非法砍伐
公园的大部分天然湿地生态系统正在经历到灌木和林地的变化，同时还受到了凤眼蓝和刺軸含羞草等外來物種入侵的威胁。由于鳄鱼皮的交易活动，新畿內亞鱷的栖息地正遭受威胁。与印尼的其他地区和巴布亚新几内亚一样，非法砍伐也发生在瓦苏尔国家公园。