First Sudanese Civil War
Im zweiten Sezessionskrieg im Südsudan war Yambio bis 1989 unter der Kontrolle der sudanesischen Regierung, danach wurde es von den Rebellen der SPLA eingenommen. Die einheimischen Azande standen der von Dinka dominierten SPLA eher reserviert gegenüber, viele verließen nach deren Ankunft die Stadt.