Депортес Киндио
В 2010 году Мурильо вернулся на родину, где непродолжительное время выступал за «Депортес Киндио», «Депортес Толима» и «Депортиво Перейра». В 2012 году он подписал соглашение с командой «Кортулуа». 26 июля в матче против «Сентаурос» Элькин дебютировал за новый клуб. 9 сентября в поединке против «Хувентуда» Мурильо забил свой первый гол за новый клуб и помог ему добиться победы.