Malayan Union
巴巴布德星吉成为第二任党主席，当时党的方向已导至反殖民主义。尽管多数印度人支持马来亚联邦，但国大党原则上不支持。 马来亚联邦最后在1948年撤回，以马来亚联合邦取代。不过约一万印度人口被拒绝马来亚公民身份，拒绝发公民权给印度人不止影响从印度移民来马来亚有十几年的人，也深深影响在马来亚出生的印度人。结果，数以千计的富有印度人决定离开马来亚，带走了其大部分的经济蛋糕。国大党之后参与陈祯禄领导的全马来亚联合行动理事会，以反对缺乏自由度的1948年马来亚联合邦协议。