中国人民银行
1994年11月，刘士余任中国建设银行房地产信贷部副主任。1996年至1998年，任中国人民银行银行司助理巡视员、副司长；1998年至2002年，任中国人民银行银行监管二司副司长、司长；2002年至2004年，任中国人民银行办公厅主任、党委办公室主任。2004年7月，任中国人民银行党委委员、行长助理；2006年6月，任中国人民银行党委委员、副行长。