Young Germany
Marr se tourne vers l'anarchisme et l'athéisme, fonde l'Union secrète des travailleurs suisses et publie la revue athée et hégelienne "Blätter der Gegenwart für sociales Leben" (« Feuilles du présent pour la vie sociale ») (1844/45). Il fonde aussi la « Maison d'édition de la librairie allemande » qui ne publie toutefois qu'un seul livre, "Catéchisme d'un républicain de l'avenir". En , il est expulsé de Lausanne et publie l'année suivante un essai, "Das junge Deutschland in der Schweiz" (« La Jeune-Allemagne en Suisse »), son essai le plus connu dans lequel transparaît son attitude fondamentalement antilibérale et son anarchisme.