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잔지바르는 잔지바르 대학교, 1999년 잔지바르 주립 대학교(SUZA)로 변모한 이전의 스와힐리어 외국어 대학(TAKILUKI)의 소재지이며, 잔지바르에서 가장 유명한 학교는 루뭄바 단과대학으로서 알려진 루뭄바 제2학교이다. 또한 많은 사립 학교들이 있는데, 그중 하나인 SOS 학교는 1993년에 고아를 위하여 계획된 학교이다. 오늘날, SOS 학교는 다른 사립 학교들과 비교하여 적은 비용으로 모든 아이들에게 교육을 제공한다.