Central nervous system
與周圍神經系統相反的是，中樞神經系統的神經元（包含腦部），全部都是中間神經元，但是在中樞神經系統中，中間神經元意指小型，呈局部投射狀的神經元（的投射具有長距離連接）。中樞神經系統的中間神經元大部分為抑制性神經元，使用 GABA或甘胺酸作為神經傳導物質。少部分的興奮性中間神經元則使用麩胺酸作為神經傳導物質，這類中間神經元亦會釋放乙醯膽鹼之類的調節物質（neuromodulators）。