Dorje Shugden
ダライ・ラマ7世の時代以降は、シュクデンを支持する保守陣営が完全に復権したため、ガンデンポタン政府の公式宗教儀礼からニンマ派の要素が取り除かれた。それ以降12世までのダライ・ラマはニンマ派の教義を修行することはなかったため、シュクデン問題が表面化することはなかった。ただし、ダライ・ラマ9世から12世は、成人し政権の座につく20歳前後に夭折していて、政治的謀略で毒殺されていたとの疑惑がたびたび指摘されている。この期間にゲルク派はシュクデンを旗印に武力行使を含む強硬手段を用いてチベットの支配を確固たるものとした。