Леонес Негрос
Руис начал профессиональную карьеру в клубе «Леон». 20 июля 2008 года в матче против «Леонес Негрос» он дебютировал в Лиге Ассенсо. 26 февраля в поединке против «Леонес Негрос» Иберт забил свой первый гол за «львов». В 2011 году он полгода выступал за «Торос Неса». Летом того же года Руис перешёл в «Керетаро». 24 июля в матче против столичной «Америки» он дебютировал в мексиканской Примере. 2 октября в поединке против «Гвадалахары» Иберт забил свой первый гол за «Керетаро».