フロリダ湾
ハンターはその後、七年戦争が終わるまでの間を士官候補生として、フィリップ・デュレル提督の何隻かの旗艦で過ごした。その旗艦とは、ロイヤルアン、、そして100門艦のである。このロイヤル・ジョージには、パリ条約締結の1763年まで乗艦し、ビスケー湾で任務についていた。1760年2月、ハンターは海尉試験に合格し、昇進して海尉と認められた。しかし、1780年まで海尉として任務に就くことはなかった。平和時にも海軍で現役の仕事をつづけ、ニューファンドランド島までフリゲート艦で向かい、その後航海士（マスターズ・メイト）として、1767年にサミュエル・フッドの艦隊が北アメリカに寄港していた時、艦隊の1隻であったの艦上で任務についた。1768年、フッドはハンターを航海長に任命した。1769年にトリニティ・ハウス（灯台協会）の試験に合格した後、ハンターは航海長の任命が事実であるかどうかを確認した。航海長としての初仕事は、28門艦に乗艦して西インド諸島での任務に向かうことだった。ハンターはそこで、沿岸地域や、ハバナのスペインの複数の砦の海図や平面図を作り、海軍本部へ送った。1771年、ケリーズフォートはフロリダ湾を、案内人によって航海している際にで座礁し、もう少しで壊れる所だったが、ハンターの尽力により、マストと大砲をいくつか失っただけですんだ。