Naval Station Norfolk
スカルピンは1990年8月3日に退役し、1990年8月30日に除籍された。最後の艦長はJ・B・アラン中佐であった。スカルピンの退役式はノーフォーク海軍基地で行われた。船体は原子力艦再利用プログラムに従ってワシントン州ブレマートンで2000年10月1日に解体が始められ、2001年10月30日に解体が完了した。