Guerra de los Huesos
La colección de Yale en sus primeros años era básicamente mineralógica, recolectada por el geólogo y mineralogista Benjamin Silliman. Marsh fue uno de los tres primeros curadores del museo, y cuando Peabody murió en 1869 utilizó su herencia para financiar expediciones que incrementaron considerablemente las colecciones del museo. Su primer interés fue el estudio de los dinosaurios, y durante el infame periodo de la historia de la paleontología conocido como Guerra de los Huesos, descubrió 56 nuevas especies de dinosaurios, embarcando literalmente toneladas de fósiles al suroeste de Estados Unidos. Sus hallazgos también incluyeron fósiles de vertebrados e invertebrados, pistas fósiles de animales prehistóricos y artefactos arqueológicos y etnológicos.