Secondary structure
由於RNA二級結構差不多全都是由鹼基對作為中介，它可以說是確定在一個分子或複合物中哪些鹼基成對。但是，傳統的華生—克里克鹼基對並非唯一在RNA的配對方法，霍氏配對方法亦很普遍。