台北経済文化代表処
台湾の政治情勢が緩和し、開放的になっていく中で、民進党は国民党と選挙で競い合うようになった。1990年代初頭には、民進党書記長に就任し、党委員長の施明徳と許信良氏の下で活躍したが、1998年の三合一選挙（立法委員、台北・高雄市長、台北・高雄. 市議会議員）の結果が振るわなかった責任をとって辞任した。民進党は国民党が運営する台北経済文化代表処に対抗して自らの代表を独自に米国に派遣することとなり、邱がワシントンD.C.に派遣された。