Sudan People's Liberation Movement
La región ha sido particularmente afectada por la guerra, primero con la ocupación europea en 1880, luego a mediados del siglo XX con la formación de grupos rebeldes independentistas como Anyanya y la aparición en 1983 del Ejército de Liberación del Pueblo de Sudán. Desde 2005 la guerrilla ugandesa Ejército de Resistencia del Señor (ERS o "LRA", por sus siglas en inglés), opera al sur de Sudán y ha perpetrado ataques contra la población civil, así como reclutamientos forzosos a menores. Entre 2008 y 2009 se crearon y se fomenta al grupo paramilitar Arrow Boys para protegerse de ataques del Ejército de Resistencia del Señor.