Growth hormone
如果阴茎的长度小于正常值的标准偏差2.5个標準差以上，则在医学上被认为是小阴茎。导致小阴茎的原因主要有：脑垂体生长激素和/或的缺乏、男性荷尔蒙的分泌不足、基因上的病症、一些Homeobox基因的变化。一些种类的微型阴茎可以在幼年时期补充生长激素或是睾丸酮来加以改善。只進行阴茎延长术对此是没有效果的。