Transitional Federal Government
2004年になると、ケニアのナイロビでソマリア暫定連邦政府樹立のため、ソマリランドを除くソマリア国内各派が会談を行なった。アブドゥラヒ・ユスフもこの会談に参加し、同年10月10日に実施された暫定大統領選挙で270票のうち179票を得票、14日よりソマリア暫定連邦政府大統領となった。同月中にプントランド自治政府大統領職を辞し、ソマリアの統一政権樹立に専念する意向を示した。