Staatsmeisterschaft von Rio de Janeiro
Petković ging zurück nach Brasilien, wo er bei Flamengo Rio de Janeiro einen Vertrag erhielt. Mit dem Klub konnte 2000 und 2001 Staatsmeisterschaft von Rio de Janeiro gewinnen. 2001 kam außerdem der Sieg im Copa dos Campeões hinzu, einem Qualifikationsturnier des CBF zur Copa Libertadores.