サパティスタ民族解放軍
しかし政権末期には、NAFTAに反発し武力蜂起したゲリラ組織であるサパティスタ民族解放軍に代表される、先住民や貧困層の不満への対応に追われ、またPRIから後任の大統領候補に指名されていたルイス・ドナルド・コロシオ候補の暗殺に関与したのではないかという疑惑や、海外への不正蓄財の疑惑が浮上しその支持が急低下した。