ポルトガル王政復古戦争
これらの戦いによって、町の人口は減少し、次第に町は廃墟に変じた。1521年にマヌエル1世により、再度ベージャが市の地位に昇格しただけであった。ポルトガル王政復古戦争（1640年-1667年）では、ベージャはポルトガル＝スペイン間で攻撃と占領が繰り返された。