오용
의학계 안팎에서의 항생제의 광범위한 사용은 저항성 세균의 출현에 중대한 역할을 하였다. 항생제는 사료로 동물들을 키울 때에도 종종 사용되며, 다른 이유보다 이러한 사용이 저항성을 갖는 세균을 발생하게 한다. 이러한 경우에서 일부 국가에서 항생제는 처방 없이 판매되기도하며, 저항성균이 발생하는 원인이 된다. 관리가 잘 된다고 여겨지는 인체에 사용되는 약제에서 저항성 세균이 발생하는 것은 환자나 의사의 항생제의 오용 및 과용이 원인이 되는것으로 알려져있다. 가축의 사료에 항생제를 첨가하는 관행은 저항성의 또 다른 원인이 된다. 가정 내에서 사용하는 항균성 비누나 다른 상품은, 명확하지는 않지만 (감염 통제에 도움이 되지 않는다는 면에서) 또한 권장되지 않는다. 제약사의 부적절한 관행 또한 항생제 저항성균 발생의 한 원인이 될 가능성이 있다.