Deportes Quindío
Хоао Родригес родился в Кукуте. В 2012 году в возрасте 16 лет присоединился к юношеской Академии «Депортес Киндио». После выступления на чемпионате Южной Америки до 15 лет, он попался на глаза клубных скаутов со всего мира, в том числе и «Челси». Хоао провел два месяца на просмотре в юношеской команде «Челси» до 16 лет и оставил хорошее впечатление, достаточное чтобы подписать соглашение о будущем пятилетнем профессиональном контракте, вступающим в силу в его семнадцатилетие. Родригес стал первым колумбийцем в истории лондонского клуба. В рамках соглашения, Хоао, остался в «Депортес Киндио» до начала сезона 2013/14, после чего прибыл в Лондон. В январе 2014 года Родригес вернулся в Колумбию на правах аренды в «Униаутонома», за который сыграл 6 матчей и забил 1 гол в ворота «Индепендьенте Медельин».