Battle of the Thames
1806年に連邦下院議員に選出された。彼はタカ派として同郷のヘンリー・クレイと同盟して1812年にイギリスとの戦争を支持した。米英戦争が始まるとジョンソンは陸軍大佐に任命された。彼と彼の兄ジェームズはアッパー・カナダにおいてウィリアム・ハリソンの下で戦った。テムズの戦いに参加し、ショーニー族の指導者テクムセを殺害したとされる。彼はこれを後の政治活動に利用した。