Russian Professional Football League
クラブは2007年にジェムチュジナ＝A（）という名前で再建された。アルセン・ナイデョーノフが監督兼副会長に就いた。2007年はアマチュア・フットボールリーグ（4部）に参加した。ここで2位となり、2008年はロシア・セカンドディビジョン南ゾーンに昇格した。2008年にクラブ名がFCジェムチュジナ・ソチに変更された。南ゾーンで優勝したことにより、2010シーズンは9シーズンぶりにロシア・ファーストディビジョンに昇格した。