比叡山
この間、戦勝で京都の自治権を得た法華一揆と比叡山延暦寺との対立で、天文5年7月には比叡山側から援軍を求められた本願寺だったが派兵には応じず、軍資金を送って比叡山への支持表明のみ行った（結果は比叡山・六角連合軍が勝利した）。8月には細川晴国も味方の裏切りで敗死した。