Ферганская долина
Тектоническая активность быстро возобновилась в конце плиоцена, что привело к размыву континентальных отложений в межгорные бассейны в четвертичный период. Складчатость переросла в четвертичный период в Тянь-Шане, поскольку изменения климата привели к ледниковым периодам плейстоцена. Большинство хребтов горного хребта представляют собой асимметричные антиклинали, ограниченные взбросами и надвигами. Складчатость и надвиг часто ориентированы на крупные впадины, такие как Ферганская долина или Таримская впадина.