Reactive oxygen species
تؤدي الزيادة في أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS) بعد الإصابة بفيروس التهاب الكبد B إلى حدوث التهاب، ما يؤدي إلى زيادة أخرى في أنواع الأكسجين التفاعلية (ROS). تسبب أنواع الأكسجين التفاعلية أكثر من 20 نوعًا من تلف الحمض النووي. تلف الحمض النووي المؤكسد يسبب الطفرات. بالإضافة إلى ذلك، يمكن أن يتسبب إصلاح تلف الحمض النووي في حدوث تغييرات جينية في موقع الضرر أثناء إصلاح الحمض النووي. قد تسبب التغيرات والطفرات الوراثية عيوبًا في الآلية الخلوية التي تساهم بعد ذلك في الإصابة بأمراض الكبد. بحلول الوقت الذي تتسبب فيه التغيرات اللاجينية والطفرية المتراكمة في نهاية المطاف في تطور السرطان، يبدو أن التغيرات اللاجينية لها دور أكبر في هذه التسرطن من الطفرات. يتحور جين واحد أو جينين فقط TP53 وربما ARID1A، في أكثر من 20% من سرطانات الكبد بينما يحتوي كل جين على محفزات مفرطة الميثيل (قمع التعبير الجيني) في أكثر من 20% من سرطانات الكبد، مع سبعة من هذه الجينات يجري فرط الميثيل في أكثر من 75% من سرطانات الكبد. بالإضافة إلى التعديلات في مواقع إصلاح الحمض النووي، تحدث التغيرات اللاجينية أيضًا عن طريق HBx الذي يقوم بتجنيد إنزيمات ميثيل ترانسفيراز DNA ،DNMT1 و/أو DNMT3A، إلى مواضع جينية معينة لتغيير مستويات المثيلة والتعبير الجيني. يغير HBx أيضًا أستلة هيستون التي يمكن أن تؤثر على التعبير الجيني.