Unternehmen Cerberus
Im Februar 1942 nahm die Flottille am Unternehmen Cerberus teil und im März 1942 versenkte das zur Flottille gehörende Schnellboot "S 104" vor Cromer den britischen Zerstörer "HMS Vortigern". Später folgten nach der Invasion von Frankreich dann Einsätze im Küstengebiets Belgiens und Englands. Zu dieser Zeit war der Liegeplatz Rotterdam. Ende April 1942 war die Verlegung von Ostende nach Rotterdam erfolgt. Die Flottille wurde später nach Norwegen verlegt und ging über Frederikshavn (Dänemark) nach Kristiansand, wo sie am 9. November 1944 eintraf, und ging am nächsten Tag weiter nach Egersund. Bereits am 17. Dezember 1944 wurde die Flottille wieder in die Deutsche Bucht und von dort nach Holland befohlen. Die seit Oktober 1944 als Begleitschiff zur Flottille gehörende "Hermann von Wißmann" blieb bei der Verlegung in Norwegen.