Emperor Go-Mizunoo
延宝8年（1680年）8月19日、85歳で崩御し、泉涌寺内の月輪陵（つきのわのみささぎ）に葬られた。なお京都市上京区の相国寺境内には後水尾天皇の毛髪や歯を納めた、後水尾天皇髪歯塚が現存する。昭和60年（1985年）7月12日までは、神話時代を除いた歴代天皇（崩御時は法皇）のうちで最長寿であった。記録を抜いた昭和天皇は、「後水尾天皇の時は平均寿命が短く、後水尾天皇の方が立派な記録です」と述べた。また、第125代天皇明仁も平成30年（2018年）3月7日に後水尾天皇の崩御時点での年齢に到達している。