Сент-Джонстон
В июле 2007 года Койл продлил свой контракт с командой «Сент-Джонстон» до конца сезона 2009/10. В начале сезона 2007/08 под руководством Койла клуб дошёл до финала Шотландского кубока вызова. За неделю до финального матча Койл принял предложение клуба «Бернли» и перешёл работать в него. «Сент-Джонстон» выиграл кубок уже под руководством Сэнди Стюарта, обыграв «Данфермлин Атлетик» со счетом 2:3 на стадионе «Денс Парк».