Ulmensterben
Vom Ulmensterben ist die Flatterulme deutlich weniger betroffen als andere Ulmen. Der Große Ulmensplintkäfer ("Scolytus scolytus") und der Kleine Ulmensplintkäfer ("Scolytus multistriatus"), die die hauptsächlichen Überträger des Ulmensterbens sind, fliegen die Flatterulme aufgrund von Rindeninhaltsstoffen seltener an. Gegen den Schlauchpilz "Ophiostoma novo-ulmi" verfügt sie über unvollständige Resistenz.