University of Valencia
17世紀に、大学ではトマス主義と反トマス主義で論争が起き、結果的に大学自体が二つに分裂した。この論争は次第に激しくなり、バレンシア王国全体に広がった。大学では、27,000冊の蔵書があった図書館がスーシェ将軍 () の兵に焼かれた。この頃の著名なバレンシア大学の学者としては、カルロス3世の治政下で幅広い文化的素養と影響力を持ったフランシスコ・ペレス・バジェール（）がいる。またこの頃、バレンシア大学の周囲では、貧しい学生のための学寮（、コレヒオ・マジョール）が次々と設立された。聖ビラノーバのトマス () が1561年に設立したのが最初で、ドーニャ・アンヘラ・アロンサール (Doña Angela Alonsar)、モーセン・ペドロ・マルティン (Mosen Pedro Martín) などが続いたが、最も有名なのはコルプス・クリスティ (Corpus Christi) で、これはフアン・デ・リベラ () によって設立された。またフェリペ2世はサン・ホルヘ (San Jorge) に、メルコール・デ・ビレーナは1643年に、同様の学寮を設立した。