المناطق القبلية الخاضعة للإدارة الاتحادية
بدأ النزاع المسلح في عام 2004 عندما تصاعدت التوترات المتجذرة لتصبح مقاومة مسلحة بسبب بحث الجيش الباكستاني عن مقاتلي تنظيم القاعدة في منطقة وزيرستان الجبلية في باكستان (في المناطق القبلية الخاضعة للإدارة الاتحادية). كان ذلك ضمن مساهمة باكستان في الحرب الدولية على الإرهاب. اندلعت اشتباكات أخرى بين القوات المسلحة الباكستانية الموحدة والجماعات المسلحة من آسيا الوسطى، التي تحالفت مع المقاتلين العرب، في 2008-2010. وانضم إلى المسلحين الأجانب قدامى المحاربين الباكستانيين غير العسكريين الذين شاركوا في الحرب الأفغانية في الغرب، والتي أسست فيما بعد حركة طالبان باكستان وغيرها من المنظمات الجامعة المتشددة، مثل لشكر إسلام. أما حركة تطبيق الشريعة المحمدية فقد تأسست في عام 1992 متحالفة مع حركة طالبان باكستان ولشكر إسلام.