Pope Boniface VIII
腓力四世在位时期做出的最具持久影响的决策是对教会所奉行的强硬政策。13世纪末，为筹措战争经费并满足王室各种开销，腓力四世下令向一直享有各种免税特权的法国教士开征俗世什一税，此举遭到教宗博義八世的强烈抨击和抵制。为制造一种全民授权、全民支持的氛围，腓力四世于1302年在巴黎圣母院召开了由教职人员、世俗贵族和富裕市民代表参加的国务会议，这次会议被认为是法国三级会议的始祖，而且是法国由割据君主制转向等级君主制的标志。1303年，法王派駐在意大利的宫廷大臣诺加莱在教宗驻地囚禁了教宗并大加凌辱，博義八世后虽被救出但旋即忧愤而死。此后教宗的威势江河日下。腓力扶植法国的主教登上教宗御座，并在1309年把聖座从罗马迁至法国境内的“飞地”阿维农，此后近70年，被称为“阿维农之囚”的教宗便为法籍教士和法国世俗权力把持。