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呼格吉勒图的研究范围包括现代蒙古语、蒙古语标准音、蒙古语方言、蒙古文正字法、中世纪蒙古语、八思巴文、17至18世纪蒙古文献语言、阿尔泰语系诸语言（包括蒙古语族、突厥语族、满-通古斯语族）比较研究等等。