Princess Mononoke
1997年的《魔法公主》回到生態及《風之谷》劇中的政治主題，故事情節集中於居住在森林裡的動物之間的鬥爭及人類利用森林來擴展工業。《魔法公主》與《風之谷》這兩部影片含蓄地批評了人類對自然產生的不利影響，並將軍隊塑造成負面的形象。《魔法公主》也被認為是他最暴力的電影之一，這部電影在日本獲得巨大的商業成功，當時成為日本史上最賣座的電影，直到被《鐵達尼號》超過為止；並最終在日本電影金像獎奪得最佳影片獎。宮崎駿在傾全力執導《魔法公主》之後暫時性的退休。