Club Deportivo Universidad Católica
В начале 2014 года Боттинелли был отдан в аренду в чилийский «Универсидад Католика». 1 февраля в матче против «Палестино» он дебютировал в чилийской Примере. 15 февраля в поединке против «Уачипато» Джонатан забил свой первый гол за «Универсидад Католика».