黑旗軍
在臺灣民主國正規軍方面（實際僅有清軍受過正規訓練，而清軍又可分兩部分：即在台北未戰自潰的二十營「廣勇」與駐守台南的黑旗軍，黑旗軍約八千人；兩正規軍合計約兩萬八千人，但僅黑旗軍真正出動抗日），前後出動約3萬3千人。根據調查官井出季和太根據總督府檔案寫成記載，戰場遺留臺方兵士屍體達七、八千具，除此之外，另有14,000臺灣軍士戰死的學術估算（其中以黑旗軍死亡約一千五百餘名的記載，推估臺灣義軍共犧牲了至少一萬兩千五百以上）。