Castillo de Dublín
O'Doherty viajó a Dublín para defender su caso ante el lord teniente de Irlanda, Arthur Chichester. Desafortunadamente, su llegada coincidió con la huida del Castillo de Dublín de Lord Delvin, líder de una revuelta planificada. O'Doherty exigió que su inocencia fuera declarada públicamente. En cambio, Chichester ordenó que O'Doherty estableciera una fianza de más de 1000 libras, su devolución condicionada a su comportamiento futuro, y le prohibió abandonar Irlanda, prohibiéndole ir personalmente a Londres para presionar al rey Jacobo. No se proporcionó ninguna evidencia de su participación en ningún complot, pero el incidente dañó severamente las relaciones de O'Doherty con el gobierno.