매사추세츠 만
헨리에타 스완 레빗은 회중파 교회 목사인 조지 로스웰 레빗(George Roswell Leavitt)와 그의 부인 헨리에타 스완 켄드릭(Henrietta Swan Kendrick)의 딸로 메사추세츠 주 랭카스터에서 태어났다. 레빗의 집안은 17세기 초기에 매사추세츠 만 식민지에 정착한 영국계 청교도 부제 존 레빗의 후손이었다. 그녀는 오버린 대학을 다니다가 1892년에 래드클리프 대학에서 학사 졸업하였다. 레빗은 대학 4년째가 되어서야 천문학 강의를 듣기 시작했는데, A-를 받았다.