Вюрцбургский университет
Фишер поступил в Боннский университет в 1872 году, но уже в том же году перевёлся в Страсбургский университет. Окончив его в 1874 году с работой по фталеину, был оставлен при университете. В 1875 году он отправился в Мюнхенский университет и в 1879 году стал профессором химии. В 1881 году назначен профессором в Университете в Эрлангене. В 1888 году приглашён профессором химии в Вюрцбургский университет. В 1892 году приглашён в Университет в Берлине, где он проработал до самой смерти в 1919 году.