新人民軍
大学時代の恩師は、フィリピン共産党 (PKP)の創設者で毛沢東主義者のであり、シソンからは大統領選での支持も受けている。また、共産党員を閣僚に起用する案を掲げるなど、フィリピン共産党 (CPP)との協力にも積極的である。大統領就任後は、新人民軍との間で、無期限の停戦合意にも成功している。