Keiyō Line
南船橋車站是由京葉線本線與高谷支線、二俣支線三條路線所組合成的三角線之東側頂點。雖然路線上南船橋車站僅有京葉線一條路線通過，但實際的運務上根據時間帶的不同部分行駛於武藏野線上的列車會自西船橋方向經過二俣支線抵達南船橋。其中部分列車會在本站直接折返，部分會進入京葉本線並行駛至海濱幕張之後才折返。為了方便辨識，在南船橋車站這裡會將實際上是京葉線支線的二俣支線稱呼為「武藏野線」，因此站內的四條乘車線也分別兩兩標示為京葉線與武藏野線的停車月台。