Casuarina equisetifolia
大部份植物的根系會和不同的真菌有[[互利共生|互利]][[共生]]的關係，稱之為[[菌根]]。真菌會幫助植物從土壤中獲得水份和礦物質，而植物則會提供真菌從光合作用中組成的碳水化合物。一些植物會提供[[內生生物|內生]]真菌居所，而真菌則會產生毒素以保護植物不被草食性動物食用。植物的根系也可与细菌共生，形成根瘤，是根上的瘤状突起，如[[豆科]]植物、[[木麻黄]]、[[罗汉松]]、[[杨梅]]等，能够与土壤中的[[根瘤菌]]共生，根瘤菌能将空气中的氮转变为氨，提供给植物，同时根瘤菌可以从植物的根中吸取水分和养料，供自身生长发育所需。