ファイブフォークスの戦い
ジョンソンの師団はその後の7か月間、包囲された塹壕線の中で過ごした。1865年3月下旬、北軍が南軍の右翼側面に回り込んだのに対応するために、ジョンソンの師団が塹壕から出て、3月29日のルイス農園の戦いとなった。3月31日、ジョンソンは師団を率いてホワイトオーク道路での反撃を行った。北軍2個師団を撃退したが、北軍の援軍のために進撃を止められ、後退させられた。4月1日のファイブフォークスの戦いでは、ジョンソンの師団から2個旅団がジョージ・ピケットの指揮下に付けられ、その大半が破壊された。アポマトックスに向けた後退戦では師団の残り部隊を率いた。4月6日に起きたセイラーズクリークの戦いでは、指揮下の師団が打ち砕かれたが、ジョンソンは捕虜になるのを免れた。アポマトックス・コートハウスでリー軍が降伏する時まで、ジョンソンは指揮する部隊も無いままにリー軍に同行していた。投降後にジョンソンは仮釈放された。