Baylor College of Medicine
عادت جونز بعد تخرجها إلى هوت سبرنغز، وعملت في الطب هناك ست سنوات. عندما لفتت أزمة الطلاب التسعة من مدرسة ليتل روك في أركنساس النظر وبدأت الصحف تسلط الضوء عليها في عام 1959، انتقل الطلاب إلى هيوستن، تكساس، حيث قُبلت جونز بصفتها أول امرأة سوداء تدخل كلية بايلور للطب التابعة للمستشفيات. نتيجة فصل الموظفين من المستشفى وتحديد قوائم المرضى في تكساس، أنهت آخر ثلاثة أشهر من فترة التخصص في الطب من مستشفى فريمان في واشنطن العاصمة، ثم أسست عيادة خاصة في «الجناح الثالث» لهيوستن -وهو جزء من المدينة الداخلية من هيوستن- لمساعدة الذين لا يحظون بالرعاية في أماكن أخرى. ترأست قسم القلب في مستشفى سانت إليزابيث في هيوستن في نفس السنة. وأصبحت أيضًا مساعدة رئيس الطب في مستشفى ريفرسايد العام. نُصّبت في عام 1963 برتبة أستاذ طبي مساعد في كلية بايلور للطب. مواصِلةً تعليمها، أتمت جونز تعليمها في مدرسة الطب في جامعة فرجينيا الغربية في عام 1965 ومدرسة خريجي الطب كوك كاونتي في شيكاغو في عام 1966. كرمها فرع هيوستن ثيتا سيغما في جمعية المرأة في الاتصالات بجائزة ماتركس للطب في عام 1969.