Внутренние болезни
На протяжении 15 лет профессор Ш. З. Загидуллин — учёный секретарь учёного совета университета; в течение трёх лет являлся председателем Итоговой государственной аттестационной комиссии на лечебном факультете. Он был организатором и председателем кандидатского диссертационного совета БГМУ по внутренним болезням, кардиологии и педиатрии (1997—2002), а после его реорганизации — заместителем председателя докторского диссертационного совета (до 2012), заместителем председателя проблемной комиссии БГМУ «Внутренние болезни».