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基督教與伊斯兰教中的殉教行為，也捲入教派自殺的爭論中。當主流宗教的殉道者接受或主動選擇死亡，他們可謂進行一種在他人協助下的自殺。這種說法並不新，近代研究宗教改革的學者理察·馬流斯為中世紀殉道者托马斯·莫尔寫的傳記中，顯示摩爾曾經對接受殉教猶疑，因為輕易接受殉道與自殺太過相似。