Ферганская долина
После гибели Чигая ханом становится Тауекель-хан. Тауекель-хан начинает войну против Бухары. Начинается месть за Хак-Назар хана. В 1582 году Баба султан терпит поражение от объединённого войска Тауекеля и Абдаллаха. В 1586 году казахи совершают неудачный поход на Ташкент. Правитель Ташкентского ханства Баба-султан заключает союз с Бухарой. Бухарские и ташкентские войска вторгаются в Южный Казахстан, штурмуют города Туркестан, Сауран, Созак и Сайрам. Захватчики потерпели поражение при Сауране. В свою очередь казахские войска наносят встречный удар, возвращают Ташкент и начинают вторжение в Бухарское ханство. Казахские войска во главе султаном Есимом захватывают Самарканд. Во время штурма Бухары казахские войска узнают о смерти Тауекель-хана. Султан Есим заключает мирный договор с Бухарой. По договору Коканд, Андижан, и другие города Ферганская долина вошли в состав Казахского ханства, за исключением Самарканда. После казахско-бухарской войны Есим-хан в 1613 году закрепляет Самарканд за Казахским ханством. Ферганская долина оказалась в составе Казахского ханства с 1598 по 1709 годы, а Самарканд с 1613 по 1718 годы.