に向かった。その日の夕刻、パイクはオーストラリアのダーウィンに向かうよう指示された。2日後の1942年1月2日にマニラは陥落する。ダーウィンに向かう途中、パイクはモルッカ海峡、マナド近海で哨戒を行った。1月12日に白鷹型敷設艦と思しき艦艇、および1月8日と10日、13日には警戒中の日本の駆逐艦を発見する。1月24日、パイクは25日間の行動を終えてダーウィンに帰投した。