南昌起義
中華民國初年，佑清寺被軍閥佔為營房。後國民革命軍軍隊將寺內殿宇划作軍火庫，成為禁區，僧人被驅逐。期間寺內火藥數次爆炸，寺內建築遭到破壞。1927年，「南昌起義」戰鬥期間，起義軍攻打國民革命軍彈藥庫——佑清寺。1929年，南昌居士姚國美、曾非歟等與南海行宮住持恆定和尚一起捐資募款以修復佑清寺。姚國美捐出診金數萬元，合眾重修大雄寶殿，改建山門，復建念佛堂，重塑佛像等。姚國美還在山門右側房開設診所，用藥金供給寺中香火。山門左側房則為佛經流通處。寺內西側還建有花崗岩結構的四層四角形鐘樓，原普賢寺內的銅鐘被安置於其上。修復完工後，姚國美等倡議改寺名為「佑民寺」。後來，姚國美等在念佛堂成立南昌居士林（又名「覺集念佛林」）。此後，釋慈舟、釋印光和居士梅光羲等先後入寺講經。西藏諾那呼圖克圖及其弟子貢噶上師也在寺內啟壇，灌頂傳道。