Arabidopsis thaliana
モデル植物であるシロイヌナズナ ("Arabidopsis thaliana") におけるDNAメチル化の理解が大きく進んでいる。植物におけるDNAメチル化はほ乳類とは異なる。ほ乳類におけるDNAメチル化は主にCpG部位のシトシンヌクレオチドで起こるが、植物ではシトシンはCpG、CpHpG、CpHpH部位でメチル化される（Hはグアニン以外のヌクレオチドを表す）。