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2016年3月22日，時代力量推出公民投票法的修正案，林昶佐強調依據聯合國原住民族權利宣言以及原住民族基本法，為保障原住民族的集體權利與獨立性，在公投法中增列了「原住民族及部落知情同意權」，只要影響原住民族相關集體權利之公民投票，首應交由原住民族先行決定。