Index Librorum Prohibitorum
Главной его работой является обширный труд по церковной истории «Selecta historiae ecclesiasticae capita etc.» (Париж, 1677—1686, 26 томов), заканчивающийся историей Тридентского собора (1545). В своей работе Наталис был близок к галликанизму, поэтому сочинение было включено папой Иннокентием XI в Индекс запрещённых книг.