セインツの海戦
クックはイギリスに戻った後、勉強のために1年間フランスへ行き、1782年に海軍に戻って、「」のアラン・ガードナー艦長のもとで任務に就いて、デュークが激戦を繰り広げたセインツの海戦を目撃した。クックは、パリ条約によってアメリカ独立戦争が終結した後も、ガードナーと共に行動し、その後50門艦「」に、ガードナーから一等海尉として配属された。ガードナーはジャマイカで准将となり、自らの旗をエウロパにたなびかせて、クックを指揮下に置いたが、クックは重傷を負い、免役されて帰国した。1790年のまでにはクックは全快し、保護者であるアレキサンダー・フッドから、旗艦の90門艦「」の三等海尉の任務を命じられた。しかしこの危機では戦闘に至らず、ロンドンは退役し、クックは陸上生活となった。