Cavite City
필리핀인과 중국인, 타갈로그인의 피가 섞인 혼혈인이었으나 아기날도의 집안은 필리핀 카비테 주(州)의 명문가의 후예였다. 그가 3세가 되었을 때 홍역을 치른 직후 1872년 카비테 지역에 반스페인 폭동으로 혼란한 상황이 닥쳤다. 갑작스러운 소요사태에 당황한 친척들은 그를 작은 나무 아래 방치해놓은 채 피신했다. 후에 에밀리오를 찾았을 때는 개미에 물려 온몸이 부어 올랐으며 너무 울어서 목소리도 완전히 쉰 상태였다. 야생 늑대와 호랑이, 들개 등이 다녔는데도 방치된 상태에서 그는 극적으로 생존해 있었다. 그는 홍역이 재발하여 빈사지경에 처하기도 했다. 그는 후일 마닐라의 산토 토마스 대학에서 공부했다.