中国东方航空
2002年10月11日，云南航空与中国东方航空集团公司联合重组，成为中国东方航空集团公司下属航空运输企业，改组中国东方航空云南分公司，2003年3月1日起所有航班的IATA代码从3Q改为MU。但是由于企业文化的差异和新公司的归属感不足，云航与东航之间的摩擦一直没有充分的解决。之后的包头空难和331返航事件都给东航的整体品牌蒙上了阴影。直到2009年东航董事长刘绍勇重启了与云南省政府的谈判，试图将云南分公司下放给政府参与管理和经营。2010年7月28日，中国东方航空集团公司与云南省政府在云南昆明举行揭牌仪式，正式宣布筹建由东航集团与云南省国资委共同投资的合资公司——东方航空云南有限公司。2011年8月2日正式颁证运行，自此由中国东方航空云南分公司正式更名为中国东方航空云南有限公司。