ワイタンギ条約
最初の任務の一つはワイラウ大虐殺の状況の調査であった。彼は入植者の行動が違法だったことに気づき、軍備の薄さにもよってマオリ側の指導者Te Rauparahaと対立することを避けた。しかしニュージーランドカンパニーと移民は裏切りだと感じた。その結果、彼は地域を統制するための管理官を設置した。またニュージーランドカンパニーが購入したと主張したマオリ族の土地に対して、より現実的な代価を払うよう要求した。これらの行動によってフィッツロイの評判は悪化した。土地の売買は継続的な問題だった。移民は土地を買いたがり、一部のマオリ人は売るつもりがあった。しかしワイタンギ条約の下で土地の売買は政府を仲介者としてゆっくりとしか行われなかった。財政の不足を補うためにフィッツロイは関税を上げ、資産税と所得税を導入した。これらの方策はすべて失敗し、植民地政府は破産に直面した。フィッツロイは空手形を切らざるを得なくなった。