African forest elephant
Das Bild änderte sich erst wieder unter Hinzuziehung molekulargenetischer Untersuchungen, die im Jahr 2017 vorgestellt wurden und neben den rezenten Elefantenarten auch Fossilien des Europäischen Waldelefanten einbezogen. Diese ergaben eine nähere Verwandtschaft mit "Loxodonta", wobei sich eine engere Bindung zum Waldelefanten ("Loxodonta cyclotis") als zum Afrikanischen Elefant ("Loxodonta africana") abzeichnete. "Palaeoloxodon" wird daher wieder weitgehend als eigenständige Gattung geführt. Vertiefende Analysen deckten darüber hinaus ein weitaus komplexeres Verwandtschaftsverhältnis zwischen den verschiedenen Elefantenarten auf. Demnach bestehen genetische Übereinstimmungen innerhalb der verschiedensten Elefantengruppen, diese setzen sich aus drei Komponenten zusammen: Die erste betrifft Allele, die sich der Afrikanische Elefant und der (afrikanische) Waldelefant teilen und die möglicherweise bis in die Stammgruppe der beiden Arten zurückreichen. Als zweite Komponente weisen der Europäische Waldelefant und der westafrikanische Waldelefant eine signifikante Anzahl gemeinsamer Genkomponenten auf. Letztendlich ließen sich aber auch genetische Übereinstimmungen mit dem Wollhaarmammut ("Mammuthus primigenius") aufzeigen. Als Ursache für diese Genmischung können verschiedene Hybridisierungsereignisse in der Frühphase der stammesgeschichtlichen Entwicklung der einzelnen Elefantenformen angenommen werden. Sowohl "Palaeoloxodon" als auch "Loxodonta" und "Mammuthus" entstanden jeweils in Afrika, wo alle drei Gattungen im Pliozän vor rund 5 Millionen Jahren nachweisbar sind. Die Hybridisierung erfolgte dann in einer Zeitphase, bevor die genetische Isolation der einzelnen Arten zu wirken begann.