巴士海峽
台灣與菲律賓對於巴士海峽的經濟海域劃分尚未協商，因此常發生菲律賓軍隊扣押甚至槍殺台灣漁民的事件，引發雙方外交上的衝突。2013年5月9日，台灣屏東縣琉球鄉籍漁船在巴士海峽上遭菲國公務船用機槍掃射，造成船長之父中彈喪命，引起雙邊關係緊張。總統馬英九召開國安高層會議，決議自15日起，終止菲律賓勞工入台申請、召回駐菲律賓代表、要求菲律賓駐台代表返菲等三項反制措施。民間也引發相當程度的反彈聲浪。