FC Admira Wacker Mödling
Марк Янко начал свою карьеру в клубе «Адмира Ваккер Мёдлинг» из Мёдлинга в Нижней Австрии. После нескольких успешных сезонов в «Адмире» Янко перешёл в «Ред Булл» из Зальцбурга, став в сезоне 2004/05 одним из ключевых игроков команды и забив 11 мячей в 10 матчах.