Венский сецессион
Котера проектировал фасад собора Св. Петра, деревянный павильон «Товарищества художников Манеса» (Spolek výtvarných umělců Mánes), Окружной дом в Градец-Кралове (1902), Моцартеум в Праге (1911—1913), дворец Лембергер в Вене (1913—1915) и многое другое в разных городах Чехии. В начальный период своего творчества он находился под влиянием классицизма, прививаемого студентам Академии, а также венского модерна и творчества художников объединения «Венский сецессион». Позднее, после знакомства с работами Фрэнка Ллойда Райта, Котера стал тяготеть к функционализму. Одновременно, под влиянием Ч. Р. Макинтоша, Й. Хоффмана, Й. Плечника, Й. М. Ольбриха, Котера постепенно освобождал свои проекты как от академизма, так и от декора в стиле модерна. Он также стал включать в свои композиции национальные элементы, близкие традиционной чешской рустике (грубый камень, дерево, фахверк), формируя индивидуальный стиль.