中央、總武緩行線
雖然外觀上改造至跟0番台非常相似的外型，但運作的機器並沒有更換，結果試作車的車身老化的程度比0番台更顯著。雖然JR東日本已決定以E233系1000番台取代209系，但在首列列車出廠前這些試作車已需退役。為填補退役試作車的空缺，JR東日本需從中央、總武緩行線抽調3列209系500番台列車至京濱東北線，而中央-總武緩行線的列車空缺則以3列新出廠的E231系補充。