معاهدة أميان
بدأ النظام في الانحدار في سبعينيات القرن السابع عشر، وبعد ذلك أضعفته الثورة الفرنسية بشدة في عام 1792. غزت القوات الفرنسية بقيادة نابليون مالطا وتمكنت من إبعاد النظام في عام 1798، وعليه أصبحت مالطا واقعة تحت احتلال فرنسي. تمرد شعب مالطا ضد الفرنسيين، وأصبحت الجزر محميات بريطانية في عام 1800. كان من المقرر أن تعود مالطا إلى النظام بموجب معاهدة أميان في عام 1802، ولكن ظل البريطانيون محتفظين بالسيطرة على الجزر حتى أصبحت رسميًا مستعمرات بريطانية بموجب معاهدة باريس في عام 1814.