Swiss Indoors
Más tarde Del Potro clasificó por primera vez al . Después de resultar noveno en la etapa de clasificación, perdió en primera ronda frente al colombiano Alejandro Falla en cuatro sets. Luego disputó el Torneo de Tokio llegando a la tercera ronda perdiendo ante Tim Henman. También se clasificó para su primer Masters 1000 en perdiendo en 1.ª ronda. Disputó el Torneo de Basilea, llegando a los cuartos de final y perdiendo ante el n.º 7 del ranking mundial, Fernando González por 7-5, 4-6, 4-6.