Комиссия по расследованию антиамериканской деятельности
В августе 1938 года Маршалл отправился в своё последнее путешествие на Аляску, чтобы продолжить исследования хребта Брукс. Тогда же им заинтересовалась Комиссия по расследованию антиамериканской деятельности Палаты представителей США. Эта комиссия сообщила в газете "New York Times" о том, что восемь федеральных чиновников, включая Маршалла, являются пособниками коммунистов, поскольку поддерживают контакты с такими организациями, как «Альянс рабочих» () и . Маршалл же был слишком занят в путешествиях, чтобы отвечать на эти обвинения: после Аляски он отправился в штат Вашингтон, затем в Монтану, Орегон, Неваду, Юту, Аризону, Нью-Мексико и Калифорнию. В следующем году он ещё один последний раз ненадолго приехал на Аляску, совершил путешествие по западным национальным лесам, изучая возможности лесной рекреации.