John Dory
マトウダイ目にはNelson（2006）の体系において、Cyttoidei 亜目およびマトウダイ亜目の2亜目の下、6科16属32種が認められている。かつて本目に所属していたヒシダイ亜目 Caproidei の1科2属11種は、現在ではスズキ目の内部に含められるようになっている。本目が単系統群であるかどうかは長く議論の的とされていたが、ヒシダイ類を除外することによって単系統性を確立したものと考えられている。