X chromosome
發生X染色體去活化的時間很早，在二細胞至四細胞時期就已發生，其中外細胞團的細胞（extraembryonic tissue，未來將成為胎盤）中的Xi將繼續保持失活狀態；內細胞團的細胞（inner cell mass，未來將成為胚胎）中的Xi則會復原，之後再失去活性。以老鼠為例，其第一次X染色體去活化受基因銘印影響，全部使父系X染色體成為Xi，母系X染色體成為Xa，第二次去活化則是隨機選擇。這種機制使胎盤的X染色體全為母系，可能可以避免其受母體細胞排斥（但由於控制排斥的基因多不在X染色體上，關閉胎盤的父系X染色體可能無法避免移植排斥，目前這種說法未有定論）。