反恐战争
巴基斯坦与阿富汗在地理、历史、文化、宗教、种族等方面关系密切。9·11事件后，巴基斯坦参与国际反恐战争，但是暗中包庇塔利班和其它恐怖組織，阿富汗政府曾於2008年指責巴基斯坦三軍情報局介入針對阿富汗總統卡爾扎伊的未遂暗殺行動。