Patriot Act
1999 wechselte er ins US-Finanzministerium eingestellt, zunächst als Assistent des Chefjustiziars Neal S. Wolin, dann zum kommissarischen stellvertretenden Chefjustiziar befördert. Cohen wirkte mit am Gesetzestext Title III des USA PATRIOT Act, der sich mit Geldwäsche beschäftigt. 2001 wechselte er zurück in die Privatwirtschaft und praktizierte Wirtschaftsrecht in der Großkanzlei Wilmer Cutler Pickering Hale and Dorr, wo er 2004 zum Partner ernannt wurde.