Депортес Киндио
Мера — воспитанник клуба «Депортиво Кали». Для получения игровой практики Херман на правах аренды выступал за клубы низших дивизионов «Кордоба», «Атлетико де ла Сабана» и «Депортиво Пасто». 20 апреля 2011 года в матче против «Депортес Киндио» он дебютировал за «Депортиво Кали» в Кубке Мустанга. В 2013 году Мера на правах аренды перешёл в американский «Колорадо Рэпидз». 2 июня в матче против «Далласа» он дебютировал в MLS.