Barnard College
Никсон родилась в Нью-Йорке, штат Нью-Йорк. Мать — актриса Анна Нолл, отец — радиожурналист Уолтер Никсон. Синтия была единственным ребёнком в семье. Её родители расстались, когда ей было шесть лет. После этого девочка осталась жить с матерью. В 1988 году она окончила со степенью бакалавра Барнард-колледж.