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2020年9月18日，中国科普作家、网络名人方舟子在新语丝上发表评论驳斥閻麗夢有关「新冠病毒人造」的说法，并对其学术背景提出质疑。他表示「閻麗夢在中国大陆受的是医学教育，读博士学位时的课题并不是研究病毒，而是眼科和病毒一点关系都没有。……如果闫博士真的发现了在病毒基因组序列里头有什么样的秘密能够证明是人为制造的，别人怎么可能发现不了呢？怎么轮得到她一个学医出身的、才研究了几个月的病毒的人来发现呢？」