C.D. Nacional
CDナシオナルは2008-09シーズン開幕に向けての最後の選手補強として、ハファエルを獲得した。この移籍に際して、ポルトガルの大手オンラインスポーツ紙はハファエルについて「ユース時代にブラジルのECバイーアで大活躍した選手で、素晴らしいテクニックを持っている」と言及した。ハファエルはCDナシオナルと2012-13シーズン末までの5シーズン契約を結び、2008年7月5日にチームに合流した