Région des Fleuves
Le territoire de la commune de Mariquina se trouve dans la Cordillère de la Côte dont les collines culminent à une altitude de 400 mètres environ. Le territoire comprend une portion de côte sur l'Océan Pacifique. Une partie du territoire dont l'agglomération principale San José de la Mariquina se trouve dans la vallée du Rio Cruces. La commune est située à à vol d'oiseau au sud de la capitale Santiago et à au nord-est de Valdivia capitale de la Région des Fleuves.