北里柴三郎
北里柴三郎はドイツ滞在中に、脚気の原因を細菌とする東大教授・緒方正規の説に対し脚気菌ではないと批判した為、緒方との絶縁こそなかったものの「恩知らず」の烙印を押され、母校の東大医学部と対立する形になってしまった。それは単に東大を敵に回すことだけでなく柴三郎自身の研究者生命も危うくすることを意味していた。日本に帰国した柴三郎は自分の希望する研究ができると思っていたが、実際は北里の思う通りには行かなかった。東大と対立した柴三郎を研究者として暖かく受け入れてくれる研究所はどこもなく、学界に大きな力と人脈を持つ東大を恐れて誰も援助する者もいなかった。研究者・北里柴三郎はまさに孤立無援の状態であり、これが東大の恩師を敵に回した者の厳しい現実だった。そんな時、この北里柴三郎の危機的状況を静かに目撃していた福澤諭吉は海外で大きな快挙を成し遂げたのにそれにふさわしい研究環境が用意されない日本の状況を深く失望して、福沢諭吉の全面協力、多大な資金援助により、1892年（明治25年）10月、北里柴三郎の為の「私立伝染病研究所」を芝公園内に設立することにした。そして、北里柴三郎は福沢に感謝して、そこの初代所長となった。この時、福澤諭吉は57歳、北里柴三郎は40歳である。同年11月には、伝染病研究所は大日本私立衛生会（副会頭は長与専斎、この長与と福沢諭吉は適塾では同じ塾生の間柄）の所属となり、年間3600円の財政支援を受けることになった。