天津泰达足球俱乐部
2006年1月27日，于根伟宣布退役，出任天津泰达足球俱乐部副总经理。2006年中国足球超级联赛，天津泰达依旧为于根伟报了名，球衣号码仍然是10号。 2007至2009赛季，他兼任球队助理教练，先后辅佐雅拉宾斯基以及左树声两位主帅。2009赛季末，随着球队内部动荡，于根伟离开俱乐部，之后一直投身于校园足球以及青少年足球培养。