Lake Natron
Все фламинго и малый в частности — социальные птицы, образующие большие гнездовые колонии, у каждой популяции малого фламинго они свои. Известно только пять мест, в которых малые фламинго регулярно формируют гнездовые колонии: впадина Макгадикгади в Ботсване, солончак Этоша в Намибии, озеро Натрон в Танзании, солончаки Зинзувада ("Zinzuwada") и Пурабчерия ("Purabcheria") в штате Гуджарат в Индии. Иногда птицы устраивают колонии в других местах, но не на постоянной основе. На озере Абията в Эфиопии в 2005 году было выведено около 3 тысяч птенцов, в дельте Сенегала на юге Мавритании в 2010 году было выведено очень небольшое количество птенцов (первое зафиксированное размножение в Западной Африке). Молодые птицы безуспешно пробуют размножаться в других местах, колонии составляют не более 500 пар. На плотине в ЮАР в 2006 году был построен искусственный остров, на котором птицы успешно размножались летом 2007/2008 годов (9 тысяч птенцов) и летом 2008/2009 годов (13 тысяч птенцов). Это первое зарегистрированное размножение малого фламинго в Южной Африке и первое зарегистрированное размножение представителей вида на искусственном сооружении. Возможно, колонии существуют также на территории Большого Качского Ранна в Индии и в районе Афтут-Эс-Сахель в Мавритании. На озере Натрон в Танзании и озёрах Накуру и Элментейта в Кении малый фламинго устраивает смешанные гнездовые колонии с розовым фламинго.