福田康夫
福田康夫當選為自民黨的總裁後，接著就是在國會兩院會議上的選舉了。眾議院由於是執政的自民黨所全面掌控，所以自民黨黨魁福田康夫在眾議院獲得338票高票獲得提名，最大在野黨民主黨黨魁小澤一郎則是獲得117票。日本參議院由於是以民主黨為首的在野聯盟過半，所以小澤一郎在參議院選舉第一輪以117票領先福田康夫的106票；由於沒有人過半，所以進行第二輪的投票。第二輪參議院投票中，小澤一郎拿下133票，福田康夫則是維持106票，小澤一郎獲得參議院提名為日本首相。依照《日本國憲法》六十七條規定，若參眾兩院提名的首相人選不同，以眾議院的決定為優先。參眾兩院召開協商會，若未能對首相人選達成協議，將依據憲法規定，由眾議院的表決結果為最終決定。