Rebuild of Evangelion
عادت ميساتو كشخصية محورية في "إعادة بناء إيفانجيليون". كان ظهورها الأول لهذه السلسلة في '، حيث ظهرت مشابهة تقريباً لنظيرتها في الأنمي بخلاف بعض التغييرات البسيطة. في هذه السلسلة، يبدو أن ميساتو متدخلة أكثر في ما يحدث في نيرف وتغيرت رتبتها إلى . بسبب ذلك، فهي على علم بامتلاك نيرف لليليث. في '، شجعت ميساتو شينجي على الاقتراب من والده وأحضرت أسكا إلى شقتها على أمل تكوين صداقة حميمة بين القائدين الاثنين. تلعب ميساتو دوراً مشابهاً للأخت الكبرى لأسكا ولم تبدأ علاقتها الحميمة مع كاجي من جديد. في مشهد مسترجع من الاصطدام الثاني، ظهرت ميساتو بأنها استيقظت ورأت موت والدها أمام عينيها. بعد تضرر سيارتها رينو ألباين خلال وصول أسكا، قامت ميساتو باستبدالها بالجيل الأول من مازدا كوزمو.