BirdLife International
ガラパゴスササゴイは、一部の専門家（アメリカ鳥学会およびバードライフ・インターナショナルを含む）により、ササゴイ ("B. striata") の亜種（または単に色の変化型）と考えられており、 以前はササゴイ (B. striatus) として、本種およびアメリカササゴイ ("B. virescens") は「同一種」とされた。