CSエメレク
CDエル・ナシオナルの最大のライバルは、LDUキトである。この2チームの対戦はクラシコ・キテーニョ（キト・ダービー）と呼ばれている。同じくキトに本拠地を置くデポルティーボ・キトともライバル関係にある。また、グアヤキルの強豪2クラブであるバルセロナSC、CSエメレクともライバル関係にある。