La Paz
남부나무타기쥐는 남아메리카 안데스 산맥 동부 경사면에서 발견된다. 분포 지역은 아르헨티나 북서부 후후이주 지역부터 북쪽으로 볼리비아 중부 산타크루스 주와 볼리비아 북서부 라파스 주까지 이어진다. 아르헨티나의 저고도 지역과 라파스 고고도 지역 등을 포함한 해발 고도 350~2600m에서 발견되며 가드너나무타기쥐("Rhipidomys gardneri")와 계곡 일부 지역을 공유하지만, 일반적으로 가드너나무타기쥐보다는 높은 지역에서 서식한다. 일반적인 서식지는 울창한 숲 계곡의 융가스 숲 지역이지만 아르헨티나의 저산대 숲과 천이 지역 숲, 저지대 숲에서도 발견된다. 야행성 동물로 나무를 잘 타는 동물이며, 커피농장에서는 유해동물로 간주하기도 한다.