Aaron Burr
ジェファーソンはニューヨーク州出身のアーロン・バーと密接に協力しながら自党を糾合し、特に新税を攻撃し、1800年のアメリカ合衆国大統領選挙に打って出た。当時の習慣に従い、公然たる選挙運動はしなかった。アメリカ合衆国憲法修正第12条の成立前に、この新しい国の選挙制度の問題が露呈した。選挙人選挙でジェファーソンとバーの得票数が同数で1位となり、アメリカ合衆国下院（このときはまだ連邦党が多数党だった）で当選者を決めることになった。