石垣島
石垣島的第一座天文觀測設施是建有20m電波望遠鏡的国立天文台VERA石垣島局。VERA最初計劃只在岩手縣奥州市水澤区與石垣島各設置2-4台電波望遠鏡，而到了1980年代初期，野邊山宇宙電波觀測所的45m毫米波電波望遠鏡建成，J-Net（覆蓋日本全土的VLBI觀測網）開始運作，當局亦結合觀測成果及VLBI相關技術發展，決定將2局計劃改為4局系統。由於最初只有水澤、入来、小笠原3個局的預算獲通過，石垣島局直至2002年3月方建成運作，比其他3個局晚了1年。