FC Tobol
Seine aktive Laufbahn begann Bauyrschan Scholschijew im Jahre 2008 bei FK Almaty. Nach der Auflösung des Vereins zum Ende der Saison 2008 wechselte er zu FK Atyrau. Mit diesem Verein gewann er 2009 den kasachischen Pokal. Nach einer weiteren Saison in Atyrau ging er zu Tobyl Qostanai.