BK Frem København
Anfang 2003 wurde Jacobsen an den dänischen Erstligaklub Brøndby IF ausgeliehen. In der Liga gab er sein Debüt am 19. Spieltag gegen Viborg FF, hierbei spielte er von Beginn an und wurde in der 70. Minute für Dennis Cagara ausgewechselt. Zum Jahresende verließ er den Verein. Er absolvierte nur vier Spiele, unter anderem aufgrund einer Knieverletzung, die zu einem mehrmonatigen Ausfall führte. Im Juli 2004 nahm der damals 21-Jährige einen Vertrag beim Zweitligisten BK Frem København an, mit denen er als Drittplatzierter nur knapp den Aufstieg verpasste. Von den Fans wurde er zum Jahresende zum Spieler des Jahres gewählt. Im Januar 2006 wechselte er zu Aalborg BK und spielte somit wieder erstklassig. Sein erstes Tor in der obersten dänischen Spielklasse erzielte er am 26. Spieltag beim Auswärtsspiel gegen Brøndby IF, er traf zum 2:3-Anschlusstreffer bei der 3:4-Niederlage. In der Saison 2007/08 gewann er an der Seite von Jeppe Curth, Rade Prica, Andreas Johansson und Siyabonga Nomvethe den Meistertitel. Insgesamt absolvierte Jacobsen jedoch nur wenige Spiele pro Saison und verließ Aalborg zur Saison 2008/09 wieder, um erneut für BK Frem zu spielen. Seit Sommer 2009 ist Jacobsen vereinslos.