Jacques le Mineur
La confusion semble provenir de l'identification du "frère" de Jésus, Jacques le Juste avec Jacques le Mineur effectuée par Jérôme de Stridon (saint Jérôme), qui considère les « frères » de Jésus comme des cousins, précisément des fils de Marie Jacobé avec Clopas. L'identification proposée par S. Jérôme est devenue la tradition de l'Église catholique romaine. De plus à partir du , l'idée que Joseph et Marie aient eu d'autres enfants est devenue une hérésie, et . Il est donc logique que des critiques aient considéré que tous ceux qui étaient appelés frère de Jésus étaient des fils de Clopas, bien que S. Jérôme n'ait alors parlé que des deux fils de Clopas mentionnés dans les évangiles: Jacques le Mineur et José. Cette identification n'a toutefois jamais été acceptée par les Églises orientales qui distinguent Jacques le Mineur et Jacques frère du Seigneur et les fêtent séparément et pour qui l'apôtre Jude est bien celui qui est appelé « frère » de Jésus dans les évangiles synoptiques et dans d'autres textes chrétiens.