Recopa Sudamericana
В начале 2015 года он вернулся на родину подписав контракт с «Сан-Лоренсо де Альмагро». Сумма трансфера составила 1,7 млн евро. 24 февраля в матче против «Дефенса и Хустисия» Франко дебютировал за новую команду. В этом же поединке Муссис забил свой первый гол за «Сан-Лоренсо». В своём первом сезоне он помог команде занять второе место, а также выйти в финал Рекопа Южной Америки. В феврале 2016 года Франко помог «Сан-Лоренсо» выиграть Суперкубок Аргентины.