NAMCO x CAPCOM
本作のタイトルは『NAMCO x CAPCOM』のように会社名を入れる案もあったが、全てを入れると非常に長くなるうえ、続編ではなく新規タイトルだということもあって、夢のクロスオーバーが実現した企画（プロジェクト）という意味で現在のタイトルになった。公式ブログでも同様のことが書かれ、「様々な作品がクロスオーバーして出会う領域」として「クロスゾーン」と名付けられた。