Paris Foreign Missions Society
La diócesis fue erigida el 16 de julio de 1927, mediante breve "Catholicae Fidei" del papa Pío XI, desmembrando su territorio de la diócesis de Nagasaki e inicialmente confiada a la administración de la Sociedad de las Misiones Extranjeras de París. El 27 de marzo de 1928 cedió parte de su territorio para la creación de la misión "sui iuris" de Miyazaki (hoy diócesis de Oita).