Hironobu Sakaguchi
以全英语拍摄《灵魂深处》的决定很早就已做出。原案由坂口博信编写，名为《盖亚》。剧本由和编写。电影由榊原幹典共同导演，会田纯和克里斯·李二人担任制片人。李将首个长篇写实动画电影《灵魂深处》和华特·迪士尼的《白雪公主与七个小矮人》——首个长篇赛璐珞动画——做了对比。为了电影满足导演坂口博信的构想，一些剧本被重新编写，之中大多于制作初期完成。坂口表示他对电影最终剪辑很满意，称他即使有机会也不做任何修改。电影在拍摄即将结束之际巨额超支，为弥补增长制作投入于支付员工薪水，不得不注入新资金。电影最终耗资1.37亿美元，其中约3,000万用电影销售商哥伦比亚影业的营销；开销超出传闻的原7,000万美元预算。单用于史克威尔夏威夷工作室建设的投入为4,500万美元。本片也是哥伦比亚电影公司自1986年《》之后的首部动画长片。