San Pedro Sula
Варгас — воспитанник клуба Реал Эспанья из города Сан-Педро-Сула. 9 марта 2014 года в матче против «Депортес Савио» он дебютировал в чемпионате Гондураса. В конце 2015 года Альянс стал получать больше игрового времени и выиграл конкуренцию за место в основе.