American Civil Liberties Union
В 1963 Найер был принят на работу в Американский союз защиты гражданских свобод (ACLU), в 1965 стал исполнительным директором нью-йоркского отделения союза, а в 1970 — национальным директором. В ACLU он продвигал распространение гражданских свобод на заключённых в тюрьмах и учреждениях для несовершеннолетних, пациентов психиатрических больниц и приютов для умственно отсталых, а также выступал против криминализации абортов и в поддержку прав женщин.